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Diversité génétique humaine et évolution

12 décembre 2025

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1. Vue d'ensemble

Ce cours traite de la diversité génétique humaine, principalement à travers l'étude des SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Il explique comment cette diversité reflète l'histoire évolutive de l'espèce, notamment via la variabilité entre populations, les mécanismes évolutifs comme la dérive génétique, la sélection naturelle, et l'impact des migrations. La paléogénomique permet d'étudier la génétique ancienne à partir de fossiles. L'objectif est de comprendre comment ces mécanismes façonnent le génome actuel et leur importance en anthropologie et médecine.

2. Concepts clés & Éléments essentiels

  • Diversité génétique humaine : principalement via SNPs, 1 SNP/1000 pb, bi-alléliques
  • Mutation : force évolutive créant de nouveaux allèles
  • Génotypage : détermination du génotype pour un marqueur
  • Séquençage à haut débit : technologie moderne pour étudier le génome
  • Variabilité génétique : plus élevée en Afrique, support de l'hypothèse "Out of Africa"
  • Bottlenecking : réduction de la diversité suite à un événement démographique
  • Dérive génétique : fluctuation aléatoire des fréquences alléliques
  • Sélection naturelle : adaptation spécifique (ex. SNP EPAS1 chez Tibétains)
  • Exemple : SNP EPAS1, allèle C favorisé en altitude pour résistance à l’hypoxie
  • Paléogénomique : séquençage d’ADN ancien, étude de la diversité passée
  • Forces évolutives : mutation, migration, dérive, sélection

3. Points à Haut Rendement

  • Densité en SNP : 1/1000 pb, majorité bi-alléliques
  • Variabilité génétique : plus grande en Afrique, support de l’origine africaine
  • Bottlenecking : perte d’allèles, réduction de diversité
  • Dérive génétique : changement aléatoire des fréquences alléliques, notamment après événements démographiques
  • Exemple SNP EPAS1 : allèle C associé à la résistance à l’hypoxie, sélection chez Tibétains
  • Paléogénomique : séquençage d’ADN ancien, permet d’étudier la diversité passée
  • Forces évolutives : mutation, migration, dérive, sélection
  • Impact de la migration : mélange des populations, introduction de nouveaux allèles
  • Séquençage haut débit : permet génotypage massif et étude fine de la diversité
  • Hypothèse "Out of Africa" : diversité plus grande en Afrique, origine de Homo sapiens

4. Tableau de Synthèse

ConceptPoints ClésNotes
SNP1/1000 pb, bi-alléliquesVariabilité majeure, marqueur évolutif
BottleneckingRéduction diversité, perte d’allèlesÉvénements démographiques, impact sur la variabilité
Dérive génétiqueFluctuation aléatoire, effets accentués après bottleneckModifie fréquences alléliques au hasard
Sélection naturelleEx. SNP EPAS1, adaptation à l’altitudeAllèle favorisé, augmentation de sa fréquence
PaléogénomiqueSéquençage ADN fossile, étude de la diversité ancienneComprendre l’histoire évolutive de l’espèce
Forces évolutivesMutation, migration, dérive, sélectionInteractions déterminant la génétique des populations

5. Mini-Schéma (ASCII)

Diversité génétique humaine
 ├─ SNPs
 │   ├─ Densité : 1/1000 pb
 │   └─ Bi-alléliques
 ├─ Mécanismes évolutifs
 │   ├─ Mutation
 │   ├─ Migration
 │   ├─ Dérive génétique
 │   └─ Sélection naturelle
 └─ Histoire évolutive
     ├─ Out of Africa
     └─ Bottlenecking

6. Bullets de Révision Rapide

  • La majorité des SNPs sont bi-alléliques
  • La diversité génétique est plus élevée en Afrique
  • La dérive génétique peut réduire la variabilité
  • Le bottlenecking entraîne perte d’allèles
  • La sélection favorise certains allèles (ex. SNP EPAS1)
  • La paléogénomique étudie l’ADN ancien
  • La migration contribue à la diversité
  • La technologie de séquençage à haut débit révolutionne l’étude génétique
  • La théorie "Out of Africa" explique la distribution de la variabilité
  • La mutation crée de nouveaux allèles
  • La diversité génétique reflète l’histoire démographique et évolutive

Diversité génétique humaine et évolution

Fiche de révision

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Fiche de Révision : Diversité Génétique Humaine et Mécanismes Évolutifs

1. 📌 L'essentiel

  • La diversité génétique humaine est principalement mesurée via les SNPs, avec une densité d'environ 1 SNP tous les 1000 paires de bases.
  • La majorité des SNP sont-alléliques, permettant une grande variabilité.
  • La variabilité génétique est plus importante en Afrique, support de l'hypothèse "Out of Africa".
  • La dérive génétique et le bottlenecking sont des mécanismes qui réduisent la diversité.
  • La sélection naturelle favorise certains allèles, comme le SNP EPAS1 chez les Tibétains.
  • La paléogénomique permet d’étudier la diversité ancienne à partir de fossiles.
  • La migration contribue à la diversité en mélangeant différentes populations.
  • La mutation est la force évolutive qui crée de nouveaux allèles.
  • La séquençage à haut débit facilite l’étude précise de la variabilité.
  • Les forces évolutives interagissent pour façonner le génome actuel.

2. 🧩 Structures & Composants clés

  • SNP (Single Nucleotide Polymorphisme) — variation ponctuelle d’un seul nucléotide, marqueur de diversité.
  • Dérive génétique — fluctuation aléatoire des fréquences alléliques, surtout après événements démographiques.
  • Bottlenecking — réduction drastique de la diversité suite à un événement démographique.
  • Sélection naturelle — processus d’adaptation où certains allèles sont favorisés.
  • Paléogénomique — séquençage de l’ADN ancien pour étudier la diversité passée.
  • Migration — déplacement de populations, apportant de nouveaux allèles.
  • Mutation — changement aléatoire de l’ADN, source de nouveaux allèles.
  • Diversité génétique — plus élevée en Afrique, reflet de l’origine africaine.
  • Hypothèse "Out of Africa" — théorie selon laquelle Homo sapiens est originaire d’Afrique.
  • Allèle EPAS1 — exemple d’adaptation à l’altitude chez les Tibétains.

3. 🔬 Fonctions, Mécanismes & Relations

  • La mutation crée de nouveaux allèles, augmentant la diversité.
  • La migration introduit de nouveaux allèles dans une population.
  • La dérive génétique modifie aléatoirement la fréquence des allèles, surtout après bottleneck.
  • La sélection naturelle augmente la fréquence des allèles avantageux (ex. EPAS1).
  • La diversité génétique est un reflet de l’histoire démographique et évolutive.
  • La paléogénomique permet de comparer la diversité ancienne et moderne.
  • La hiérarchie : mutation → migration/dérive → sélection.
  • La variabilité accrue en Afrique soutient l’origine africaine de l’Homo sapiens.
  • La réduction de diversité par bottleneck limite la variabilité future.

4. Tableau de Synthèse

ÉlémentCaractéristiques clésNotes / Différences
SNP1/1000 pb, bi-alléliquesMarqueur de diversité, évolutif
BottleneckingRéduction de la diversité, perte d’allèlesImpact démographique, réduit la variabilité
Dérive génétiqueFluctuation aléatoire des fréquences alléliquesEffet accentué après bottleneck
Sélection naturelleFavorise certains allèles (ex. EPAS1)Adaptation spécifique
PaléogénomiqueSéquençage ADN ancienÉtude de la diversité passée
MigrationIntroduction de nouveaux allèlesMécanisme de diversification

5. Diagramme Hiérarchique ASCII

Diversité génétique humaine
 ├─ SNPs
 │   ├─ Densité : 1/1000 pb
 │   └─ Bi-alléliques
 ├─ Mécanismes évolutifs
 │   ├─ Mutation
 │   ├─ Migration
 │   ├─ Dérive génétique
 │   └─ Sélection naturelle
 └─ Histoire évolutive
     ├─ Out of Africa
     └─ Bottlenecking

6. ⚠️ Pièges & Confusions fréquentes

  • Confondre SNP et mutation : le SNP est une variation spécifique, la mutation est le mécanisme.
  • Croire que la dérive ne concerne que les petites populations, alors qu’elle peut aussi agir sur de grandes populations.
  • Confondre bottlenecking et fondation de population : le bottleneck est une réduction passagère.
  • Penser que la sélection favorise tous les allèles bénéfiques, alors qu’elle peut aussi agir sur des allèles neutres.
  • Confusion entre diversité génétique et polymorphisme.
  • Sous-estimer l’impact de la migration sur la diversité.
  • Confondre la diversité actuelle avec la diversité historique.
  • Ignorer le rôle de la mutation dans la création de nouveaux allèles.

7. ✅ Checklist Examen Final

  • Définir SNP et sa densité dans le génome humain.
  • Expliquer le rôle de la mutation dans la diversité.
  • Décrire la différence entre dérive et bottlenecking.
  • Illustrer l’impact de la sélection naturelle avec l’exemple EPAS1.
  • Expliquer le principe de la paléogénomique.
  • Discuter de l’hypothèse "Out of Africa".
  • Identifier les mécanismes qui augmentent ou réduisent la diversité.
  • Comprendre l’effet de la migration sur la variabilité.
  • Savoir comment la technologie de séquençage à haut débit est utilisée.
  • Reconnaître les effets des événements démographiques sur la diversité.
  • Maîtriser la hiérarchie des mécanismes évolutifs.
  • Être capable de représenter la hiérarchie génétique sous forme ASCII.

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