Qu'est-ce que la transcription en biologie moléculaire ?
La production d’un ARN à partir d’un ADN lu par l’ARN polymérase.
Quelle différence existe-t-il entre gènes codants et non codants ?
Les gènes codants produisent des ARN codants, les non codants produisent des ARN non codants.
Quels ARN sont principalement produits par les gènes codants ?
Les ARNm sont principalement produits par les gènes codants.
Quelle proportion du génome bactérien code pour des protéines ?
Environ 80 % du génome bactérien code pour des protéines.
Quelle fraction du génome humain est transcrite ?
Environ 75 % du génome humain est transcrit.
Quelle proportion du génome humain correspond à des ARNm traduits ?
Seulement 8 % de la fraction transcrite correspond à des ARNm traduits.
Qu'est-ce que la différenciation cellulaire ?
La formation de différents types cellulaires à partir d’un même génome par expression de gènes différents.
Quelles sont les étapes du Northern blot ?
Extraction des ARN, séparation par électrophorèse, transfert sur membrane, hybridation avec sonde d’ADN.
Que révèle l’intensité du signal dans un Northern blot ?
Elle est proportionnelle à la quantité d’ARN.
Que renseigne la taille des bandes dans un Northern blot ?
La taille des transcrits.
Quel est le rôle d’un gène rapporteur ?
Étudier l’activité d’un promoteur en fusionnant un gène codant une enzyme quantifiable.
Citez une enzyme codée par un gène rapporteur utilisée pour la quantification.
La luciférase.
Quelles sont les principales méthodes directes pour mesurer la quantité d’ARN ?
RT-qPCR, puces à ADN et séquençage de deuxième génération.
Qu'est-ce qu'un régulon selon Jacob, Monod et Lwoff ?
Un régulon est un ensemble formé par un gène de structure et ses régulateurs cis et trans.
Quelle différence distingue un facteur cis d'un facteur trans ?
Un facteur cis est une séquence d’ADN liée au gène, un facteur trans est une protéine diffusible non liée.
Qu'est-ce qu'un opéron bactérien ?
Un opéron regroupe plusieurs gènes contrôlés par un même promoteur et transcrits en un seul transcrit.
Quels enzymes codent les gènes lacZ, lacY et lacA dans l’opéron lactose ?
Ils codent respectivement une β-galactosidase, une perméase et une acétyltransférase.
Que fait LacI en absence de lactose ?
LacI se fixe sur l’opérateur et réprime la transcription.
Qu'impose la fixation de l’allolactose sur LacI ?
Elle inactive LacI et permet la transcription des gènes.
Comment l’opéron lactose utilise-t-il le lactose ?
Par perméase, isomérisation en allolactose, puis dégradation.
Que fait l’AMPc en absence de glucose ?
Il active CAP qui facilite le recrutement de l’ARN polymérase.
Comment la bactérie consomme-t-elle glucose et lactose en diauxie ?
Elle consomme d’abord le glucose puis le lactose après épuisement.
Qu'est-ce que l'unité de transcription en biologie moléculaire ?
C'est la région d'ADN parcourue continûment par l'ARN polymérase du promoteur à la terminaison.
Que désigne la CDS dans la transcription de l'ADN ?
La partie codante de l'ADN transcrit traduite en protéine.
Par quel codon commence la CDS ?
Par un codon AUG.
Par quel codon se termine la CDS ?
Par un codon STOP.
Quelle différence y a-t-il entre eucaryotes et bactéries concernant exons et introns ?
Chez les eucaryotes, les exons sont réunis après suppression des introns.
Comment se déroulent transcription et traduction chez les bactéries ?
Elles sont simultanées.
Quels ARN l'ARN polymérase bactérienne transcrit-elle ?
Les ARNm, ARNr, ARNt et quelques autres ARN.
Quelle est la composition en sous-unités de l'ARN polymérase bactérienne ?
Elle est constituée de cinq sous-unités selon la structure α2ββ’ω.
Quelles sous-unités de l'ARN polymérase bactérienne sont catalytiques ?
Les sous-unités β et β’ sont catalytiques.
Quelles sous-unités de l'ARN polymérase bactérienne sont stabilisatrices ?
Les sous-unités α et ω sont stabilisatrices.
Quel ARN transcrit l'ARN polymérase I ?
Elle transcrit l'ARNr 45S.
Quels ARN transcrit l'ARN polymérase II ?
Elle transcrit les ARNm.
Quels ARN transcrit l'ARN polymérase III ?
Elle transcrit notamment les ARNt et l'ARNr 5S.
Quelle est la réaction chimique de la transcription ajoutant un ribonucléotide ?
Dans quel sens l'ARN polymérase lit-elle le brin matrice et synthétise-t-elle l'ARN ?
Elle lit le brin matrice de 3’ vers 5’ et synthétise l’ARN de 5’ vers 3’.
Quelle séquence consensus se trouve en position -10 du promoteur procaryote ?
La boîte TATA consensus TATAAT.
Quelle séquence consensus se trouve en position -35 du promoteur procaryote ?
L'élément consensus TTGACA.
Quelle est la distance entre la boîte TATA et l'élément -35 dans un promoteur procaryote ?
16 à 19 paires de bases.
Qu'est-ce que le facteur sigma chez les bactéries ?
Une sous-unité de l'ARN polymérase qui reconnaît la boîte TATA et l'élément -35.
Quel effet la liaison du facteur sigma a-t-elle sur l'affinité de l'ARN polymérase pour l'ADN ?
Elle diminue l'affinité globale.
Quel effet la liaison du facteur sigma a-t-elle sur la spécificité de l'ARN polymérase ?
Elle augmente la spécificité pour les séquences promotrices.
Quel est le facteur sigma général le plus courant chez les bactéries ?
Sigma70.
Quel facteur sigma bactérien répond au choc thermique ?
Sigma32.
Qu'est-ce que le complexe de pré-initiation (PIC) ?
Un complexe formé au promoteur basal par les facteurs généraux de transcription.
Quels facteurs généraux composent le PIC pour l'ARN polymérase II ?
TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF et TFIIH.
De quoi est constitué TFIID ?
De TBP et de TAF.
Quelle est la première étape de l'assemblage du PIC ?
La reconnaissance de la boîte TATA par TBP.
Quel facteur stabilise le PIC après TBP ?
TFIIA et TFIIB stabilisent le PIC.
Quel facteur recrute l'ARN polymérase II associée à TFIIF ?
Le PIC après stabilisation par TFIIA et TFIIB.
Quel est le rôle de TFIIE et TFIIH dans l'assemblage du PIC ?
Ils interviennent après le recrutement de l'ARN polymérase II.
Quel effet a la phosphorylation du CTD par TFIIH ?
Elle accumule des charges négatives et déclenche l'échappement au promoteur.
Quelle est la différence entre éléments cis proximaux et distaux ?
Les éléments cis proximaux sont proches du gène, les distaux sont éloignés.
Quels éléments cis distaux correspondent aux enhancers et silencers ?
Les éléments cis distaux incluent les enhancers et les silencers.
Qu'impose un enhancer sur la transcription ?
Un enhancer fixe une protéine activatrice qui augmente la transcription.
Quel effet a un silencer sur l'expression génique ?
Un silencer fixe une protéine répressive qui réduit l'expression du gène.
Avec quoi interagissent les facteurs de régulation de la transcription ?
Ils interagissent avec l'ARN polymérase, le médiateur et les séquences cis.
Quel est le rôle des facteurs de régulation sur le PIC ?
Ils modulent la stabilité du PIC et le recrutement de l'ARN polymérase.
Comment les co-régulateurs modifient-ils la chromatine ?
Ils modifient la chromatine par modification des histones et méthylation de l'ADN.
Quelle est la taille du motif hélice-tour-hélice ?
Il mesure 60 acides aminés.
Comment le motif doigt de zinc eucaryote fixe-t-il l'ion Zn2+ ?
Par quatre cystéines ou deux cystéines et deux histidines.
Sous quelle forme fonctionnent souvent les FRT ?
Sous forme d’homodimères ou d’hétérodimères.
Quels motifs permettent la dimérisation des FRT ?
Le leucine zipper et l’hélice-boucle-hélice.
Qu'impose la liaison d’un messager secondaire aux FRT ?
L’activation des FRT.
Quelle différence principale existe entre euchromatine et hétérochromatine ?
L’euchromatine est décondensée et accessible, l’hétérochromatine est condensée et inactive.
Quel effet ont les HAT sur la transcription ?
Ils activent la transcription par acétylation des histones.
Quel effet ont les HDAC sur la transcription ?
Ils inhibent la transcription par désacétylation des histones.
Quel est l'effet principal de la rifampicine sur les bactéries ?
Elle inhibe l'ARN polymérase bactérienne.
Quel effet antimicrobien possède la rifampicine ?
Elle a un effet antimycobactérien.
Quelle est la nature de l'actinomycine D et son origine ?
C'est un agent intercalant de l'ADN produit par Streptomyces.
Quel est le spectre d'action de l'actinomycine D sur les ARN polymérases ?
Elle inhibe toutes les ARN polymérases.
À quoi sert l'actinomycine D en médecine ?
Elle est utilisée comme anticancéreux.
Quels cibles différencient les inhibiteurs anticancéreux de ceux ciblant l'ARN polymérase I ?
Les anticancéreux ciblent l'ARN polymérase II, les facteurs de transcription, le PIC ou le médiateur, tandis que l'ARN polymérase I est ciblée pour ralentir la biosynthèse des ribosomes.
Quel est l'effet des inhibiteurs ciblant l'ARN polymérase I ?
Ils ralentissent la biosynthèse des ribosomes et la traduction.
Quelles sont les trois étapes communes du cycle de la transcription ?
L'initiation, l'élongation et la terminaison.
Teste tes connaissances avec un QCM de 37 questions sur Régulation de la transcription.
1. Quel processus produit un ARN à partir d’un ADN lu par l’ARN polymérase ?
2. Quelle distinction décrit correctement les gènes codants et les gènes non codants ?
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