Flashcards : Alignement et polymorphisme génomique — 90 cartes

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1Question

Quels sont les trois composants d'un nucléotide ?

Réponse

Une base azotée, un pentose et un acide phosphorique.

2Question

Quelles bases azotées sont classées comme puriques ?

Réponse

L'adénine et la guanine.

3Question

Quelles bases azotées sont classées comme pyrimidiques ?

Réponse

L'uracile, la cytosine et la thymine.

4Question

Quel pentose compose les ARN ?

Réponse

Le ribose.

5Question

Quelle différence structurelle distingue le désoxyribose du ribose ?

Réponse

Le désoxyribose ne possède pas de groupement OH en 2′.

6Question

Qu'est-ce qu'un nucléoside ?

Réponse

L'association d'une base azotée et d'un pentose reliés par une liaison N-glycosidique.

7Question

Quel est le rôle de l'ATP dans les organismes vivants ?

Réponse

C'est la devise énergétique universelle.

8Question

Que fournit l'hydrolyse de l'ATP en ADP et phosphate inorganique ?

Réponse

De l'énergie à de nombreuses réactions biochimiques.

9Question

Qu'est-ce qu'un polynucléotide ?

Réponse

Un enchaînement de mononucléotides unis par des liaisons phosphodiesters.

10Question

Quelle charge a le squelette phosphodiester des acides nucléiques au pH physiologique ?

Réponse

Il est chargé négativement.

11Question

Quelles sont les extrémités définissant la polarité d'un acide nucléique ?

Réponse

Les extrémités 5′ phosphate et 3′ OH.

12Question

Quelle différence de solubilité existe entre bases et acides nucléiques ?

Réponse

Les bases sont peu solubles dans l’eau, les acides nucléiques sont solubles.

13Question

Quelle longueur d'onde les bases et acides nucléiques absorbent-ils ?

Réponse

Ils absorbent les ultraviolets à 260 nm.

14Question

Combien de liaisons hydrogène unissent l'adénine à la thymine dans l'ADN ?

Réponse

Deux liaisons hydrogène.

15Question

Combien de liaisons hydrogène unissent la guanine à la cytosine dans l'ADN ?

Réponse

Trois liaisons hydrogène.

16Question

Qu'impose la dénaturation de l'ADN par chauffage ou pH extrême ?

Réponse

La rupture des liaisons hydrogène entre les brins d'ADN.

17Question

Quelle différence de sucre distingue ARN et ADN ?

Réponse

L'ARN contient du ribose, l'ADN du désoxyribose.

18Question

Quelle base azotée remplace la thymine dans l'ARN ?

Réponse

L'uracile remplace la thymine dans l'ARN.

19Question

Quelle proportion d'ARN ribosomiques dans les ARN totaux cellulaires ?

Réponse

Environ 82 % des ARN totaux sont ribosomiques.

20Question

Quels ARNr composent la petite sous-unité ribosomique eucaryote ?

Réponse

L'ARNr 18S compose la petite sous-unité ribosomique.

21Question

Quelle séquence termine un ARNt et quel est son rôle ?

Réponse

La séquence CCA en 3′ OH termine un ARNt et fixe l'acide aminé.

22Question

Quels sont les niveaux successifs de compaction de l'ADN ?

Réponse

Nucléosome, fibre de 30 nm, boucles, chromosome.

23Question

Quelle est la longueur de l'ADN humain déployé ?

Réponse

L'ADN humain mesurerait 1,8 mètre déployé.

24Question

Combien de paires de bases contient le génome humain haploïde ?

Réponse

Le génome humain haploïde contient 3,1 milliards de paires de bases.

25Question

Par quelles structures successives s'effectue la compaction de l'ADN ?

Réponse

Par les nucléosomes, les solénoïdes, les boucles puis le chromosome.

26Question

Quelles fonctions la chromatine assure-t-elle pour l'ADN ?

Réponse

La compaction, l'accessibilité et la protection de l'ADN.

27Question

Combien de fois l'ADN est-il compacté dans sa forme chromatinienne ?

Réponse

Environ 10 000 fois.

28Question

Qu'est-ce que la réplication de l'ADN ?

Réponse

Le doublement du contenu en ADN d'une cellule avant sa division.

29Question

Qu'est-ce que signifie que la réplication de l'ADN est semi-conservative ?

Réponse

Chaque molécule fille contient un brin parental et un brin néosynthétisé.

30Question

Quand se déroule la réplication de l'ADN dans le cycle cellulaire ?

Réponse

Pendant la phase S du cycle cellulaire.

31Question

Combien d'origines de réplication y a-t-il chez les eucaryotes humains ?

Réponse

Entre 20 000 et 30 000 origines réparties homogènement.

32Question

Quelle est la taille d'un réplicon chez l'homme ?

Réponse

Entre 100 et 200 kb.

33Question

Quelle différence principale existe entre mutation et lésion d'ADN ?

Réponse

Une mutation modifie la séquence d'ADN, une lésion modifie chimiquement l'ADN sans forcément changer la séquence.

34Question

Quels types de lésions provoquent les rayonnements UV sur l'ADN ?

Réponse

Les rayonnements UV provoquent des dimères de thymines et des pontages covalents ADN-protéine.

35Question

Quels types de lésions provoquent les rayonnements ionisants sur l'ADN ?

Réponse

Les rayonnements ionisants provoquent des cassures et des pontages covalents de l'ADN.

36Question

Combien de lésions d'ADN le soleil induit-il par cellule et par jour ?

Réponse

Environ 80 000 lésions d'ADN par cellule et par jour.

37Question

Combien d'adduits le tabagisme induit-il par cellule et par jour ?

Réponse

Environ 200 adduits par cellule et par jour.

38Question

Quels sont les enzymes clés du système BER pour réparer les anomalies chimiques des bases ?

Réponse

ADN glycosylase, AP endonucléase, ADN polymérase et ADN ligase.

39Question

Comment le système MMR distingue-t-il le brin à corriger ?

Réponse

Il distingue le brin néosynthétisé du brin parental méthylé.

40Question

Quelles sont les deux voies principales pour réparer les cassures double brin ?

Réponse

Recombinaison générale et NHEJ (jonction d'extrémités non homologues).

41Question

Qu'est-ce que la recombinaison générale ?

Réponse

Un échange d'information génétique entre séquences homologues pouvant réparer ou se produire accidentellement.

42Question

Quelle est la première étape de la recombinaison méiotique ?

Réponse

Une cassure simple brin.

43Question

Que peut produire la résolution de la structure de Holliday ?

Réponse

Un simple échange ou un crossing-over avec enjambement chromosomique.

44Question

Combien de fois la recombinaison méiotique survient-elle par méiose chez l'homme ?

Réponse

Environ 60 fois.

45Question

Quelle est la condition minimale d'identité pour la recombinaison générale ?

Réponse

Une zone d'environ 300 pb d'identité complète.

46Question

Quels types de séquences peuvent être concernés par la recombinaison générale ?

Réponse

Les séquences répétées, notamment les séquences SINE.

47Question

Que provoque une recombinaison accidentelle entre séquences répétées en tandem ?

Réponse

Une recombinaison inégale avec expansion et réduction du nombre de copies.

48Question

Qu'est-ce que le génotype d'un individu ?

Réponse

La constitution génétique définie par l'assortiment de ses allèles.

49Question

Qu'est-ce que le phénotype d'un individu ?

Réponse

La manifestation apparente du génome sous forme de traits ou variations.

50Question

Quelle est la première étape du passage du génotype au phénotype ?

Réponse

La transcription qui produit un ARN à partir de l'information génétique.

51Question

Quelle ARN polymérase transcrit les préARN ribosomiques chez les eucaryotes ?

Réponse

L'ARN polymérase I.

52Question

Quelle ARN polymérase transcrit les ARN prémessagers chez les eucaryotes ?

Réponse

L'ARN polymérase II.

53Question

Quelle ARN polymérase transcrit les précurseurs des ARNt et de l'ARNr 5S ?

Réponse

L'ARN polymérase III.

54Question

Dans quelle direction l'ARN polymérase se déplace-t-elle sur le brin matrice ?

Réponse

De 3′ vers 5′ sur le brin antisens matrice.

55Question

Quelle est la séquence consensus et la position de la TATA box ?

Réponse

5′-TATAAAA-3′ vers −25 à −30, présente dans 70 % des gènes codants.

56Question

Quelles étapes comprend la maturation des ARN prémessagers en ARNm matures ?

Réponse

L'ajout d'une coiffe en 5′, d'une queue polyA en 3′ et l'épissage.

57Question

Que consiste la coiffe en 5′ ajoutée à l'ARN prémessager ?

Réponse

L'ajout d'une guanine modifiée.

58Question

Quelle fonction a la coiffe en 5′ sur l'ARN ?

Réponse

Elle protège l'ARN des nucléases et intervient dans l'initiation de la traduction.

59Question

Quel signal recrute les facteurs CPSF et CstF pour la polyadénylation ?

Réponse

Le signal AAUAAA.

60Question

Que sont les exons dans l'ARNm mature ?

Réponse

Des séquences conservées.

61Question

Que sont les introns dans l'ARN prémessager ?

Réponse

Des séquences intercalaires transcrites puis excisées lors de l'épissage.

62Question

Sur quoi repose l'épissage des ARN prémessagers ?

Réponse

Sur deux réactions de transestérification formant un lasso d'intron puis reliant les exons par une liaison phosphodiester.

63Question

Combien de protéines et quels ARNsn comprend le spliceosome ?

Réponse

Environ 150 protéines et cinq ARNsn U1, U2, U4, U5 et U6.

64Question

Qu'est-ce que la traduction en biologie moléculaire ?

Réponse

La traduction est la transformation du message génétique en séquence d'acides aminés.

65Question

Où se déroule la traduction dans la cellule ?

Réponse

La traduction se déroule dans le cytoplasme au niveau des ribosomes.

66Question

Quel rôle jouent les ARNt lors de la traduction ?

Réponse

Les ARNt apportent les acides aminés correspondant aux codons grâce à leur anticodon.

67Question

Quelles sont les caractéristiques du code génétique ?

Réponse

Le code génétique est un code à trois lettres, universel, non chevauchant, dégénéré et non ambigu.

68Question

Combien de codons codent les acides aminés et combien sont des codons-stop ?

Réponse

61 codons codent les acides aminés et 3 sont des codons-stop.

69Question

Quels sont les codons-stop dans le code génétique ?

Réponse

Les codons-stop sont UAA, UAG et UGA.

70Question

Pourquoi le code génétique est-il dit dégénéré ?

Réponse

Parce qu’un même acide aminé peut être codé par plusieurs codons.

71Question

Quelle exception existe à l'universalité du code génétique ?

Réponse

Certaines mitochondries utilisent des codons avec une signification différente.

72Question

Quels codons sont des codons-stop ?

Réponse

UAA, UAG et UGA sont des codons-stop.

73Question

Quel codon initiateur code la méthionine chez les eucaryotes ?

Réponse

Le codon AUG code la méthionine chez les eucaryotes.

74Question

Qu'est-ce qu'un cadre ouvert de lecture (ORF) ?

Réponse

C'est la succession de triplets entre un codon AUG en 5′ et un codon-stop en 3′ sans interruption pendant au moins 20 codons.

75Question

Quels éléments composent un ARNm mature de 5′ en 3′ ?

Réponse

Une coiffe, le nucléotide +1, une région 5′-UTR, une séquence traduite, une région 3′-UTR et une queue de polyA.

76Question

Quelle est la composition de la grande sous-unité 60S du ribosome eucaryote ?

Réponse

Elle contient les ARNr 5S, 5,8S, 28S et 49 protéines.

77Question

Quels ARNr contient la petite sous-unité 40S du ribosome eucaryote ?

Réponse

Elle contient l’ARNr 18S et 33 protéines.

78Question

Quels sont les trois sites ribosomiques de fixation des ARNt ?

Réponse

Les sites A, P et E.

79Question

Que signifie le site A du ribosome ?

Réponse

Le site de fixation de l’aminoacyl-ARNt.

80Question

Quelles sont les quatre étapes de la traduction ?

Réponse

Activation des acides aminés, initiation, élongation et terminaison.

81Question

Quelle spécificité assurent les aminoacyl-ARNt synthétases ?

Réponse

Elles assurent une double spécificité pour l’acide aminé et l’ARNt.

82Question

Quel est le coût énergétique de la traduction par acide aminé incorporé ?

Réponse

Quatre liaisons riches par acide aminé incorporé.

83Question

Quel rôle joue le facteur eRF lors de la terminaison ?

Réponse

Il reconnaît un codon-stop au site A et provoque l’hydrolyse du polypeptide.

84Question

Qu'est-ce qu'une protéine ?

Réponse

Un polymère de résidus d'acides aminés construit à partir de 20 acides aminés.

85Question

Que désigne la structure primaire d'une protéine ?

Réponse

L'enchaînement linéaire de ses acides aminés.

86Question

Quelles sont les principales structures secondaires des protéines ?

Réponse

Les hélices α, feuillets β, coudes β et boucles.

87Question

Qu'est-ce que la structure tertiaire d'une protéine ?

Réponse

La forme tridimensionnelle globale stabilisée par diverses interactions.

88Question

Quels types d'interactions stabilisent la structure tertiaire ?

Réponse

Les interactions hydrogène, ioniques, hydrophobes et ponts disulfure.

89Question

Quelle différence existe-t-il entre structure quaternaire et protéine monomérique ?

Réponse

La structure quaternaire est un assemblage non covalent de plusieurs chaînes, la monomérique n'en a pas.

90Question

De quoi est composé l'hémoglobine ?

Réponse

De deux chaînes α et deux chaînes β, chacune avec une molécule d'hème.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 51 questions sur Alignement et polymorphisme génomique.

1. Concernant la composition et le rôle des nucléotides :

2. À propos de la classification des bases azotées, cochez la (les) proposition(s) exacte(s) :

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