Qu’est-ce qu’une liaison covalente ?
Une liaison chimique de forte énergie formée par la mise en commun d’électrons externes.
Quelle énergie caractérise une liaison covalente ?
Une forte énergie.
Entre quels groupements s’établit une liaison hydrogène ?
Entre un groupement donneur et un groupement accepteur de liaison hydrogène.
Comment la force d’une liaison hydrogène se compare-t-elle à celle d’une liaison ionique ?
Elle est plus faible.
Selon Lewis, quelle caractéristique électronique définit un acide ?
Il porte une lacune électronique et accepte un doublet d’électrons.
Quelle relation définit le pH en fonction des ions hydronium ?
Dans le couple AH/A⁻, quelle forme est protonée et acide ?
AH.
Quelle est l’équation de Henderson-Hasselbalch pour le couple AH/A⁻ ?
Entre quelles fonctions se forme la liaison peptidique ?
Entre la fonction amine d’un acide aminé et la fonction carboxylique d’un autre.
Qu’est-ce qui distingue un peptide, un polypeptide et une protéine ?
Un peptide est court, un polypeptide dépasse 20 acides aminés et une protéine est une macromolécule fonctionnelle formée d’une ou plusieurs chaînes polypeptidiques.
Dans quel sens la structure primaire d’une protéine décrit-elle les acides aminés ?
De l’extrémité N-ter à l’extrémité C-ter.
Quelles structures la dénaturation des protéines désorganise-t-elle ?
Les structures secondaires et tertiaires.
Que provoque l’hydrolyse des protéines ?
La rupture des liaisons peptidiques et la séparation des acides aminés.
Quelles bases azotées sont des purines ?
L’adénine et la guanine.
À pH physiologique, quelle charge porte l’ADN grâce à ses groupements phosphate ?
Une charge négative.
À quelle longueur d’onde les bases azotées absorbent-elles la lumière ?
Environ 260 nm.
Quelles liaisons la dénaturation des acides nucléiques rompt-elle ?
Les liaisons hydrogène.
À quelle proportion des états simple brin et double brin correspond la température de fusion de l’ADN ?
La moitié est simple brin et l’autre moitié double brin.
Quelles liaisons doivent être hydrolysées pour cliver un acide nucléique ?
Les liaisons phosphodiester.
Que libère une exonucléase en clivant un acide nucléique ?
Le dernier nucléotide de la chaîne.
Où une endonucléase clive-t-elle un acide nucléique ?
En dehors de ses extrémités.
Quels nucléotides sont assemblés en ARN lors de la transcription ?
Les rNTP.
Quel nucléotide triphosphate le hydroxyle 3′ attaque-t-il pendant la polymérisation ?
Le phosphore α du nucléotide complémentaire.
Dans quel sens les polymérases lisent-elles le brin matrice ?
Dans le sens 3′→5′.
De quoi une ADN polymérase a-t-elle besoin pour commencer la synthèse ?
D’une extrémité 3′ OH préexistante sur une amorce ARN ou ADN.
Quel modèle de réplication de l’ADN Meselson et Stahl ont-ils établi en 1958 ?
La réplication est semi-conservative : chaque molécule fille contient un brin ancien et un brin nouvellement synthétisé.
Dans quel sens les ADN polymérases synthétisent-elles l’ADN, entraînant une synthèse continue sur un brin et discontinue sur l’autre ?
Dans le sens 5′→3′.
Quelle source d’énergie l’hélicase utilise-t-elle pour séparer les deux brins d’ADN ?
L’hydrolyse de l’ATP.
Qu’est-ce qu’un fragment d’Okazaki ?
Un fragment d’ADN synthétisé sur le brin discontinu à partir d’une amorce ARN.
Quelles réactions biochimiques constituent le catabolisme ?
Les réactions de dégradation des molécules.
Comment l’expression d’un gène constitutif se distingue-t-elle d’une expression induite ?
Elle persiste indépendamment d’un stimulus, même si son taux peut varier.
Qu’est-ce qu’une unité de transcription ?
Une séquence d’ADN transcrite en une molécule d’ARN.
Dans quel sens les ARN polymérases ADN dépendantes synthétisent-elles l’ARN ?
Dans le sens 5′ → 3′.
Combien d’ARN polymérases transcrivent les gènes d’une cellule bactérienne ?
Une seule.
Qu’est-ce qu’un opéron bactérien ?
Un ensemble de gènes transcrits ensemble depuis un même promoteur sous le contrôle d’un opérateur.
Que contient un transcrit monocistronique ?
La séquence d’un seul gène.
Combien de gènes couvre un transcrit polycistronique ?
Plusieurs gènes.
Qu’active généralement la source de carbone dans les opérons cataboliques ?
La plupart des opérons cataboliques.
Qu’est-ce qui réprime généralement les opérons anaboliques ?
Le produit final de synthèse.
Quel nucléotide est transféré sur l’extrémité 5′ triphosphate lors de la formation de la coiffe des ARNm ?
Un GMP.
Quelles parties de l’ARN sont méthylées lors de la formation de la coiffe ?
La guanosine terminale et les deux premiers nucléotides.
Quelle séquence le complexe polyA synthétase reconnaît-il en fin de transcription ?
5′ AAUAAA 3′.
À quelle distance en aval la polyA synthétase clive-t-elle l’ARNm ?
10 à 30 nucléotides en aval.
Qu’ajoute la polyA synthétase à l’extrémité 3′ de l’ARNm ?
Une cohorte d’adénosines.
Quelle est la longueur et la structure générale d’un ARN de transfert ?
C’est un ARN simple brin de 70 à 100 nucléotides, de structure tridimensionnelle commune.
Où se trouve la séquence de l’ARNt qui s’apparie à l’ARNm ?
Dans la boucle de l’anticodon.
Quelles sont les deux étapes de la charge d’un ARNt par une aminoacyl-ARNt synthétase ?
L’acide aminé est activé, puis lié par une liaison ester à l’extrémité 3′ de l’ARNt.
Quelle séquence RBS bactérienne s’apparie à l’ARNr 16S lors de l’initiation ?
5′ AGGAGG 3′.
Quel type d’enzyme constitue les protéines chaperons ?
Des ATPases.
Que préviennent les protéines chaperons pendant le repliement ?
Les interactions indésirables entre acides aminés.
À quel processus la synthèse des protéines membranaires et sécrétées est-elle couplée chez les eucaryotes ?
À leur translocation au travers de la membrane du réticulum endoplasmique.
Qu’est-ce qu’une liaison ionique ?
Une liaison chimique de faible énergie entre deux ions de charges opposées.
Qu’est-ce qui distingue une fonction donneuse d’une fonction accepteuse de liaison hydrogène ?
La donneuse porte un H labile ; l’accepteuse possède un doublet non liant.
Quelles fonctions chimiques principales trouve-t-on dans les molécules biologiques ?
Les fonctions carboxylique, aldéhyde, alcool, cétone, thiol, phosphate, amine et amide.
Que peut faire une base de Brønsted ?
Capter un ou plusieurs protons.
À pH égal au pKa, quelles sont les proportions de AH et A⁻ ?
Elles sont présentes chacune à 50 %.
Comment le pKa est-il relié à la constante d’acidité Ka ?
Dans quel plan se trouvent les six atomes associés à la liaison peptidique ?
Dans un même plan, d’un carbone alpha à l’autre.
Quelle est la longueur de la liaison peptidique ?
1,33 Å, soit moins qu’une liaison simple.
Comment qualifie-t-on une protéine formée de plusieurs chaînes polypeptidiques ?
Elle est multimérique.
Quels éléments faut-il considérer pour calculer le pHi d’une protéine ?
Les chaînes latérales et les extrémités N-ter et C-ter.
Entre quelles valeurs se situe la masse molaire moyenne d’une protéine ?
Entre 15 et 100 kDa.
Qu’est-ce qu’un complexe protéique dans l’environnement cellulaire ?
Un assemblage permanent ou transitoire de protéines.
Quels agents peuvent dénaturer les protéines ?
La chaleur, les détergents, l’urée et les variations de pH.
Quelles sont les deux voies d’hydrolyse des protéines ?
L’hydrolyse peut être chimique ou enzymatique.
Quels atomes relie la liaison N-glycosidique dans une base purique ?
Le C1′ du (désoxy)ribose et le N9.
Quelle fonction du ribose participe à la liaison phosphodiester ?
Une fonction hydroxyle en 3′ ou en 5′.
Comment les atomes de l’eau se répartissent-ils lors d’une hydrolyse ?
Entre les deux molécules générées.
Que modifie une isomérisation sans modifier la composition moléculaire ?
La structure de la molécule.
Dans quel acide nucléique trouve-t-on la thymine ?
Dans l’ADN.
Quel sucre contient l’ARN ?
Le β-D-ribofuranose.
Comment l’absorbance de l’ADN change-t-elle pendant sa dénaturation ?
Elle augmente.
Quelle concentration d’ADN double brin correspond à une DO260 de 1 dans une cuvette de 1 cm ?
50 μg/mL.
À quelle DO260 atteint une solution d’ADN complètement simple brin après chauffage ?
Environ 1,4.
Sur quels carbones l’hydrolyse chimique de l’ARN peut-elle laisser le phosphate ?
Sur le C2′ ou le C3′.
Quels résidus acides et basiques composent le site catalytique des nucléases ?
Les résidus aspartate ou glutamate et arginine ou lysine.
Quel sens de synthèse produit un brin complémentaire lu dans le sens 3′→5′ ?
Le sens 5′→3′.
Combien de groupements phosphate conserve le premier nucléotide d’ARN ?
Trois groupements phosphate.
Quels facteurs de processivité remplissent ce rôle chez les bactéries et chez les eucaryotes ?
Les anneaux β chez les bactéries et les PCNA chez les eucaryotes.
À quelle vitesse l’ADN polymérase III d’E. coli synthétise-t-elle sans facteur de processivité ?
À environ 20 nucléotides par seconde.
Dans une séquence lue de 5’ vers 3’, à quelle extrémité correspond la partie amont ?
À l’extrémité 5’.
Qu’est-ce qu’un métabolite ?
Une molécule organique produite par le métabolisme.
Qu’est-ce qu’une voie métabolique ?
L’ensemble des réactions biochimiques au cours desquelles des métabolites sont synthétisés.
Quels groupes de molécules sont des polymères de métabolites du vivant ?
Les lipides, les protéines, les polysaccharides et les acides nucléiques.
Que caractérise la processivité d’une enzyme ?
Sa capacité à effectuer une même opération en continu.
Où commencent généralement les transcrits par rapport au promoteur ?
En aval de la séquence promotrice.
Quelle proportion du transcrit la partie codante représente-t-elle ?
Seulement une partie ; les séquences terminales sont non codantes.
Quels mécanismes peuvent réguler positivement ou négativement un opéron ?
Un activateur agit positivement et un répresseur négativement.
Qu’assure la spécificité des aminoacyl-ARNt synthétases ?
La fidélité de l’association entre chaque acide aminé et son ARNt.
Quels composants contient la petite sous-unité ribosomique 30S d’E. coli ?
21 protéines et l’ARNr 16S.
Quelles modifications post-traductionnelles peuvent modifier la fonction d’une protéine ?
La déformylation, la phosphorylation et la glycosylation.
Où certaines protéines bactériennes sont-elles transloquées ou sécrétées ?
Dans le périplasme ou à l’extérieur de la cellule.
Quelles fonctions remplissent les ADN polymérases peu processives chez les bactéries et les eucaryotes ?
La polymérase I bactérienne participe à la réparation et à la maturation des fragments d’Okazaki ; la polymérase α eucaryote intervient dans l’initiation de la synthèse d’ADN.
Qu’est-ce que la masse molaire d’une protéine ou d’un polypeptide ?
La masse d’une mole, exprimée en g/mol.
Dans quelle unité peut-on exprimer la masse d’une molécule de protéine ?
En daltons (Da).
Lors de l’hydrolyse alcaline de l’ARN, quel groupe est déprotoné par OH⁻ ?
L’hydroxyle en C2′.
Lors de l’hydrolyse alcaline de l’ARN, quel produit cyclique se forme après le clivage ?
Un phosphate cyclique 2′,3′.
Quelle structure constitue généralement un réplicon chez les bactéries ?
Un chromosome bactérien.
Combien d’origines de réplication possède un réplicon ?
Une seule origine.
Quelle forme ont les facteurs de processivité et que stabilisent-ils ?
Ce sont des anneaux encerclant l’ADN double brin, qui stabilisent l’ADN polymérase.
Combien de sous-unités comptent respectivement les ARN polymérases eucaryotes I, II et III ?
14, 12 et 17 sous-unités.
Quelles sous-unités bactériennes sont les homologues fonctionnelles respectives de RPB1 et RPB2 ?
β’ et β.
Teste tes connaissances avec un QCM de 46 questions sur Réplication et transcription de l’ADN.
1. Dans une molécule, deux atomes partagent des électrons de leur couche externe. Quel type de liaison les unit ?
2. Dans une interaction entre deux groupements, un H labile porté par le premier se lie au site accepteur du second. Quelle liaison se forme, sachant qu’elle est plus faible qu’une liaison ionique ?
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