Flashcards : Chromatine et ADN (87 cartes)

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1Question

Quelles sont les quatre bases de l’ADN ?

Réponse

A, G, T et C.

2Question

Dans l’ADN, quelles concentrations sont égales quelle que soit l’espèce ?

Réponse

L’adénine égale la thymine, et la cytosine égale la guanine.

3Question

Dans l’ADN, quelles concentrations totales sont égales ?

Réponse

Celles des bases puriques et des bases pyrimidiques.

4Question

En quelle année Watson et Crick proposent-ils le modèle de la double hélice ?

Réponse

En 1953.

5Question

Quels éléments Watson et Crick utilisent-ils pour proposer le modèle de la double hélice ?

Réponse

La composition en bases et les diagrammes de diffraction des rayons X.

6Question

Où se trouvent les bases hydrophobes dans la double hélice d’ADN ?

Réponse

À l’intérieur de la double hélice.

7Question

Où se trouvent les chaînes de désoxyribose-phosphate dans la double hélice ?

Réponse

À l’extérieur de la double hélice.

8Question

Comment les deux chaînes d’ADN s’apparient-elles selon leurs bases ?

Réponse

Selon les couples A-T et G-C.

9Question

Comment sont orientées les deux chaînes antiparallèles d’ADN ?

Réponse

L’une de 5′ vers 3′ et l’autre de 3′ vers 5′.

10Question

Combien de liaisons hydrogène unissent les paires A-T ?

Réponse

Deux liaisons hydrogène.

11Question

Qu’est-ce qui rend les appariements G-C plus solides que les appariements A-T ?

Réponse

Ils comportent davantage de liaisons hydrogène.

12Question

À quelle température le chauffage provoque-t-il la dénaturation de l’ADN ?

Réponse

À 90 °C.

13Question

Quelles interactions stabilisent la double hélice de l’ADN ?

Réponse

Les liaisons hydrogène, les forces de Van der Waals et les interactions ioniques.

14Question

Quel cation contribue à stabiliser la double hélice par des interactions ioniques ?

Réponse

Le cation Mg²⁺.

15Question

Quelle isoforme d’ADN est la plus répandue chez les eucaryotes ?

Réponse

L’ADN B.

16Question

À quelle forme correspond l’ADN B ?

Réponse

À la forme hydratée de la molécule native.

17Question

Combien de paires de bases l’ADN B possède-t-il par tour ?

Réponse

10,4 paires de bases.

18Question

De combien tourne chaque plateau de l’ADN B par rapport au précédent ?

Réponse

34,6°.

19Question

Quand deux molécules circulaires d’ADN sont-elles des topoisomères ?

Réponse

Lorsqu’elles ont la même séquence de bases mais un nombre d’enlacements différent.

20Question

Quelle relation caractérise l’ADN relâché entre LL, TT et WW ?

Réponse

L=TL=T et W=0W=0.

21Question

Quel effet le surenroulement négatif a-t-il sur les brins d’ADN ?

Réponse

Il facilite leur séparation.

22Question

Quel effet le surenroulement positif a-t-il sur la double hélice ?

Réponse

Il resserre la double hélice.

23Question

Comment les topoisomérases modifient-elles le nombre d’enlacements de l’ADN ?

Réponse

Elles clivent un ou deux brins, font passer un segment à travers la brèche, puis la ressellent.

24Question

Combien de brins les topoisomérases de type I coupent-elles ?

Réponse

Un seul brin.

25Question

Quelle longueur totale approximative atteint l’ADN humain ?

Réponse

Environ 2 mètres.

26Question

Combien de paires de bases compte l’ADN humain ?

Réponse

3,2×1093{,}2 \times 10^9 paires de bases.

27Question

Combien de chromosomes contient une cellule humaine diploïde ?

Réponse

46 chromosomes.

28Question

Quand les chromosomes humains sont-ils visibles sous leur forme la plus compactée ?

Réponse

Au moment de la division cellulaire.

29Question

De quels éléments la chromatine est-elle le complexe ?

Réponse

D’ADN nucléaire et de protéines histones et non-histones.

30Question

Quelles fonctions du génome sont influencées par la dynamique de la chromatine ?

Réponse

La réplication, la transcription et la réparation.

31Question

Qu’est-ce qu’un nucléosome ?

Réponse

L’unité fondamentale de l’organisation chromosomique, formée d’ADN enroulé autour d’un noyau d’histones.

32Question

Combien de copies de chaque histone composent le cœur du nucléosome ?

Réponse

Deux copies de H2A, H2B, H3 et H4.

33Question

Quelles charges des histones neutralisent les charges négatives des phosphates de l’ADN ?

Réponse

Leurs charges positives.

34Question

Quel rôle l’histone H1 joue-t-elle entre les nucléosomes ?

Réponse

Elle relie les nucléosomes entre eux.

35Question

Combien de paires de nucléotides séparent environ les nucléosomes de la fibre de 10 à 11 nm ?

Réponse

Environ 200 paires de nucléotides.

36Question

Combien de paires de nucléotides sont associées au cœur dans la fibre de 10 à 11 nm ?

Réponse

Environ 150 paires de nucléotides.

37Question

Que peut faire glisser un complexe de remodelage le long de l’ADN ?

Réponse

L’octamère d’histones.

38Question

Quelles modifications post-traductionnelles peuvent toucher les queues N-terminales des histones ?

Réponse

L’acétylation, la méthylation et la phosphorylation.

39Question

Quel effet l’acétylation des histones a-t-elle sur leurs charges positives ?

Réponse

Elle en neutralise une partie.

40Question

À quel état transcriptionnel l’acétylation des histones est-elle souvent associée ?

Réponse

À une transcription active.

41Question

Qu’est-ce que la méthylation de l’ADN ?

Réponse

Une modification épigénétique sans changement de séquence, transmissible aux cellules filles et impliquée dans la régulation des gènes.

42Question

Où les méthyltransférases méthylent-elles les cytosines chez les eucaryotes ?

Réponse

Sur le carbone 5 des cytosines situées dans des doublets CpG.

43Question

Chez quels organismes la méthylation décrite n’est-elle pas retrouvée ?

Réponse

Chez les procaryotes.

44Question

À quelle activité transcriptionnelle l’hyperméthylation et l’hypométhylation sont-elles associées ?

Réponse

L’hyperméthylation réduit ou éteint la transcription, tandis que l’hypométhylation est associée à des régions plus actives.

45Question

Quelle anomalie épigénétique et quelle croissance caractérisent le syndrome de Beckwith-Wiedemann ?

Réponse

Une hyperméthylation de zones contrôlant la croissance et une croissance excessive.

46Question

Quelle anomalie épigénétique et quelle croissance caractérisent le syndrome de Silver-Russel ?

Réponse

Une hypométhylation et un retard de croissance.

47Question

Vers quel pôle migrent les acides nucléiques en électrophorèse ?

Réponse

Vers le pôle positif.

48Question

À quelle longueur d’onde les acides nucléiques absorbent-ils le plus les UV ?

Réponse

À 260 nm.

49Question

Que représente la température de fusion Tm de l’ADN ?

Réponse

La température à laquelle 50 % de l’ADN est dénaturé.

50Question

Quels facteurs augmentent la Tm de l’ADN ?

Réponse

Une teneur en GC plus élevée et une plus grande longueur du brin.

51Question

Comment varie la composition en bases de l’ADN selon l’espèce ?

Réponse

Elle varie selon l’espèce.

52Question

Quels rapports de bases restent proches de 1 dans l’ADN ?

Réponse

Les rapports A/T et G/C.

53Question

Quel rapport A/G est indiqué pour E. coli ?

Réponse

1.

54Question

Quel rapport A/G est indiqué pour l’Homme ?

Réponse

1,56.

55Question

Comment les plateaux de bases sont-ils orientés par rapport à l’axe de la double hélice ?

Réponse

Ils lui sont perpendiculaires.

56Question

Quel sillon de la double hélice est le plus accessible aux interactions protéiques ?

Réponse

Le grand sillon.

57Question

Pourquoi les plateaux de bases ont-ils la même dimension ?

Réponse

Chaque paire associe une grande base purique à une petite base pyrimidique.

58Question

Quel effet le grand nombre de liaisons hydrogène a-t-il sur la double hélice ?

Réponse

Il contribue fortement à sa cohésion interne.

59Question

Quelle forme tautomère peut perturber la complémentarité et entraîner des mutations ?

Réponse

La forme imino.

60Question

Quel est le diamètre de l’hélice droite de l’ADN B ?

Réponse

2,4 nm.

61Question

Quel est le pas de l’hélice B ?

Réponse

3,4 nm.

62Question

De combien chaque paire de bases allonge-t-elle l’hélice B ?

Réponse

0,33 nm.

63Question

Quelle conformation adopte la liaison N-β-glycosidique dans l’ADN B ?

Réponse

La conformation anti.

64Question

Pourquoi l’ADN eucaryote se comporte-t-il comme une molécule circulaire ?

Réponse

Ses extrémités sont fixées à des points d’ancrage.

65Question

Quel type de supertours la gyrase bactérienne introduit-elle ?

Réponse

Uniquement des supertours négatifs.

66Question

À quels processus du génome le nucléosome participe-t-il ?

Réponse

À la réplication, à la réparation et à la transcription.

67Question

Quelles propriétés caractérisent les histones du cœur ?

Réponse

Ce sont de petites protéines riches en acides aminés basiques et fortement conservées entre les espèces.

68Question

Quelle organisation structurale caractérise le repli d’histone ?

Réponse

Trois hélices alpha reliées par deux boucles.

69Question

Quels modèles la fibre de chromatine de 30 nm peut-elle suivre ?

Réponse

Un modèle en solénoïde ou en zigzag.

70Question

Que font les HAT aux histones ?

Réponse

Elles leur ajoutent un groupement acétyle.

71Question

Que font les HDAC aux histones ?

Réponse

Elles leur enlèvent un groupement acétyle.

72Question

Que font les HM aux lysines des histones ?

Réponse

Elles leur ajoutent un groupement méthyle.

73Question

Quel effet la méthylation a-t-elle sur les charges des histones ?

Réponse

Elle ne les modifie pas.

74Question

Où les îlots CpG sont-ils notamment regroupés, et avec quelle densité ?

Réponse

Dans les régions promotrices en 5′, avec une densité quatre à cinq fois supérieure à celle du reste du génome.

75Question

Quelle proportion des séquences d’îlots CpG est méthylée chez les mammifères ?

Réponse

Environ 70 %.

76Question

Quel produit résulte de la désamination oxydative de la cytosine, et quel est son devenir habituel ?

Réponse

De l’uracile, généralement reconnu et réparé.

77Question

Quel produit résulte de la désamination oxydative de la 5-méthylcytosine ?

Réponse

De la thymine, pouvant laisser un mésappariement mutagène.

78Question

Quels signes cliniques peuvent caractériser le syndrome de Beckwith-Wiedemann ?

Réponse

Une macroglossie, une organomégalie, une omphalocèle, une hémihypertrophie, une anomalie génito-urinaire ou une hypoglycémie néonatale.

79Question

Quelle proportion des cas de Beckwith-Wiedemann comporte une tumeur embryonnaire pédiatrique ?

Réponse

5 % des cas.

80Question

Quels signes peuvent caractériser le syndrome de Silver-Russel ?

Réponse

Un retard de croissance intra-utérin, une dysmorphie faciale, une macrocéphalie relative, une asymétrie corporelle, des difficultés alimentaires ou une clinobrachydactylie du cinquième doigt.

81Question

À quelle anomalie le cours associe-t-il le syndrome de Beckwith-Wiedemann après fécondation in vitro ?

Réponse

À l’hypométhylation du gène KCNQ1OT1.

82Question

Quelle est la fréquence des perturbations de Beckwith-Wiedemann après AMP ?

Réponse

Environ 5 %, contre environ 1 % dans la population générale.

83Question

Quel degré de certitude le cours attribue-t-il aux preuves sur les perturbations après AMP ?

Réponse

Les preuves restent à conforter.

84Question

Quel gel sépare plus finement que le gel d’agarose ?

Réponse

Le gel de polyacrylamide.

85Question

Comment le bromure d’éthidium permet-il de visualiser l’ADN ?

Réponse

Il s’intercale dans la double hélice et révèle les bandes sous ultraviolet.

86Question

Quel ADN présente une absorbance supérieure : simple brin ou double brin ?

Réponse

L’ADN simple brin.

87Question

Que permet un refroidissement lent après dénaturation thermique de l’ADN ?

Réponse

La réassociation des brins complémentaires par hybridation moléculaire.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 36 questions sur Chromatine et ADN.

1. Quelles lettres désignent les quatre bases présentes dans l’ADN ?

2. Quelle relation entre les concentrations des bases est observée dans l’ADN, quelle que soit l’espèce ?

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