QCM : Transcription chez les procaryotes (33 questions)

Explication

Le sucre de l’ARN est le ribose, tandis que celui de l’ADN est le désoxyribose. La réponse qui inverse ces sucres les confond, celle qui cite l’uracile confond sucre et base, et celle qui attribue le ribose aux deux efface la distinction.

Explication

Dans l’ARN, l’uracile remplace la thymine de l’ADN. La thymine est la base propre à l’ADN dans cette distinction, l’adénine s’apparie avec l’uracile, et la guanine est une autre base de l’ARN.

Explication

L’ARN est synthétisé et représenté dans le sens 5′ vers 3′, avec un phosphate en 5′ et un hydroxyle en 3′. Les réponses incorrectes inversent soit l’orientation, soit l’emplacement des groupements terminaux.

Explication

La structure secondaire résulte du repliement de l’ARN et de l’appariement de bases, notamment en tige-boucle. La structure primaire désigne la séquence, tandis que la composition en bases et la chaîne linéaire ne décrivent pas ce repliement.

Explication

La transcription est la synthèse d’un ARN à partir d’une matrice d’ADN, et l’ARN obtenu est appelé transcrit. La traduction produit une protéine, la réplication copie l’ADN et le transcrit désigne le produit, non le processus.

Explication

L’ARN transcrit a la même séquence que le brin codant, en remplaçant la thymine par l’uracile : ATGC devient AUGC. UACG correspond à la séquence complémentaire, ATGC conserve la thymine et CGUA inverse l’ordre des bases.

Explication

La transcription comprend l’initiation, l’élongation et la terminaison. La traduction, la maturation et la réplication sont des processus distincts et ne remplacent pas l’une de ces trois étapes.

Explication

Chez les eucaryotes, le transcrit subit une maturation comprenant notamment l’épissage avant de sortir du noyau et d’être traduit. La traduction dans le noyau et l’épissage après traduction inversent l’ordre, tandis que le compartiment commun presque simultané caractérise les procaryotes.

Explication

L’ARN polymérase catalyse les liaisons phosphodiester qui relient les nucléotides dans la chaîne d’ARN. L’appariement des bases détermine la séquence, la séparation des brins relève du déroulement de l’ADN, et les liaisons peptidiques relient des acides aminés.

Explication

L’ARN polymérase allonge l’ARN dans le sens 5’ vers 3’ en utilisant les nucléosides triphosphates ATP, CTP, UTP et GTP. Le sens 3’ vers 5’ concerne son déplacement sur le brin matrice, tandis que les monophosphates ne sont pas les substrats indiqués.

Explication

Les procaryotes possèdent une ARN polymérase, alors que les eucaryotes en possèdent trois, nommées I, II et III. Les autres répartitions inversent ou égalisent à tort ces nombres.

Explication

Le complexe bactérien comprend deux sous-unités α et une sous-unité de chaque type β, β’ et ω. L’ajout de σ décrit l’holoenzyme, tandis qu’une seule α ou deux β ne correspondent pas à la composition indiquée.

Explication

L’association de la sous-unité sigma au cœur α₂ββ’ω produit l’holoenzyme α₂ββ’ωσ. Le cœur seul n’inclut pas sigma, et les compositions avec deux sigma ou sans ω ne respectent pas cette distinction.

Explication

Le facteur sigma s’associe de manière réversible au cœur enzymatique pour former l’holoenzyme qui permet l’initiation. L’association irréversible confond la nature de cette liaison, le facteur alpha n’est pas le facteur décrit, et l’absence de sigma ne forme pas l’holoenzyme d’initiation.

Explication

Le facteur sigma principal dirige la majorité de la transcription, alors que les facteurs alternatifs orientent l’holoenzyme vers des sous-ensembles spécialisés de promoteurs. Inverser leurs rôles méconnaît cette distinction, l’absence de rôle nie la fonction des facteurs alternatifs, et le statut d’unique facteur contredit leur coexistence.

Explication

Escherichia coli possède sept facteurs sigma. Le nombre un correspond à Mycoplasma genitalium, le nombre 63 à Streptomyces coelicolor, et six omet l’un des facteurs sigma d’E. coli.

Explication

Après l’initiation, l’ARN polymérase libère le promoteur et entre en élongation ; la terminaison est suivie de la dissociation du complexe. Placer la terminaison en premier inverse l’ordre, intervertir les complexes méconnaît les étapes antérieures à l’initiation, et l’élongation commence après la libération du promoteur.

Explication

Le site +1 est le nucléotide où commence la transcription ; le promoteur se trouve en amont et n’est pas transcrit. Assimiler +1 au début du promoteur confond deux éléments, le prendre pour une fin inverse sa fonction, et inclure le promoteur dans la région transcrite est incorrect.

Explication

La proximité des séquences consensus est associée à un promoteur généralement fort et efficace ; l’éloignement est associé à un promoteur faible et peu efficace. L’inversion des effets et l’idée que l’éloignement renforce le promoteur contredisent cette relation, tandis que la distance à +1 n’est pas le critère décrit.

Explication

Pour un promoteur de type sigma 70, les séquences consensus TTGACA et TATAAT sont typiquement séparées de 17 paires de bases. Quinze est une borne de la plage indiquée, dix correspond à la position de la région −10 par rapport à +1, et six ne correspond pas à l’espacement typique.

Explication

Les éléments UP, présents dans certains promoteurs en amont de -35 et riches en A/T, sont reconnus par αCTD et renforcent la liaison de l’ARN polymérase à l’ADN. Le site -10 est associé à l’ouverture de l’ADN, le facteur sigma guide la reconnaissance des promoteurs et les éléments UP renforcent plutôt qu’ils ne réduisent l’interaction.

Explication

Les ARN polymérases eucaryotes ne peuvent pas initier seules la synthèse sur les éléments promoteurs et ont besoin de facteurs généraux de transcription, fonction comparable au guidage assuré par les facteurs sigma bactériens. L’initiation autonome et l’attribution de la synthèse d’ARN aux facteurs généraux confondent leurs rôles, tandis que les facteurs sigma sont bactériens.

Explication

L’initiation progresse du complexe fermé au complexe ouvert, puis à l’initiation de la synthèse d’ARN; le facteur sigma quitte ensuite le complexe au démarrage de l’élongation. Commencer par le complexe ouvert inverse les deux premiers états, et placer le départ de sigma avant l’initiation ou l’ouverture permute les étapes.

Explication

Durant l’élongation, environ 7 à 8 nucléotides à l’extrémité 3′ de l’ARN s’apparient au brin matrice, tandis que l’extrémité 5′ passe dans le canal de sortie, qui couvre environ 7 nucléotides. L’inversion des extrémités est incorrecte, les deux longueurs ne sont pas permutées, et l’extrémité 5′ passe dans le canal au lieu de rester appariée.

Explication

Un mauvais appariement provoque une pause, qui active l’activité nucléase de l’ARN polymérase; le clivage de l’ARN permet ensuite à la synthèse de reprendre. Le clivage ne précède pas la pause, il relève d’une activité nucléase plutôt que polymérase, et la reprise suit le clivage.

Explication

GreA clive généralement 2 à 3 nucléotides et aide à prévenir la formation de complexes arrêtés; GreB peut cliver jusqu’à 18 nucléotides et réactiver des complexes déjà arrêtés. Inverser les rôles ou les tailles de clivage attribue à chaque facteur la fonction caractéristique de l’autre.

Explication

La terminaison bactérienne peut se produire intrinsèquement, sans facteur extrinsèque, ou dépendre de Rho. L’initiation désigne le début de la transcription, l’inversion des deux modes attribue mal le rôle de Rho, et la maturation de l’ARN n’est pas l’autre mode de terminaison.

Explication

La tige-boucle suivie d’une série de U caractérise la terminaison intrinsèque : la polymérase marque une pause, puis le complexe de transcription se déstabilise. L’hydrolyse de l’ATP et la fixation au site rut relèvent du mécanisme dépendant de Rho, tandis que la formation de la tige-boucle précède la déstabilisation.

Explication

Rho est un anneau de six sous-unités identiques qui se fixe au site rut, une région simple brin de l’ARN riche en C et longue de 40 à 60 nucléotides. La richesse en U contredit la caractéristique du site rut, et les autres réponses modifient le nombre ou la nature des sous-unités ou du site.

Explication

Dans la terminaison dépendante de Rho, l’hydrolyse de l’ATP permet à Rho de progresser le long de l’ARN et de rejoindre la polymérase en pause, ce qui provoque l’arrêt. La réponse qui omet l’ATP néglige l’énergie nécessaire au déplacement, la tige-boucle appartient au mécanisme intrinsèque, et la polymérase n’est pas l’agent qui poursuit Rho.

Explication

Un gène est une région d’ADN portant l’information nécessaire à la synthèse d’un ARN ou d’une protéine. Un opéron est une région transcrite en un seul ARNm contenant l’information de plusieurs protéines, tandis que l’ARN est un produit et le promoteur une région associée à l’initiation de la transcription.

Explication

Le Northern-blot détecte l’ARN grâce à une sonde complémentaire, permet d’en déterminer la taille et d’estimer la quantité du transcrit. La cartographie à la nucléase S1 positionne le site +1, tandis que la protection à la RNAse mesure le signal protégé par appariement.

Explication

Après digestion par la nucléase S1 et électrophorèse, la diminution de taille du fragment d’ADN marqué indique la position du site +1. L’intensité renseigne sur la quantité, la taille de l’ARN concerne son analyse par Northern-blot, et un fragment intact ne révèle pas le point de protection.