QCM : Phylogénie et arbre du vivant (26 questions)

Questions et réponses du QCM

1. Quelle formulation correspond à une question phylogénétique bien définie ?

Mesurer la vitesse de déplacement des oiseaux, des crocodiles et des tortues
Déterminer la position des oiseaux par rapport aux crocodiles et aux tortues
Décrire les milieux de vie fréquentés par les oiseaux, les crocodiles et les tortues
Comparer la taille moyenne des oiseaux avec celle des crocodiles et des tortues

Déterminer la position des oiseaux par rapport aux crocodiles et aux tortues

Explication

Une question phylogénétique précise cherche à établir une relation de parenté ou une position dans un arbre, comme celle des oiseaux par rapport aux crocodiles et aux tortues. La comparaison de tailles, de vitesses ou de milieux de vie ne constitue pas directement une question phylogénétique.

2. Quel rôle la racine joue-t-elle dans la lecture d’un arbre phylogénétique ?

Elle indique le côté le plus ancien et oriente l’histoire évolutive
Elle signale le groupe placé graphiquement le plus haut dans l’arbre
Elle mesure la durée actuelle de l’évolution de chaque groupe
Elle désigne le groupe qui possède le plus grand nombre de caractères

Elle indique le côté le plus ancien et oriente l’histoire évolutive

Explication

La racine représente le côté le plus ancien de l’arbre et permet d’orienter l’histoire évolutive. La position graphique d’un groupe et le nombre de caractères représentés ne mesurent pas son ancienneté ni son évolution.

3. Que signifie la présence d’une polytomie dans un arbre phylogénétique ?

Les groupes concernés sont séparés par des durées évolutives identiques
Les données ne permettent pas de préciser les relations entre plusieurs branches
L’arbre montre une succession certaine de plusieurs ancêtres communs
Les organismes concernés possèdent exactement les mêmes caractères dérivés

Les données ne permettent pas de préciser les relations entre plusieurs branches

Explication

Une polytomie est un nœud d’où partent plusieurs branches lorsque les données ne permettent pas de déterminer précisément les relations de parenté. Elle ne signifie ni identité des caractères, ni succession évolutive certaine, ni durées égales.

4. Quelle étape ouvre la construction d’un arbre phylogénétique ?

Regrouper les organismes selon leur ressemblance générale visible
Choisir les organismes qui vivent dans des milieux écologiquement identiques
Sélectionner des organismes représentatifs des groupes à comparer
Classer les organismes selon la taille de leurs populations actuelles

Sélectionner des organismes représentatifs des groupes à comparer

Explication

La construction commence par la sélection d’organismes représentatifs des groupes étudiés, afin de comparer leurs caractères et de reconstruire leurs relations de parenté. Une ressemblance générale ou un milieu commun peut être trompeur et ne suffit pas à établir ces relations.

5. Dans quelle situation deux structures sont-elles considérées comme homologues ?

Lorsqu’elles remplissent une fonction identique chez deux organismes
Lorsqu’elles apparaissent dans le même milieu de vie
Lorsqu’elles sont héritées d’un ancêtre commun
Lorsqu’elles présentent une forme extérieure très similaire

Lorsqu’elles sont héritées d’un ancêtre commun

Explication

Des structures sont homologues lorsqu’elles proviennent d’un ancêtre commun. Une similitude de forme ou de fonction constitue seulement un indice ou une hypothèse, car elle peut résulter d’évolutions indépendantes.

6. Comment définir un extra-groupe dans une étude phylogénétique ?

Un organisme choisi au hasard parmi les espèces du groupe étudié
Un groupe descendant directement de l’ancêtre commun le plus récent étudié
Un organisme extérieur au groupe étudié mais suffisamment proche pour servir de référence
Un ensemble d’organismes présentant le plus grand nombre de caractères dérivés

Un organisme extérieur au groupe étudié mais suffisamment proche pour servir de référence

Explication

L’extra-groupe est extérieur au groupe d’étude tout en étant suffisamment proche pour aider à déterminer les états ancestraux et dérivés. Les organismes comparés à l’intérieur de l’étude appartiennent, eux, au groupe étudié.

7. Comment polariser un caractère présent dans le groupe d’étude et dans l’extra-groupe ?

Le considérer comme un état dérivé apparu dans le groupe d’étude
Le considérer comme un état général et primitif
Le considérer comme un caractère inutilisable pour comparer les groupes
Le considérer comme une innovation propre au groupe d’étude

Le considérer comme un état général et primitif

Explication

Un état présent à la fois dans le groupe d’étude et dans l’extra-groupe est considéré comme général et primitif. Un état présent uniquement dans le groupe d’étude est au contraire interprété comme une innovation ou un état dérivé.

8. Dans une matrice de caractères, que signifie généralement le codage 0 par rapport au codage 1 ?

0 indique un caractère absent et 1 un caractère présent chez chaque organisme
0 indique l’état partagé avec l’extra-groupe et 1 l’état partagé dans le groupe d’étude
0 indique un état dérivé et 1 un état ancestral dans tous les groupes
0 indique un état propre au groupe d’étude et 1 un état partagé avec l’extra-groupe

0 indique l’état partagé avec l’extra-groupe et 1 l’état partagé dans le groupe d’étude

Explication

Le codage distingue notamment l’état partagé avec l’extra-groupe, noté 0, de l’état partagé dans le groupe d’étude, noté 1. Confondre ces deux codes inverse donc leur signification phylogénétique.

9. Pourquoi un caractère présentant le même état chez tous les organismes étudiés est-il considéré comme non informatif ?

Parce qu’il ne permet pas de distinguer les groupes entre eux
Parce qu’il définit automatiquement un groupe monophylétique
Parce qu’il est nécessairement absent chez l’extra-groupe
Parce qu’il exige davantage de transformations sur chaque arbre

Parce qu’il ne permet pas de distinguer les groupes entre eux

Explication

Un caractère constant ne fournit aucune variation permettant de séparer les organismes ou les groupes. Il ne permet donc pas de comparer les scénarios de parenté sur cette base.

10. Selon la méthode de la parcimonie, quel arbre faut-il retenir parmi plusieurs arbres compatibles avec les données ?

Celui qui place l’extra-groupe au plus près de tous les taxons
Celui qui demande le plus petit nombre de transformations des caractères
Celui qui contient le plus grand nombre de groupes monophylétiques
Celui qui présente le plus grand nombre de caractères observés

Celui qui demande le plus petit nombre de transformations des caractères

Explication

La parcimonie privilégie l’arbre le plus court, c’est-à-dire celui qui nécessite le moins de transformations des caractères. Le nombre de groupes ou de caractères observés ne constitue pas le critère de sélection.

11. Quelle propriété permet à une synapomorphie de définir un groupe monophylétique ?

C’est un caractère variable apparu indépendamment dans plusieurs lignées
C’est un caractère dérivé partagé hérité d’un ancêtre commun exclusif
C’est un caractère propre à une seule espèce sans ancêtre commun identifié
C’est un caractère ancestral présent chez tous les organismes comparés

C’est un caractère dérivé partagé hérité d’un ancêtre commun exclusif

Explication

Une synapomorphie est un caractère dérivé partagé provenant d’un ancêtre commun exclusif, ce qui permet de reconnaître un groupe monophylétique. Un caractère ancestral ou apparu indépendamment ne fournit pas cette même indication.

12. Quelle définition correspond à un groupe monophylétique ?

Un groupe réunissant des espèces ayant seulement une ressemblance morphologique
Un groupe formé par des espèces provenant de plusieurs ancêtres sans lien exclusif
Un groupe comprenant un ancêtre commun mais excluant certaines lignées descendantes
Un groupe comprenant un ancêtre commun et l’ensemble de ses descendants

Un groupe comprenant un ancêtre commun et l’ensemble de ses descendants

Explication

Un groupe monophylétique inclut l’ancêtre commun ainsi que tous ses descendants. L’exclusion de certaines lignées descendantes caractérise plutôt un groupe paraphylétique.

13. Pourquoi les oiseaux sont-ils considérés comme plus proches des crocodiles que des tortues ?

Parce que les tortues descendent directement d’un ancêtre des crocodiles
Parce que les oiseaux et les crocodiles appartiennent au même groupe paraphylétique
Parce qu’ils partagent avec les crocodiles un ancêtre commun plus récent
Parce qu’ils possèdent avec les crocodiles davantage de caractères ancestraux

Parce qu’ils partagent avec les crocodiles un ancêtre commun plus récent

Explication

La proximité phylogénétique est déterminée par l’ancêtre commun le plus récent : celui des oiseaux et des crocodiles est plus récent que leur ancêtre commun avec les tortues. Le nombre de caractères ancestraux ne suffit pas à établir cette relation.

14. Comment reconnaître un groupe paraphylétique sur un arbre phylogénétique ?

Il contient l’ancêtre commun mais exclut une partie de ses descendants
Il comprend deux groupes frères sans inclure leur ancêtre commun
Il contient tous les descendants d’un ancêtre mais aucun ancêtre commun
Il réunit des organismes partageant un caractère dérivé apparu plusieurs fois

Il contient l’ancêtre commun mais exclut une partie de ses descendants

Explication

Un groupe paraphylétique conserve l’ancêtre commun mais laisse au moins certains de ses descendants en dehors du groupe. L’inclusion de l’ancêtre et de tous ses descendants correspond à un groupe monophylétique.

15. Pourquoi un arbre phylogénétique peut-il être révisé à la lumière de nouvelles études ?

Parce qu’il dépend des organismes, des caractères, des données et des hypothèses retenus
Parce qu’il est déterminé par la position graphique des noms sur la page
Parce qu’il repose sur un classement fixe qui ne change pas avec les caractères étudiés
Parce qu’il représente une vérité définitive indépendante des données disponibles

Parce qu’il dépend des organismes, des caractères, des données et des hypothèses retenus

Explication

Un arbre phylogénétique est une hypothèse de reconstruction fondée sur un ensemble donné d’organismes, de caractères, de données et d’hypothèses. Une modification de ces éléments peut donc conduire à réviser les relations proposées.

16. Quels sont les trois domaines du vivant distingués dans cette classification ?

Les Eucaryotes, les Virus et les Bactéries
Les Bactéries, les Archées et les Eucaryotes
Les Archées, les Plantes et les Protistes
Les Bactéries, les Champignons et les Animaux

Les Bactéries, les Archées et les Eucaryotes

Explication

La classification présentée distingue les Bactéries, les Archées et les Eucaryotes. Les champignons, les animaux et les plantes sont des lignées eucaryotes, tandis que les virus ne constituent pas l’un des trois domaines.

17. Quelle combinaison de structures distingue les Eucaryotes des Bactéries et des Archées ?

Des flagelles, une capsule et une paroi épaisse
Des chaînes lipidiques ramifiées et des ribosomes
Un noyau, des organites et un cytosquelette
Une paroi, des ribosomes et une membrane plasmique

Un noyau, des organites et un cytosquelette

Explication

Les Eucaryotes possèdent un noyau, des organites et un cytosquelette, contrairement aux Bactéries et aux Archées. La présence d’une membrane plasmique et de ribosomes ne permet pas de distinguer ainsi ces groupes.

18. Quelle relation entre les Archées et les autres domaines correspond à l’hypothèse actuelle présentée ?

Les Archées sont plus proches des Eucaryotes et ne forment pas un groupe monophylétique
Les Archées sont équidistantes des deux autres domaines dans l’arbre évolutif
Les Archées dérivent des Eucaryotes et constituent une lignée exclusivement unicellulaire
Les Archées sont plus proches des Bactéries et forment un groupe monophylétique

Les Archées sont plus proches des Eucaryotes et ne forment pas un groupe monophylétique

Explication

L’hypothèse présentée rapproche les Archées des Eucaryotes et ne les considère pas comme un groupe monophylétique. Les assimiler aux Bactéries ou les présenter comme une lignée issue des Eucaryotes contredit cette relation évolutive.

19. Quelles synapomorphies caractérisent principalement les Eucaryotes ?

Un noyau, un cytoplasme compartimenté et un cytosquelette
Une paroi de chitine, des chloroplastes et des flagelles
Des ribosomes, une membrane et une paroi sans compartiments
Des chaînes lipidiques ramifiées, un noyau et des vacuoles

Un noyau, un cytoplasme compartimenté et un cytosquelette

Explication

Les principales synapomorphies des Eucaryotes sont le noyau, la compartimentation du cytoplasme et le cytosquelette. La paroi de chitine caractérise notamment les champignons, mais elle ne définit pas l’ensemble des Eucaryotes.

20. Quelle caractéristique décrit correctement les Eumycètes ?

Ce sont des champignons hétérotrophes dont la paroi contient de la chitine
Ce sont des champignons dépourvus de paroi et vivant dans les tissus animaux
Ce sont des organismes autotrophes dont la paroi contient principalement de la cellulose
Ce sont des organismes photosynthétiques dont la paroi contient des chloroplastes

Ce sont des champignons hétérotrophes dont la paroi contient de la chitine

Explication

Les Eumycètes sont des champignons hétérotrophes, aérobies, unicellulaires ou pluricellulaires, et leur paroi contient de la chitine. La cellulose est associée à la paroi des plantes, tandis que les chloroplastes ne constituent pas la paroi cellulaire.

21. Comment les Eumycètes se situent-ils parmi les grandes lignées eucaryotes ?

Ils appartiennent aux Chlorobiontes avec les plantes terrestres, au sein des Archéoplastidés
Ils appartiennent aux Rhodobiontes avec les algues rouges, au sein des Straménopiles
Ils appartiennent aux Opisthocontes avec les animaux, au sein des Amorphés
Ils appartiennent aux Amorphés avec les algues, au sein des Opisthocontes

Ils appartiennent aux Opisthocontes avec les animaux, au sein des Amorphés

Explication

Les Eumycètes et les animaux sont regroupés parmi les Opisthocontes, eux-mêmes inclus dans les Amorphés. Les Chlorobiontes et les Rhodobiontes désignent d’autres lignées eucaryotes.

22. Pourquoi les algues ne constituent-elles pas un groupe monophylétique ?

Parce que les algues brunes sont des Bactéries tandis que les autres sont des Eucaryotes
Parce que les algues vertes et rouges sont des champignons alors que les brunes sont des animaux
Parce que les algues vertes, rouges et brunes appartiennent à des lignées eucaryotes différentes
Parce que les algues vertes, rouges et brunes possèdent des noyaux de structures différentes

Parce que les algues vertes, rouges et brunes appartiennent à des lignées eucaryotes différentes

Explication

Les algues vertes appartiennent aux Chlorobiontes, les rouges aux Rhodobiontes et les brunes aux Straménopiles, ce qui montre leur origine répartie entre plusieurs lignées. Leur diversité de lignées, plutôt qu’une différence de noyau, explique l’absence de groupe monophylétique.

23. Quelle description correspond aux bactéries ?

Des organismes pluricellulaires formant des tissus et possédant des organes spécialisés
Des organismes nucléés dont la forme principale dépend de compartiments internes
Des organismes unicellulaires pouvant vivre seuls ou en colonies, avec plusieurs morphologies
Des organismes filamenteux dont la croissance produit des structures reproductrices complexes

Des organismes unicellulaires pouvant vivre seuls ou en colonies, avec plusieurs morphologies

Explication

Les bactéries sont unicellulaires, peuvent vivre seules ou en colonies et présentent notamment des formes de coque, de bacille, de spirille et de spirochète. Les descriptions fondées sur des tissus ou des organes concernent des organismes pluricellulaires.

24. Quel rôle les bactéries jouent-elles dans les écosystèmes ?

Elles produisent la matière organique en captant systématiquement l’énergie lumineuse
Elles transforment les roches en tissus vivants au cours de leur développement
Elles consomment l’oxygène atmosphérique et bloquent les échanges de matière
Elles décomposent la matière et participent à plusieurs cycles biogéochimiques

Elles décomposent la matière et participent à plusieurs cycles biogéochimiques

Explication

Les bactéries agissent comme décomposeurs et contribuent au recyclage de la matière ainsi qu’aux cycles biogéochimiques, notamment celui de l’azote. La production de matière par photosynthèse concerne certaines bactéries, mais pas l’ensemble du groupe.

25. Quel événement est associé à l’activité ancienne des cyanobactéries ?

La disparition de l’oxygène atmosphérique par une respiration dépourvue de lumière
La formation des premiers noyaux eucaryotes par compartimentation cellulaire
L’enrichissement de l’atmosphère en oxygène grâce à leur photosynthèse
L’apparition des premiers animaux par association de cellules photosynthétiques

L’enrichissement de l’atmosphère en oxygène grâce à leur photosynthèse

Explication

Les cyanobactéries possèdent de la chlorophylle a et des photosystèmes, ce qui leur permet de réaliser la photosynthèse et a contribué à enrichir l’atmosphère en oxygène il y a environ 2,5 milliards d’années. Leur activité photosynthétique ne correspond pas à une disparition de l’oxygène.

26. Pourquoi faut-il connaître l’échelle avant d’interpréter une image biologique ou astronomique ?

Parce qu’un même aspect visuel peut correspondre à des objets dont les dimensions sont très différentes
Parce que l’échelle indique directement si l’objet observé est vivant ou non
Parce que l’échelle remplace les observations nécessaires sur la forme et la structure
Parce que l’échelle permet d’identifier la composition chimique d’un objet sans autre information

Parce qu’un même aspect visuel peut correspondre à des objets dont les dimensions sont très différentes

Explication

L’échelle permet de mettre en relation une image et la taille réelle de l’objet : un pore nucléaire mesure environ 2,2 µm, tandis qu’un cratère lunaire mesure environ 20 km. Elle aide donc à éviter une interprétation erronée de structures visuellement comparables, mais elle ne révèle pas directement leur composition chimique.

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Qu'est-ce qu'une question phylogénétique ?

La question précise à laquelle l’arbre doit répondre.

Que représente la racine d'un arbre phylogénétique ?

Le côté le plus ancien de l’arbre.

Quel rôle joue la racine dans l'histoire évolutive ?

Elle permet d’orienter l’histoire évolutive.

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