Fiche de révision : Généralités de bactériologie

📋 Plan du Cours

1. Microbiologie et agents infectieux
2. Bactéries virus et champignons
3. Virus et transmission
4. Diagnostic microbiologique
5. Morphologie et paroi bactériennes
6. Multiplication et structures bactériennes
7. Spores et besoins de croissance
8. Flores commensales et prélèvements
9. Pathogénicité et portage
10. Processus infectieux
11. Origine des bactéries pathogènes
12. Transmission et prévention

📖 1. Microbiologie et agents infectieux

🔑 Notions clés & Définitions

• Microbiologie : Ensemble des disciplines biologiques qui étudient les microorganismes, notamment les bactéries, les champignons et les virus.
• Agent infectieux : Agent biologique pathogène responsable d’une infection ou d’une maladie infectieuse.

★ À maîtriser

• Les quatre grandes catégories d’agents infectieux sont:
  • les bactéries
  • les virus
  • les parasites
  • les champignons

Compléments

• Au XVIIème siècle, Van Leeuwenhoek invente le microscope et découvre les « animalcules microscopiques ».

📖 2. Bactéries virus et champignons

🔑 Notions clés & Définitions

• Bactérie : Être unicellulaire procaryote dépourvu de noyau et d’organites, possédant généralement un chromosome d’ADN double brin circulaire et se reproduisant par scissiparité.
• Virus : Agent infectieux acellulaire possédant un seul type d’acide nucléique, ADN ou ARN, et ne pouvant se multiplier qu’à l’intérieur d’une cellule vivante.
• Champignon : Organismes eucaryotes possédant plusieurs chromosomes d’ADN et se multipliant en dehors des cellules eucaryotes.

📝 Points essentiels

• La taille habituelle des bactéries est de 1 à 10 μm.

💡 Astuce mémo

Bactérie avec paroi, virus dépendant d’une cellule, champignon eucaryote autonome

📖 3. Virus et transmission

★ À maîtriser

📌 Les virus nus résistent davantage à l’environnement et aux surfaces, tandis que les virus enveloppés sont plus fragiles et ont une survie limitée sur les surfaces et le matériel.

• Les virus se transmettent par contact direct avec des liquides biologiques ou des sécrétions respiratoires, par voie sexuelle, materno-fœtale ou sanguine, et par voie oro-fécale ou cutanée selon le virus.

Compléments

• Les virus enveloppés comprennent notamment:

  • les virus de l’herpès
  • les virus des hépatites B et C
  • le VIH
  • les coronavirus
  • le virus de la grippe

• Les virus nus comprennent notamment:

  • les rotavirus
  • les papillomavirus
  • les adénovirus
  • le virus de l’hépatite A

💡 Astuce mémo

Virus nus résistants, virus enveloppés fragiles

📖 4. Diagnostic microbiologique

★ À maîtriser

📌 Le diagnostic direct met en évidence le microorganisme ou ses constituants, tandis que le diagnostic indirect met en évidence les anticorps produits par l’hôte.

• La PCR détecte l’ADN ou l’ARN, les tests antigéniques détectent des antigènes et la sérologie détecte les anticorps.

Compléments

• La mise en culture bactérienne permet l’identification et l’antibiogramme, tandis que la mise en culture fongique permet l’identification et l’antifongigramme.

💡 Astuce mémo

Diagnostic direct du germe, diagnostic indirect des anticorps

📖 5. Morphologie et paroi bactériennes

🔑 Notions clés & Définitions

• Paroi bactérienne : Structure commune à toutes les bactéries, dont la composition variable contient toujours du peptidoglycane.

★ À maîtriser

• Les bactéries ont principalement une forme arrondie appelée coque ou cocci, ou une forme allongée appelée bacille.

📌 Les bactéries Gram positif restent violettes après la coloration de Gram, tandis que les bactéries Gram négatif sont décolorées puis apparaissent roses après contre-coloration à la fuchsine.

Compléments

• La distinction entre bactéries Gram positif et Gram négatif intervient dans leur classification, le choix des antibiotiques et l’interprétation de leur structure pariétale.

💡 Astuce mémo

Gram positif violet, Gram négatif rose

📖 6. Multiplication et structures bactériennes

🔑 Notions clés & Définitions

• Glycocalix : Réseau lâche de polysaccharides et de protéines sécrété par les bactéries dans le milieu extérieur.

📝 Points essentiels

• La multiplication bactérienne se fait par division binaire, avec coupure au niveau d’un septum central, puis production exponentielle d’un clone bactérien.

• Escherichia coli peut se multiplier toutes les 20 minutes et la majorité des bactéries forme des colonies visibles en 18 à 24 heures.

• Le glycocalix favorise l’adhésion aux matériels étrangers et la formation de biofilms, ce qui participe au pouvoir pathogène.

💡 Astuce mémo

Division binaire → clone → colonie

📖 7. Spores et besoins de croissance

🔑 Notions clés & Définitions

• Spore bactérienne : Forme de repos réversible produite en conditions défavorables, qui cesse de se multiplier jusqu’à la germination en conditions favorables.

★ À maîtriser

• Les spores résistent à:
  • la dessiccation
  • la chaleur
  • les agents chimiques
  • les antibiotiques
  • les antiseptiques
  • l’alcool

📌 Les bactéries aérobies strictes nécessitent l’oxygène, les bactéries anaérobies strictes ne le tolèrent pas, les bactéries aéro-anaérobies facultatives peuvent vivre avec ou sans oxygène et les bactéries microaérophiles nécessitent une faible concentration d’oxygène.

Compléments

• Clostridium difficile est une bactérie anaérobie stricte et sporulée, tandis qu’Escherichia coli et Staphylococcus aureus sont aéro-anaérobies facultatives.

💡 Astuce mémo

Conditions défavorables → spores résistantes ; conditions favorables → germination

📖 8. Flores commensales et prélèvements

🔑 Notions clés & Définitions

• Microbiote : Ensemble des microorganismes, notamment les bactéries, les champignons et les virus, vivant dans un environnement spécifique.

📝 Points essentiels

• Le microbiote s’implante rapidement dès la naissance, évolue progressivement et sa colonisation ainsi que sa diversité se stabilisent vers 2 à 3 ans.

• Les flores commensales assurent: une barrière contre l’implantation des bactéries pathogènes, un rôle métabolique comme la synthèse de vitamine K, une stimulation de la maturation immunitaire

• Les principales flores commensales sont:

  • la flore oropharyngée
  • la flore cutanée
  • la flore digestive
  • la flore vaginale

📌 Dans un prélèvement normalement stérile comme le sang, les urines, le LCR ou le liquide articulaire, la présence d’une bactérie évoque une infection, tandis que dans un prélèvement contenant une flore commensale elle peut correspondre à une contamination, une colonisation ou une infection.

💡 Astuce mémo

Prélèvement normalement stérile : bactérie = infection ; prélèvement colonisé : bactérie = contamination, colonisation ou infection

📖 9. Pathogénicité et portage

🔑 Notions clés & Définitions

• Microorganisme pathogène : Capable de provoquer une maladie infectieuse chez un individu dont les mécanismes de défense sont normaux.
• Microorganisme opportuniste : Provoque une infection lorsque les défenses de l’hôte diminuent ou lorsqu’une porte d’entrée apparaît.

★ À maîtriser

• Le portage sain correspond à l’hébergement de bactéries pathogènes sans maladie, et ce portage peut être transitoire.

Compléments

• Le streptocoque A, le pneumocoque et le méningocoque peuvent être présents chez un individu en portage sain.

💡 Astuce mémo

Pathogène chez l’hôte sain, opportuniste si défenses diminuées

📖 10. Processus infectieux

📝 Points essentiels

• 🔄 Le processus infectieux suit quatre étapes:

  1. colonisation
  2. pénétration ou invasion
  3. multiplication intra- ou extracellulaire
  4. destruction des cellules ou des tissus

• Les facteurs de virulence bactériens comprennent:

  • les adhésines
  • le glycocalix
  • les biofilms
  • les invasines
  • les sidérophores
  • l’échappement à la phagocytose
  • les toxines
  • les enzymes

📌 Une infection grave survient lorsque la capacité d’agression des bactéries dépasse les mécanismes de défense de l’hôte.

💡 Astuce mémo

Colonisation → invasion → multiplication → destruction

📖 11. Origine des bactéries pathogènes

★ À maîtriser

• Les bactéries pathogènes peuvent provenir de la flore commensale, de l’environnement ou des animaux.

Compléments

• Une antibiothérapie peut déséquilibrer la flore digestive et favoriser une colite à Clostridium difficile.

• Une infection du site opératoire peut être due à Staphylococcus aureus provenant de la flore commensale.

• Aeromonas peut provenir d’une plaie traumatique contaminée par l’eau, Clostridium d’une contamination tellurique et Pasteurella d’une morsure de chien ou de chat.

💡 Astuce mémo

Déséquilibre flore-défenses → infection

📖 12. Transmission et prévention

📝 Points essentiels

📌 La prévention de la transmission repose notamment sur l’hygiène des mains, la désinfection des surfaces et du matériel, ainsi que le port d’équipements de protection individuelle selon le risque.

📌 Les bactéries sporulées résistent aux solutions hydro-alcooliques, si bien qu’une friction au soluté hydro-alcoolique ne suffit pas pour les éliminer.

• La réalisation des prélèvements doit éviter leur contamination par les flores commensales du patient, du soignant ou du matériel.

📊 Tableaux de synthèse

Comparaison des microorganismes

Types de prélèvements