Fiche de révision : Généralités de bactériologie

📋 Plan du Cours

1. Microbiologie et agents infectieux
2. Virus, champignons et bactéries
3. Structure et multiplication bactériennes
4. Biofilms, spores et besoins bactériens
5. Flores commensales et prélèvements
6. Relations hôte-bactérie
7. Défenses immunitaires de l’hôte
8. Antibiotiques et résistances
9. Diagnostic bactériologique et BMR
10. Antisepsie et désinfection
11. Vaccination et prévention

📖 1. Microbiologie et agents infectieux

🔑 Notions clés & Définitions

• Microbiologie : Ensemble des disciplines biologiques qui étudient les microorganismes, notamment les bactéries, les champignons, les parasites et les virus.
• Agent infectieux : Agent biologique pathogène responsable d’une infection ou d’une maladie infectieuse.

★ À maîtriser

• Les quatre grandes catégories d’agents infectieux sont:
  • les bactéries
  • les virus
  • les parasites
  • les champignons

Compléments

• Au XVIIème siècle, Van Leeuwenhoek invente le microscope et découvre les « animalcules microscopiques ».

📖 2. Virus, champignons et bactéries

🔑 Notions clés & Définitions

• Bactérie : Être unicellulaire procaryote dépourvu de noyau et d’organites, possédant généralement un chromosome d’ADN double brin circulaire et se reproduisant par scissiparité.
• Virus : Agent infectieux acellulaire possédant un seul type d’acide nucléique, ADN ou ARN, qui ne se multiplie qu’à l’intérieur d’une cellule vivante.

★ À maîtriser

📌 Les virus sont protégés par une capside protéique avec ou sans enveloppe, les champignons sont eucaryotes à ADN et les bactéries sont des procaryotes à ADN double brin protégés par une paroi.

Compléments

• Les bactéries mesurent généralement 1 à 10 μm, les virus environ 150 nm et les spores d’Aspergillus 2 à 100 μm.

💡 Astuce mémo

Virus obligatoirement intracellulaires, bactéries et champignons capables de se multiplier hors des cellules

📖 3. Structure et multiplication bactériennes

★ À maîtriser

📌 Les bactéries peuvent être des coques ou cocci arrondis, disposés en grappes chez les staphylocoques ou en chaînettes chez les streptocoques, ou des bacilles en bâtonnets.

📌 Les bactéries Gram positives restent violettes après l’alcool, tandis que les bactéries Gram négatives sont décolorées puis apparaissent roses après contre-coloration à la fuchsine.

• La multiplication bactérienne se fait par division binaire au niveau d’un septum central, produisant une population clonale qui peut former une colonie visible en culture.

Compléments

• Escherichia coli peut se multiplier toutes les 20 minutes et la majorité des bactéries forment des colonies visibles après 18 à 24 heures de culture.

💡 Astuce mémo

Forme → Gram → division → colonie

📖 4. Biofilms, spores et besoins bactériens

🔑 Notions clés & Définitions

• Biofilm : Communauté bactérienne organisée dans un glycocalix composé de polysaccharides et de protéines, favorisant l’adhésion aux matériels étrangers et la persistance de l’infection.
• Spore : Forme bactérienne au repos, produite en conditions défavorables, qui ne se multiplie plus et peut germer lorsque les conditions redeviennent favorables.

📝 Points essentiels

📌 Un biofilm sur une prothèse peut nécessiter le retrait du matériel si le lavage est insuffisant et impose un traitement antibiotique prolongé.

📌 Les bactéries sporulées résistent à la dessiccation, à la chaleur, à certains agents chimiques, aux antibiotiques, aux antiseptiques et à l’alcool, de sorte que les solutions hydro-alcooliques ne suffisent pas.

💡 Astuce mémo

Matériel étranger → biofilm → traitement prolongé ou retrait du matériel

📖 5. Flores commensales et prélèvements

🔑 Notions clés & Définitions

• Microbiote : Ensemble des microorganismes vivant dans un environnement spécifique, notamment les bactéries, les champignons et les virus.

★ À maîtriser

• Les principales flores commensales comprennent: la flore oro-pharyngée avec les streptocoques, la flore digestive avec notamment les anaérobies, la flore cutanée avec notamment les staphylocoques, la flore vaginale avec notamment les lactobacilles

📌 Dans un prélèvement normalement stérile comme le sang, les urines, le LCR ou le liquide articulaire, la présence d’une bactérie évoque une infection, tandis que dans un prélèvement colonisé elle peut correspondre à une contamination, une colonisation ou une infection.

Compléments

📌 La flore cutanée résidente est stable et comprend notamment les staphylocoques à coagulase négative, les corynébactéries et les propionibactéries, tandis que la flore transitoire comprend notamment Streptococcus A et Staphylococcus aureus.

💡 Astuce mémo

Prélèvement stérile : bactérie = infection ; prélèvement colonisé : bactérie = contamination, colonisation ou infection

📖 6. Relations hôte-bactérie

🔑 Notions clés & Définitions

• Pathogène opportuniste : Microorganisme qui provoque une infection lorsque les défenses de l’hôte diminuent ou lorsqu’une porte d’entrée apparaît.

★ À maîtriser

• Le portage sain correspond à l’hébergement de bactéries pathogènes sans maladie, comme Streptococcus A, le pneumocoque ou le méningocoque, et ce portage est transitoire.

• 🔄 Le processus infectieux suit trois étapes:

  1. colonisation
  2. pénétration ou invasion avec multiplication intra- ou extracellulaire
  3. destruction des cellules ou des tissus

Compléments

• Les bactéries pathogènes peuvent provenir de la flore commensale, de l’environnement ou des animaux, notamment Clostridium difficile après antibiothérapie, Staphylococcus aureus lors d’une infection opératoire, Aeromonas après traumatisme contaminé par l’eau et Pasteurella après morsure.

💡 Astuce mémo

Déséquilibre entre virulence et défenses → infection

📖 7. Défenses immunitaires de l’hôte

🔑 Notions clés & Définitions

• Immunodépression : Diminution ou perte des défenses immunitaires augmentant le risque d’infections répétées, graves ou dues à des microorganismes habituellement bénins.

★ À maîtriser

• Les défenses locales empêchent l’entrée des microorganismes grâce à des facteurs mécaniques, chimiques et à la flore de barrière.

📌 L’immunité innée est rapide, identique quel que soit le microorganisme et fait intervenir notamment les macrophages, les polynucléaires et le complément, tandis que l’immunité adaptative est spécifique, plus tardive et dotée d’une mémoire immunitaire.

Compléments

• Les barrières mécaniques comprennent notamment:
  • les jonctions serrées
  • le péristaltisme
  • le flux urinaire
  • le mucus
  • les cils
  • la toux
  • les paupières
  • les larmes

💡 Astuce mémo

Barrières locales → immunité innée → immunité adaptative

📖 8. Antibiotiques et résistances

🔑 Notions clés & Définitions

• Antibiotique : Substance naturelle ou synthétique qui inhibe spécifiquement certains processus vitaux des microorganismes à très faible dose.

📝 Points essentiels

• Les principales cibles des antibiotiques sont:
  • la paroi
  • les membranes
  • l’ADN
  • le ribosome

📌 Un antibiotique n’est pas actif sur toutes les bactéries, car son action dépend de l’accès à la cible, du maintien d’une concentration suffisante et de la reconnaissance de cette cible.

📌 Le bon usage des antibiotiques repose sur le choix du bon antibiotique, de la bonne durée et de la bonne dose, avec une réévaluation selon l’antibiogramme.

📖 9. Diagnostic bactériologique et BMR

🔑 Notions clés & Définitions

• Antibiogramme : Test in vitro qui détermine la sensibilité d’une bactérie aux antibiotiques par les concentrations minimales inhibitrices ou les diamètres d’inhibition.
• Bactérie multirésistante : Bactérie résistante à des antibiotiques clés avec une facilité de propagation du mécanisme de résistance, sans que la classification dépende seulement du nombre de molécules concernées.

📝 Points essentiels

• 🔄 Les étapes du diagnostic bactériologique sont:
  1. examen macroscopique et microscopique
  2. mise en culture
  3. identification de la bactérie
  4. antibiogramme
  5. diagnostic et traitement

📌 La résistance naturelle est commune à toutes les souches d’une espèce bactérienne, tandis que la résistance acquise concerne certaines souches et résulte de mutations ou de l’acquisition de gènes exogènes.

💡 Astuce mémo

Prélèvement → examen → culture → identification → antibiogramme

📖 10. Antisepsie et désinfection

★ À maîtriser

📌 L’antisepsie s’applique aux tissus vivants, la désinfection aux surfaces ou objets inanimés et la stérilisation obtient l’absence de microorganismes.

📌 Les antiseptiques ont généralement un spectre large et une action rapide, tandis que les antibiotiques ont un spectre plus étroit et une action plus lente.

Compléments

• Les antiseptiques agissent notamment sur les bactéries végétatives et sporulées, les virus et les champignons, avec une bactéricidie in vitro de 5 Log, contre 4 Log pour les antibiotiques dans le tableau présenté.

💡 Astuce mémo

Antiseptique sur tissu vivant, désinfectant sur objet inanimé, stérilisation sans microorganisme

📖 11. Vaccination et prévention

🔑 Notions clés & Définitions

• Vaccination : Immunoprophylaxie active qui induit une réponse immunitaire spécifique, différée et durable, afin d’éviter une maladie ou d’en réduire les manifestations lors d’une exposition ultérieure.

★ À maîtriser

📌 Les vaccins vivants atténués contiennent des agents infectieux vivants dont la virulence est diminuée, tandis que les vaccins inertes contiennent des agents inactivés ou des composants isolés sans pouvoir infectant.

📌 Les vaccins vivants atténués procurent généralement une protection rapide et prolongée avec des rappels souvent inutiles, tandis que les vaccins inertes ont une immunogénicité plus faible et nécessitent souvent des rappels.

Compléments

• Les vaccins antibactériens cités comprennent notamment:
  • la diphtérie
  • le tétanos
  • la poliomyélite
  • la coqueluche
  • Haemophilus influenzae de type b
  • le pneumocoque
  • le méningocoque
  • la tuberculose
  • la typhoïde
  • la leptospirose

💡 Astuce mémo

Vaccin vivant atténué : protection rapide et durable ; vaccin inerte : rappels nécessaires

📊 Tableaux de synthèse

Comparaison des microorganismes

Types de résistance bactérienne