Fiche de révision : Organites intracellulaires et rôles

Plan du Cours

  1. Organisation générale de la cellule
  2. Structure du noyau interphasique
  3. Réplication et réparation de l’ADN
  4. Transcription et maturation des ARN
  5. Traduction et cycle cellulaire
  6. Mitose et méiose
  7. Réticulum endoplasmique et Golgi
  8. Lysosomes et digestion cellulaire
  9. Peroxysomes et détoxification
  10. Chloroplastes et photosynthèse
  11. Mitochondries et respiration cellulaire

1. Organisation générale de la cellule

Notions clés & Définitions

  • Organite : Maugras, Dictionnaire de biologie cellulaire, 1996 - Structure intracellulaire différenciée du cytoplasme par une membrane.

Points essentiels

  • La cellule manifeste les fonctions suivantes :
    • l’assimilation
    • la croissance
    • l’excrétion
    • la respiration
    • la reproduction

2. Structure du noyau interphasique

Notions clés & Définitions

  • Noyau : Organite majeur de la vie cellulaire qui contient la presque totalité de l’ADN cellulaire.
  • Gène : Unité d’information génétique située au niveau de l’ADN.
  • Génome : Ensemble des gènes d’un organisme.
  • Nucléoplasme : Substance fondamentale du noyau constituée d’un gel protéique contenant notamment des phosphatases ainsi que des ARN- et ADN-polymérases.

★ À maîtriser

  • L’enveloppe nucléaire comprend deux membranes, un espace périnucléaire et des pores nucléaires qui permettent les échanges entre le noyau et le cytoplasme.

  • Le nucléole synthétise les ARN ribosomiques 28 S, 18 S et 5,8 S, dont S désigne le coefficient de sédimentation de Svedberg.

  • La chromatine contient 30 % d’ADN, 5 % d’ARN, 30 à 40 % de protéines histones structurales et 10 à 25 % de protéines non histones régulatrices de l’activité de l’ADN.

📌 L’euchromatine est une chromatine dispersée, tandis que l’hétérochromatine est une chromatine condensée.

  • Le cœur octamérique comprend deux molécules de chacune des histones :
    • H2A
    • H2B
    • H3
    • H4
  • Selon Watson et Crick (1953), l’ADN est formé de deux chaînes polynucléotidiques antiparallèles dont les bases s’apparient A-T et G-C.

Compléments

📌 Chez les eucaryotes, les gènes comprennent des exons codants et des introns non codants, tandis que les bactéries ne possèdent pas d’introns et que certains gènes des Archéobactéries en possèdent.

  • Le nucléole est un granule sphérique au microscope optique et une structure hétérogène, dense et spongieuse, sans membrane limitante, au microscope électronique.

  • Le nucléosome, élément de la chromatine en collier de perles, a un diamètre de 11 nm.

  • L’ARN est généralement constitué d’une seule chaîne polynucléotidique et les bases s’y apparient A-U et G-C.

  • Les principaux types d’ARN sont :

    • les ARN ribosomiques
    • les ARN de transfert
    • les ARN messagers
    • les petits ARN nucléolaires

Astuce mémo

Euchromatine dispersée, hétérochromatine condensée

3. Réplication et réparation de l’ADN

★ À maîtriser

  • La réplication de l’ADN est semi-conservative : chacun des deux brins parentaux sert de matrice à la formation d’un brin complémentaire par appariement des bases.
  • L’ADN-polymérase allonge le nouveau brin dans le sens 5’ vers 3’, et l’ADN-ligase soude les fragments d’Okazaki du brin tardif.

  • La réparation par excision de l’ADN comprend l’élimination de la partie endommagée par des nucléases, le comblement de la brèche par l’ADN-polymérase et la soudure de la cassure par l’ADN-ligase.

Compléments

  • La réplication fait intervenir : une fourche de réplication et un œil de réplication, une hélicase, une ADN-polymérase, une topoisomérase, une ADN-ligase

📌 Les fragments d’Okazaki mesurent 1 500 à 2 000 nucléotides chez les procaryotes et 100 à 200 nucléotides chez les eucaryotes.

4. Transcription et maturation des ARN

Notions clés & Définitions

  • Transcription : Synthèse d’ARN à partir d’un brin matrice d’ADN par une ARN-polymérase, ou transcriptase.

★ À maîtriser

  • Lors de la transcription, l’ARN-polymérase lit le brin matrice dans le sens 3’ vers 5’ et synthétise l’ARN dans le sens 5’ vers 3’, en utilisant l’uracile à la place de la thymine.

  • La maturation de l’ARN pré-messager comprend : l’excision des introns et la soudure des exons, l’ajout d’une coiffe en méthylguanosine en 5’, l’ajout d’une queue poly-A en 3’

  • Les trois catégories d’ARN-polymérases eucaryotes ont les rôles suivants :

    • l’ARN-polymérase I transcrit l’ARNr 45 S
    • l’ARN-polymérase II transcrit l’ARN pré-messager
    • l’ARN-polymérase III transcrit les ARNt, l’ARN 5 S et les petits ARN nucléolaires

Compléments

  • 🔄 La transcription comporte trois étapes :
    1. l’initiation
    2. l’élongation
    3. la terminaison

📌 Chez les procaryotes, un ARNm peut contenir plusieurs gènes et être polycistronique, tandis que l’ARNm eucaryote est présenté comme monocistronique.

📌 Les ribosomes procaryotes sont de 70 S, tandis que les ribosomes eucaryotes sont de 80 S; une sous-unité ribosomique contient 60 % d’ARNr et 40 % de protéines.

Astuce mémo

Initiation → élongation → terminaison

5. Traduction et cycle cellulaire

Notions clés & Définitions

  • Codon : Succession de trois nucléotides de l’ARNm.
  • Anticodon : Groupe de trois nucléotides porté par l’ARNt.

★ À maîtriser

  • Les sites de fixation des ARNt sur le ribosome sont le site A aminoacyl, le site P peptidyl et le site E de sortie.
  • L’initiation de la traduction commence au codon AUG, qui correspond à la méthionine; l’ARNt initiateur porte l’anticodon UAC et se fixe au site P avant l’association de la grande sous-unité ribosomique.
  • Les codons stop de la traduction sont UAA, UAG et UGA.
  • L’interphase comprend les phases G1, S et G2.

📌 En G1, la quantité d’ADN est de 2n et reste stable; en phase S, la réplication la porte à 4n alors que la cellule conserve 2n chromosomes.

Compléments

  • L’élongation de la traduction comprend la formation de liaisons peptidiques entre les acides aminés et la translocation du ribosome.

  • La synthèse protéique nécessite : des ribosomes, des acides aminés, des ARNt, des ARNm, des enzymes telles que les aminoacyl-ARNt synthétases, des ions comme Mg²⁺, de l’énergie fournie par l’ATP et le GTP

  • En G1, un chromosome correspond à un nucléofilament, tandis qu’après la réplication de phase S il comprend deux nucléofilaments accolés au centromère.

  • En G2, la cellule achève sa croissance, synthétise des ARN et des protéines et commence la condensation de la chromatine.

Astuce mémo

G1 → S → G2

6. Mitose et méiose

Notions clés & Définitions

  • Méiose : Succession de deux divisions cellulaires qui produit quatre cellules filles haploïdes à partir d’une cellule mère diploïde.

★ À maîtriser

  • Un chromosome mitotique comprend deux chromatides réunies au centromère, associé au kinétochore auquel se fixent les microtubules kinétochoriens.

  • La prophase I de méiose comprend les stades leptotène, zygotène, pachytène, diplotène et diacinèse; les bivalents apparaissent au zygotène, le crossing-over au pachytène et les chiasmas au diplotène.

  • En anaphase I, les chromosomes homologues se séparent, ce qui réduit de moitié le nombre de chromosomes.

  • À la télophase I, deux cellules filles haploïdes contenant chacune n chromosomes sont formées; l’interphase II ne comporte pas de phase S.

📌 La méiose I est réductionnelle, tandis que la méiose II est équationnelle et correspond à une mitose classique; la méiose aboutit à quatre cellules haploïdes différentes.

Compléments

  • En mitose, la condensation maximale des chromosomes est atteinte en métaphase et implique l’empilement des nucléosomes grâce à l’histone H1.

📐 Formule - L’indice centromérique est le rapport de la longueur du bras court à la longueur totale du chromosome : Ic=longueur du bras courtlongueur totale du chromosomeIc = \frac{\text{longueur du bras court}}{\text{longueur totale du chromosome}}.

  • Les cinq types de chromosomes sont :

    • métacentrique
    • submétacentrique
    • acrocentrique
    • télocentrique
    • punctiforme
  • La régulation du cycle cellulaire dépend de : le rapport nucléo-cytoplasmique, les signaux cytoplasmiques, des facteurs externes comme la température et l’éclairement, des facteurs internes comme les hormones GH et T3, des inhibiteurs comme les rayons X, les UV et la colchicine

Astuce mémo

Méiose I sépare les homologues, méiose II les chromatides

7. Réticulum endoplasmique et Golgi

Notions clés & Définitions

  • Appareil de Golgi : Ensemble des dictyosomes, dont chacun possède une face cis de formation et une face trans de maturation.

★ À maîtriser

  • Le système endomembranaire comprend :
    • l’enveloppe nucléaire
    • le réticulum endoplasmique
    • l’appareil de Golgi
    • les peroxysomes
    • les endosomes et les phagosomes
    • les lysosomes
    • la vacuole végétale

📌 Le réticulum endoplasmique existe sous deux formes : le réticulum endoplasmique rugueux ou granulaire (RER ou REG) et le réticulum endoplasmique lisse (REL).

  • Le réticulum endoplasmique assure trois fonctions principales :
    • le transport, le transit et le tri des molécules
    • la synthèse et la dégradation de composés chimiques
    • l’emmagasinage et la rétention de composés chimiques

📌 La voie cytosolique de circulation des protéines est post-traductionnelle, tandis que la voie du réticulum endoplasmique est co-traductionnelle.

  • Le transfert co-traductionnel dans le REG commence par la traduction et la synthèse d’une séquence signal; la SRP s’y fixe et arrête la synthèse, puis rejoint son récepteur membranaire; après dissociation de la SRP, la synthèse reprend, la peptidase excise le signal et le polypeptide est libéré dans la cavité du RE.

  • Le Golgi assure : le transport sélectif ou sécrétion contrôlée, le transport non sélectif ou sécrétion constitutive, la phosphorylation des protéines lysosomales et leur transfert vers les lysosomes

Compléments

  • Dans le réticulum endoplasmique, la glycosyl-transférase ajoute un groupement glucidique aux résidus asparagine des protéines, formant des glycoprotéines N-liées.

  • La synthèse de testostérone dans les cellules interstitielles de Leydig comprend la synthèse du cholestérol dans le REL, sa transformation en prégnénolone dans les mitochondries et la transformation de la prégnénolone en testostérone dans le REL.

  • L’O-glycosylation golgienne peut ajouter :

    • du galactose
    • de l’acide N-acétylneuraminique
    • de la N-acétylglucosamine

Astuce mémo

RE → face cis → face trans

8. Lysosomes et digestion cellulaire

Notions clés & Définitions

  • Lysosome : Organite contenant des hydrolases et assurant la digestion intracellulaire des substances.

★ À maîtriser

📌 Les lysosomes primaires contiennent uniquement des hydrolases, tandis que les lysosomes secondaires contiennent des hydrolases et les substances à digérer.

📌 La digestion de matériaux extracellulaires est appelée hétérophagie, tandis que la digestion de matériaux intracellulaires est appelée autophagie.

Compléments

  • Les hydrolases lysosomales comprennent :

    • les nucléases
    • les lipases
    • les glucidases
    • les protéases
    • les phosphatases
  • L’hétérophagie implique l’internalisation de matériaux, leur passage par un endosome ou un phagosome, leur digestion dans un endolysosome ou phagolysosome et la formation de vacuoles hétérophagiques et de corps résiduels.

  • 🔄 L’autophagie met en jeu : la prise en charge des structures intracellulaires dans un autophagosome, la formation d’un autophagolysosome, la digestion dans des vacuoles autophagiques

Astuce mémo

Hétérophagie digère l’extracellulaire, autophagie l’intracellulaire

9. Peroxysomes et détoxification

★ À maîtriser

  • Les peroxysomes ne possèdent ni ADN ni ribosomes.

  • Les peroxysomes participent à la détoxification cellulaire, notamment dans le foie et le rein, grâce aux oxydases et aux peroxydases telles que la catalase.

Compléments

  • Les peroxysomes mesurent généralement 0,1 à 1 μm de diamètre et peuvent atteindre 1,7 μm chez les plantes; leur matrice peut contenir un nucléoïde protéique cristallin.

  • Les peroxysomes sont présents dans toutes les cellules eucaryotes sauf les hématies et les réticulocytes.

  • La catalase peroxysomale décompose le peroxyde d’hydrogène par dismutation.

Astuce mémo

Oxydases → H₂O₂ → catalase

10. Chloroplastes et photosynthèse

Notions clés & Définitions

  • Photosynthèse : Processus par lequel le chloroplaste utilise la lumière pour synthétiser des sucres, notamment du glucose.

★ À maîtriser

  • Les principaux plastes se distinguent ainsi : les chloroplastes contiennent de la chlorophylle, les chromoplastes contiennent des caroténoïdes, les leucoplastes sont sans pigments et comprennent les amyloplastes, les protéoplastes et les oléoplastes

  • Un chloroplaste mesure 3 à 10 μm de diamètre et comprend une double membrane, un stroma et des thylakoïdes organisés en grana et lamelles intergranaires.

  • L’équation globale de la photosynthèse est 6CO2+12H2O→lumieˋreC6H12O6+6O2+6H2O6CO_2 + 12H_2O \xrightarrow{\text{lumière}} C_6H_{12}O_6 + 6O_2 + 6H_2O.

📌 La phase lumineuse de la photosynthèse nécessite la lumière, tandis que la phase obscure est présentée comme ne nécessitant pas la lumière.

  • La phase lumineuse se déroule dans les membranes thylakoïdiennes, met en jeu les photosystèmes I et II et la photolyse de l’eau, et produit de l’ATP et du NADPH.

Compléments

  • Le chloroplaste contient de l’amidon, des ribosomes et de l’ADN et constitue un organite semi-autonome.

  • La phase obscure fixe le CO₂ dans le stroma par le cycle de Calvin, avec notamment le ribulose 1,5-diphosphate et le glycéraldéhyde 3-phosphate, et conduit à la production de glucose.

11. Mitochondries et respiration cellulaire

★ À maîtriser

  • Une mitochondrie mesure environ 10 μm de long et 0,5 à 1 μm de diamètre et comprend deux membranes, un espace intermembranaire, des crêtes et une matrice.

  • Les mitochondries contiennent de l’ADN, de l’ARN et des ribosomes et sont des organites semi-autonomes.

  • La membrane interne porte les enzymes de la chaîne respiratoire suivantes :

    • NADH déshydrogénase
    • FADH₂ déshydrogénase
    • cytochrome C réductase
    • cytochrome oxydase
    • l’ATP-synthétase du complexe Fo-F1

📐 Formule - L’équation globale de la respiration cellulaire est C6H12O6+6O2→6CO2+6H2O+ATPC_6H_{12}O_6 + 6O_2 \rightarrow 6CO_2 + 6H_2O + ATP.

  • 🔄 La respiration cellulaire aérobie comprend trois étapes :
    1. la glycolyse
    2. le cycle de Krebs
    3. la chaîne de transport des électrons et la phosphorylation oxydative

Compléments

  • La membrane externe mitochondriale porte des porines qui permettent des échanges entre l’espace intermembranaire et le cytoplasme.

  • La concentration en ions H⁺ est plus élevée dans l’espace intermembranaire mitochondrial que dans la matrice.

  • Les mitochondries importent :

    • des cations
    • des anions
    • des acides aminés
    • des acides gras
    • de l’ADP
  • Les mitochondries synthétisent leur ADN, leur ARN et des protéines mitochondriales, notamment des enzymes de la chaîne respiratoire.

Astuce mémo

Glycolyse → Krebs → chaîne respiratoire

Tableaux de synthèse

Comparaison de la réplication et de la transcription

ProcessusMatriceProduit
RéplicationLes deux brins d’ADNADN complémentaire
TranscriptionUn brin matrice d’ADNARN

Comparaison des phases photosynthétiques

PhaseLieuRôle ou produit
Phase lumineuseMembranes des thylakoïdesUtilise la lumière et produit ATP et NADPH
Phase obscureStromaFixe le CO₂ par le cycle de Calvin et conduit au glucose

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1. Comment se définit un organite dans la cellule ?

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Selon quelle source et quelle année la définition d’un organite est-elle donnée ?

Maugras, *Dictionnaire de biologie cellulaire*, 1996.

Quelles fonctions la cellule manifeste-t-elle ?

L’assimilation, la croissance, l’excrétion, la respiration et la reproduction.

Que contient principalement le noyau, organite majeur de la vie cellulaire ?

La presque totalité de l’ADN cellulaire.

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