Flashcards : Peptides et protéines — 68 cartes

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1Question

Qu'est-ce qu'un peptide ?

Réponse

Une chaîne d'acides aminés liés par des liaisons peptidiques.

2Question

Qu'est-ce qui détermine la séquence des acides aminés d'une protéine ?

Réponse

L'information génétique contenue dans les gènes.

3Question

Quelle forme ont généralement les protéines globulaires ?

Réponse

Une forme compacte.

4Question

Quelle forme ont généralement les protéines fibreuses ?

Réponse

Une forme allongée et organisée.

5Question

Qu'est-ce qu'une liaison peptidique ?

Réponse

Une liaison covalente amide entre un carboxyle et une amine avec élimination d'eau.

6Question

Quelle est la formule chimique de la formation d'une liaison peptidique ?

Réponse

COOH+NH2→CO−NH+H2O\mathrm{COOH + NH_2 \rightarrow CO-NH + H_2O}

7Question

À quoi correspond l'angle φ dans une chaîne peptidique ?

Réponse

À la rotation autour de la liaison Cα–N.

8Question

À quoi correspond l'angle ψ dans une chaîne peptidique ?

Réponse

À la rotation autour de la liaison Cα–C du groupement carboxyle.

9Question

Qu'est-ce que la structure primaire d'une chaîne polypeptidique ?

Réponse

L'enchaînement linéaire et covalent des acides aminés dans l'ordre génomique.

10Question

Quelle taille distingue un oligopeptide d'un polypeptide ?

Réponse

Un oligopeptide comporte moins de 25 acides aminés.

11Question

Quelle taille distingue un polypeptide d'une protéine ?

Réponse

Une protéine comporte plus de 100 acides aminés.

12Question

Quelle est la séquence du glutathion ?

Réponse

γGlu–Cys–Gly.

13Question

Quel rôle joue le glutathion dans la cellule ?

Réponse

Il agit comme agent réducteur en maintenant les fonctions thiol réduites.

14Question

Quelle est la structure du glucagon ?

Réponse

Un peptide monocaténaire et linéaire de 29 acides aminés.

15Question

Combien de chaînes et d'acides aminés comporte l'insuline ?

Réponse

Deux chaînes de 21 et 30 acides aminés respectivement.

16Question

Qu'est-ce que la structure secondaire d'une protéine ?

Réponse

Une organisation spatiale locale stabilisée par des liaisons hydrogène.

17Question

Quelles sont les principales structures secondaires des protéines ?

Réponse

L’hélice α, le feuillet β, le coude β et la pelote statistique.

18Question

Par quoi l’hélice α est-elle stabilisée ?

Réponse

Par des liaisons hydrogène intrachaîne.

19Question

Combien de résidus comporte un tour d’hélice α ?

Réponse

Environ 3,6 résidus par tour.

20Question

Quel rôle joue le coude β dans la chaîne polypeptidique ?

Réponse

Il permet à la chaîne de changer de direction.

21Question

Combien de résidus sont nécessaires pour former un coude β ?

Réponse

Au moins quatre résidus.

22Question

Qu'est-ce que la structure tertiaire d'une protéine ?

Réponse

Le repliement global d'une chaîne polypeptidique sur elle-même.

23Question

Quels types de liaisons stabilisent la structure tertiaire ?

Réponse

Des liaisons hydrogène, interactions ioniques, hydrophobes et ponts disulfure.

24Question

Quelle réaction forme un pont disulfure entre deux cystéines ?

Réponse

Cys-SH + HS-Cys 11Cys-S-S-Cys.

25Question

Que désigne la structure quaternaire d'une protéine ?

Réponse

L'association de plusieurs chaînes polypeptidiques avec chacune une structure tertiaire.

26Question

Combien de sous-unités possède l'hémoglobine adulte normale ?

Réponse

Quatre sous-unités.

27Question

Quelles chaînes composent l'hémoglobine adulte normale ?

Réponse

Deux chaînes α et deux chaînes non-α.

28Question

Quel type d'oligomère est l'hémoglobine adulte normale ?

Réponse

Un hétérotétramère.

29Question

Comment s'organisent les kératines en structures successives?

Réponse

Les kératines s'organisent en deux hélices α, une superhélice, une protofibrille puis une microfibrille.

30Question

Quelles sont les caractéristiques des kératines en tant que protéines fibreuses?

Réponse

Les kératines sont des protéines fibreuses à hélices α, présentes dans cheveux et ongles, stabilisées par des ponts disulfure.

31Question

Quelle est la taille approximative du collagène en nombre de résidus?

Réponse

Le collagène possède environ 1000 résidus.

32Question

Quel motif répétitif caractérise la séquence du collagène?

Réponse

Le collagène présente un motif répété Gly–X–Y.

33Question

Quels acides aminés sont abondants dans le collagène?

Réponse

Le collagène contient beaucoup de proline et d’hydroxyproline.

34Question

Le collagène contient-il de la cystéine?

Réponse

Le collagène ne contient pas de cystéine.

35Question

Quelle est la structure principale de la fibroïne?

Réponse

La fibroïne est principalement organisée en feuillets β.

36Question

Quels acides aminés sont fréquents dans la fibroïne?

Réponse

La fibroïne est riche en glycine associée à la valine ou à la sérine.

37Question

Où se trouvent les acides aminés hydrophiles dans une protéine globulaire en milieu aqueux ?

Réponse

Ils sont principalement en surface.

38Question

Où se trouvent les acides aminés hydrophobes dans une protéine globulaire en milieu aqueux ?

Réponse

Ils sont principalement à l’intérieur.

39Question

Quels acides aminés sont cités comme hydrophiles dans le cours ?

Réponse

Asp, Asn et Glu.

40Question

Quels acides aminés sont cités comme hydrophobes dans le cours ?

Réponse

Phe, Trp et Leu.

41Question

Quels acides aminés sont cités comme amphiphiles dans le cours ?

Réponse

Pro, Thr et Ser.

42Question

Combien d’acides aminés contient la myoglobine ?

Réponse

153 acides aminés.

43Question

Quelle est la proportion d’hélices α dans la myoglobine ?

Réponse

Environ 75 % de la structure est en hélice α.

44Question

Quelle est la structure quaternaire de la glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase ?

Réponse

C’est un homotétramère.

45Question

Qu'est-ce que la maturation post-traductionnelle ?

Réponse

C'est l'ensemble des étapes rendant une chaîne polypeptidique fonctionnelle.

46Question

Quelle différence existe-t-il entre glycosylation et glycation ?

Réponse

La glycosylation est enzymatique, la glycation est non enzymatique.

47Question

Quel acide aminé est concerné par la N-glycosylation ?

Réponse

L'asparagine est concernée par la N-glycosylation.

48Question

Où a lieu la O-glycosylation dans la cellule ?

Réponse

La O-glycosylation a lieu dans l'appareil de Golgi.

49Question

Que reflète la fraction HbA1c de l'hémoglobine glyquée ?

Réponse

Elle reflète la glycémie moyenne sur environ trois mois.

50Question

Quelle est la valeur attendue de la fraction HbA1c ?

Réponse

La valeur attendue est de 4–6 %.

51Question

Quelle est la succession des formes pour obtenir l'insuline mature ?

Réponse

Pré-pro-insuline, pro-insuline, puis insuline.

52Question

Quelle étape suit l'élimination du peptide signal dans la maturation de l'insuline ?

Réponse

Les clivages successifs produisent l'insuline mature.

53Question

Qu'est-ce que la dénaturation d'une protéine ?

Réponse

La perte de l’organisation tridimensionnelle due à la perturbation des interactions de repliement.

54Question

Quels sont les principaux facteurs dénaturants des protéines ?

Réponse

La température élevée, pH extrêmes, forte concentration ionique, solvants apolaires et certaines substances chimiques.

55Question

Quel effet a l’urée à 8 M sur les protéines ?

Réponse

Elle perturbe les interactions non covalentes.

56Question

Quel est le rôle du 2-mercaptoéthanol à 1 mM dans la dénaturation ?

Réponse

Il rompt les ponts disulfure.

57Question

Quelles méthodes de dosage des protéines sont présentées ?

Réponse

Absorption UV, colorimétrie visible, Biuret, Lowry et Bradford.

58Question

Quelle coloration produit la méthode de Biuret et à quelle longueur d'onde ?

Réponse

Une coloration violette mesurée à 540 nm.

59Question

Quelle est la particularité de la méthode de Lowry ?

Réponse

Elle combine Biuret et Folin-Ciocalteu pour une coloration bleue à 691 nm.

60Question

Quel colorant utilise la méthode de Bradford et quelle est sa gamme de dosage ?

Réponse

Le bleu de Coomassie G250 en milieu acide, pour 1–5 µg.

61Question

Qu'est-ce qu'une enzyme ?

Réponse

Une enzyme est une protéine catalysant une réaction chimique biologiquement spécifique.

62Question

Quelle différence entre endopeptidases et exopeptidases ?

Réponse

Les endopeptidases coupent à l'intérieur, les exopeptidases aux extrémités.

63Question

Quels acides aminés la trypsine reconnaît-elle préférentiellement ?

Réponse

La trypsine reconnaît la lysine et l’arginine.

64Question

Quels acides aminés la pepsine et la chymotrypsine reconnaissent-elles ?

Réponse

Elles reconnaissent notamment des acides aminés aromatiques.

65Question

Sur quelle extrémité agissent les aminopeptidases ?

Réponse

Les aminopeptidases agissent sur l’extrémité N-terminale.

66Question

Sur quelle extrémité agissent les carboxypeptidases ?

Réponse

Les carboxypeptidases agissent sur l’extrémité C-terminale.

67Question

Sur quels acides aminés agit la carboxypeptidase A ?

Réponse

Elle agit sur les acides aminés aromatiques et aliphatiques.

68Question

Quels acides aminés la carboxypeptidase B cible-t-elle ?

Réponse

Elle cible les acides aminés basiques.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 27 questions sur Peptides et protéines.

1. Quelle définition décrit correctement un peptide ?

2. Quelle origine détermine principalement la séquence des acides aminés d’une protéine ?

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