Flashcards : Structure et fonctions des protéines — 59 cartes

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1Question

Quelles fonctions principales remplissent les protéines dans le vivant ?

Réponse

Elles participent à la structure, au mouvement, à la signalisation, à la respiration et à la réplication de l’information génétique.

2Question

Quels rôles les protéines jouent-elles dans les tissus et le transport cellulaire ?

Réponse

Elles assurent la structure des tissus et le transport de vésicules.

3Question

Quelle fonction musculaire est assurée par les protéines ?

Réponse

Elles réalisent le travail musculaire.

4Question

Qu'est-ce qu'une chaîne peptidique ?

Réponse

Une longue chaîne linéaire d'acides aminés liés par des liaisons peptidiques.

5Question

Dans quel sens se déroule la synthèse des protéines ?

Réponse

Du terminal N vers le terminal C.

6Question

Quel rôle joue le GTP dans la synthèse protéique ?

Réponse

Il est consommé par le ribosome pour assurer la translocation de l'ARNm.

7Question

Quelle est la répétition du squelette peptidique ?

Réponse

N—Cα—CO—N—Cα—CO.

8Question

Que portent les chaînes latérales R sur le squelette peptidique ?

Réponse

Elles sont greffées sur le squelette peptidique.

9Question

Quelle information contient la séquence primaire des acides aminés ?

Réponse

Elle détermine le repliement et la forme tridimensionnelle de la protéine.

10Question

Quelle est la polarité et le moment dipolaire de l'eau ?

Réponse

L'eau est polaire avec un moment dipolaire de 1,8 debye.

11Question

Quelle est la polarité et le moment dipolaire du CO2 gazeux ?

Réponse

Le CO2 gazeux est apolaire avec un moment dipolaire nul.

12Question

Quelle proportion de poids l'eau représente-t-elle dans la plupart des organismes ?

Réponse

L'eau représente plus de 70 % du poids.

13Question

Quel rôle joue l'eau dans le vivant en tant que solvant ?

Réponse

L'eau est le solvant majeur du vivant.

14Question

En quelles espèces l'eau s'ionise-t-elle ?

Réponse

L'eau s'ionise en H+ et OH−.

15Question

Comment les ions issus de l'ionisation de l'eau influencent-ils les biomolécules ?

Réponse

Ils modulent les assemblages et influencent la structure des biomolécules.

16Question

Quelle est la formule de la force électrostatique entre deux charges ?

Réponse

F=qiqj4πε0Drij2F=\frac{q_iq_j}{4\pi\varepsilon_0Dr_{ij}^2}

17Question

Quelle est l'énergie typique d'une liaison covalente ?

Réponse

Environ 300 kJ·mol−1.

18Question

Quelle est l'énergie typique des interactions faibles ?

Réponse

De l'ordre de 2 à 30 kJ·mol−1.

19Question

Qu'est-ce qu'une liaison hydrogène ?

Réponse

Une liaison entre groupements donneurs et accepteurs complémentaires.

20Question

De quoi dépend la force d'une liaison hydrogène ?

Réponse

De la distance, de l'orientation et de l'environnement.

21Question

Quelle est l'énergie typique d'une liaison hydrogène ?

Réponse

Environ 2 à 25 kJ·mol−1.

22Question

Qu'est-ce que la structure tertiaire d'une protéine?

Réponse

La forme tridimensionnelle fonctionnelle obtenue par le repliement de la structure primaire.

23Question

Quelle est la disposition préférentielle des chaînes hydrophobes dans une protéine repliée?

Réponse

Elles forment un cœur interne.

24Question

Où se trouvent les groupements polaires contenant oxygène ou azote dans une protéine repliée?

Réponse

À la surface de la protéine.

25Question

Par quelles interactions la structure repliée d'une protéine est-elle stabilisée?

Réponse

Par des interactions faibles entre les parties de la chaîne polypeptidique et avec son environnement.

26Question

Combien de résidus par tour comporte une hélice α type ?

Réponse

Environ 3,6 résidus par tour.

27Question

Quel est le pas d'une hélice α type ?

Réponse

5,4 Å.

28Question

Quelle est la translation entre deux acides aminés pontés dans une hélice α ?

Réponse

1,5 Å.

29Question

Qu'est-ce qu'un feuillet β en structure secondaire ?

Réponse

Une structure formée par des brins β stabilisés par des liaisons hydrogène.

30Question

Où se situent les chaînes latérales dans un feuillet β ?

Réponse

De part et d’autre du feuillet.

31Question

Entre quels groupes s’établissent les liaisons hydrogène des structures secondaires ?

Réponse

Entre les groupes C=O et N–H du squelette peptidique.

32Question

Qu'est-ce qu'un assemblage multimérique ?

Réponse

Une nanomachine protéique formée de plusieurs chaînes polypeptidiques associées.

33Question

Quel exemple illustre une forme monomérique ?

Réponse

La myoglobine.

34Question

Quel exemple illustre une forme multimérique ?

Réponse

L'hémoglobine.

35Question

Quelle charge ont les protéines associées dans le ribosome ?

Réponse

Elles sont basiques et chargées positivement.

36Question

Quelle caractéristique de la glycine facilite l'enchevêtrement des hélices dans le collagène ?

Réponse

Sa petite taille peu encombrante.

37Question

Quel est le rôle des kinésines et dynéines sur les microtubules ?

Réponse

Ce sont des moteurs moléculaires qui se déplacent sur eux.

38Question

Quelle source d'énergie utilisent kinésines et dynéines ?

Réponse

L'ATP.

39Question

Que provoque la SDS-PAGE dénaturante sur les protéines ?

Réponse

Elle leur donne une charge négative uniforme.

40Question

Sur quoi dépend principalement la distance de migration en SDS-PAGE ?

Réponse

Sur la masse des protéines.

41Question

Qu'est-ce qu'une kinase en communication cellulaire ?

Réponse

Une protéine permettant le transfert de groupements phosphoryle.

42Question

Quels lobes la structure cristallographique de la PKA présente-t-elle ?

Réponse

Un lobe N et un lobe C.

43Question

Quels éléments la structure de la PKA comprend-elle en plus des lobes ?

Réponse

Une boucle d’activation et un domaine catalytique conservé.

44Question

Quelles protéines interviennent dans la respiration et la structure ?

Réponse

L’hémoglobine intervient dans la respiration et le collagène dans la structure.

45Question

Quelles protéines sont impliquées dans le mouvement ?

Réponse

L’actine et la myosine sont impliquées dans le mouvement.

46Question

Quel est l'angle entre les liaisons H–O dans la molécule d'eau ?

Réponse

L'angle est proche de 105°.

47Question

Quelle est la disposition angulaire des liaisons C=O dans le CO2 ?

Réponse

Les liaisons C=O sont disposées selon un angle plat.

48Question

Quelle énergie correspond à l'agitation thermique à température ambiante ?

Réponse

Environ 2,5 kJ·mol−1.

49Question

Quel est l'état de l'eau à température ambiante malgré l'agitation thermique ?

Réponse

L'eau reste liquide.

50Question

Que décrit le diagramme de Ramachandran ?

Réponse

Les angles caractéristiques des conformations régulières des chaînes polypeptidiques.

51Question

Quelle est la forme et la taille d'une hématie ?

Réponse

Un disque biconcave d'environ 7 micromètres de diamètre et 2,5 micromètres d'épaisseur.

52Question

Combien d'hémoglobines tétramériques contient une hématie ?

Réponse

Environ 280 millions.

53Question

De quoi est composé le récepteur ionotrope AMPA au glutamate ?

Réponse

D'un tétramère membranaire de quatre chaînes protéiques avec des N-glycosylations.

54Question

Quels rôles joue la glycosylation sur les protéines ?

Réponse

Elle stabilise le repliement, forme des oligomères, retient dans le réticulum et contrôle la qualité.

55Question

Combien de types de collagène existe-t-il environ ?

Réponse

Environ 28 types.

56Question

Quel est l'effet du DTT et du bêta-mercaptoéthanol sur les ponts disulfure ?

Réponse

Ils les réduisent.

57Question

Que permet d'identifier la réduction des ponts disulfure par DTT et bêta-mercaptoéthanol ?

Réponse

Un état oligomérique covalent.

58Question

Quel motif contient le domaine catalytique conservé des kinases ?

Réponse

Le motif DXXXXN.

59Question

Combien de résidus environ concerne le repliement canonique des kinases ?

Réponse

Environ 250 résidus.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 25 questions sur Structure et fonctions des protéines.

1. Concernant les fonctions générales des protéines :

2. Parmi les associations entre protéines et fonctions biologiques, la(les)quelle(s) est(sont) exacte(s) ?

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