Flashcards : Enzymologie générale et catalyse (51 cartes)

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1Question

Quelle enzyme Anselme Payen a-t-il découverte en décomposant l’amidon?

Réponse

La diastase.

2Question

Quelle définition de la catalyse Jöns Jacob Berzelius a-t-il donnée en 1835?

Réponse

L’accélération d’une réaction chimique par une substance inchangée.

3Question

Quelle découverte Eduard Buchner a-t-il faite en 1897 sur les extraits de levures?

Réponse

Ils restent catalytiquement actifs sans être vivants.

4Question

Quelle distinction Eduard Buchner a-t-il établi en 1897?

Réponse

L’activité biologique est distincte du caractère vivant.

5Question

Quelle est l'équation générale d'une réaction enzymatique ?

Réponse

E+S⇌ES→E+PE + S \rightleftharpoons ES \rightarrow E + P

6Question

Que se forme d'abord dans une réaction enzymatique ?

Réponse

Le complexe enzyme-substrat se forme de manière réversible.

7Question

Que se passe-t-il après la formation du complexe enzyme-substrat ?

Réponse

Le produit est libéré et l'enzyme régénérée.

8Question

Qu'est-ce qu'une enzyme ?

Réponse

Un catalyseur biologique qui accélère une réaction sans être consommé.

9Question

Quelle est la nature fréquente des enzymes ?

Réponse

Ce sont souvent des protéines.

10Question

Que signifie que l'enzyme est régénérée à la fin du cycle ?

Réponse

Elle n'est pas consommée et redevient active.

11Question

Quelle différence principale existe entre réactions cataboliques et anaboliques ?

Réponse

Les réactions cataboliques dégradent des molécules, les anaboliques les synthétisent.

12Question

Comment les enzymes utilisent-elles l'énergie pour coupler des réactions ?

Réponse

Elles récupèrent l’énergie d’une réaction favorable pour réaliser une réaction défavorable.

13Question

Qu'est-ce qu'une protéine globulaire soluble ?

Réponse

Une chaîne d'acides aminés repliée en ensemble compact avec cœur hydrophobe et périphérie polaire hydratée.

14Question

Que se passe-t-il si des résidus hydrophobes sont à la surface d'une protéine mal repliée ?

Réponse

Les protéines s'associent, forment des agrégats et peuvent précipiter.

15Question

Quelle est l'énergie typique d'une liaison covalente ?

Réponse

Environ 100 kcal/mol.

16Question

Quelle est l'énergie typique des liaisons faibles ?

Réponse

De l'ordre de 1 à 2 kcal/mol.

17Question

Quels sont les principaux types de liaisons faibles ?

Réponse

Liaisons hydrogène, ioniques, Van der Waals et hydrophobes.

18Question

Quelle proportion de l'énergie totale du repliement protéique représentent les liaisons hydrophobes ?

Réponse

Environ 50 %.

19Question

Que caractérise l'état natif N d'une protéine ?

Réponse

Une protéine correctement repliée.

20Question

Comment est l'état dénaturé U d'une protéine ?

Réponse

Une protéine mal repliée mais pas totalement débobinée.

21Question

Quel chemin suit le repliement protéique ?

Réponse

De l'état U vers un état intermédiaire I, puis vers des structures presque idéales, enfin l'état natif N.

22Question

Que dit le paradoxe de Levinthal sur le repliement aléatoire ?

Réponse

Il prendrait un temps supérieur à l'âge de l'univers.

23Question

Quelle implication tire Levinthal du paradoxe sur l'évolution des protéines ?

Réponse

L'évolution a sélectionné des structures capables de se replier correctement.

24Question

Qu'est-ce qu'une protéine chaperonne reconnaît sur une protéine instable ?

Réponse

Les conformations instables exposant des résidus hydrophobes.

25Question

Comment une protéine chaperonne aide-t-elle une protéine à se replier ?

Réponse

Elle aide à retrouver une conformation correctement repliée sans accompagner jusqu’à l’état natif.

26Question

Que font les chaperonnes après avoir reconnu les surfaces hydrophobes exposées ?

Réponse

Elles déstructurent partiellement la protéine grâce à de l’énergie.

27Question

Que se passe-t-il après la déstructuration partielle par les chaperonnes ?

Réponse

Elles libèrent la protéine pour qu’elle puisse se replier correctement.

28Question

Quelles étapes alternent dans le cycle des chaperonines ?

Réponse

Expansion de la cavité, inversion de la polarité des parois, contraction et expulsion de la protéine repliée.

29Question

Qu'est-ce que le turnover enzymatique ?

Réponse

La capacité d'une enzyme à transformer un nombre de substrats par seconde.

30Question

Que signifie un Kcat de 39 pour l'orotidine MP-DC ?

Réponse

L'enzyme peut transformer jusqu'à 39 molécules de substrat par seconde.

31Question

Par quel facteur l'anhydrase carbonique accélère-t-elle sa réaction ?

Réponse

Par un facteur de 7,7⋅1067,7·10^{6}.

32Question

Quelle est la demi-vie de la réaction catalysée par l'anhydrase carbonique sans enzyme ?

Réponse

5 secondes.

33Question

Quand le terme enzyme a-t-il été utilisé pour la première fois?

Réponse

En 1877.

34Question

Quelle est l’origine du mot « enzyme »?

Réponse

Il vient du grec « énzymon » signifiant « dans le levain ».

35Question

Combien de substrats interviennent dans la plupart des réactions biologiques ?

Réponse

Au moins deux substrats interviennent.

36Question

Quel est le schéma élémentaire simplifié d'une réaction enzymatique ?

Réponse

Un substrat se transforme en produit : S → P.

37Question

Pour quelles utilisations les enzymes sont-elles employées en analyse ?

Réponse

Pour doser des substrats, mesurer l’activité enzymatique et cibler médicaments ou toxiques.

38Question

Quelles sont les applications industrielles des enzymes en fermentation ?

Réponse

La fabrication de bière, pain, vin et bioéthanol par fermentation.

39Question

Quel autre usage industriel des enzymes est mentionné en dehors de la fermentation ?

Réponse

Les biocapteurs de glucose.

40Question

Quelle est la taille d'un domaine protéique en acides aminés ?

Réponse

Entre 70 et 200 acides aminés.

41Question

Combien de domaines contient en moyenne une protéine ?

Réponse

Deux à trois domaines en moyenne.

42Question

Quelle énergie moyenne libère la fixation d'un ligand enzymatique ?

Réponse

Entre 5 et 10 kcal/mol.

43Question

Quel effet la fixation d'un ligand enzymatique provoque-t-elle sur la protéine ?

Réponse

Un réarrangement conformationnel spécifique.

44Question

Quelles caractéristiques possèdent les protéines thermophiles ?

Réponse

Un large cœur hydrophobe, de nombreux ponts disulfure et des liaisons hydrogène et ioniques fortes.

45Question

Comment sont les protéines psychrophiles par rapport à la flexibilité et la dénaturation ?

Réponse

Plus flexibles et plus facilement dénaturées.

46Question

Combien de sous-unités GroEL composent les deux tonneaux des chaperonines GroEL-GroES ?

Réponse

14 sous-unités GroEL.

47Question

Combien de sous-unités GroES forment les couvercles des chaperonines GroEL-GroES ?

Réponse

7 sous-unités GroES par couvercle.

48Question

Quelle est la demi-vie de la réaction d'orotidine MP-DC sans enzyme ?

Réponse

78 000 000 ans.

49Question

Par quel facteur l'enzyme accélère-t-elle la réaction d'orotidine MP-DC ?

Réponse

Par un facteur de 1,4⋅10171,4·10^{17}.

50Question

Quelle transformation catalyse l'anhydrase carbonique ?

Réponse

Elle transforme le bicarbonate HCO3− en CO2.

51Question

Pourquoi l'anhydrase carbonique transforme-t-elle le bicarbonate en CO2 ?

Réponse

Pour permettre l'élimination pulmonaire du CO2 produit par les muscles.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 21 questions sur Enzymologie générale et catalyse.

1. Quelle découverte est attribuée à Anselme Payen en 1871 ?

2. Que décrit Jöns Jacob Berzelius en 1835 lorsqu’il définit la catalyse ?

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