📌 L'essentiel

• La dégradation des protéines libère des acides aminés qui alimentent le cycle de l’azote.
• La désamination libère de l’ammoniac, recyclé ou éliminé par le cycle de l’urée ou l’ammoniogénèse.
• La glutamine est un transporteur clé de l’azote entre organes.
• Le cycle de l’urée permet l’élimination de l’ammoniac toxique, principalement dans le foie.
• En période post-prandiale, la priorité est l’uréogenèse ; en jeûne, l’ammoniogénèse prédomine.
• La désamination oxydative diffère de la transamination par l’élimination directe de NH₃.
• Des anomalies enzymatiques du cycle de l’urée peuvent entraîner des hyperammonémies graves.
• La régulation fine du cycle de l’urée est essentielle pour l’homéostasie azotée.
• La synthèse d’amines biogènes et de dérivés hormonaux découle de la décarboxylation d’acides aminés.

📖 Concepts clés

Cycle de l’azote : Ensemble de réactions permettant la transformation et l’élimination de l’azote issu de la dégradation des acides aminés.

Désamination : Processus par lequel le groupe NH₂ d’un acide aminé est retiré, libérant de l’ammoniac NH₃ ou NH₄⁺.

Uréogenèse : Synthèse d’urée dans le foie pour éliminer l’ammoniac toxique, comprenant plusieurs étapes enzymatiques.

Ammoniogénèse : Production et élimination d’ammoniac par les reins sous forme d’ammonium, souvent en situation de jeûne ou d’hypertrophie catabolique.

Glutamine : Acide aminé neutre qui transporte l’azote entre organes et joue un rôle central dans la régulation azotée et le cycle de l’urée.

Cycle de Krebs : Cycle métabolique qui intègre certains acides aminés pour fournir de l’énergie et des intermédiaires métaboliques.

Acides aminés essentiels : Acides aminés qui doivent être apportés par l’alimentation car synthétisés en quantité insuffisante par l’organisme (ex : leucine, valine).

Acides aminés non essentiels : Synthétisés par l’organisme (ex : alanine, glutamine).

📐 Formules et lois

Transamination : Catalysée par des aminotransférases (ALAT, ASAT), utilise le cofacteur PLP $$ \text{Acide aminé} + \text{γ-CGT} \leftrightarrow \text{Cétoglutamate} + \text{Acide aminé} $$

Désamination oxydative : Requiert NAD+ ou NADP+ $$ \text{Acide aminé} + \text{NAD}^+ \rightarrow \text{α-cétoglutarate} + \text{NH}_3 + \text{NADH} + \text{H}^+ $$

Cycle de l’urée : Comprend la carbamoylphosphate synthétase, ornitine transcarbamylase, argininosuccinate synthétase, argininosuccinate lyase, et l’arginase.

Émission d’ammoniac dans le cycle : Environ 80% de NH₃ est éliminé via le cycle de l’urée dans le foie.

🔍 Méthodes

1. Analyse sanguine des acides aminés (ornithine, citrulline, arginine) en prenant soin de respecter le jeûne.
2. Dosage enzymatique pour détecter une enzyme défaillante du cycle de l’urée.
3. Mesure du taux d’urée, ammoniémie, et pH sanguin pour évaluer la fonction hépatique et rénale.
4. Observation clinique pour repérer hyperammoniémie, coma hépatique ou autres signes de troubles métaboliques.
5. En cas d’hyperammonémie, traitement par restriction protéique, lactulose ou médicaments favorisant la fixation de l’ammoniac.

💡 Exemples

• Déficit en OTC → accumulation de carbamoylphosphate, diminution de citrulline, hyperammoniémie néonatale.
• Cirrhose hépatique → hyperammoniémie par impairment du cycle de l’urée.
• Effort intense ou jeûne prolongé → dégradation accrue des acides aminés, libération d’ammoniac via désamination musculaire.

⚠️ Pièges

• Confondre transamination (conversion d’un acide aminé en un autre) et désamination oxydative (libération directe NH₃).
• Négliger le rôle de la glutamine dans le transport de l’azote.
• Confondre cycle de l’urée (foie) et ammoniogénèse (rein) ou autres voies de détoxification.
• Il ne faut pas considérer systématiquement la concentration en urée comme indice unique de dysfonction hépatique sans vérifier la fonction rénale.

📊 Synthèse comparative

✅ Checklist examen

• Comprendre la différence entre transamination et désamination oxydative.
• Connaître le déroulement du cycle de l’urée et sa régulation.
• Savoir identifier les symptômes d’une hyperammonémie.
• Maîtriser les principaux troubles enzymatiques du cycle.
• Savoir interpréter les dosages de l’urée, ammoniémie, et acides aminés en contexte clinique.

Synthèse rapide

• La dégradation des protéines libère des acides aminés qui alimentent le cycle de l’azote.
• La désamination libère de l’ammoniac, dont l’élimination est assurée notamment par le cycle de l’urée dans le foie.
• La glutamine joue un rôle central dans le transport et la régulation de l’azote.
• Le cycle de l’urée est essentiel à l’homéostasie azotée, sa défaillance entraînant des hyperammonémies sévères.
• La régulation de la production d’ammoniac et d’urée dépend d’un équilibre enzymatique fin et de l’état métabolique de l’individu.