Où ont lieu simultanément transcription et traduction chez les procaryotes ?
Dans le cytoplasme.
Où se déroule la transcription chez les eucaryotes ?
Dans le noyau.
Chez Saccharomyces cerevisiae, où se trouve la boîte TATA du promoteur cœur par rapport au TSS ?
À environ −90 nucléotides.
Chez Saccharomyces cerevisiae, à quelle position se trouve le TSS ?
À +1.
Chez les mammifères, où se trouve la boîte TATA du promoteur cœur par rapport au TSS ?
À −30 nucléotides.
Chez les mammifères, à quelle position se trouve le TSS ?
À +1.
Quel effet les enhancers ont-ils sur la transcription ?
Ils stimulent la transcription.
Quels ARN l’ARN polymérase II synthétise-t-elle ?
Les ARNm et certains petits ARN nucléaires, ou snARN.
Quel facteur se fixe d’abord à la boîte TATA lors de l’assemblage du complexe de pré-initiation ?
TFIID, via TBP.
Que permet l’ajout d’extraits nucléaires à l’ADN promoteur minimal avec l’ARN polymérase II pure et les quatre NTP ?
Une transcription basale fonctionnelle.
Quelle est la composition approximative du complexe Mediator ?
Environ 30 sous-unités.
Quel signal le complexe Mediator transmet-il au complexe de pré-initiation ?
Le signal d’activation des facteurs fixés sur les enhancers ou les UAS.
Comment un répresseur peut-il concurrencer un activateur ?
En occupant le même site ADN.
Comment un répresseur peut-il empêcher l’action du domaine d’activation ?
En masquant le domaine d’activation.
Comment un répresseur peut-il modifier la chromatine ?
En recrutant des facteurs comme HDAC.
Qu’est-ce qu’un nucléosome ?
L’unité fondamentale de la chromatine, formée d’un octamère d’histones entouré de 147 paires de bases d’ADN.
Quelles propriétés caractérisent l’euchromatine ?
Elle est ouverte, accessible et transcriptionnellement active.
Quelles propriétés caractérisent l’hétérochromatine ?
Elle est condensée, inaccessible et transcriptionnellement silencieuse.
Que crée le facteur pionnier A1 en déplaçant localement les nucléosomes ?
Une région libre de nucléosomes, accessible aux facteurs A2, A3, A4 et aux facteurs généraux de transcription.
À quoi le facteur pionnier A1 se fixe-t-il directement ?
À l’ADN compacté dans les nucléosomes.
Qu’est-ce qu’une marque épigénétique ?
Une modification chimique covalente et réversible de l’ADN ou des histones, sans changement de la séquence nucléotidique.
Que font les writers, les readers et les erasers des marques épigénétiques ?
Les writers les déposent, les readers les reconnaissent et les lisent, et les erasers les retirent.
Quelle modification de l’ADN prédomine chez les mammifères ?
La méthylation de la cytosine en position 5 des dinucléotides CpG.
À quel état du gène la méthylation d’un promoteur est-elle associée ?
À un gène silencieux et à une chromatine fermée.
Quels effets la méthylation des histones peut-elle avoir sur la transcription ?
Elle peut activer ou réprimer la transcription selon le résidu méthylé.
Que provoque l’acétylation des lysines des queues d’histones ?
Elle neutralise leur charge positive et relâche la chromatine vers un état d’euchromatine associé à l’activation.
Quelles étapes de maturation les ARNm eucaryotes subissent-ils ?
Le coiffage, la polyadénylation et l’épissage.
Quelles étapes de maturation les ARNm procaryotes ne subissent-ils pas ?
Le coiffage, la polyadénylation et l’épissage.
Comment l’ADN procaryote est-il principalement organisé ?
Il est quasi nu et majoritairement circulaire.
Comment l’ADN eucaryote est-il organisé ?
En nucléosomes dans la chromatine.
Combien d’ARN polymérases principales les eucaryotes possèdent-ils ?
Trois : les polymérases I, II et III.
À quelle étape se situe principalement le contrôle de la transcription procaryote ?
À l’initiation de la transcription.
Chez la levure, que facilitent les protéines activatrices fixées aux séquences UAS ?
La fixation de l’ARN polymérase II.
Jusqu’à quelle position s’étend le promoteur proximal des mammifères ?
Jusqu’à −200 nucléotides.
De −1 000 à −50 000 paires de bases, quelle région régulatrice des mammifères porte des éléments à distance ?
Le promoteur distal.
Quels ARNr l’ARN polymérase I synthétise-t-elle ?
Les ARNr 28S, 18S et 5,8S.
Quels ARN l’ARN polymérase III synthétise-t-elle ?
Les ARNt, l’ARNr 5S et d’autres petits ARN.
Combien de sous-unités compte l’ARN polymérase II ?
Douze sous-unités.
Quelle séquence répétée constitue le domaine CTD de l’ARN polymérase II ?
Le heptapeptide YSPTSPS.
Quelle proportion des gènes humains possède une boîte TATA ?
Environ 30 %.
Par quel élément de l’ARN polymérase II le Mediator est-il recruté ?
Par son CTD.
À quoi le Mediator contribue-t-il au niveau de l’ARN polymérase II ?
À sa fixation.
Avec quels facteurs le Mediator interagit-il directement à distance ?
Avec les facteurs activateurs fixés à distance.
Quelle longueur d’ADN peut être associée à un nucléosome ?
De 147 à 160 paires de bases.
Que forme l’ajout de l’histone H1 à un nucléosome ?
Un chromatosome stabilisé.
Quels types d’histones composent l’octamère nucléosomique ?
H2A, H2B, H3 et H4.
Quelles enzymes déposent et effacent la méthylation de l’ADN ?
Les DNMT la déposent et les enzymes TET l’effacent.
Quel effet la phosphorylation des sérines des histones a-t-elle sur la transcription ?
Elle a un effet activateur sur la transcription et la réponse cellulaire.
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1. Une particule de chromatine comprend un octamère d’histones et un segment d’ADN directement enroulé autour de lui. Quelle longueur d’ADN correspond à cette organisation fondamentale ?
2. Une modification chimique est apportée à une histone, peut être inversée et ne change pas la séquence nucléotidique de l’ADN. Comment la désigne-t-on ?
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