Quelles zones couvre l'océan ouvert ?
Les zones au-delà des plateaux continentaux, notamment les gyres subtropicaux.
Quelle proportion de la surface terrestre couvre l'océan ouvert ?
Environ 40 % de la surface de la planète.
Quelles sont les caractéristiques principales de l'océan ouvert ?
Stratification thermique et nutritive, oligotrophie, production fondée sur le picoplancton, production régénérée à 90 %.
Quel type de production domine dans l'océan ouvert ?
La production régénérée représente 90 %.
Quels sont les principaux organismes phytoplanctoniques de l'océan ouvert ?
Prochlorococcus, Synechococcus et les picoeucaryotes.
Quels groupes composent le bactérioplancton de l'océan ouvert ?
SAR11, Archées, Roseobacter, SAR86 et Flavobacteriia.
Que sont les photohétérotrophes selon Suzuki et Beja (2008) ?
Ce sont des microorganismes utilisant la lumière pour l'énergie et des composés organiques pour le carbone.
Quelle est la différence principale entre photoautotrophes et photohétérotrophes ?
Les photoautotrophes synthétisent leur biomasse à partir de molécules inorganiques, les photohétérotrophes à partir de molécules organiques.
Que produisent les phototrophes oxygéniques ?
Ils produisent du dioxygène moléculaire.
Les phototrophes anoxygéniques produisent-ils du dioxygène ?
Non, ils n’en produisent pas.
Où vivent les phototrophes anoxygéniques anaérobies ?
Ils vivent dans des environnements anoxiques.
Que produisent les phototrophes anoxygéniques anaérobies à partir du CO2 ?
Ils produisent leur biomasse à partir du CO2.
Où vivent les phototrophes anoxygéniques aérobies ?
Ils vivent dans des environnements oxiques.
Les phototrophes anoxygéniques aérobies produisent-ils beaucoup de biomasse à partir du CO2 ?
Non, ils n’en produisent pas de quantités significatives.
Quels sont les trois grands types de photohétérotrophes ?
Les cyanobactéries, les microorganismes à protéorhodopsines et les phototrophes aérobies anoxygéniques.
Quels genres de cyanobactéries contiennent des chlorophylles ?
Synechococcus et Prochlorococcus.
Quelle est la majorité du mode nutritionnel des cyanobactéries Synechococcus et Prochlorococcus ?
Ils sont majoritairement photoautotrophes.
Que permettent les réactions anaplérotiques du cycle des acides tricarboxyliques chez les phototrophes aérobies anoxygéniques ?
D’incorporer du CO2.
Quelles sources réduites utilisent Synechococcus et Prochlorococcus ?
Ils utilisent le DMSP comme source réduite de soufre et l’urée comme source réduite d’azote.
Que montre l’absorption de DMSP malgré la disponibilité de sulfate ?
Les cyanobactéries absorbent le DMSP même avec beaucoup de sulfate disponible.
Quels composés Prochlorococcus et Synechococcus peuvent-ils absorber ?
Ils peuvent absorber des nucléosides et des acides aminés.
Que nécessite l’absorption de leucine et thymidine par des autotrophes ?
Il faut mesurer la production bactérienne hétérotrophe dans l’obscurité.
Qui a découvert les protéorhodopsines en 2000 ?
Beja et al.
Où ont été découvertes les protéorhodopsines par Beja et al. ?
Dans une banque génomique BAC de la baie de Monterey.
Qu'est-ce qui influence les réponses métaboliques chez Dokdonia ?
L'état global de stress des cellules.
Quelle exception existe dans les réponses métaboliques de Dokdonia ?
Certaines réponses dépendent d'une limitation en substrat.
Quel rôle joue la protéorhodopsine chez Vibrio AND4 ?
Elle favorise la survie pendant la privation.
Dans quel stress la protéorhodopsine intervient-elle chez Psychroflexus torquis ?
Lors d'un stress salin.
Comment les protéorhodopsines modifient-elles les rendements chez P. angustum ?
Selon le cycle jour-nuit quand les conditions sont non optimales.
Qu'est-ce que l'homologie indique en biologie évolutive ?
Une origine évolutive commune.
Que mesure la similarité entre deux séquences ?
Le degré de correspondance entre elles.
Quelle différence principale existe entre un alignement local et global ?
L'alignement local compare une région, le global compare la totalité.
À quoi servent les alignements en biologie moléculaire ?
À prédire la fonction, la structure et la phylogénie.
Que suggère un alignement pairwise entre gènes ou protéines ?
Une parenté indiquant une homologie et des motifs communs.
Que font les matrices de score dans l'alignement de séquences ?
Elles attribuent des valeurs liées à la probabilité de changements entre acides aminés ou nucléotides.
Comment obtient-on le score global d'un alignement avec une matrice de score ?
En sommant les scores individuels des correspondances.
Quel score reçoit une correspondance dans l'exemple blastn ?
+5.
Quel score reçoit une non-correspondance dans l'exemple blastn ?
−4.
Quelle méthode BLAST utilise-t-il pour rechercher rapidement des séquences ?
Une approche heuristique.
Quelles étapes BLAST réalise-t-il après avoir identifié des correspondances candidates ?
Il produit des alignements locaux et les évalue.
Pourquoi les séquences protéiques sont-elles plus informatives que l'ADN pour l'alignement ?
À cause de la dégénérescence du troisième codon, appelée wobble.
Teste tes connaissances avec un QCM de 17 questions sur Photohétérotrophes et alignements.
1. Quelles zones correspondent à l’océan ouvert ?
2. Quelle caractéristique décrit correctement la production dans l’océan ouvert oligotrophe ?
Révisez le cours complet dans la fiche de révision de Photohétérotrophes et alignements.
Voir la fiche →Importe ton cours et l'IA génère des flashcards en 30 secondes.
Générateur de flashcards