Quelle est la forme typique du chromosome bactérien ?
Le chromosome bactérien est généralement circulaire.
Comment est compacté le chromosome bactérien ?
Il est compacté par les topoisomérases et les protéines associées au nucléoïde (NAPs).
Quelle est la taille du plus petit génome bactérien cité ?
0,112 Mbp chez Candidatus nasuia.
Quelle est la taille du plus grand génome bactérien cité ?
13,03 Mbp chez Sorangium cellulosum.
Quelle est la taille du génome d'Escherichia coli ?
4,6 Mbp.
Quelle proportion du génome bactérien est généralement codante ?
85 à 90 % du génome bactérien est codant.
Quelle est la densité génique d'Escherichia coli ?
Environ 900 gènes par Mbp.
Quels gènes et opérons spécifiques contient le génome d'Escherichia coli ?
Deux gènes codant des alanine racémases et sept opérons d'ARN ribosomique.
Qu'est-ce qu'un plasmide ?
Une petite molécule d'ADN double brin, circulaire et extrachromosomique.
Quelle est la taille typique des plasmides ?
De 1 à plus de 200 kilobases paires.
Combien de copies de plasmides peut contenir une cellule selon leur type ?
De 1 à 5, 10 à 20, ou 30 à 100 copies par cellule.
Comment les plasmides sont-ils transmis aux cellules filles ?
De façon aléatoire et non équitable lors de la division cellulaire.
Quel type de gènes portent les plasmides ?
Des gènes non essentiels au métabolisme mais conférant un avantage sélectif.
Qu'est-ce qu'un épisome ?
Un plasmide pouvant être libre ou intégré au chromosome bactérien.
Que permettent les plasmides conjugatifs ?
Le transfert d'ADN par conjugaison.
Que produisent les plasmides Col ?
Des bactériocines qui tuent des espèces proches.
Comment est la réplication du chromosome bactérien ?
Elle est semi-conservative et bidirectionnelle.
Quel rôle joue la protéine Tus avec les sites ter ?
Elle forme un système polaire bloquant la fourche de réplication sur la face non permissive.
Quelle est la fonction de DnaA lors de la réplication bactérienne ?
DnaA ouvre localement l'ADN à la DnaA box.
Quelle enzyme pose l'amorce ARN pendant la réplication bactérienne ?
DnaG pose l'amorce ARN.
Quel est le rôle de l'ADN polymérase III dans la réplication bactérienne ?
Elle synthétise les nouveaux brins d'ADN.
Quelle enzyme remplace les amorces ARN par de l'ADN ?
L'ADN polymérase I remplace les amorces ARN par de l'ADN.
Quelle enzyme relie les fragments d'Okazaki ?
L'ADN ligase relie les fragments d'Okazaki.
Combien de temps dure la réplication du chromosome bactérien ?
Elle dure environ 40 minutes.
Qu'initie la réplication en cercle roulant chez les plasmides ?
RepC reconnaît DSO et coupe un seul brin.
Que fait PcrA dans la réplication en cercle roulant ?
PcrA sépare les brins d'ADN.
Quel rôle joue l'ADN polymérase III dans le cercle roulant ?
Elle synthétise le nouveau brin autour du plasmide.
Comment RepC termine-t-il la réplication du brin déplacé ?
Il recoupe et ligature le brin déplacé au niveau de DSO.
Quel est le rôle de SSO dans la réplication des plasmides ?
SSO permet la synthèse du second brin selon la séquence amorce ARN.
Quel est le résultat final de la réplication en cercle roulant ?
Deux plasmides circulaires double brin sont produits.
Quelle est la nature de la réplication en cercle roulant ?
Elle est asynchrone et unidirectionnelle.
Comment se déroule la copie des deux brins dans la réplication en cercle roulant ?
Un brin est copié puis déplacé, puis le brin déplacé est copié grâce à SSO dans une seule direction.
Quelles sont les séquences consensus des régions -35 et -10 du promoteur bactérien ?
-35 : TTGACA et -10 : TATAAT.
À quoi correspond le site +1 dans la transcription ?
Au premier nucléotide transcrit en ARNm.
Quelle base est le site +1 dans cet exemple ?
L'adénine.
Quelle est la fonction de la séquence Shine-Dalgarno sur l'ARNm ?
S'apparier à l'ARNr 16S pour positionner le codon AUG dans le site P.
Que devient ATG sur l'ADN codant dans l'ARNm et que code-t-il ?
Il devient AUG et code la méthionine.
Que devient TAA sur l'ADN codant dans l'ARNm et que signifie-t-il ?
Il devient UAA et signale l'arrêt de la traduction.
Quelles sont les étapes principales de la transcription chez Escherichia coli ?
Reconnaissance du promoteur, complexe fermé puis ouvert, initiation en +1, libération du facteur sigma, élongation 5'→3', terminaison.
Qu'est-ce qu'un opéron en génétique bactérienne ?
Un ensemble de gènes contigus transcrits en un seul ARNm avec séquences régulatrices.
Combien d'opérons d'ARN ribosomique possède Escherichia coli ?
Sept opérons d'ARN ribosomique.
Quels types de séquences contient un exemple d'opéron ribosomique chez Escherichia coli ?
Les séquences 23S, 16S, ARNtGlu et 5S.
Quels gènes compose l'opéron lactose ?
Les gènes lacZ, lacY et lacA.
Que codent respectivement lacZ, lacY et lacA ?
β-galactosidase, β-galactoside perméase et galactoside transacétylase.
Quel est le rôle du répresseur LacI dans l'opéron lac ?
Il empêche la transcription en se fixant aux opérateurs O1, O2 et O3.
Que se passe-t-il quand LacI n'est pas fixé à l'opérateur dans l'opéron lac ?
La transcription par l'ARN polymérase est permise.
Comment l'allolactose permet-il la transcription de l'opéron lac ?
Il se fixe à LacI et le détache de l'opérateur.
Qu'est-ce que la traduction en biologie bactérienne ?
La fabrication d'une protéine à partir de l'ARNm lue codon par codon par le ribosome avec l'aide des ARNt.
Quels sont les trois sites fonctionnels du ribosome ?
Les sites A, P et E pour l'arrivée, le port de la chaîne peptidique et la sortie de l'ARNt.
Quelle vitesse atteint la traduction bactérienne en résidus par minute ?
Environ 900 résidus par minute.
Quel rôle joue IF3 lors de l'initiation bactérienne ?
IF3 se fixe à la sous-unité 30S et empêche l'association prématurée de la 50S.
Comment IF2-GTP participe-t-il à l'initiation de la traduction bactérienne ?
Il favorise la liaison de l'ARNt initiateur.
Quel est le rôle de l'appariement Shine-Dalgarno-ARNr 16S dans l'initiation ?
Il place le codon AUG dans le site P avec l'ARNt initiateur portant la méthionine.
Comment la transcription et la traduction sont-elles liées chez les bactéries ?
La traduction peut commencer avant la fin de la transcription de l'ARNm.
Qu'est-ce qu'une mutation ?
Un changement héritable du génome.
Quelles sont les formes de mutations ponctuelles ?
Substitution, addition ou délétion d'un ou deux nucléotides.
Que provoque la dépurination spontanée ?
La perte d'une base purique et la formation d'un site apurinique.
Quel effet a la forme énol du 5-bromouracile ?
Elle provoque un mésappariement et une substitution AT vers GC.
Que provoquent les agents d'intercalation comme l'orangé d'acridine ?
Des insertions ou délétions et un déphasage du cadre de lecture.
Quelle est la différence entre une mutation silencieuse et une mutation non-sens ?
La silencieuse ne change pas l'acide aminé, la non-sens crée un codon stop prématuré.
Quel effet peut avoir une mutation dans une séquence régulatrice ?
Modifier l'expression du gène.
Quand une mutation a-t-elle un impact visible sur le phénotype ?
Lorsqu'elle modifie le phénotype de la bactérie.
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1. Quelle organisation décrit le mieux le chromosome bactérien dans le cas général ?
2. Quelle comparaison des tailles génomiques bactériennes est correcte ?
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