Quel sucre caractérise l’ARN par rapport à l’ADN ?
Le ribose.
Quelle base l’uracile remplace-t-il dans l’ARN ?
La thymine.
Dans quel sens l’ARN est-il synthétisé et représenté ?
Dans le sens 5’ vers 3’.
Que désigne la structure primaire de l’ARN ?
Sa séquence de nucléotides.
Qu’est-ce que la transcription ?
La synthèse d’un ARN à partir d’une matrice d’ADN.
Comment appelle-t-on l’ARN produit par transcription ?
Le transcrit.
À quel brin d’ADN l’ARN transcrit est-il identique, à l’uracile près ?
Au brin codant.
À quel brin d’ADN l’ARN transcrit est-il complémentaire ?
Au brin matrice.
Quelles sont les trois étapes de la transcription ?
Initiation, élongation et terminaison.
Dans quel compartiment se déroulent transcription et traduction chez les procaryotes ?
Dans un compartiment commun.
Quel rôle les ARN polymérases jouent-elles dans la transcription ?
Elles catalysent la formation des liaisons phosphodiester entre les nucléotides de l’ARN.
Quels nucléosides triphosphates l’ARN polymérase utilise-t-elle pour synthétiser l’ARN ?
L’ATP, le CTP, l’UTP et le GTP.
Combien d’ARN polymérases les procaryotes possèdent-ils ?
Une seule.
Quelles sous-unités composent l’ARN polymérase bactérienne ?
Une sous-unité β, une β’, deux α et une ω.
Quelle sous-unité transforme le cœur enzymatique bactérien en holoenzyme ?
La sous-unité sigma.
Quel rôle joue la sous-unité sigma dans l’initiation de la transcription ?
Elle s’associe réversiblement au cœur enzymatique pour former l’holoenzyme.
Quel rôle joue le facteur sigma principal dans la transcription ?
Il dirige la majorité de la transcription.
Vers quoi les facteurs sigma alternatifs dirigent-ils l’holoenzyme ?
Vers des sous-ensembles spécialisés de promoteurs.
Combien de facteurs sigma possède Escherichia coli ?
Sept facteurs sigma.
Quels sont les facteurs sigma d’Escherichia coli et leurs noms Rpo ?
σ70 (RpoD), σ54 (RpoN), σ38 (RpoS), σ32 (RpoH), σ28 (FliA), σ24 (RpoE) et σ19 (FecI).
Quelles étapes composent le cycle bactérien de transcription ?
Fixation au promoteur, formation des complexes fermé, intermédiaire et ouvert, initiation, libération du promoteur, élongation, terminaison et dissociation.
Où commence la transcription bactérienne et quel rôle joue le promoteur ?
Elle commence au site +1 ; le promoteur, en amont et non transcrit, signale l’initiation.
À quelles positions se trouvent les deux régions conservées des promoteurs procaryotes ?
Les régions −35 et −10 se situent respectivement à environ 35 et 10 paires de bases en amont du site +1.
Comment la proximité d’un promoteur procaryote aux séquences consensus influe-t-elle sur son efficacité ?
Un promoteur proche des séquences consensus est généralement fort et efficace ; un promoteur éloigné est faible et peu efficace.
Quelles fonctions associe-t-on aux facteurs sigma RpoD, RpoS, RpoH, RpoE, FliA, FecI et RpoN ?
RpoD est général ; RpoS répond au stress et à la phase stationnaire ; RpoH au stress thermique ; RpoE au stress extracellulaire ; FliA aux flagelles ; FecI au fer ; RpoN à l’azote.
Quelles caractéristiques des éléments UP renforcent l’interaction entre l’ARN polymérase et l’ADN ?
Ils sont en amont de la région −35, riches en A/T et reconnus par αCTD.
Quel rôle les facteurs sigma jouent-ils chez les bactéries ?
Ils guident l’ARN polymérase vers les promoteurs.
Quelles sont les étapes de l’initiation de la transcription ?
Complexe fermé, complexe ouvert, synthèse d’ARN, départ du facteur sigma et élongation.
Pendant l’élongation, à combien de nucléotides l’extrémité 3′ de l’ARN naissant s’apparie-t-elle au brin matrice ?
Environ 7 à 8 nucléotides.
Pendant l’élongation, où passe l’extrémité 5′ de l’ARN naissant ?
Dans le canal de sortie de l’ARN polymérase.
Quelle longueur le canal de sortie de l’ARN polymérase couvre-t-il environ ?
Environ 7 nucléotides.
Que provoque l’incorporation d’un nucléotide incorrect pendant l’élongation ?
Une pause de l’élongation.
Quelle activité l’incorporation d’un nucléotide incorrect active-t-elle ?
L’activité nucléase de l’ARN polymérase.
Combien de nucléotides GreA clive-t-elle généralement ?
Deux à trois nucléotides.
Quelles sont les deux formes de terminaison de la transcription bactérienne ?
La terminaison intrinsèque et la terminaison dépendante de Rho.
Quelle structure précède la série de U lors de la terminaison intrinsèque ?
Une tige-boucle riche en G et C dans l’ARN.
Que provoque la pause de l’ARN polymérase lors de la terminaison intrinsèque ?
La déstabilisation du complexe de transcription, puis l’arrêt de la transcription.
Combien de sous-unités identiques composent la protéine Rho ?
Six sous-unités disposées en anneau.
Quelle est la longueur et la composition du site rut reconnu par Rho ?
Une région simple brin de l’ARN de 40 à 60 nucléotides, riche en C.
Comment Rho rejoint-elle l’ARN polymérase lors de la terminaison dépendante de Rho ?
Elle progresse le long de l’ARN grâce à l’hydrolyse de l’ATP.
Qu’est-ce qu’un gène ?
Une région d’ADN portant l’information nécessaire à la synthèse d’un ARN ou d’une protéine.
Qu’est-ce qu’un opéron ?
Une région d’ADN transcrite en un seul ARNm contenant l’information nécessaire à la synthèse de plusieurs protéines.
Quelles informations le Northern-blot fournit-il sur un ARN détecté ?
Sa taille et une estimation de sa quantité.
Quel élément marqué sert à cartographier le site +1 par nucléase S1 ?
Un fragment d’ADN couvrant le site.
Quel signal du fragment marqué positionne le site +1 avec la nucléase S1 ?
Sa diminution de taille après digestion.
Quels couples de bases s’apparient dans l’ARN ?
A-U et G-C.
Qu’est-ce qu’une liaison phosphodiester ?
Un pont phosphate entre les carbones 3’ et 5’ de sucres adjacents.
Quels rôles les ARN non codants repliés peuvent-ils exercer ?
Des rôles structurels ou catalytiques.
Quelle proportion des ARN cellulaires les ARN messagers représentent-ils ?
Environ 5 %.
Où commence et où s’arrête la transcription, selon le modèle présenté ?
Elle commence au promoteur et s’arrête au terminateur.
Chez certains gènes, quel est le produit final plutôt qu’une protéine ?
Un ARN fonctionnel.
Dans quel sens l’ARN polymérase se déplace-t-elle sur le brin matrice ?
Dans le sens 3’ vers 5’.
Combien de transcrits un seul gène peut-il produire en une heure ?
Plusieurs milliers.
Combien d’erreurs l’ARN polymérase commet-elle par nucléotide copié ?
Environ une erreur pour nucléotides copiés.
Quelles bases l’ARN polymérase peut-elle exciser après avoir reculé ?
Le ribonucléotide incorrect et plusieurs bases correctes.
À quelle vitesse Escherichia coli synthétise-t-elle les ARN messagers ?
50 nucléotides par seconde.
Combien de résidus compte la sous-unité β de l’ARN polymérase d’Escherichia coli ?
1342 résidus.
À quoi participent les sous-unités α de l’ARN polymérase bactérienne ?
À la dimérisation, à l’assemblage avec β et β’, et à la fixation à l’ADN au niveau de la séquence UP.
Combien de facteurs sigma possède Mycoplasma genitalium ?
Un facteur sigma.
Quelle est la masse du facteur sigma σ70, ou RpoD, d’Escherichia coli ?
70 kDa.
À quelles fonctions spécialisées les facteurs sigma alternatifs sont-ils associés ?
Au stress, à la température, aux flagelles, au fer ou à l’azote.
Quelles séquences consensus caractérisent les régions −35 et −10 du promoteur bactérien σ70 ?
TTGACA caractérise la région −35 et TATAAT la région −10.
Quel est le degré de perfection des éléments consensus dans les promoteurs naturels ?
Aucun promoteur naturel ne contient tous les éléments consensus parfaits.
Pendant quelle phase la sous-unité σ70 est-elle principalement produite ?
Pendant la phase exponentielle de croissance.
Combien d’orientations permettent les séquences asymétriques des promoteurs bactériens et eucaryotes ?
Une seule orientation de fixation de l’ARN polymérase.
Dans le complexe ouvert, où les brins d’ADN se séparent-ils ?
Sur la région d’environ −12 à +3, qui inclut la région −10.
Quelle est la longueur habituelle des transcrits abortifs produits avant l’élongation ?
De 2 à 12 nucléotides.
Que doit-il se passer dans la région 3.2 de σ70 lorsque le transcrit atteint 8 à 10 nucléotides ?
Elle doit être déplacée.
Que font GreA et GreB au transcrit naissant et à l’ARN polymérase ?
Elles s’y fixent et activent l’activité nucléase de l’ARN polymérase pour cliver l’ARN mal apparié.
Combien d’acides aminés environ comptent les protéines GreA et GreB ?
Environ 160 acides aminés.
Qu’éloigne l’hélice d’ARN riche en GC lors de la terminaison intrinsèque ?
L’extrémité 3′ riche en U de son faible appariement avec le brin matrice d’ADN.
Où se produit la terminaison dépendante de Rho ?
À un site où l’ARN polymérase marque une pause.
Comment s’écrit le nom d’une protéine procaryote, comme HisA ?
Avec une majuscule initiale.
Comment s’écrit le symbole d’un gène procaryote, comme hisA ?
En italique ou souligné.
Comment une sonde oligonucléotidique reconnaît-elle la séquence d’intérêt ?
Elle lui est complémentaire sur une région ciblée.
Quelle est la première étape du Northern-blot ?
L’extraction des ARN totaux.
Quel type de sonde détecte l’ARN par protection à la RNAse ?
Un ARN antisens marqué.
Quelle enzyme allonge l’amorce hybridée à l’ARN ?
Une transcriptase inverse.
Quel élément marqué permet de suivre la transcription in vitro ?
Un nucléotide marqué.
Quelle est la composition du cœur enzymatique de l’ARN polymérase bactérienne ?
α₂ββ’ω.
Quels éléments promoteurs RpoN reconnaît-il, et de combien de paires de bases sont-ils séparés ?
Les éléments −24 et −12, séparés de 6 pb.
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1. Quelle différence de sucre distingue l’ARN de l’ADN ?
2. Dans un ARN, quelle base occupe la place qu’occupe la thymine dans l’ADN ?
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