Flashcards : Biochimie des acides aminés (53 cartes)

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1Question

À quoi servent les acides aminés dans l’organisme ?

Réponse

À former des protéines.

2Question

Quel constituant majeur de la cellule les protéines représentent-elles ?

Réponse

L’un des trois constituants majeurs.

3Question

Quelle propriété du carbone asymétrique distingue la glycine des autres acides aminés décrits ?

Réponse

La glycine ne possède pas de carbone asymétrique.

4Question

Quelles fonctions chimiques et quel radical possède un acide aminé ?

Réponse

Une fonction carboxylique, une fonction amine généralement primaire et un radical R spécifique.

5Question

Que confère le radical R spécifique à un acide aminé ?

Réponse

Des propriétés particulières.

6Question

Quel rôle joue la liaison peptidique dans la formation des peptides et des protéines ?

Réponse

Elle enchaîne les acides aminés.

7Question

Qu’exige la création cellulaire d’une liaison peptidique ?

Réponse

Des enzymes.

8Question

Quel type de réaction génère de l’eau lors de la formation d’une liaison peptidique ?

Réponse

Une réaction de condensation.

9Question

Qu’est-ce qu’un résidu d’acide aminé dans un peptide ou une protéine ?

Réponse

Ce qui reste de l’acide aminé après son incorporation et la transformation de ses extrémités.

10Question

Combien d’acides aminés connaît-on environ ?

Réponse

Environ 300.

11Question

Combien d’acides aminés fondamentaux le cours cite-t-il dans les protéines du vivant ?

Réponse

22.

12Question

Quels acides aminés sont chargés positivement à pH neutre ?

Réponse

La lysine, l’arginine et l’histidine.

13Question

Qu’est-ce que le récepteur canal cholinergique nicotinique ?

Réponse

Une protéine membranaire pouvant former un pore ionique.

14Question

Combien de sous-unités protéiques forment le canal nicotinique ?

Réponse

Quatre sous-unités.

15Question

Quels sous-domaines constituent les sous-unités du canal nicotinique ?

Réponse

Des sous-domaines bêta et des hélices alpha.

16Question

Comment s’appelle l’hélice alpha présente dans chaque sous-unité du canal nicotinique ?

Réponse

M2.

17Question

Quels résidus chargés porte l’hélice M2 du canal nicotinique ?

Réponse

Des résidus aspartate et glutamate chargés négativement.

18Question

Dans quel sens les ions circulent-ils lorsque le canal nicotinique est ouvert ?

Réponse

Le sodium entre depuis le milieu extracellulaire et le potassium sort depuis le milieu intracellulaire.

19Question

Qu’est-ce que la chiralité d’une molécule ?

Réponse

La propriété d’exister sous deux formes non interchangeables, gauche et droite, due à un carbone asymétrique.

20Question

Quel type de chiralité possèdent les acides aminés du vivant ?

Réponse

Ils sont de type L, à quelques exceptions près.

21Question

Pourquoi la glycine n’est-elle pas chirale ?

Réponse

Son carbone α présente un axe de symétrie H-C-H, car son radical est H.

22Question

Pourquoi un acide aminé est-il amphotère ?

Réponse

Il peut agir comme une base ou un acide selon le pH.

23Question

Quelles sont les deux fonctions ionisables minimales d’un acide aminé ?

Réponse

La fonction amine et la fonction acide carboxylique.

24Question

Sous quelle forme la fonction amine d’un acide aminé se trouve-t-elle en milieu très acide ?

Réponse

Sous forme NH3+\mathrm{NH_3^+}.

25Question

Sous quelle forme la fonction carboxylique d’un acide aminé se trouve-t-elle en milieu très acide ?

Réponse

Sous forme COOH\mathrm{COOH}.

26Question

À quel pH les formes protonée et déprotonée d’une fonction ionisable sont-elles en proportions égales ?

Réponse

Au pK de cette fonction ionisable.

27Question

Quel est le pK de la fonction α-carboxyle de la glycine ?

Réponse

2,4.

28Question

Quand le pH augmente, quels groupements se déprotonent en premier ?

Réponse

Ceux dont le pK est le plus petit.

29Question

À quel pH un acide aminé est-il sous forme zwitterionique globalement neutre ?

Réponse

À son pHi.

30Question

Que désigne la capacité tampon d’un milieu ?

Réponse

Sa capacité à résister à une alcalinisation ou à une acidification.

31Question

Quelles molécules contribuent à la capacité tampon des liquides physiologiques ?

Réponse

Les acides aminés, les peptides et les protéines.

32Question

Qu’est-ce que le carbone α dans un acide aminé ?

Réponse

Le premier carbone de sa chaîne.

33Question

Quelle est l’exception concernant la fonction amine de la proline ?

Réponse

Sa fonction amine est secondaire.

34Question

Dans la séquence Ala-Gly-Gly-Ala-Gly-Lys, quelle fonction perd le premier résidu ?

Réponse

Sa fonction amine à droite.

35Question

Dans la séquence Ala-Gly-Gly-Ala-Gly-Lys, quelles fonctions perdent les résidus internes ?

Réponse

Leurs fonctions carboxylique à gauche et amine à droite.

36Question

Dans la séquence Ala-Gly-Gly-Ala-Gly-Lys, quelle fonction perd le résidu Lys terminal ?

Réponse

Sa fonction carboxylique à gauche.

37Question

Quels acides aminés figurent parmi les 22 fondamentaux cités ?

Réponse

L’alanine, l’acide aspartique, l’acide glutamique, l’isoleucine, la méthionine, la sélénocystéine, le tryptophane, l’arginine, la cystéine, la glycine, la leucine, la phénylalanine, la sérine, la tyrosine, l’asparagine, la glutamine, l’histidine, la lysine, la proline, la thréonine, la valine et la pyrrolysine.

38Question

Chez quels organismes la pyrrolysine est-elle trouvée ?

Réponse

Chez les archées méthanogènes uniquement.

39Question

Quel est le produit final de la respiration anaérobie des archées méthanogènes ?

Réponse

Le méthane.

40Question

Quelles sont les catégories d’acides aminés classées selon la nature du radical ?

Réponse

Aliphatiques, hydroxylés ou soufrés, cycliques, aromatiques, basiques et acides.

41Question

Quels acides aminés sont indiqués comme non chargés à pH neutre ?

Réponse

La sérine, la thréonine, la cystéine, l’asparagine, la glutamine, la tyrosine, la glycine, l’alanine, la valine, la leucine, l’isoleucine, la méthionine, la phénylalanine, le tryptophane et la proline.

42Question

Sur quelles protéines les ligands se fixent-ils pour ouvrir le canal nicotinique ?

Réponse

Sur les protéines alpha.

43Question

Quel neurotransmetteur est le ligand cité du canal nicotinique ?

Réponse

L’acétylcholine.

44Question

Quels acides aminés sont indiqués de type D dans des protéines membranaires bactériennes ?

Réponse

L’alanine et la glutamine.

45Question

Quel proton la fonction amine peut-elle accepter ?

Réponse

Un proton, selon l’équilibre NH3+⇌NH2+H+\mathrm{NH_3^+ \rightleftharpoons NH_2 + H^+}.

46Question

Quel proton la fonction acide carboxylique peut-elle céder ?

Réponse

Un proton, selon l’équilibre COOH⇌COO−+H+\mathrm{COOH \rightleftharpoons COO^- + H^+}.

47Question

Quels groupes ionisables supplémentaires le radical R peut-il porter ?

Réponse

Des groupes NH₂ ou COOH.

48Question

Quelle relation donne le nombre de formes électriques possibles d’un acide aminé ?

Réponse

Nformes=n+1N_{formes}=n+1, où nn est le nombre de fonctions ionisables.

49Question

À quoi correspond le nombre de pK d’un acide aminé ?

Réponse

Au nombre de ses fonctions ionisables.

50Question

Comment détermine-t-on les pK d’un acide aminé par titration ?

Réponse

Avec une base forte pour titrer l’acide carboxylique et un acide fort pour titrer l’amine.

51Question

Comment calcule-t-on le pHi d’un acide aminé simple à deux fonctions ionisables ?

Réponse

pHi=pK1+pK22pHi=\frac{pK_1+pK_2}{2}

52Question

Quel est le pHi de la glycine ?

Réponse

6,05.

53Question

Quelles données faut-il connaître pour déterminer la force de la capacité tampon ?

Réponse

Les pK et le pHi.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 24 questions sur Biochimie des acides aminés.

1. Quel rôle les acides aminés jouent-ils dans l’organisme en lien avec les protéines ?

2. Quelle caractéristique distingue la glycine des autres acides aminés décrits comme possédant un carbone α asymétrique ?

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