Microarray ADN — principe ?
Hybridation spécifique entre sondes fixées et cibles marquées.
Sondes Perfect Match — rôle ?
Reproduire parfaitement la séquence cible pour une hybridation spécifique.
Mismatch probe — utilisation ?
Contrôler l'hybridation non spécifique.
Support microarray — exemples ?
Membrane, silicium, verre synthétique.
Application transcriptomique — objectif ?
Quantifier l’expression de milliers de gènes simultanément.
Puces bi-couleurs — principe ?
Comparer deux conditions avec deux fluorochromes (Cy3, Cy5).
Marquage direct — méthode ?
Incorporation de fluorochromes lors de la transcription inverse.
Conception puces ADN — méthode ?
Dépôt de sondes synthétisées ou synthèse in situ.
Préparation échantillons — étape clé ?
Extraction, contrôle qualité, hybridation.
Normalisation données — but ?
Éliminer biais systématiques pour comparabilité.
Clustering — objectif ?
Grouper gènes avec profils d’expression similaires.
Puces dédiées — exemple ?
Analyse de gènes liés à la neurotransmission.
Génotypage microarray — cible ?
Variations génétiques, SNV, CNV.
CGH-array — détection ?
Délétions, amplifications, trisomies.
ChIP-chip — principe ?
Identifier ADN lié à des protéines spécifiques.
BeadChip Illumina — utilisation ?
Génotypage SNP, étude méthylation.
Microarray miRNA — cible ?
Détection spécifique de miRNA mature.
Exome microarray — couverture ?
Tous les exons connus, transcrits alternatifs.
Microarrays génomiques — rôle ?
Détecter variations de séquence, CNV, mutations.
Techniques complémentaires — exemples ?
MeDIP-chip, DNase-chip, ChIP-chip.
Normalisation médiane — but ?
Ajuster pour que la médiane des intensités soit identique.
Analyse statistique — étape ?
Tests pour significativité, regroupement (clustering).
Applications spécifiques — exemples ?
Études de transcriptome complet, miRNA, exome.
Fabrication puces ADN — méthode ?
Dépôt de sondes par robot ou synthèse in situ.
Teste tes connaissances avec un QCM de 12 questions sur Principes et applications des microarrays ADN.
1. En quoi les Perfect Match probes diffèrent-elles des Mismatch probes dans les microarrays ADN ?
2. Qu'est-ce que la transcriptomique ?
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