Flashcards : Liaison peptidique et peptides (44 cartes)

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1Question

Qu'est-ce qu'une liaison peptidique ?

Réponse

Une liaison covalente de type amide entre deux acides aminés.

2Question

Entre quelles fonctions la liaison peptidique se forme-t-elle ?

Réponse

Entre la fonction acide carboxylique et la fonction amine de deux acides aminés.

3Question

Quelle molécule est libérée lors de la formation d'une liaison peptidique ?

Réponse

Une molécule d'eau.

4Question

Quelle molécule active l'acide aminé avant la formation de la liaison peptidique ?

Réponse

L'ATP.

5Question

Quel enzyme transfère l'aminoacyl-adénylate sur l'ARNt ?

Réponse

L'aminoacyl-ARNt synthétase.

6Question

Quel organite catalyse la formation de la liaison peptidique durant la traduction ?

Réponse

Le ribosome.

7Question

Qu'est-ce que la délocalisation électronique dans la liaison peptidique ?

Réponse

La délocalisation des électrons sur N-C-O place six atomes dans un même plan.

8Question

Quel effet la délocalisation électronique a-t-elle sur la liaison peptidique ?

Réponse

Elle confère à la liaison un caractère polaire.

9Question

Quelle conséquence a le caractère de double liaison sur la rotation autour de C-N ?

Réponse

Il empêche la rotation autour de C-N.

10Question

Quel angle fixe la liaison peptidique à cause de son caractère de double liaison ?

Réponse

L'angle oméga.

11Question

Quelle configuration de la liaison peptidique est favorisée et quel est son angle ?

Réponse

La configuration trans est favorisée avec un angle de 180°.

12Question

Quelle configuration de la liaison peptidique est le plus souvent défavorisée et quel est son angle ?

Réponse

La configuration cis est défavorisée avec un angle de 0°.

13Question

Quels angles déterminent la géométrie d'un peptide ?

Réponse

L'angle phi entre N et C alpha et l'angle psi entre C et C alpha.

14Question

Que sont les peptides en biochimie ?

Réponse

Des polymères linéaires d'acides aminés reliés par des liaisons peptidiques.

15Question

Combien d'acides aminés contiennent généralement les peptides ?

Réponse

De 2 à 10-20 acides aminés.

16Question

Quelle est la différence en nombre d'acides aminés entre polypeptides et protéines ?

Réponse

Les polypeptides ont environ 10-20 à 100 acides aminés, les protéines plus de 100.

17Question

Qu'appelle-t-on structure primaire d'un peptide ?

Réponse

L'enchaînement orienté de ses acides aminés de N-terminale à C-terminale.

18Question

Dans quel sens s'écrit la structure primaire d'un peptide ?

Réponse

De l'extrémité N-terminale vers l'extrémité C-terminale.

19Question

Que détermine l'hydrolyse complète suivie d'une chromatographie des acides aminés?

Réponse

La composition relative des acides aminés.

20Question

Quel est le risque de l'hydrolyse complète sur certains acides aminés?

Réponse

Elle peut dégrader le tryptophane et la cystéine.

21Question

Quelles enzymes sont des exopeptidases?

Réponse

Les aminopeptidases et les carboxypeptidases.

22Question

Quelle est la spécificité des endopeptidases?

Réponse

Elles coupent à l’intérieur de la chaîne peptidique.

23Question

Après quels résidus la trypsine coupe-t-elle?

Réponse

Après les résidus basiques Lys et Arg.

24Question

Après quels résidus la chymotrypsine coupe-t-elle?

Réponse

Après les résidus aromatiques Trp, Tyr et Phe.

25Question

Quelles sont les principales méthodes de séparation des peptides ?

Réponse

L’électrophorèse, les chromatographies et la spectrométrie de masse.

26Question

Quel est le rôle du SDS en électrophorèse sur gel de polyacrylamide ?

Réponse

Il dénature les peptides, se fixe par liaisons hydrophobes et leur apporte des charges négatives proportionnelles à leur taille.

27Question

Selon quel critère l’isoélectrofocalisation sépare-t-elle les peptides ?

Réponse

Selon leur point isoélectrique pI dans un gel avec gradient de pH.

28Question

Quel type de séparation conserve une séparation non dénaturante ?

Réponse

L’isoélectrofocalisation.

29Question

Comment la chromatographie sépare-t-elle un mélange ?

Réponse

Selon ses propriétés physicochimiques grâce à une phase mobile et une phase fixe.

30Question

Quelles sont les étapes principales de la chromatographie ?

Réponse

Dépôt de l’échantillon, lavage des molécules non fixées, élution des molécules fixées.

31Question

Quelle est la nature de la LH-RH et sa composition peptidique ?

Réponse

C'est une hormone hypothalamique constituée d'un décapeptide spécifique.

32Question

Quel effet la LH-RH a-t-elle sur la sécrétion hormonale ?

Réponse

Elle stimule la sécrétion de LH par l'hypophyse.

33Question

Quelle est la conséquence de la stimulation par la LH ?

Réponse

La production d'hormones sexuelles comme les œstrogènes et la testostérone.

34Question

Que sont les enképhalines ?

Réponse

Un groupe de peptides qui se lient aux récepteurs des opioïdes.

35Question

Comment se situe la distance C-N de la liaison peptidique par rapport aux liaisons simple et double ?

Réponse

Elle est intermédiaire entre une liaison simple et une liaison double.

36Question

Comment la liaison peptidique peut-elle être hydrolysée chimiquement et enzymatiquement ?

Réponse

Par un acide fort ou bromure de cyanogène chimiquement, et par peptidases ou protéases enzymatiquement.

37Question

Quelle géométrie détermine la conformation tridimensionnelle du peptide ?

Réponse

La géométrie des liaisons peptidiques.

38Question

Quel outil permet d'étudier la géométrie des liaisons peptidiques ?

Réponse

Le diagramme de Ramachandran.

39Question

Comment nomme-t-on les acides aminés liés dans un peptide ?

Réponse

Des résidus.

40Question

Quelle méthode chimique de séquençage des peptides a été décrite en 1953?

Réponse

La méthode de Sanger.

41Question

Quelle méthode récente mesure les rapports masse sur charge m/z pour séquencer les peptides?

Réponse

La spectrométrie de masse.

42Question

Quels types de chromatographies peuvent être utilisés pour séparer les peptides ?

Réponse

Celle par échange d’ions, par exclusion selon la taille, et par affinité pour un ligand fixe.

43Question

Quelle est la séquence peptidique de la met-enképhaline ?

Réponse

Tyr-Gly-Gly-Phe-Met.

44Question

Quel rôle joue la met-enképhaline lors du stress ?

Réponse

Elle augmente et participe à la régulation de la douleur.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 20 questions sur Liaison peptidique et peptides.

1. Concernant la formation de la liaison peptidique :

2. Lors de la synthèse cellulaire d’une protéine, quelles propositions concernant la formation de la liaison peptidique sont exactes ?

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