Le site d’initiation +1
Explication
Le site +1 est le premier nucléotide transcrit dans l’ARN. Le promoteur est la région reconnue pour démarrer la transcription, mais il ne correspond pas au point de départ lui-même.
Les exons sont conservés dans l’ARN mature, alors que les introns sont retirés
Explication
Les exons sont conservés dans l’ARN mature, tandis que les introns sont excisés lors de l’épissage. C’est une caractéristique fondamentale de l’organisation des gènes eucaryotes.
3’ vers 5’
Explication
Le brin matrice est lu dans le sens 3’→5’, ce qui permet la synthèse de l’ARN dans le sens 5’→3’. L’orientation est donc inversée entre lecture et synthèse.
Les pol I, II et III transcrivent chacune des catégories de gènes différentes
Explication
Chez les eucaryotes, les ARN polymérases sont spécialisées : pol I, pol II et pol III transcrivent des classes différentes de gènes. La pol II est notamment associée à la synthèse des ARNm.
TATAAT
Explication
La boîte -10, aussi appelée boîte de Pribnow, a pour séquence consensus TATAAT. Elle est reconnue par sigma 70 dans le complexe d’initiation bactérien.
15 à 18 pb
Explication
L’espacement optimal entre les éléments -35 et -10 est généralement de 15 à 18 paires de bases. Cet arrangement aide l’ARN polymérase à s’aligner correctement sur le promoteur.
TBP
Explication
TBP, une sous-unité de TFIID, se fixe à la TATA box et sert d’ancrage initial au promoteur. TFIIE et TFIIF interviennent plus tard dans l’assemblage.
Ouvrir l’ADN et phosphoryler le domaine CTD
Explication
TFIIH possède une activité hélicase qui ouvre l’ADN, et il participe aussi à la phosphorylation du CTD de la pol II. Cette phosphorylation favorise la transition vers l’élongation.
Une tige-boucle sans polyU qui ralentit l’ARN polymérase
Explication
La terminaison rho-dépendante nécessite Rho, qui se fixe sur l’ARN au site rut et rattrape l’ARN polymérase lors d’une pause. La tige-boucle avec région riche en U correspond plutôt à la terminaison rho-indépendante.
Elle est couplée à la polyadénylation et peut suivre un modèle torpille
Explication
Chez les eucaryotes, la terminaison est couplée à la polyadénylation et peut être expliquée par le modèle torpille. Rho et le site rut sont des éléments de terminaison bactérienne, pas eucaryote.
L’ajout d’une coiffe 5’
Explication
La coiffe 5’ se forme très tôt pendant la transcription et protège l’ARN des RNases tout en facilitant sa reconnaissance par le ribosome. La queue polyA intervient plus tard, à l’extrémité 3’.
Le signal PAS
Explication
Le signal PAS spécifie le site de polyadénylation et déclenche la coupure suivie de l’ajout de la queue polyA. La boîte Pribnow et la boîte -35 sont des éléments de promoteur bactérien, pas de maturation de l’ARNm.
Le spliceosome
Explication
Le spliceosome, constitué de snRNP, reconnaît les bornes d’introns et catalyse l’épissage. Le médiator et l’holoenzyme bactérienne interviennent dans la transcription, pas dans l’épissage.
Elles activent la reconnaissance des bornes d’introns via des séquences ESE
Explication
Les protéines SR se lient à des séquences exoniques ESE et favorisent la reconnaissance des bornes d’épissage par la machinerie de maturation. Le site rut concerne la terminaison rho-dépendante chez les bactéries.
Le recrutement progressif des facteurs de coiffe, d’épissage et de polyadénylation par l’ARN pol II
Explication
Le couplage repose sur le fait que l’ARN polymérase II recrute au cours de la transcription les facteurs nécessaires à la maturation. Rho et sigma 70 sont des acteurs de la transcription bactérienne.
Servir de plate-forme de recrutement pour les facteurs de maturation
Explication
Le CTD sert de plate-forme d’assemblage pour les facteurs de coiffe, d’épissage et de polyadénylation. Il ne reconnaît pas lui-même le signal AAUAAA et n’assure pas seul les réactions chimiques.
L’intron retenu
Explication
Un intron retenu n’est pas éliminé et reste présent dans l’ARN final. Un exon cassette correspond au retrait variable d’un exon, pas d’un intron.
Les ESE favorisent l’épissage, tandis que les ESS le répriment
Explication
Les ESE recrutent des protéines SR qui activent la reconnaissance des bornes d’épissage, alors que les ESS recrutent des hnRNP qui la freinent. Ces séquences contrôlent donc l’épissage, pas la polyadénylation.
Il empêche la transcription des gènes de l’opéron lactose
Explication
Sans inducteur, LacR se fixe sur les opérateurs et bloque l’accès de l’ARN polymérase, ce qui maintient une faible expression. Il n’active l’opéron qu’après liaison de l’allolactose ou d’un inducteur équivalent.
Il augmente l’expression de l’opéron lactose
Explication
Le complexe CRP-AMPc agit comme régulateur catabolique et stimule l’expression de l’opéron lactose en condition de faible glucose. Il ne remplace pas l’allolactose, qui reste l’inducteur naturel de LacR.
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Structure du gène eucaryote
Comporte promoteur, exons, introns, site +1, terminateur.
ARN polymérase bactérienne
Enzyme synthétisant l’ARN à partir d’un brin matrice.
Promoteur bactérien
Séquence ADN reconnue pour initier la transcription.
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