Fiche de révision : Flore microbienne et résistances

📋 Plan du Cours

1. Interpréter une bactérie pathogène
2. Flore cutanée et prévention
3. Flore digestive et infections
4. Flore environnementale
5. Flore microbienne générale
6. Flore ORL et transmission
7. Flore vaginale protectrice
8. Antibiotiques et résistance
9. Bactéries multirésistantes
10. BHRe et prévention croisée

📖 1. Interpréter une bactérie pathogène

★ À maîtriser

📌 La présence d'une bactérie dans un prélèvement ne signifie pas systématiquement qu'elle est responsable d'une infection, car il faut distinguer la colonisation, le portage, la contamination et l'infection.

• L'interprétation prend en compte:

  • le type de prélèvement
  • les conditions de réalisation du prélèvement
  • la quantité de bactéries retrouvées
  • les signes cliniques du patient
  • les autres résultats biologiques

• L'antibiogramme étudie la sensibilité d'une bactérie aux différents antibiotiques et contribue au choix du traitement antibiotique.

Compléments

• Les facteurs de virulence peuvent favoriser:
  • l'adhésion aux cellules de l'hôte
  • l'invasion des tissus
  • la production de toxines
  • l'échappement aux défenses immunitaires
  • la multiplication dans l'organisme

💡 Astuce mémo

Présence bactérienne ≠ infection

📖 2. Flore cutanée et prévention

🔑 Notions clés & Définitions

• Flore commensale : Constituée de bactéries aérobies et anaérobies qui vivent sur la peau et jouent un rôle de barrière.

★ À maîtriser

• Les staphylocoques à coagulase négative, notamment Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus hominis et Staphylococcus capitis, sont des commensaux cutanés opportunistes capables de produire des biofilms et d'adhérer aux cathéters et aux implants.

📌 La prévention des infections associées aux soins liées à la flore cutanée repose sur la désinfection des mains avant tout contact avec un patient ou du matériel de soins et sur la désinfection cutanée avant tout acte invasif.

Compléments

• Propionibacterium acnes et Propionibacterium granulosum sont des bactéries anaérobies commensales des glandes sébacées et des bulbes pileux, responsables d'acné et parfois d'infections postopératoires associées à un implant.

💡 Astuce mémo

Résidente stable, passage transitoire

📖 3. Flore digestive et infections

★ À maîtriser

• La muqueuse digestive contient plus d'un kilogramme de bactéries et 500 à 1 000 espèces différentes, aérobies et anaérobies, qui participent à la barrière microbienne et à la synthèse de vitamines.

• Escherichia coli représente 80 % de la flore aérobie digestive et peut provoquer des infections urinaires, des infections associées aux soins et, après acquisition de gènes de virulence, des infections intestinales ou des méningites néonatales.

• Clostridium difficile est une bactérie anaérobie sporulée portée par 5 à 10 % des personnes et naturellement résistante à de nombreux antibiotiques.

📌 Clostridium difficile peut se multiplier après une antibiothérapie et certaines souches produisent une entérotoxine et une cytotoxine responsables de diarrhées aux antibiotiques et de colites pseudomembraneuses.

Compléments

• La densité bactérienne augmente le long du tube digestif, de $10^4 \text{ à } 10^5$ bactéries dans le duodénum à $10^9 \text{ à } 10^{12}$ bactéries dans le côlon.

💡 Astuce mémo

Antibiotiques → déséquilibre → infection à Clostridium difficile

📖 4. Flore environnementale

★ À maîtriser

• Legionella pneumophila se multiplie dans l'eau tiède et se transmet par inhalation de gouttelettes d'eau contaminées, notamment lors des douches ou au niveau des tours aéro-réfrigérantes.

• Pseudomonas aeruginosa est une bactérie saprophyte présente dans l'eau et les biofilms, qui se développe rapidement dans les milieux chauds et humides et cause surtout des infections associées aux soins chez les patients à risque.

• Les espèces toxinogènes citées sont:

  • Clostridium tetani, responsable du tétanos
  • Clostridium perfringens, responsable de la gangrène gazeuse
  • Clostridium botulinum, responsable du botulisme
  • Clostridium difficile, responsable de diarrhées et de colites pseudomembraneuses

Compléments

• Lors de travaux, la concentration d'Aspergillus dans l'air peut être multipliée par 10 000, ce qui expose les patients immunodéprimés à des infections graves.

• Staphylococcus aureus peut survivre plusieurs semaines sur les surfaces, tandis que Pseudomonas aeruginosa peut survivre une semaine sur une surface humide.

💡 Astuce mémo

Eau tiède, terre, poussières et surfaces comme réservoirs

📖 5. Flore microbienne générale

★ À maîtriser

• La flore commensale humaine comprend environ 10^14 micro-organismes associés à la peau ou aux muqueuses, contre 10^12 cellules humaines.

• Les bactéries fréquemment responsables d'infections associées aux soins comprennent:

  • les staphylocoques
  • les entérobactéries
  • Pseudomonas aeruginosa
  • Clostridium difficile

• La prévention repose notamment sur:

  • la désinfection des mains
  • la désinfection cutanée
  • la désinfection des surfaces hautes
  • les précautions standard
  • les vaccinations recommandées

Compléments

• La densité bactérienne est d'environ $10^8$ bactéries par millilitre dans la bouche, $10^2 \text{ à } 10^5$ bactéries par centimètre carré sur la peau et $10^{11}$ bactéries par gramme dans le côlon.

📖 6. Flore ORL et transmission

★ À maîtriser

• Les muqueuses du nez, de la bouche et de la gorge sont colonisées par une flore aérobie et anaérobie, tandis que la trachée, les bronches et les alvéoles pulmonaires sont stériles en situation habituelle.

• Staphylococcus aureus colonise surtout la muqueuse nasale, avec un taux de portage de 10 à 30 %, et peut provoquer des infections suppuratives ainsi que des infections toxinogènes.

• Streptococcus pyogenes, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae et Neisseria meningitidis colonisent les voies aériennes supérieures et peuvent provoquer respectivement des angines ou érysipèles, des pneumopathies ou méningites, des otites ou méningites, et des méningites.

Compléments

• Les toxines citées sont: les entérotoxines, responsables de toxi-infections alimentaires, la TSST, responsable du choc toxique staphylococcique, les exfoliatines, responsables du syndrome de la peau ébouillantée, la toxine de Panton et Valentine, associée à des nécroses cutanées et à des pneumopathies graves

💡 Astuce mémo

Muqueuses colonisées, trachée et alvéoles stériles

📖 7. Flore vaginale protectrice

🔑 Notions clés & Définitions

• Lactobacilles : Bactéries dominantes de la muqueuse vaginale qui produisent de l'acide lactique, ce qui maintient un pH vaginal acide et limite la multiplication de nombreux micro-organismes.

★ À maîtriser

📌 La vaginose bactérienne correspond à un déséquilibre avec diminution des lactobacilles et augmentation des bactéries anaérobies, et non à une infection due à une seule bactérie.

• Streptococcus agalactiae, ou streptocoque du groupe B, peut être porté par la femme enceinte et être transmis au nouveau-né lors de l'accouchement, avec un risque de septicémie ou de méningite néonatale.

Compléments

• Candida albicans peut coloniser la muqueuse vaginale sans symptôme, mais une antibiothérapie, une grossesse, un diabète, une immunodépression ou une modification de la flore peuvent favoriser une candidose vaginale.

💡 Astuce mémo

Diminution des lactobacilles → hausse des anaérobies → vaginose

📖 8. Antibiotiques et résistance

🔑 Notions clés & Définitions

• Antibiotiques : Substances qui détruisent les bactéries ou bloquent leur croissance en ciblant une étape essentielle de leur développement.

📝 Points essentiels

• Les antibiotiques peuvent agir sur la paroi bactérienne, la synthèse des acides nucléiques, la synthèse des protéines ribosomiques ou le métabolisme des folates.

• Les mécanismes de résistance comprennent:

  • la production d'enzymes
  • la non-pénétration de l'antibiotique
  • l'absence ou la modification de la cible
  • l'efflux de l'antibiotique

📌 La résistance naturelle caractérise toutes les souches d'une espèce et est portée par le chromosome, tandis que la résistance acquise n'apparaît que chez certaines souches par mutation ou acquisition de gènes.

• Plus de 80 % des résistances bactériennes proviennent de l'acquisition d'informations génétiques portées par des plasmides ou des transposons, tandis que les résistances par mutation concernent 10 à 20 % des souches isolées en pathologie humaine.

💡 Astuce mémo

Cible, enzyme, imperméabilité, modification, efflux

📖 9. Bactéries multirésistantes

🔑 Notions clés & Définitions

• Bactérie multirésistante : Sensible seulement à un petit nombre d'antibiotiques utilisables en thérapeutique à cause de l'accumulation de résistances acquises à plusieurs familles.

★ À maîtriser

📌 Un patient colonisé par une BMR ne présente aucun signe clinique ou biologique d'infection et ne reçoit pas de traitement curatif, tandis qu'un patient infecté présente des signes cliniques nécessitant des prélèvements et une antibiothérapie.

• La multirésistance favorise l'impasse thérapeutique sous l'effet de l'utilisation importante des antibiotiques et de la transmission croisée.

Compléments

• Les entérobactéries résistantes aux céphalosporines de troisième génération, notamment Escherichia coli et Klebsiella pneumoniae, ont pour réservoir le tube digestif, tandis que le SARM a pour réservoir le nez.

📖 10. BHRe et prévention croisée

🔑 Notions clés & Définitions

• Bactérie hautement résistante émergente : Bactérie commensale du tube digestif résistante à de nombreux antibiotiques et possédant des mécanismes de résistance transférables.

★ À maîtriser

• Les entérobactéries productrices de carbapénémase, notamment Escherichia coli et Klebsiella pneumoniae, sont des BHRe dont le réservoir est le tube digestif.

• La prévention repose sur:

  • le bon usage des antibiotiques
  • l'hygiène de base
  • les précautions standard
  • la friction des mains
  • la gestion des excrétas
  • les précautions complémentaires d'hygiène

Compléments

• Les entérocoques résistants aux glycopeptides comprennent Enterococcus faecium et ont également le tube digestif comme réservoir.

💡 Astuce mémo

Bon usage et hygiène → réduction de la transmission

📊 Tableaux de synthèse

Types de flore et caractéristiques