Fiche de révision : Microbiologie des bactéries

📋 Plan du Cours

1. Place des bactéries dans le vivant
2. Classification et nomenclature bactériennes
3. Structure et morphologie bactériennes
4. Distribution dans les milieux
5. Bactéries du sol et de l’eau
6. Rôles écologiques et sanitaires

📖 1. Place des bactéries dans le vivant

🔑 Notions clés & Définitions

• Bactérie : Microorganisme formé d’une seule cellule, sans noyau, à structure très simple, considéré comme ni animal ni végétal.

• Nucléoïde : Chromosome circulaire bactérien qui n’est pas entouré par une membrane.

★ À maîtriser

• Les bactéries mesurent généralement 0,4 à 2 μm, mais certaines bactéries géantes du genre Thiomargarita atteignent 750 μm.

• La scissiparité est une reproduction asexuée autonome au cours de laquelle une bactérie se divise en deux cellules filles ; Escherichia coli se divise toutes les 20 min à 37 °C.

Compléments

📌 Une bactérie peut être viable et cultivable, viable mais non cultivable avec un métabolisme fortement ralenti, ou morte.

💡 Astuce mémo

Absence de noyau → organisme procaryote

📖 2. Classification et nomenclature bactériennes

🔑 Notions clés & Définitions

• Nomenclature bactérienne : La nomenclature bactérienne écrit le genre avec une majuscule et l’espèce avec une minuscule, en italique à l’ordinateur ou soulignés dans un manuscrit, et peut préciser une sous-espèce ou une souche.
• Souche type : Une souche type est la souche qui définit une espèce ; il n’y en a qu’une par espèce et elle est déposée dans un institut officiel de collection.

★ À maîtriser

• La classification basée sur l’ADN est définie à partir de la comparaison des séquences des gènes codant pour l’ARN ribosomique.

• La classification phénotypique repose notamment sur:
  • la coloration de Gram
  • la capacité à former des spores
  • les types respiratoires
  • la mobilité
  • la morphologie et le mode de groupement

Compléments

• La classification phénotypique exige d’avoir les bactéries en culture pure et peut étudier leur capacité à utiliser diverses sources de carbone et d’azote ainsi que leurs exigences nutritionnelles particulières.

💡 Astuce mémo

ADN pour la parenté, phénotype pour les caractères observables

📖 3. Structure et morphologie bactériennes

★ À maîtriser

• La structure bactérienne comprend notamment:
  • une capsule
  • une paroi
  • une membrane
  • un cytoplasme
  • des ribosomes
  • un nucléoïde
  • des plasmides
  • des pili
  • un flagelle
  • des inclusions cytoplasmiques

• Les principales formes bactériennes sont:
  • la coque
  • le bacille droit
  • le bacille incurvé
  • le cocobacille
  • la bactérie spiralée

Compléments

• Les coques peuvent être groupées en:
  • diplocoques
  • tétrades
  • chaînettes
  • amas
  • groupes cubiques

• Les bacilles peuvent être:
  • isolés
  • groupés en diplobacilles
  • organisés en chaînettes

💡 Astuce mémo

Une cellule bactérienne comme une petite capsule équipée d’un flagelle et d’un pilus

📖 4. Distribution dans les milieux

★ À maîtriser

• Les bactéries sont notamment présentes dans:

  • l’air
  • le sol
  • l’eau

• Environ 99 % des bactéries ne poussent pas sur des milieux de culture ; leur détection nécessite donc de récupérer leur ADN.

📌 Les bactéries planctoniques sont libres, mobiles ou en amas dans le microenvironnement, tandis que les bactéries sessiles adhèrent aux surfaces ou aux cellules et peuvent former un biofilm.

Compléments

• Dans l’air, on trouve environ 10² à 10⁵ bactéries par m³ et 10² à 10³ champignons par m³.

💡 Astuce mémo

Planctonique en suspension, sessile dans un biofilm

📖 5. Bactéries du sol et de l’eau

★ À maîtriser

• Dans le sol, les bactéries sont présentes à une abondance d’environ 10⁶ à 10⁹ par gramme de sol, contre 10³ à 10⁶ champignons par gramme.

• Les bactéries d’eau peuvent être:

  • indigènes dulçaquicoles
  • telluriques
  • d’origine humaine ou animale

Compléments

• Les bactéries indigènes dulçaquicoles ont une température optimale de 15 à 20 °C, tandis que les bactéries humaines ou animales vivent à des températures comprises entre 20 et 40 °C.

• Dans l’eau de distribution, les microorganismes aérobies revivifiables sont habituellement présents entre moins de 1 et 10 par mL, à 22 °C ou 36 °C.

💡 Astuce mémo

Activités bactériennes → cycles du carbone et de l’azote

📖 6. Rôles écologiques et sanitaires

★ À maîtriser

• Les bactéries du sol participent aux cycles du carbone et de l’azote, indispensables à la vie, à la formation de l’humus, à la fertilité des sols, aux plantes et à la nourriture.

• Dans l’eau, les bactéries: produisent et consomment de la matière organique lorsqu’elles sont hétérotrophes, produisent de la matière organique lorsqu’elles sont photosynthétiques, servent de nourriture au zooplancton

• Les bactéries peuvent être: symbiotiques, phytopathogènes, responsables de maladies infectieuses chez l’être humain

Compléments

• Des bactéries phytopathogènes sont associées à la pourriture molle, au flétrissement bactérien et à la moucheture ou tache des plantes, notamment Dickeya dadantii, Ralstonia solanacearum et Pseudomonas syringae.

• Chez l’être humain, Streptococcus est associé à la carie, Pseudomonas aeruginosa à la kératite et aux bronchites chroniques, Pseudomonas cepacia aux bronchites chroniques et Staphylococcus aureus aux bronchites chroniques.

💡 Astuce mémo

Bactéries utiles aux cycles biologiques, mais aussi pathogènes

📊 Tableaux de synthèse

Types de bactéries dans l’eau