Fiche de révision : Flores microbiennes et infections

📋 Plan du Cours

1. Écosystèmes et flores microbiennes
2. Biofilm et persistance microbienne
3. Relations hôte microorganisme
4. Flore endogène et défenses
5. Pathogénicité et transmission
6. Antibiorésistance et prévention
7. BMR et BHRe

📖 1. Écosystèmes et flores microbiennes

🔑 Notions clés & Définitions

• Écosystème : Larousse — Système formé par un environnement, appelé biotope, et par l’ensemble des espèces, appelé biocénose, qui y vivent, s’y nourrissent et s’y reproduisent.
• Flore microbienne : La totalité des micro-organismes présents dans un environnement spécifique.
• Flore endogène : Ensemble complexe de bactéries et de protozoaires présent sur la peau et une grande partie des muqueuses, entretenant des relations de commensalisme.
• Flore exogène : La flore exogène regroupe les flores différentes de la flore endogène, notamment les flores environnementales et celles des autres individus et êtres vivants.
• Flore transitoire : La flore transitoire correspond aux micro-organismes de passage acquis au contact de personnes, de surfaces ou d’objets lors des gestes quotidiens.

💡 Astuce mémo

Endogène = résidente ; exogène = acquise

📖 2. Biofilm et persistance microbienne

🔑 Notions clés & Définitions

• Biofilm : Bryers, 1987 — Une collection de micro-organismes vivants ou morts et de leurs produits extracellulaires liés à une surface solide, vivante ou inanimée.

★ À maîtriser

• On estime que 99 % des bactéries vivent dans des biofilms et que les biofilms sont impliqués dans 80 % des infections humaines.

• 🔄 La formation et la maturation d’un biofilm reposent notamment sur: l’adhésion à une surface, l’organisation en structure hétérogène, la communication chimique entre bactéries par quorum sensing

• La structure du biofilm constitue une barrière à la diffusion des antiseptiques et des antibiotiques, tandis que le ralentissement métabolique diminue la sensibilité aux biocides.

Compléments

• Les persisters sont une sous-population bactérienne minoritaire présentant une insensibilité majeure aux biocides, phénomène réversible et non génétiquement stable.

• La proximité des bactéries au sein du biofilm favorise les échanges génétiques.

💡 Astuce mémo

Matrice et faible métabolisme → tolérance accrue aux biocides

📖 3. Relations hôte microorganisme

🔑 Notions clés & Définitions

• Saprophytisme : Un état d’indépendance totale dans lequel les micro-organismes vivent des matières organiques de cadavres et des résidus végétaux sans relation avec d’autres êtres vivants.
• Symbiose : Une association nécessaire à la survie des micro-organismes.
• Commensalisme : Une relation dans laquelle les micro-organismes vivent et se nourrissent auprès d’autres êtres vivants sans leur nuire.
• Parasitisme : Une relation dans laquelle le micro-organisme vit aux dépens de l’hôte qui l’héberge, comme les parasites responsables de parasitoses ou les virus dans les cellules hôtes.

💡 Astuce mémo

Commensalisme ne nuit pas ; parasitisme nuit à l’hôte

📖 4. Flore endogène et défenses

★ À maîtriser

• Le microbiote humain comprend notamment:

  • le microbiote cutané
  • le microbiote respiratoire
  • le microbiote buccal
  • le microbiote génito-urinaire
  • le microbiote intestinal

• La flore endogène joue un rôle majeur dans:

  • la digestion
  • l’équilibre des épithéliums
  • le pH
  • la formation de biofilms
  • la synthèse de vitamines
  • la digestion de la cellulose
  • le contrôle des infections
  • le système immunitaire

• Les défenses non spécifiques de l’hôte comprennent: la barrière physique cutanée, les acides gras et les commensaux cutanés, le mucus et les cils respiratoires, le lysozyme des larmes et sécrétions, les facteurs antimicrobiens salivaires, l’élimination des particules par l’air, les cellules de Paneth, le rinçage urinaire

Compléments

• La flore endogène est présente dès la naissance et se régénère rapidement.

• La densité bactérienne varie selon le site, de 100 à 1 000 000 par cm² pour la flore cutanée, jusqu’à 1 000 000 000 000 par gramme pour la flore intestinale.

💡 Astuce mémo

Flore endogène équilibrée → digestion, protection et immunité

📖 5. Pathogénicité et transmission

🔑 Notions clés & Définitions

• Infection : La manifestation du conflit entre l’hôte et l’agent pathogène, pouvant être locale, régionale ou générale, et clinique ou biologique.

★ À maîtriser

• 🔄 Le cycle de l’infection suit la séquence:
  1. réservoir
  2. source ou porte de sortie
  3. exposition
  4. contamination
  5. hôte réceptif

📌 La transmission peut être verticale de la mère à l’enfant ou horizontale entre individus, et elle peut être directe du réservoir à l’hôte ou indirecte par un vecteur comme le matériel, les aliments ou l’eau.

📌 Les particules aériennes de moins de 5 µm forment des aérosols, tandis que les particules de plus de 5 µm forment des gouttelettes.

• La virulence correspond à une notion quantitative du pouvoir pathogène et dépend notamment de la dose infectante ou inoculum.

Compléments

• La méningite à méningocoque ne touche qu’un sujet porteur dans le nasopharynx sur 10 000.

💡 Astuce mémo

Réservoir → source → exposition → hôte réceptif

📖 6. Antibiorésistance et prévention

📝 Points essentiels

📌 Les antibiotiques ne provoquent pas les mutations de résistance, mais exercent une pression de sélection qui favorise les mutants déjà résistants, et peuvent stimuler les échanges de gènes ou l’expression des gènes.

• La lutte contre les bactéries multirésistantes repose sur la prévention de la transmission croisée et la limitation de l’émergence liée à la pression de sélection antibiotique.

• La prévention des bactéries multirésistantes comprend:

  • le dépistage
  • les précautions standard
  • les précautions complémentaires
  • l’hygiène des mains
  • la gestion des excrétas
  • la bonne gestion des antibiotiques

💡 Astuce mémo

Pression antibiotique → sélection de résistants → transmission croisée

📖 7. BMR et BHRe

🔑 Notions clés & Définitions

• Bactérie multirésistante : Une bactérie multirésistante est une bactérie qui reste sensible à peu de familles d’antibiotiques, avec une fréquence élevée, un potentiel de transmission croisée important et des résistances aisément transférables.
• Bactérie hautement résistante émergente : Une bactérie hautement résistante émergente possède les caractéristiques d’une BMR, mais sa fréquence est peu élevée et elle est généralement commensale du tube digestif.

📝 Points essentiels

• Le Staphylococcus aureus résistant à la méticilline et les entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre élargi sont des exemples de bactéries multirésistantes.

• Les entérocoques résistants à la vancomycine et les entérobactéries productrices de carbapénémase sont des exemples de bactéries hautement résistantes émergentes.

• Les bactéries hautement résistantes émergentes sont souvent responsables de foyers hospitaliers, d’épidémies difficiles à maîtriser et de transmissions liées à la gestion des excrétas et aux réservoirs environnementaux.

💡 Astuce mémo

BMR fréquentes ; BHRe rares mais hautement résistantes

📊 Tableaux de synthèse

Types de flores microbiennes

Relations hôte microorganisme