Flashcards : Biologie moléculaire et PCR — 55 cartes

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1Question

Qu'est-ce qu'un gène ?

Réponse

Une séquence d’ADN avec une partie exprimée et un promoteur.

2Question

Quels composants contient un nucléotide ?

Réponse

Un sucre, une base et un phosphate.

3Question

Quelle différence existe entre nucléotides libres et intégrés dans l'ADN ?

Réponse

Les libres sont triphosphates, les intégrés monophosphates.

4Question

Que contient le promoteur pour initier la transcription ?

Réponse

Des boîtes de séquence fixant des facteurs de transcription.

5Question

Quel est le rôle des facteurs de transcription au promoteur ?

Réponse

Permettre l’initiation de la transcription et recruter l’ARN polymérase.

6Question

Quelle est l'orientation du brin transcrit ou matrice antisens ?

Réponse

Il est orienté 3’→5’ et est le brin inférieur.

7Question

Quelle est l'orientation du brin sens ?

Réponse

Il est orienté 5’→3’ et est le brin supérieur.

8Question

Quel brin est lu par l'ARN polymérase lors de la transcription ?

Réponse

Le brin transcrit ou matrice antisens.

9Question

Quelle différence principale existe entre ARN procaryote et eucaryote ?

Réponse

L'ARN eucaryote contient des introns et des exons, pas le procaryote.

10Question

Quelles étapes composent la maturation de l’ARN prémessager eucaryote ?

Réponse

Elle comprend coiffe 5’, queue poly A 3’ et excision des introns.

11Question

Combien d’adénines contient la queue poly A de l’ARN ?

Réponse

Environ 1000 adénines.

12Question

Quelle séquence est associée à la polyadénylation de l’ARN ?

Réponse

La boîte AAUAAA.

13Question

Par quelles séquences commencent et finissent les introns ?

Réponse

Ils commencent par GT et finissent par AG.

14Question

Quel codon initie la traduction chez les eucaryotes ?

Réponse

Le codon AUG de la méthionine.

15Question

Quels codons terminent la traduction chez les eucaryotes ?

Réponse

Les codons UAA, UAG ou UGA.

16Question

Quelles étapes comprend l'extraction des acides nucléiques ?

Réponse

La lyse, la dénaturation des protéines, l'inactivation des nucléases et la purification.

17Question

Comment peut se faire la lyse tissulaire lors de l'extraction ?

Réponse

Par broyage mécanique.

18Question

Quels agents chimiques ou enzymatiques sont utilisés pour la lyse cellulaire ?

Réponse

Le SDS, le lysozyme et la protéinase K.

19Question

Quel est le degré de pureté des acides nucléiques extraits ?

Réponse

Environ 60 % de pureté.

20Question

Quel gel est utilisé en électrophorèse pour séparer l'ADN double brin ?

Réponse

Un gel d’agarose.

21Question

Sur quel critère l'ADN double brin migre-t-il dans un gel d'agarose ?

Réponse

Selon leur taille en paires de bases.

22Question

À quelle longueur d'onde les acides nucléiques absorbent-ils les ultraviolets ?

Réponse

À 260 nm.

23Question

Quelle molécule absorbe les UV à 280 nm et pourquoi ?

Réponse

Les protéines grâce à leurs acides aminés aromatiques.

24Question

Qu'est-ce que l'hyperchromie en relation avec l'ADN ?

Réponse

L’ADN simple brin absorbe plus les ultraviolets que l’ADN double brin.

25Question

Qu'est-ce qu'une enzyme de restriction ?

Réponse

Une endonucléase qui coupe l'ADN double brin en un site palindromique défini.

26Question

Quelle est l'origine principale des enzymes de restriction ?

Réponse

Elles proviennent notamment des bactéries.

27Question

Quel est le rôle des enzymes de restriction chez les bactéries ?

Réponse

Elles protègent des bactériophages en coupant l'ADN phagique.

28Question

Qu'est-ce qu'un isoschizomère ?

Réponse

Une enzyme qui reconnaît et coupe le même site qu'une autre enzyme.

29Question

Qu'est-ce qu'un néoschizomère ?

Réponse

Une enzyme qui reconnaît le même site mais coupe différemment.

30Question

Quels types de bouts les enzymes de restriction peuvent-elles produire ?

Réponse

Des bouts francs ou des bouts cohésifs.

31Question

Quand deux enzymes de restriction sont-elles compatibles ?

Réponse

Quand leurs extrémités peuvent être ligaturées.

32Question

Quelle enzyme coupe après un nucléotide à pyrimidine sur l'ADN ?

Réponse

La DNAse I.

33Question

Quelle enzyme dégrade l'ARN uniquement dans un hybride ARN-ADN ?

Réponse

La RNAse H.

34Question

Quelle enzyme coupe l'ARN simple ou double brin ?

Réponse

La RNAse A.

35Question

Qu'est-ce que la Taq polymérase ?

Réponse

Une ADN polymérase ADN dépendante de Thermus aquaticus.

36Question

Dans quel sens la Taq polymérase synthétise-t-elle l'ADN ?

Réponse

Dans le sens 5’→3’.

37Question

Quelle activité exonucléasique possède la Taq polymérase ?

Réponse

Une activité exonucléasique 3’→5’.

38Question

Qu'est-ce que la transcriptase inverse ?

Réponse

Une ADN polymérase ARN dépendante.

39Question

Que synthétise la transcriptase inverse à partir d'un brin d'ARN ?

Réponse

Un ADN complémentaire.

40Question

Qu'est-ce que la PCR ?

Réponse

Une réaction enzymatique qui amplifie un fragment d'ADN.

41Question

Quels sont les trois temps d'un cycle de PCR ?

Réponse

Dénaturation, hybridation des amorces, polymérisation.

42Question

Combien de cycles comporte généralement une PCR ?

Réponse

Environ 30 cycles.

43Question

Quelle est la durée approximative d'une PCR ?

Réponse

Environ 1 heure 30 minutes.

44Question

Quelle est la température de dénaturation en PCR ?

Réponse

94 °C pendant 30 secondes.

45Question

Quelle formule exprime la quantité d'ADN après n cycles de PCR sans rendement ?

Réponse

Qn=Q0×2nQ_n = Q_0 \times 2^n

46Question

Comment s'exprime la quantité d'ADN après n cycles avec un rendement r ?

Réponse

Qn=Q0(1+r)nQ_n = Q_0(1+r)^n

47Question

Quels composants sont nécessaires pour la PCR ?

Réponse

ADN matrice, deux amorces, Taq polymérase, désoxyribonucléotides triphosphates, tampon avec Mg2+.

48Question

Quelle est la longueur typique des amorces de PCR ?

Réponse

Environ 20 nucléotides.

49Question

Quelle formule estime la température de fusion des amorces ?

Réponse

Tf=4(G+C)+2(A+T)T_f = 4(G+C) + 2(A+T).

50Question

Quelle précaution impose la sensibilité de la PCR aux contaminations ?

Réponse

Circulation unidirectionnelle de la salle pré-PCR vers la salle post-PCR sans retour.

51Question

Quelle étape caractérise la RT-PCR ?

Réponse

La rétrotranscription de l’ARN en ADN complémentaire.

52Question

Que permet la PCR multiplex ?

Réponse

D’amplifier plusieurs fragments dans un même tube.

53Question

Que suit la PCR quantitative ?

Réponse

La quantité de produit à chaque cycle.

54Question

Que représente le cycle seuil CT en PCR quantitative ?

Réponse

L’entrée dans la phase exponentielle à un seuil commun de fluorescence.

55Question

Comment la PCR digitale estime-t-elle la quantité de cible ?

Réponse

Par compartimentation et application de la loi de Poisson.

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Teste tes connaissances avec un QCM de 24 questions sur Biologie moléculaire et PCR.

1. Qu’est-ce qui caractérise une enzyme de restriction ?

2. Quelle succession décrit correctement les principales étapes thermiques d’un cycle de PCR ?

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