Principes fondamentaux de la photosynthèse et de l'ADN

25 novembre 2025

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Synthèse rapide

  • La chromatographie permet de séparer les composants d'un mélange en exploitant leur vitesse différentes de déplacement.
  • Les pigments photosynthétiques absorbent principalement la lumière dans le bleu (~450 nm) et le rouge (~670 nm), reflétant le vert.
  • La photosynthèse implique deux étapes principales : réactions dépendantes de la lumière (production d'ATP, photolyse de l'eau) et réactions indépendantes (fixation du carbone via le cycle de Calvin).
  • La vitesse de la photosynthèse est influencée par la concentration en CO₂, l'intensité lumineuse, la température, et le pH.
  • La mesure du taux de photosynthèse peut se faire via la production d'O₂, l'évolution de la biomasse, ou la fixation du carbone.
  • La structure de l’ADN est une double hélice antiparallèle composée de nucléotides liés par des liaisons phosphodiester.
  • La réplication de l'ADN implique des enzymes clés : hélicase, ADN polymérase, ligase, primase, etc., avec des mécanismes précis (directionnalité 5’→3’).
  • La transcription produit un ARNm à partir de l’ADN, avec étapes de initiation, élongation, terminaison, incluant l’épissage, la coiffe et la polyadénylation.
  • La traduction transforme l’ARNm en polypeptide via la lecture des codons par le ribosome, en trois étapes : initiation, élongation, terminaison.
  • La structure des protéines (primaire à quaternaire) détermine leur fonction, influencée par la séquence d’acides aminés, la polarité, et les interactions (liaisons H, disulfures, etc.).

Concepts et définitions

  • Chromatographie : technique de séparation des composants d’un mélange basé sur leur vitesse de déplacement dans un support stationnaire.
  • Spectre d’absorption : gamme de longueurs d’onde qu’un pigment absorbe, liée à l’énergie qu’il capte.
  • Spectrum d’action : courbe représentant la vitesse de la photosynthèse en fonction de la longueur d’onde de la lumière.
  • Cycle de Calvin : ensemble de réactions indépendantes de la lumière pour fixer le carbone en molécules organiques.
  • Nucléotide : unité de base de l’ADN composée d’un sucre, d’un groupe phosphate, et d’une base azotée.
  • Enzymes de réplication : hélicase, ADN polymérase, ligase, primase, gyrase, SSB.
  • ARN messager (ARNm) : molécule transcrite de l’ADN, servant de modèle pour la synthèse protéique.
  • Polypeptide : chaîne d’acides aminés formant une protéine, organisation primaire à quaternaire.

Formules, lois, principes

  • Rf = distance parcourue par la composante / distance parcourue par le solvant
  • La complémentarité des bases : A=T (2 liaisons H), G≡C (3 liaisons H).
  • La polymérisation de l’ADN : synthèse en 5’→3’ par ajout de nucléotides au groupe hydroxyle 3’.
  • La transcription : synthèse de l’ARN à partir de l’ADN, avec l’ARN polymérase.
  • La traduction : lecture de l’ARNm par le ribosome, en codons, pour assembler la chaîne peptidique.
  • La thermorégulation : animaux endothermes maintiennent la température par métabolisme ; ectothermes dépendent de l’environnement.
  • La cinétique enzyme : $ v = k [S] $ (Michaelis-Menten).

Méthodes et procédures

  1. Chromatographie sur papier ou couche mince : dissolution du mélange, passage dans un support, calcul du Rf.
  2. Mesure de la photosynthèse : collecte d’O₂, pesée sèche, titrage du CO₂.
  3. Analyse de spectre : mesure d’absorbance sur spectrophotomètre pour pigments.
  4. Réplication de l’ADN : dénaturation, soustraction d’ADN, synthèse / réparation.
  5. Transcription : fixation de l’ARN polymérase, synthèse d’ARN complémentaire.
  6. Traduction : assemblage des acides aminés via le ribosome, en trois étapes.
  7. Étude de la structure protéique : organisation primaire à quaternaire.

Exemples illustratifs

  • Séparation de pigments de chlorophylle via chromatographie sur papier pour déterminer leur composition.
  • Mesure du taux de photosynthèse par la quantité d’oxygène libérée chez une plante exposée à différentes lumières.
  • Reconstitution de la réplication de l’ADN avec enzymes: hélicase pour dénaturation, ADN polymérase pour synthèse, ligase pour jointure.

Pièges et points d'attention

  • Confusion entre spectrum d’absorption et spectrum d’action.
  • Erreur fréquente : considération erronée de la direction de synthèse en ADN (5’→3’).
  • Mélanger les différentes enzymes de la réplication et leurs fonctions.
  • Confondre transcription et traduction.
  • N’oublier pas que la polymérisation de l’ADN est antiparallèle.
  • Erreur dans la détermination du niveau de la structure protéique (quaternaire versus tertiaire).

Glossaire

  • Chromatographie : séparation par migration différentielle.
  • Spectrum d’absorption : gamme d’onde absorbée par un pigment.
  • Cycle de Calvin : fixation du carbone en phase indépendante de la lumière.
  • Nucléotide : unité de base de l’ADN, comprenant un sucre, phosphate, et base azotée.
  • Enzymes de réplication : hélicase, ADN polymérase, ligase, primase, gyrase.
  • ARNm : messager de l’ADN, porteur de l’information génétique.
  • Polypeptide : chaîne d’acides aminés pliée en une protéine.
  • Structure primaire/secondaire/tertiaire/quaternaire : organisation spatiale de la protéine.
  • Base azotée : A, T, G, C dans l’ADN / A, U, G, C dans l’ARN.
  • Ligase : enzyme qui lie les fragments d’ADN en formant des liaisons phosphodiester.
  • Polymère : molécule composée d’unités répétées (nucléotides, acides aminés).