Flashcards : Protides, peptides et enzymologie — 68 cartes

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1Question

Qu'est-ce que la biochimie étudie ?

Réponse

Les processus chimiques à la base de la vie.

2Question

Que regroupent les protides ?

Réponse

Les acides aminés naturels et leurs composés unis comme peptides et protéines.

3Question

Quelle différence principale distingue peptides et protéines ?

Réponse

Le nombre d'acides aminés et la masse moléculaire.

4Question

Combien d'acides aminés contient généralement un peptide ?

Réponse

Moins de 50 acides aminés.

5Question

Quelle masse minimale caractérise une protéine ?

Réponse

Au moins 10 kDa.

6Question

Quelles fonctions assurent les protides ?

Réponse

Des fonctions structurales, enzymatiques, de transport, stockage, mouvement et communication hormonale.

7Question

Combien d'acides aminés protéinogènes classiques existe-t-il ?

Réponse

Il existe 20 acides aminés protéinogènes classiques.

8Question

Quels sont les deux acides aminés exotiques protéinogènes ?

Réponse

La sélénocystéine et la pyrrolysine sont les deux acides aminés exotiques.

9Question

Quelle est la structure générale d'un acide aminé ?

Réponse

Un carbone α lié à un amine, un carboxyle, un hydrogène et une chaîne latérale R.

10Question

Comment sont répartis les 20 acides aminés classiques selon leur polarité ?

Réponse

Ils sont répartis en 9 non polaires, 6 polaires non chargés et 5 polaires chargés.

11Question

Quelle propriété distingue la cystéine des autres acides aminés soufrés ?

Réponse

La cystéine peut former des ponts disulfure covalents.

12Question

La méthionine forme-t-elle des ponts disulfure ?

Réponse

Non, la méthionine ne forme pas de ponts disulfure.

13Question

Quelle est l'équation d'Henderson-Hasselbalch pour une fonction carboxylique ?

Réponse

pH=pKa+log⁡COO−COOHpH=pK_a+\log\frac{COO^-}{COOH}

14Question

Quelle est l'équation d'Henderson-Hasselbalch pour une fonction amine ?

Réponse

pH=pKb+log⁡NH2NH3+pH=pK_b+\log\frac{NH_2}{NH_3^+}

15Question

Quel est le point isoélectrique des acides aminés acides ?

Réponse

Il est proche de 3.

16Question

Quel est le point isoélectrique de la lysine et de l'arginine ?

Réponse

Il est entre 10 et 11.

17Question

Quel est le point isoélectrique de l'histidine ?

Réponse

Il est proche de 8.

18Question

Quel est le point isoélectrique des acides aminés neutres ?

Réponse

Il est proche de 6.

19Question

À quelle longueur d'onde les acides aminés absorbent-ils les ultraviolets ?

Réponse

À moins de 230 nm.

20Question

Quelle est la longueur d'onde d'absorption classique du tryptophane ?

Réponse

280 nm.

21Question

Quelle est la première étape de la biosynthèse des dérivés du tryptophane ?

Réponse

La conversion du tryptophane en 5-hydroxytryptophane.

22Question

Quel est le produit final de la biosynthèse à partir du tryptophane ?

Réponse

La mélatonine.

23Question

Quelle molécule est transformée en L-DOPA dans le métabolisme de la tyrosine ?

Réponse

La tyrosine.

24Question

Quelle est la séquence de transformation de la tyrosine vers l'adrénaline ?

Réponse

Tyrosine → L-DOPA → dopamine → noradrénaline → adrénaline.

25Question

À partir de quel acide aminé l'oxyde nitrique est-il produit ?

Réponse

L'arginine.

26Question

Quelle enzyme produit l'oxyde nitrique à partir de l'arginine ?

Réponse

La NO synthase.

27Question

Quelle molécule est formée lors de la production d'oxyde nitrique par la NO synthase ?

Réponse

La citrulline.

28Question

Comment l'homocystéine est-elle reconvertie en méthionine ?

Réponse

Par la méthionine synthase dépendante de la vitamine B12 et du tétrahydrofolate.

29Question

Qu'est-ce que la liaison peptidique relie dans une chaîne polypeptidique ?

Réponse

Les acides aminés.

30Question

Dans quel sens est lue une chaîne polypeptidique ?

Réponse

De l'extrémité N-terminale vers l'extrémité C-terminale.

31Question

Comment se note le tétrapeptide Ala-Tyr-Asp-Gly ?

Réponse

AYDG.

32Question

À quoi correspond la notation AYDG en termes d'acides aminés ?

Réponse

Alanyl-tyrosyl-aspartyl-glycine.

33Question

Quelle est la masse moyenne d'un résidu d'acide aminé dans une chaîne polypeptidique ?

Réponse

110 Da.

34Question

Combien de séquences différentes peut présenter une chaîne polypeptidique de 100 résidus ?

Réponse

20100=1,27×1013020^{100}=1{,}27\times10^{130} séquences.

35Question

Quels sont les quatre niveaux de structure des protéines ?

Réponse

Primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire.

36Question

Toutes les protéines possèdent-elles une structure quaternaire ?

Réponse

Non, toutes ne possèdent pas de structure quaternaire.

37Question

Quel est le pas de l'hélice α ?

Réponse

Le pas est de 0,54 nm.

38Question

Quelle distance occupe chaque résidu sur l'axe de l'hélice α ?

Réponse

Chaque résidu occupe 0,15 nm.

39Question

Quels types d'interactions stabilisent les structures protéiques ?

Réponse

Ponts disulfure, liaisons hydrogène, interactions hydrophobes, électrostatiques et liaisons de coordination.

40Question

Quels facteurs peuvent provoquer la dénaturation des protéines ?

Réponse

La chaleur, des pH extrêmes, des solvants miscibles, agents chaotropiques et détergents.

41Question

Qu'est-ce que le protéome ?

Réponse

L'ensemble des protéines présentes dans un échantillon biologique à un moment donné.

42Question

Après quels acides aminés la trypsine clive-t-elle ?

Réponse

Après la lysine et l'arginine.

43Question

Quelle exception existe-t-il à la coupure par la trypsine ?

Réponse

Elle ne clive pas si l'acide aminé suivant est une proline.

44Question

Après quels acides aminés la chymotrypsine clive-t-elle ?

Réponse

Après la phénylalanine, la tyrosine ou le tryptophane.

45Question

Quelle exception existe-t-il à la coupure par la chymotrypsine ?

Réponse

Elle ne clive pas si l'acide aminé suivant est une proline.

46Question

Par quelles enzymes l'acétylation est-elle réalisée ?

Réponse

Par des acétyltransférases.

47Question

Par quelles enzymes l'acétylation peut-elle être inversée ?

Réponse

Par des déacétylases.

48Question

Quel est le tripeptide noté GSH ?

Réponse

Le glutathion est le tripeptide γ-glutamyl-cystéyl-glycine.

49Question

Quelle est la particularité de la structure primaire du collagène de type I ?

Réponse

Elle est riche en glycine, avec une glycine tous les trois acides aminés.

50Question

Quels acides aminés sont notamment présents dans le collagène de type I ?

Réponse

La proline et l'hydroxyproline sont notamment présents.

51Question

Combien et quels types de chaînes possède une immunoglobuline G ?

Réponse

Elle possède deux chaînes légères (kappa ou lambda) et deux chaînes lourdes gamma.

52Question

Quel est le rôle principal de la myoglobine ?

Réponse

Elle assure le stockage de l'oxygène dans le muscle.

53Question

Quelle est la formule de la constante de dissociation KdK_d d'un complexe protéine-ligand ?

Réponse

Kd=k−1k1=P⋅LPLK_d=\frac{k_{-1}}{k_1}=\frac{P\cdot L}{PL}

54Question

Quelle est la formule de la fraction de saturation protéique YY ?

Réponse

Y=LL+KdY=\frac{L}{L+K_d}

55Question

Quelle est la plage de variation de la fraction de saturation protéique ?

Réponse

Elle varie de 0 à 1, soit de 0 à 100 %.

56Question

Quelle forme de courbe produit une interaction protéine-ligand simple ?

Réponse

Une courbe de saturation hyperbolique.

57Question

Quelle forme de courbe produit l'hémoglobine allostérique ?

Réponse

Une courbe sigmoïde liée à plusieurs sites dépendants.

58Question

Quelle est la proportion de l'hémoglobine A α2β2 chez l'adulte ?

Réponse

Elle représente 97 % de l'hémoglobine adulte.

59Question

Quelle est la proportion de l'hémoglobine A2 α2δ2 chez l'adulte ?

Réponse

Elle représente 2 à 3 % de l'hémoglobine adulte.

60Question

Quelle est la proportion de l'hémoglobine F α2γ2 chez l'adulte ?

Réponse

Elle représente moins de 1 % de l'hémoglobine adulte.

61Question

Qu'est-ce qu'une enzyme ?

Réponse

Une macromolécule biologique protéique qui catalyse une réaction biochimique spécifique.

62Question

Quelle est l'équation de Michaelis-Menten ?

Réponse

v=Vm[S]Km+[S]v=\frac{V_m[S]}{K_m+[S]}

63Question

Que représente la constante Km en enzymologie ?

Réponse

La concentration en substrat pour que l'enzyme soit à moitié saturée.

64Question

Quelle est la vitesse initiale lorsque la concentration en substrat est égale à Km ?

Réponse

La vitesse initiale vaut Vm2\frac{V_m}{2}.

65Question

Qu'est-ce qu'un coenzyme ?

Réponse

Une molécule qui participe à la transformation du substrat et est restituée intacte après catalyse.

66Question

Quels coenzymes transfèrent des hydrogènes ?

Réponse

NAD(H) et NADP(H) sont des coenzymes de transfert d'hydrogène.

67Question

Quels coenzymes sont impliqués dans le transfert de fractions monocarbonées ?

Réponse

Le tétrahydrofolate est impliqué dans le transfert de fractions monocarbonées.

68Question

Quels coenzymes contiennent des hèmes ?

Réponse

Les cytochromes contiennent des hèmes comme coenzymes.

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