Fiche de révision : Agents infectieux

📋 Plan du Cours

1. Grandes catégories d’agents infectieux
2. Structure et classification bactérienne
3. Physiologie et croissance bactérienne
4. Relations entre bactéries et hôte
5. Pouvoir pathogène bactérien
6. Épidémiologie bactérienne
7. Résistance bactérienne et bactéries multirésistantes
8. Structure et cycle viral
9. Pouvoir pathogène et transmission virale
10. Parasites et champignons
11. Prions et agents non conventionnels
12. Émergence des virus grippaux
13. Ectoparasites et transmission
14. Maladies à prions et inactivation
15. Microbiote et réservoirs humains

📖 1. Grandes catégories d’agents infectieux

🔑 Notions clés & Définitions

• Bactérie : Être unicellulaire procaryote dépourvu de noyau et d’organites clos, mesurant environ 1 à 5 μm.
• Virus : Contient un seul type d’acide nucléique, ADN ou ARN, ne possède pas toutes les protéines nécessaires à sa biosynthèse et mesure le plus souvent 20 à 300 nm.
• Prion : Protéine anormale qui convertit la protéine normale en protéine anormale sans utiliser d’ADN ni d’ARN.

📝 Points essentiels

📌 Les bactéries sont des cellules procaryotes, les virus sont des particules acellulaires dépendantes d’une cellule vivante, les champignons et parasites sont des eucaryotes, tandis que les prions sont des protéines anormales dépourvues d’ADN et d’ARN.

💡 Astuce mémo

Cellules organisées pour bactéries, champignons et parasites ; particules ou protéines pour virus et prions

📖 2. Structure et classification bactérienne

🔑 Notions clés & Définitions

• Procaryote : Être vivant unicellulaire dépourvu de noyau et bordé d’une membrane.

• Paroi bactérienne : Structure rigide contenant du peptidoglycane, qui contribue à définir la forme et le type de la bactérie.

★ À maîtriser

• Les bactéries sphériques sont appelées cocci, les bactéries en bâtonnet sont appelées bacilles et les bactéries incurvées ou spiralées comprennent les vibrions et les tréponèmes.

📌 La coloration de Gram colore les bactéries Gram positif en violet et les bactéries Gram négatif en rose.

Compléments

• Mycobacterium tuberculosis est un bacille acido-alcoolo-résistant identifié par les colorations de Ziehl-Neelsen ou à l’auramine.

• Les bactéries non visibles à la coloration de Gram comprennent:

  • les spirochètes
  • Chlamydia
  • les mycoplasmes dépourvus de paroi
  • Rickettsia
  • Coxiella
  • Borrelia

💡 Astuce mémo

Gram positif violet, Gram négatif rose

📖 3. Physiologie et croissance bactérienne

★ À maîtriser

• Le cytoplasme bactérien contient les ribosomes, l’unique chromosome circulaire d’ADN bicaténaire, des plasmides et diverses inclusions de réserve.

• La capsule favorise la virulence, le biofilm ou glycocalix assure l’adhérence, les pili permettent la fixation, les flagelles assurent la mobilité et la spore constitue un moyen de résistance bactérienne.

• Le glucose est le substrat énergétique le plus utilisé par les bactéries, dont les besoins énergétiques servent notamment à produire de l’ATP, du G6P et de l’acétyl-CoA.

📌 Les bactéries aérobies strictes nécessitent l’oxygène, les bactéries aéro-anaérobies peuvent vivre avec ou sans oxygène et les bactéries anaérobies strictes ne le tolèrent pas.

• 🔄 La fission binaire bactérienne: une bactérie mère se divise, deux bactéries filles sont produites, les deux bactéries filles sont identiques entre elles et à la mère

Compléments

• Les principaux besoins élémentaires sont:

  • le carbone
  • l’hydrogène
  • l’oxygène
  • l’azote
  • le soufre
  • le phosphore
  • le fer
  • le calcium
  • le magnésium
  • le potassium

• Escherichia coli peut se multiplier en environ 20 minutes, tandis que Mycobacterium tuberculosis a une croissance supérieure à 20 heures et Listeria peut se multiplier à 4 °C.

💡 Astuce mémo

Nourrir → respirer → se diviser

📖 4. Relations entre bactéries et hôte

🔑 Notions clés & Définitions

• Microbiote : Ensemble des micro-organismes vivant dans un écosystème donné.

★ À maîtriser

📌 Le commensalisme permet à une espèce de bénéficier d’une nourriture, d’une protection ou d’un autre avantage sans nuire à l’autre, tandis que le parasitisme correspond à une vie aux dépens d’un autre être vivant.

📌 La colonisation correspond à la présence de bactéries sur un revêtement cutanéo-muqueux sans dommage pour l’hôte, tandis que l’infection associe envahissement microbien, lésions et symptômes.

Compléments

• Le microbiote humain comprend environ 10¹¹ bactéries sur la peau, 10¹⁰ dans la bouche et 4 × 10¹³ dans le côlon, contre environ 3 × 10¹³ cellules humaines. — Sender et al., PLoS Biol, 2016

💡 Astuce mémo

Rupture de l’équilibre hôte-microbiote → désordre ou maladie

📖 5. Pouvoir pathogène bactérien

★ À maîtriser

• 🔄 Le développement du pouvoir pathogène bactérien suit: la colonisation de la peau ou des muqueuses, l’invasion après franchissement de la barrière cutanéo-muqueuse, l’infection avec lésions et symptômes

• Les bactéries peuvent provenir d’un réservoir exogène environnemental ou d’un réservoir endogène constitué par le microbiote humain.

• La capsule permet à la bactérie d’échapper aux défenses de l’organisme, notamment à la phagocytose.

• Le biofilm est formé de polysaccharides favorisant l’adhésion des bactéries entre elles et à une surface, ce qui les protège des cellules phagocytaires et des antibiotiques.

Compléments

• Les pili permettent l’adhérence des bactéries aux cellules épithéliales, comme les pili d’Escherichia coli qui favorisent la fixation à l’épithélium vésical et son internalisation.

💡 Astuce mémo

Colonisation → invasion → infection

📖 6. Épidémiologie bactérienne

📝 Points essentiels

📌 Une infection bactérienne endogène provient de bactéries commensales de l’organisme devenues pathogènes, tandis qu’une infection exogène provient de bactéries provenant de l’extérieur.

• Les transmissions bactériennes directes comprennent les gouttelettes, les aérosols, les mains, les contacts sexuels et la transmission maternofoetale.

• Les transmissions bactériennes indirectes se font par l’eau ou les aliments contaminés, le matériel contaminé ou souillé, ou des vecteurs tels que les puces, les poux, les moustiques et les tiques.

📌 Une maladie sporadique correspond à un cas isolé, une maladie épidémique atteint simultanément un grand nombre d’individus dans un espace et un temps limités, une maladie endémique persiste dans une collectivité ou une région, et une pandémie est une épidémie mondiale.

• Les portes d’entrée bactériennes comprennent:
  • la voie digestive
  • la voie respiratoire
  • la voie cutanée
  • la voie urinaire
  • la voie génitale
  • la voie maternofoetale

💡 Astuce mémo

Réservoir → transmission → porte d’entrée → infection

📖 7. Résistance bactérienne et bactéries multirésistantes

🔑 Notions clés & Définitions

• Résistance bactérienne : Capacité d’une souche bactérienne à se développer à des concentrations d’antibiotique supérieures à celles atteintes chez le patient.
• BMR : Bactérie qui cumule plusieurs mécanismes de résistance aux antibiotiques.

★ À maîtriser

• La résistance bactérienne peut apparaître rapidement après l’introduction d’un antibiotique, augmenter rapidement, être transférée par plasmide ou transposon et se diffuser de manière épidémique.

Compléments

• Les principales BMR comprennent: le SARM, les entérobactéries résistantes aux céphalosporines de troisième génération, les entérocoques résistants aux glycopeptides, Acinetobacter baumannii résistant à l’imipénème, Pseudomonas aeruginosa résistant à la ceftazidime

• Les BHRe comprennent les entérobactéries productrices de carbapénémases et les Enterococcus faecium résistants aux glycopeptides.

💡 Astuce mémo

Antibiotique → sélection de résistants → diffusion épidémique

📖 8. Structure et cycle viral

🔑 Notions clés & Définitions

• Virion : Particule virale complète constituée d’un acide nucléique unique entouré d’une capside, avec parfois une enveloppe membranaire.

★ À maîtriser

📌 Les virus enveloppés possèdent une membrane lipidique fragile rapidement dégradée, tandis que les virus nus ne possèdent pas d’enveloppe et résistent mieux dans l’environnement.

• 🔄 Le cycle viral comprend:
  1. l’attachement
  2. la pénétration par fusion ou endocytose
  3. la décapsidation
  4. la réplication
  5. l’assemblage et la maturation
  6. la libération

Compléments

• Les symétries de capside virale sont:
  • la symétrie icosaédrique
  • la symétrie hélicoïdale
  • la symétrie complexe

💡 Astuce mémo

Attachement → pénétration → décapsidation → réplication → assemblage → libération

📖 9. Pouvoir pathogène et transmission virale

★ À maîtriser

• Les virus sont des pathogènes intracellulaires obligatoires qui se multiplient en utilisant le matériel de la cellule hôte et présentent une spécificité d’hôte importante.

📌 Une infection virale aiguë est rapide et courte, une infection persistante ou chronique se poursuit à vitesse réduite, et une infection latente reste cachée avant une éventuelle réactivation.

• Les virus nus se transmettent le plus souvent indirectement grâce à leur résistance, tandis que les virus enveloppés se transmettent le plus souvent directement en raison de leur fragilité.

Compléments

• Le virus de l’hépatite B, bien qu’enveloppé, reste stable plus de 7 jours dans du sang séché.

• Les infections virales peuvent entrer par les voies cutanée, digestive, respiratoire, génitale et conjonctivale.

💡 Astuce mémo

Virus nus résistants plutôt indirects ; virus enveloppés fragiles plutôt directs

📖 10. Parasites et champignons

🔑 Notions clés & Définitions

• Parasite : Organisme vivant aux dépens d’un autre être vivant, l’hôte, qui lui sert de milieu dans une association hétérospécifique obligatoire.

★ À maîtriser

📌 Les protozoaires sont des parasites unicellulaires eucaryotes, tandis que les helminthes sont des parasites pluricellulaires appartenant aux métazoaires.

• Les helminthes comprennent les némathelminthes ou vers ronds et les plathelminthes ou vers plats.

• Les champignons sont des micro-organismes eucaryotes du règne des Fungi responsables de mycoses, vivant souvent dans l’environnement et se diffusant par des spores.

Compléments

• Les nématodes ovipares parasitent l’intestin et ont l’homme comme seul hôte, tandis que les nématodes vivipares parasitent les tissus et impliquent plusieurs hôtes.

• Les champignons comprennent les levures comme Candida, Cryptococcus, Malassezia et Pneumocystis, ainsi que les champignons filamenteux comme les dermatophytes et Aspergillus.

💡 Astuce mémo

Protozoaires unicellulaires ; helminthes pluricellulaires

📖 11. Prions et agents non conventionnels

🔑 Notions clés & Définitions

• Agent transmissible non conventionnel : Agent contagieux dépourvu d’ADN et d’ARN, qui n’est donc ni une bactérie ni un virus.

★ À maîtriser

📌 Les viroïdes sont constitués d’un ARN compacté qui ne code aucune protéine, tandis que les prions sont des protéines dépourvues d’information génétique.

• Les prions ne sont pas cultivables en laboratoire, sont difficiles à détecter, résistent fortement aux procédés physiques d’inactivation et ne présentent pas de structure pathogène connue.

Compléments

📌 Les prions sont spécifiques d’une espèce, titrables, capables de muter et responsables d’infections progressives à incubation très longue comme certains virus, mais ils ne possèdent pas de particule identifiable et n’induisent ni inflammation ni réponse immunitaire.

💡 Astuce mémo

Prion : infectieux comme un virus, mais dépourvu d’acide nucléique

📖 12. Émergence des virus grippaux

★ À maîtriser

📌 Le glissement antigénique grippal correspond à de petites mutations ponctuelles des gènes de l’hémagglutinine ou de la neuraminidase, tandis que le saut antigénique correspond à un réassortiment de segments d’ARN produisant une modification majeure.

• Le glissement antigénique concerne les virus influenza A et B, survient tous les ans ou tous les deux ans et est responsable d’épidémies saisonnières prévisibles.

• Le saut antigénique concerne uniquement les virus influenza A, est imprévisible et est responsable de la plupart des pandémies grippales.

Compléments

• Les virus influenza A possèdent un génome réparti en 8 segments et ont un réservoir animal, tandis que les virus influenza B et C ont un réservoir humain.

• La grippe espagnole de 1918-1919 était une grippe H1N1 probablement d’origine aviaire.

💡 Astuce mémo

Glissement = petites mutations ; saut = réassortiment majeur

📖 13. Ectoparasites et transmission

🔑 Notions clés & Définitions

• Gale : Ectoparasitose due à Sarcoptes scabiei hominis, transmise principalement par un contact cutané prolongé ou parfois indirectement par des draps et vêtements.

📝 Points essentiels

• Les poux se transmettent principalement par contact direct entre personnes ou indirectement par échange de bonnets ou de casques, tandis que les morpions correspondent aux poux localisés dans les régions génitales.

📖 14. Maladies à prions et inactivation

📝 Points essentiels

• Les encéphalopathies spongiformes transmissibles sont des affections neurodégénératives caractérisées par des atteintes cérébrales progressives et irréversibles, avec une incubation de quelques années à plusieurs décennies.

• Les principales maladies à prions sont:

  • la tremblante du mouton
  • l’encéphalopathie spongiforme bovine
  • le kuru
  • la maladie de Creutzfeldt-Jakob
  • le syndrome de Gerstmann-Sträussler-Scheinker

📌 L’inactivation des prions nécessite des procédés spécifiques comme la soude, l’hypochlorite de sodium ou l’autoclave à 134 °C pendant 18 minutes, et l’usage de matériel à usage unique est recommandé.

💡 Astuce mémo

Accumulation de prions → atteintes cérébrales irréversibles

📖 15. Microbiote et réservoirs humains

★ À maîtriser

• Les bactéries commensales peuvent devenir pathogènes lorsque les défenses de l’hôte sont perturbées, ce qui explique l’origine endogène de certaines infections.

• Les porteurs sains hébergent des bactéries pathogènes sans développer d’infection, mais peuvent les transmettre et provoquer des épidémies.

Compléments

• Les réservoirs naturels peuvent être:
  • le sol
  • les surfaces
  • l’eau
  • l’air
  • un hôte végétal
  • un hôte animal

📊 Tableaux de synthèse

Comparaison des agents infectieux