Flashcards : Phylogénie et arbre du vivant (55 cartes)

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1Question

Qu'est-ce qu'une question phylogénétique ?

Réponse

La question précise à laquelle l’arbre doit répondre.

2Question

Que représente la racine d'un arbre phylogénétique ?

Réponse

Le côté le plus ancien de l’arbre.

3Question

Quel rôle joue la racine dans l'histoire évolutive ?

Réponse

Elle permet d’orienter l’histoire évolutive.

4Question

Qu'est-ce qu'une polytomie en phylogénie ?

Réponse

Un nœud d’où partent plusieurs branches sans relations précises.

5Question

Par quoi commence la construction d'un arbre phylogénétique ?

Réponse

Par la sélection d'organismes représentatifs des groupes étudiés.

6Question

Qu'est-ce qui permet de comparer les organismes dans un arbre phylogénétique ?

Réponse

La comparaison de leurs caractères.

7Question

Qu'est-ce que des structures homologues ?

Réponse

Des structures héritées d'un ancêtre commun.

8Question

Que constitue une simple similitude entre structures ?

Réponse

Une hypothèse d'homologie.

9Question

Qu'est-ce qu'un extra-groupe en phylogénie ?

Réponse

Un groupe extérieur proche servant de référence pour déterminer les états ancestraux.

10Question

Comment est qualifié un état présent dans le groupe d’étude et l’extra-groupe ?

Réponse

Il est général et primitif.

11Question

Comment est qualifié un état présent uniquement dans le groupe d’étude ?

Réponse

C'est une innovation et un état dérivé.

12Question

Que signifie construire une matrice de caractères en phylogénie ?

Réponse

Sélectionner des caractères et coder chaque organisme par un état.

13Question

Quel code est attribué à l’état partagé avec l’extra-groupe dans une matrice ?

Réponse

Le code 0.

14Question

Quel code est attribué à l’état partagé dans le groupe d’étude ?

Réponse

Le code 1.

15Question

Pourquoi un caractère identique chez tous les organismes est-il non informatif ?

Réponse

Il ne permet pas de distinguer les groupes.

16Question

Quelle méthode retient l’arbre avec le plus petit nombre de transformations ?

Réponse

La méthode de la parcimonie.

17Question

Comment appelle-t-on l’arbre qui nécessite le moins de transformations ?

Réponse

L’arbre le plus court.

18Question

Qu'est-ce qu'une synapomorphie en phylogénie ?

Réponse

Un caractère dérivé partagé hérité d'un ancêtre commun exclusif.

19Question

Que définit une synapomorphie dans un groupe phylogénétique ?

Réponse

Un groupe monophylétique.

20Question

Qu'inclut un groupe monophylétique ?

Réponse

Un ancêtre commun et tous ses descendants.

21Question

Pourquoi les oiseaux sont-ils plus proches des crocodiles que des tortues ?

Réponse

Ils partagent un ancêtre commun plus récent avec les crocodiles.

22Question

Qu'est-ce qu'un groupe paraphylétique ?

Réponse

Un groupe contenant un ancêtre commun mais pas tous ses descendants.

23Question

Qu'est-ce qu'un arbre phylogénétique ?

Réponse

Une hypothèse de reconstruction des relations de parenté.

24Question

De quoi dépend une hypothèse d'arbre phylogénétique ?

Réponse

Des organismes étudiés, caractères choisis, données disponibles et hypothèses formulées.

25Question

Quels sont les trois domaines du vivant présentés ?

Réponse

Les Bactéries, les Archées et les Eucaryotes.

26Question

Quelles structures manquent aux Bactéries et Archées mais sont présentes chez les Eucaryotes ?

Réponse

Le noyau, les organites et le cytosquelette.

27Question

Quelle hypothèse actuelle concerne la monophylie des Archées ?

Réponse

Les Archées ne forment pas un groupe monophylétique.

28Question

Selon l’hypothèse actuelle, à quel domaine les Archées sont-elles plus proches ?

Réponse

Les Archées sont plus proches des Eucaryotes que des Bactéries.

29Question

Quelles sont les principales synapomorphies des Eucaryotes ?

Réponse

Présence d’un noyau, compartimentation du cytoplasme et cytosquelette.

30Question

Quelles caractéristiques définissent les Eumycètes ?

Réponse

Champignons hétérotrophes, aérobies, unicellulaires ou pluricellulaires avec paroi en chitine.

31Question

À quels groupes appartiennent les Eumycètes et les animaux ?

Réponse

Aux Opisthocontes et aux Amorphés.

32Question

Pourquoi les algues ne forment-elles pas un groupe monophylétique ?

Réponse

Parce qu’elles appartiennent à différents groupes : Chlorobiontes, Rhodobiontes et Straménopiles.

33Question

Quelles morphologies présentent les bactéries ?

Réponse

Coque, bacille, spirille et spirochète.

34Question

Quel rôle écologique jouent les bactéries dans les cycles biogéochimiques ?

Réponse

Elles décomposent la matière et participent au recyclage, notamment du cycle de l’azote.

35Question

Quelle contribution ont eu les cyanobactéries il y a environ 2,5 milliards d’années ?

Réponse

Elles ont enrichi l’atmosphère en oxygène par photosynthèse.

36Question

Quels types de caractères peut-on utiliser pour comparer des organismes ?

Réponse

Des caractères morpho-anatomiques ou moléculaires.

37Question

Donnez un exemple de caractère morpho-anatomique utilisé en comparaison.

Réponse

La mandibule.

38Question

Donnez un exemple de caractère moléculaire utilisé en comparaison.

Réponse

Les séquences d'ADN.

39Question

Quel est l’état primitif de la mandibule dans l’exemple étudié ?

Réponse

La mandibule non fenestrée.

40Question

Quel est l’état dérivé de la mandibule dans l’exemple étudié ?

Réponse

La mandibule fenestrée.

41Question

Quel arbre est retenu parmi des longueurs L = 6, L = 4 et L = 5 ?

Réponse

Celui dont la longueur vaut L = 4.

42Question

Que sont deux groupes frères en phylogénie ?

Réponse

Deux groupes monophylétiques partageant leur ancêtre commun le plus récent.

43Question

Que forment ensemble deux groupes frères ?

Réponse

Un groupe monophylétique.

44Question

Pourquoi le groupe traditionnel des reptiles est-il paraphylétique si on exclut les oiseaux ?

Réponse

Parce que les oiseaux descendent d'un ancêtre commun des reptiles.

45Question

À partir de quels ARN ribosomiques étudie-t-on les relations entre les trois domaines ?

Réponse

Les ARN ribosomiques 16S et 18S.

46Question

Quelle caractéristique des chaînes d’acides gras distingue les Archées des Bactéries et Eucaryotes ?

Réponse

Les Archées ont des chaînes ramifiées, les autres non ramifiées.

47Question

Quelle digestion caractérise les Eumycètes ?

Réponse

Une exodigestion par sécrétion d’enzymes lytiques dégradant la matière organique à l’extérieur.

48Question

Quelles sont les caractéristiques des chloroplastes des Archéoplastidés ?

Réponse

Ils ont deux membranes issues d’une endosymbiose primaire.

49Question

Quels groupes incluent les Archéoplastidés ?

Réponse

Les algues vertes, les plantes terrestres et les algues rouges.

50Question

Quelles sont les particularités des flagelles des Straménopiles ?

Réponse

Ils possèdent un flagelle lisse et un flagelle plumeux.

51Question

Quels types métaboliques peuvent avoir les bactéries ?

Réponse

Photo-autotrophes, photo-hétérotrophes, chimio-autotrophes ou chimio-hétérotrophes.

52Question

Quel genre bactérien fixe l’azote en symbiose avec certaines plantes ?

Réponse

Le genre Rhizobium.

53Question

Quelle est la formule chimique de la photosynthèse chez les cyanobactéries ?

Réponse

6CO2+6H2O+lumieˋre→C6H12O6+6O26CO_2 + 6H_2O + lumière \rightarrow C_6H_{12}O_6 + 6O_2.

54Question

Quelles formes et adaptations présentent les Archées ?

Réponse

Coque, bacille, spirille, spirochète, et certaines sont thermophiles, halophiles ou acidophiles.

55Question

Quelle est la taille approximative des bactéries, Archées et cellules eucaryotes ?

Réponse

Bactéries et Archées : 0,5 µm à plusieurs dizaines de µm; cellules animales : 10-30 µm; cellules photosynthétiques : 30-100 µm.

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1. Quelle formulation correspond à une question phylogénétique bien définie ?

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