QCM : Initiation de la transcription et épigénétique (17 questions)

Question 1

1. Une particule de chromatine comprend un octamère d’histones et un segment d’ADN directement enroulé autour de lui. Quelle longueur d’ADN correspond à cette organisation fondamentale ?

147 paires de bases

180 paires de bases

160 paires de bases

8 paires de bases

Explication

Le nucléosome comprend un octamère d’histones entouré directement par 147 paires de bases d’ADN. La valeur de 160 confond cette longueur directe avec la plage d’ADN parfois associée au nucléosome, 180 surestime le segment, et 8 confond paires de bases et histones.

Answer

147 paires de bases

Question 2

2. Une modification chimique est apportée à une histone, peut être inversée et ne change pas la séquence nucléotidique de l’ADN. Comment la désigne-t-on ?

Une modification de séquence

Une mutation nucléotidique

Une marque épigénétique

Une altération irréversible

Explication

Une marque épigénétique est une modification chimique covalente et réversible de l’ADN ou des histones, sans changement de la séquence nucléotidique. Une mutation ou une modification de séquence altère la séquence, tandis qu’une altération irréversible ne respecte pas le caractère réversible.

Answer

Une marque épigénétique

Question 3

3. Dans une région génomique, l’ADN est condensé et peu accessible aux facteurs de transcription, et les gènes y sont silencieux. À quel état de chromatine cette région correspond-elle ?

À l’euchromatine

À une région libre de nucléosomes

À une chromatine décondensée

À l’hétérochromatine

Explication

L’hétérochromatine est condensée, inaccessible et transcriptionnellement silencieuse. L’euchromatine désigne l’état ouvert et actif, une région libre de nucléosomes décrit une configuration locale d’accessibilité, et la chromatine décondensée correspond à l’état ouvert.

Answer

À l’hétérochromatine

Question 4

4. Lors d’un assemblage du complexe de pré-initiation, TFIIA et TFIIB sont déjà associés de part et d’autre de TFIID. Quelle étape doit suivre ?

L’ARN polymérase II peu ou non phosphorylée arrive avec TFIIF

L’ARN polymérase II peu ou non phosphorylée arrive avec TFIIE

TFIIH phosphoryle le CTD avant l’arrivée de l’ARN polymérase II

TFIIH est recruté avant l’ARN polymérase II et TFIIF

Explication

Après la fixation de TFIIA et TFIIB, l’ARN polymérase II peu ou non phosphorylée arrive avec TFIIF; TFIIE puis TFIIH sont recrutés ensuite. Associer la polymérase à TFIIE confond son partenaire d’arrivée avec le facteur recruté à l’étape suivante, et placer TFIIH ou la phosphorylation plus tôt inverse l’ordre d’assemblage.

Answer

L’ARN polymérase II peu ou non phosphorylée arrive avec TFIIF

Question 5

5. Un répresseur se fixe sur une région régulatrice et recrute une HDAC, entraînant une chromatine moins favorable à la transcription. Quel mécanisme de répression illustre cette situation ?

La modification de la chromatine par recrutement d’un facteur tel qu’une HDAC

La compétition avec l’activateur pour son site de fixation sur l’ADN

Le masquage du domaine d’activation de l’activateur

Le blocage direct du recrutement du complexe Mediator

Explication

Le recrutement d’une HDAC correspond à une modification de la chromatine qui peut contribuer à bloquer la transcription. La compétition vise le site ADN de l’activateur, le masquage concerne son domaine d’activation, et le blocage de Mediator constitue un autre mécanisme distinct.

Answer

La modification de la chromatine par recrutement d’un facteur tel qu’une HDAC

Question 6

6. Quelle comparaison décrit correctement le nombre d’ARN polymérases chez les procaryotes et les eucaryotes ?

Une chez les procaryotes ; trois principales, plus celles des organites, chez les eucaryotes

Trois chez les procaryotes ; une principale, plus celles des organites, chez les eucaryotes

Trois chez les procaryotes ; trois principales chez les eucaryotes, sans polymérases d’organites

Une chez les procaryotes ; une seule chez les eucaryotes, répartie entre plusieurs fonctions

Explication

Les procaryotes possèdent une seule ARN polymérase, tandis que les eucaryotes en ont trois principales — I, II et III — ainsi que des polymérases d’organites. Les autres réponses inversent les nombres, réduisent le nombre eucaryote ou omettent les polymérases d’organites.

Answer

Une chez les procaryotes ; trois principales, plus celles des organites, chez les eucaryotes

Question 7

7. Un activateur fixé sur un enhancer distant stimule un gène. Quel rôle le complexe Mediator joue-t-il dans cette activation ?

Recruter une HDAC pour inhiber la transcription

Transmettre au complexe de pré-initiation le signal d’activation

Reconnaître la boîte TATA et y fixer le complexe de pré-initiation

Ouvrir l’ADN et phosphoryler la sérine 5 du CTD

Explication

Mediator transmet au complexe de pré-initiation le signal des facteurs activateurs fixés sur les enhancers ou les UAS. La reconnaissance de la boîte TATA relève de TFIID, l’ouverture de l’ADN et la phosphorylation du CTD de TFIIH, et le recrutement d’HDAC est un mécanisme de répression.

Answer

Transmettre au complexe de pré-initiation le signal d’activation

Question 8

8. Quel type d’ARN l’ARN polymérase II synthétise-t-elle en plus des ARNm ?

Les ARNr 28S, 18S et 5,8S

Certains petits ARN nucléaires, ou snARN

Les ARN de transfert, ou ARNt

L’ARNr 5S

Explication

L’ARN polymérase II synthétise les ARNm et certains snARN. Les ARNt et l’ARNr 5S relèvent de l’ARN polymérase III, tandis que les ARNr 28S, 18S et 5,8S relèvent de l’ARN polymérase I.

Answer

Certains petits ARN nucléaires, ou snARN

Question 9

9. Une cellule doit déposer une marque sur la chromatine, la faire reconnaître par une protéine, puis la retirer pour revenir à l’état basal. Quels rôles assurent ces trois étapes, dans l’ordre ?

Writers, erasers, puis readers

Readers, erasers, puis writers

Erasers, writers, puis readers

Writers, readers, puis erasers

Explication

Les writers déposent les marques, les readers les reconnaissent et les lisent, et les erasers les retirent afin de permettre un retour à l’état basal. L’ordre readers-erasers-writers inverse les étapes, erasers-writers-readers attribue mal le dépôt initial, et writers-erasers-readers place le retrait avant la lecture.

Answer

Writers, readers, puis erasers

Question 10

10. Un promoteur de Saccharomyces cerevisiae présente son site d’initiation à +1. À quelle position approximative se trouve sa boîte TATA dans le promoteur cœur ?

À environ +90 nucléotides

À environ −90 nucléotides

À environ +1 nucléotide

À environ −30 nucléotides

Explication

Chez Saccharomyces cerevisiae, la boîte TATA se situe à environ −90 nucléotides du TSS, lequel est à +1. La position −30 correspond aux mammifères, tandis que les positions positives placent à tort la boîte en aval ou au site d’initiation.

Answer

À environ −90 nucléotides

Question 11

11. Dans une expérience, le facteur A1 se fixe à de l’ADN compacté dans des nucléosomes. Quel changement facilite ensuite l’accès d’A2, A3, A4 et des facteurs généraux de transcription ?

A1 condense davantage les nucléosomes et attire les facteurs généraux

A1 remplace les histones par des bases nouvelles dans la séquence d’ADN

A1 déplace localement les nucléosomes et crée une zone accessible

A2, A3 et A4 déplacent d’abord les nucléosomes pour permettre la fixation d’A1

Explication

Le facteur pionnier A1 peut se fixer directement à l’ADN compacté, déplacer localement les nucléosomes et créer une zone accessible aux autres facteurs. La condensation renforce l’inaccessibilité, le déplacement par A2, A3 et A4 inverse l’ordre du mécanisme, et une modification de séquence ne fait pas partie de ce processus.

Answer

A1 déplace localement les nucléosomes et crée une zone accessible

Question 12

12. Dans une expérience, une séquence régulatrice recrute des activateurs et augmente la transcription, tandis qu’une autre recrute des répresseurs et la réduit. Comment nommer ces deux séquences, dans cet ordre ?

Enhancer, puis silencer

Enhancer, puis promoteur proximal

Silencer, puis promoteur proximal

Silencer, puis enhancer

Explication

Un enhancer fixe des activateurs et stimule la transcription, tandis qu’un silencer fixe des répresseurs et l’inhibe. Inverser ces noms confond leurs effets, et le promoteur proximal porte des sites de fixation pour des protéines activatrices sans correspondre à ces deux éléments distaux.

Answer

Enhancer, puis silencer

Question 13

13. Un essai in vitro utilisant un promoteur minimal, de l’ARN polymérase II pure et les quatre NTP ne produit aucun ARN. Quelle modification permet d’obtenir une transcription basale fonctionnelle ?

Ajouter des protéines activatrices spécifiques sans extrait nucléaire

Ajouter davantage d’ARN polymérase II pure au mélange

Ajouter des extraits nucléaires contenant des facteurs généraux de transcription

Remplacer l’ARN polymérase II par l’ARN polymérase I

Explication

Les extraits nucléaires apportent les facteurs généraux de transcription nécessaires à l’activité basale de l’ARN polymérase II. Augmenter la quantité de polymérase ou remplacer celle-ci par l’ARN polymérase I ne fournit pas ces facteurs; des activateurs spécifiques ne remplacent pas non plus cet apport basal.

Answer

Ajouter des extraits nucléaires contenant des facteurs généraux de transcription

Question 14

14. Un promoteur est déméthylé au niveau de ses CpG. Quel état du gène est associé à cette situation ?

Un gène actif et une chromatine fermée

Un gène silencieux et une chromatine ouverte

Un gène actif et une chromatine ouverte

Un gène silencieux et une chromatine fermée

Explication

La déméthylation des CpG du promoteur est associée à un gène actif et à une chromatine ouverte. Un gène silencieux et fermé correspond à un promoteur méthylé; les deux autres réponses dissocient à tort l’activité de l’état d’ouverture.

Answer

Un gène actif et une chromatine ouverte

Question 15

15. Lors de l’annotation d’un promoteur cœur de mammifère, le TSS est repéré à +1. Où faut-il situer approximativement la boîte TATA ?

À +30 nucléotides du TSS

À +1 nucléotide du TSS

À −90 nucléotides du TSS

À −30 nucléotides du TSS

Explication

Dans le promoteur cœur des mammifères, la boîte TATA est située à −30 nucléotides du TSS, fixé à +1. La position −90 est celle indiquée pour la levure, et les positions positives ne correspondent pas à l’emplacement amont de la boîte.

Answer

À −30 nucléotides du TSS

Question 16

16. Dans une expérience, l’acétylation des lysines des queues d’histones neutralise leur charge positive. Quel effet cette modification produit-elle sur l’interaction avec l’ADN et sur la chromatine ?

Elle maintient l’attraction avec l’ADN et favorise une chromatine condensée et active

Elle réduit l’attraction avec l’ADN et favorise une chromatine relâchée et active

Elle renforce l’attraction avec l’ADN et favorise une chromatine condensée et silencieuse

Elle réduit l’attraction avec l’ADN et favorise une chromatine condensée et silencieuse

Explication

L’acétylation neutralise la charge positive des lysines, ce qui réduit leur attraction électrostatique avec l’ADN négatif et relâche la chromatine vers un état d’euchromatine associé à l’activation. Renforcer l’attraction inverse le mécanisme, maintenir cette attraction correspond à une confusion avec la méthylation, et associer le relâchement au silence inverse l’effet transcriptionnel.

Answer

Elle réduit l’attraction avec l’ADN et favorise une chromatine relâchée et active

Question 17

17. Dans une cellule en division active, un ribosome commence à traduire un ARNm alors que sa transcription est encore en cours dans le cytoplasme. Quel type de cellule cela caractérise-t-il ?

Une cellule eucaryote, où la transcription cytoplasmique précède la traduction nucléaire

Une cellule procaryote, où transcription et traduction sont couplées dans le cytoplasme

Une cellule procaryote, où la transcription est nucléaire et la traduction cytoplasmique

Une cellule eucaryote, où transcription et traduction sont couplées dans le noyau

Explication

Chez les procaryotes, transcription et traduction se déroulent simultanément dans le cytoplasme. La séparation entre noyau et cytoplasme caractérise les eucaryotes, tandis que les deux autres propositions inversent les lieux des processus.

Answer

Une cellule procaryote, où transcription et traduction sont couplées dans le cytoplasme

QCM : Initiation de la transcription et épigénétique (17 questions)

Questions et réponses du QCM

1. Une particule de chromatine comprend un octamère d’histones et un segment d’ADN directement enroulé autour de lui. Quelle longueur d’ADN correspond à cette organisation fondamentale ?

2. Une modification chimique est apportée à une histone, peut être inversée et ne change pas la séquence nucléotidique de l’ADN. Comment la désigne-t-on ?

3. Dans une région génomique, l’ADN est condensé et peu accessible aux facteurs de transcription, et les gènes y sont silencieux. À quel état de chromatine cette région correspond-elle ?

4. Lors d’un assemblage du complexe de pré-initiation, TFIIA et TFIIB sont déjà associés de part et d’autre de TFIID. Quelle étape doit suivre ?

5. Un répresseur se fixe sur une région régulatrice et recrute une HDAC, entraînant une chromatine moins favorable à la transcription. Quel mécanisme de répression illustre cette situation ?

6. Quelle comparaison décrit correctement le nombre d’ARN polymérases chez les procaryotes et les eucaryotes ?

7. Un activateur fixé sur un enhancer distant stimule un gène. Quel rôle le complexe Mediator joue-t-il dans cette activation ?

8. Quel type d’ARN l’ARN polymérase II synthétise-t-elle en plus des ARNm ?

9. Une cellule doit déposer une marque sur la chromatine, la faire reconnaître par une protéine, puis la retirer pour revenir à l’état basal. Quels rôles assurent ces trois étapes, dans l’ordre ?

10. Un promoteur de Saccharomyces cerevisiae présente son site d’initiation à +1. À quelle position approximative se trouve sa boîte TATA dans le promoteur cœur ?

11. Dans une expérience, le facteur A1 se fixe à de l’ADN compacté dans des nucléosomes. Quel changement facilite ensuite l’accès d’A2, A3, A4 et des facteurs généraux de transcription ?

12. Dans une expérience, une séquence régulatrice recrute des activateurs et augmente la transcription, tandis qu’une autre recrute des répresseurs et la réduit. Comment nommer ces deux séquences, dans cet ordre ?

13. Un essai in vitro utilisant un promoteur minimal, de l’ARN polymérase II pure et les quatre NTP ne produit aucun ARN. Quelle modification permet d’obtenir une transcription basale fonctionnelle ?

14. Un promoteur est déméthylé au niveau de ses CpG. Quel état du gène est associé à cette situation ?

15. Lors de l’annotation d’un promoteur cœur de mammifère, le TSS est repéré à +1. Où faut-il situer approximativement la boîte TATA ?

16. Dans une expérience, l’acétylation des lysines des queues d’histones neutralise leur charge positive. Quel effet cette modification produit-elle sur l’interaction avec l’ADN et sur la chromatine ?

17. Dans une cellule en division active, un ribosome commence à traduire un ARNm alors que sa transcription est encore en cours dans le cytoplasme. Quel type de cellule cela caractérise-t-il ?

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