Combien de molécules différentes sont d'usage courant ?
Environ 60 000 molécules.
Quels types de substances figurent parmi les 60 000 molécules d'usage courant ?
Médicaments, additifs alimentaires, fertilisants, pesticides, métaux, solvants et produits de combustion.
Quel pourcentage des molécules d'usage courant peut interagir avec l'ADN ?
Entre 5 et 10 %.
À quels types de rayonnements l'être humain est-il exposé ?
Rayonnements ionisants, non ionisants (UVB, UVA) et ultrasons.
Quelle est la longueur approximative de l’ADN humain déroulé?
Environ 1,20 mètre.
Sous quelle forme l’ADN des cellules eucaryotes est-il compacté?
Sous forme de chromatine.
Combien de paires de bases contient le génome humain diploïde?
Environ 6 × 10⁹ paires de bases.
Combien de gènes contient environ le génome humain diploïde?
Environ 25 000 gènes.
Quel pourcentage de l’ADN est transcrit en ARNm dans le génome humain?
Environ 2 %.
Qu’est-ce qu’une lésion de l’ADN?
Une modification transitoire entraînant une anomalie chimique ou physique.
Qu’entraîne une lésion non réparée avant la réplication?
L’insertion d’une base erronée et une mutation héréditaire.
Quelles sont les deux grandes familles de lésions de l’ADN?
Les cassures et les altérations de bases.
Quel risque génétique entraîne la désamination de la cytosine ?
Une transition C→T.
Quelle lésion bloqueuse résulte de la désamination de la guanine ?
La xanthine.
Quel produit résulte de la désamination de la 5-méthylcytosine ?
La thymine.
Pourquoi la thymine issue de la désamination de la 5-méthylcytosine pose-t-elle problème ?
Elle n’est pas reconnue par les protéines de réparation.
Combien de pertes de bases formant des sites apuriniques subissent les cellules de mammifères par jour ?
Environ 10 000 par cellule et par 24 heures.
Quelle est la conséquence la plus fréquente des lésions apuriniques dans les cellules de mammifères ?
Une délétion plutôt qu’une mutation ponctuelle.
Qu'est-ce qu'un agent alkylant en chimie?
Un composé électrophile qui forme des liaisons covalentes avec les bases.
Que possèdent les alkylants bifonctionnels?
Deux groupements fonctionnels.
Quel effet principal ont les alkylants bifonctionnels comme les moutardes azotées?
Ils forment des pontages entre deux bases.
Quelles sont les sources des hydrocarbures polycycliques aromatiques?
Le tabac, la combustion du fuel et les grillades.
Citez un hydrocarbure polycyclique aromatique mentionné.
Le benzo(a)pyrène.
Quels dommages l'UV provoque-t-il sur l'ADN?
Bases oxydées, cassures de brins, dimères cyclobutaniques, photoproduits (6-4) et Dewar.
Quelles sont les étapes de la cancérogenèse liée aux lésions de l’ADN ?
Initiation, promotion, progression et métastase.
Quels types de gènes peuvent subir des mutations induites par des lésions ?
Les proto-oncogènes, oncogènes et gènes suppresseurs de tumeur.
De quoi dépend le devenir d’une lésion d’ADN ?
De sa reconnaissance et de l’arrêt de la réplication.
Que produit une réparation fidèle d’une lésion d’ADN ?
La restauration de l’ADN.
Quelle conséquence peut avoir une réparation infidèle d’une lésion d’ADN ?
La production d’une mutation.
Que peut entraîner l’absence de réparation d’une lésion d’ADN ?
L’apoptose ou un effet létal.
Quel est le rôle des protéines de checkpoint G1/S, S et G2/M ?
Elles arrêtent le cycle cellulaire pour permettre l'élimination des lésions avant la duplication de l'ADN.
Comment la BER reconnaît-elle une base anormale et répare-t-elle le brin ?
Une glycosylase reconnaît la base, ouvre le site, insère des nucléotides puis ligature.
Quelle est la particularité de la voie courte de la BER en cellules humaines ?
Elle insère un seul nucléotide et dépend de Polβ.
Quels sont les acteurs clés de la reconnaissance et incision dans la NER ?
XPC-RAD23B reconnaît, XPB et XPD ouvrent, XPF-ERCC1 et XPG incisent.
Quels rôles jouent MutS, MutL et MutH dans la réparation des mésappariements chez Escherichia coli ?
MutS reconnaît la distorsion, MutL forme le complexe, MutH coupe le brin néoformé non méthylé.
Quelle est la différence de reconnaissance entre MutSα et MutSβ chez l'humain ?
MutSα reconnaît mésappariements et insertions-délétions 1-2 nucléotides, MutSβ celles de plus de 2 nucléotides.
Comment la recombinaison homologue répare-t-elle les cassures double brin ?
Elle utilise la chromatide sœur pendant la phase S comme support de réparation.
Qu'est-ce que la synthèse translésionnelle ?
Un mécanisme de contournement d’une lésion pendant la réplication par basculement de polymérase.
Quels facteurs influencent l'erreur ou la mutagenèse en synthèse translésionnelle ?
Le type de lésion, le contexte de séquence et la polymérase de TLS recrutée.
Quelle est la limite de l’analyse sur plasmide pour étudier la synthèse translésionnelle ?
Elle est simple mais peu représentative des cellules eucaryotes.
Quelle est la difficulté de l’analyse sur ADN génomique ?
Elle est délicate mais représentative des cellules eucaryotes.
Qu'est-ce que relie la signature moléculaire d'un agent génotoxique ?
L'exposition, les lésions, les mutations et un cancer.
Quels gènes sont mutés par les adduits du benzo(a)pyrène dans ses cancers ?
Les gènes ras et p53.
Quelles transversions sont observées sur les codons 61 et 12 de ras par le benzo(a)pyrène ?
Des transversions A→T ou G→T.
Quel codon de p53 est un site préférentiel d'adduit et de mutation pour l'aflatoxine B1 ?
Le codon 249.
Quelle transversion est observée au codon 249 de p53 avec l'aflatoxine B1 ?
Une transversion T→G.
Quel volume d'air un humain respire-t-il en 50 ans ?
Environ 250 000 m³.
Quelle quantité de matière sèche un humain consomme-t-il en 50 ans ?
Plus de 15 tonnes.
Quel volume d'eau un humain utilise-t-il en 50 ans ?
Environ 750 000 litres.
Quelle forme de thymine prédomine au pH physiologique ?
La forme cétone.
Quelle forme de guanine est favorisée par une variation locale du pH ?
La forme alcool.
Quelle cible alkyle le cyclophosphamide dans l'ADN?
Le N7 de la guanine sur les deux brins.
Quel type d'agent est le cyclophosphamide?
Un anticancéreux très cytotoxique et peu sélectif.
Qu'est-ce que la réversion du dommage en réparation de l'ADN ?
Une réparation directe sur la lésion sans excision préalable de l'ADN atteint.
Quelle est la particularité de la photolyase ?
C'est une enzyme activée par la lumière.
Que fait l'AGT lors de la réparation de l'ADN ?
Elle transfère un groupement alkyle sur un résidu cystéine de la protéine.
Que devient la protéine AGT après transfert du groupement alkyle ?
Elle devient inactive puis est dégradée après ubiquitinylation.
Combien de nucléotides la voie longue de la BER ajoute-t-elle et quels enzymes sont impliqués ?
Elle ajoute 2 à 8 nucléotides et implique Polδ ou Polε, PCNA, RFC, FEN-1 et une ligase.
Quelle différence existe-t-il entre la réparation couplée à la transcription et la réparation globale du génome ?
La réparation couplée arrête l'ARN polymérase et recrute CSA/CSB, la globale reconnaît directement par XPC-RAD23B.
Comment les polymérases de TLS sont-elles recrutées chez les eucaryotes ?
Par la machinerie de réplication, notamment PCNA.
Pourquoi les enzymes sont-elles adaptées à l’étude des lésions sur plasmide ?
Elles sont spécifiques d’une lésion ou d’un groupe de lésions.
Quels sont les inconvénients des anticorps pour l’étude sur ADN génomique ?
Ils sont spécifiques et difficiles à élaborer.
Quels codons de p53 sont des points chauds des lésions et mutations du benzo(a)pyrène selon Denissenko et al. ?
Les codons 157, 248 et 273.
Dans quelle revue et année l'étude de Denissenko, Pao, Tang et Pfeifer a-t-elle été publiée ?
Dans Science en 1996.
Quelle signature moléculaire caractérisent les UV ?
Des lésions bipyrimidiques, dont les dimères cyclobutaniques et les photoproduits (6-4).
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1. Laquelle des propositions décrit correctement l’ordre de grandeur et la diversité des molécules d’usage courant auxquelles l’être humain peut être exposé ?
2. Sur environ 60 000 molécules d’usage courant, quelle proportion peut présenter une interaction avec l’ADN ?
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