Fiche de révision : Microorganismes et santé humaine

📋 Plan du Cours

1. Bactéries et organisation procaryote
2. Champignons et parasites eucaryotes
3. Virus et dépendance cellulaire
4. Critères de classification microbienne
5. Holobionte et microbiomes humains
6. Implantation et biofilms
7. Symbiose et dysbiose
8. Pouvoir pathogène et virulence

📖 1. Bactéries et organisation procaryote

🔑 Notions clés & Définitions

• Bactérie : Organisme procaryote unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau.

★ À maîtriser

• Les bactéries possèdent un nucléoïde contenant un ADN bicaténaire, des ribosomes et des inclusions cytoplasmiques, mais aucun organite interne ni noyau.

• La paroi bactérienne constituée de peptidoglycanes donne sa forme à la bactérie et lui permet de résister à la forte pression osmotique du cytosol.

📌 La coloration de Gram distingue les bactéries à paroi simple, violettes et dites Gram positif, des bactéries à paroi complexe possédant une membrane externe, roses et dites Gram négatif.

Compléments

• Les formes bactériennes les plus fréquentes sont les bacilles en bâtonnets et les coques, ou cocci, en billes.

• Les appendices bactériens facultatifs comprennent: le flagelle pour la mobilité, le pilus pour le transfert d’ADN ou l’adhésion, les fimbriae pour l’adhésion bactérienne

💡 Astuce mémo

Procaryote sans noyau, mais avec nucléoïde et ribosomes

📖 2. Champignons et parasites eucaryotes

🔑 Notions clés & Définitions

• Eucaryote : Organisme dont les cellules possèdent au moins un noyau entouré d’une double membrane contenant l’ADN bicaténaire.

★ À maîtriser

• Les champignons et les parasites possèdent des organites spécialisés, des ribosomes, un cytosquelette et une membrane plasmique contenant des stérols, doublée ou non d’une paroi.

Compléments

📌 Les champignons et parasites peuvent être unicellulaires, comme les levures, ou pluricellulaires, comme les vers.

• Les champignons et parasites présentent une grande diversité de taille, du micromètre au mètre, de développement intracellulaire ou extracellulaire, de formes et de mobilité.

💡 Astuce mémo

Une cellule à noyau, organites et cytosquelette

📖 3. Virus et dépendance cellulaire

🔑 Notions clés & Définitions

• Virus : Entité biologique possédant un seul type d’acide nucléique, une capside protéique et parfois une enveloppe lipidique.

★ À maîtriser

• Le génome viral est constitué soit d’ADN simple ou double brin, soit d’ARN, et code notamment pour des enzymes virales spécifiques.

📌 La capside protège le génome viral, tandis que l’enveloppe lipidique facultative porte des glycoprotéines impliquées dans la reconnaissance et la fixation aux récepteurs cellulaires.

• Les virus détournent le métabolisme et les constituants d’une cellule hôte pour se répliquer à l’identique.

Compléments

• Les glycoprotéines d’attachement sont présentes sur les virus nus et enveloppés, mais elles se trouvent sur la capside des virus nus et dans l’enveloppe lipidique des virus enveloppés.

• Les virus mesurent généralement entre 10 et 100 nm et sont observés en microscopie électronique, contrairement aux bactéries généralement observables au microscope optique.

💡 Astuce mémo

Absence de métabolisme autonome → réplication obligatoire dans une cellule hôte

📖 4. Critères de classification microbienne

🔑 Notions clés & Définitions

• Classification universelle : Nomenclature latine hiérarchisée dont l’espèce est l’unité fondamentale.

★ À maîtriser

📌 Dans l’usage courant, le nom scientifique associe le nom du genre et celui de l’espèce, l’ensemble étant écrit en italique.

Compléments

• Les critères de classification comprennent:
  • les critères taxonomiques
  • les critères morphologiques
  • les critères génomiques
  • les critères biologiques
  • les critères épidémiologiques

💡 Astuce mémo

Taxonomie, morphologie, génome, biologie, épidémiologie

📖 5. Holobionte et microbiomes humains

🔑 Notions clés & Définitions

• Holobionte : Constitué d’un organisme hôte et de tous ses microorganismes résidents symbiotiques.
• Écosystème : Système d’interactions entre des groupes d’organismes et leur milieu physique ou inanimé.

★ À maîtriser

📌 Un microbiote est l’ensemble des microorganismes vivant dans un même microbiome, tandis qu’un microbiome comprend ces microorganismes, leur information génétique et l’environnement où ils interagissent.

• Les microbiotes intestinal et buccal sont composés à 90 % de bactéries et regroupent chacun près de 800 à 1000 espèces bactériennes, avec des compositions différentes.

Compléments

• Les projets de séquençage de l’ADN des microbiotes, lancés entre 1995 et 2005, ont permis d’établir des cartographies fines des microbiotes humains.

💡 Astuce mémo

Microbiote = microbes ; microbiome = microbes, gènes et environnement

📖 6. Implantation et biofilms

🔑 Notions clés & Définitions

• Biofilm : Communauté organisée de microorganismes, généralement fixée à une surface, qui fonctionne sur les plans structurel et fonctionnel.

★ À maîtriser

• L’implantation d’un microorganisme dépend notamment de la température, du potentiel redox, de l’humidité et du pH.

• La capacité d’adhérer aux muqueuses ou à d’autres surfaces constitue un avantage écologique pour les microorganismes.

Compléments

• Le flux salivaire et la déglutition éliminent les bactéries buccales incapables d’adhérer aux surfaces dentaires ou muqueuses.

💡 Astuce mémo

Adhésion aux surfaces → résistance à l’élimination par les flux

📖 7. Symbiose et dysbiose

🔑 Notions clés & Définitions

• Symbiose : Association intime et durable entre deux microorganismes appartenant à des espèces différentes.
• Dysbiose : Perturbation de l’écosystème qui entraîne un déséquilibre associé à une pathologie.

📝 Points essentiels

• 🔄 Les facteurs favorisant les lésions carieuses sont:
  1. une alimentation très riche en sucres
  2. une hygiène bucco-dentaire déficiente
  3. une baisse du flux salivaire
  4. la prolifération de bactéries pathogènes

📌 Dans un écosystème stable, les interactions entre microorganismes et avec l’hôte contribuent à l’équilibre et sont associées à la santé.

💡 Astuce mémo

Déséquilibre de l’écosystème → prolifération pathogène → pathologie

📖 8. Pouvoir pathogène et virulence

★ À maîtriser

• Les microorganismes pathogènes spécifiques provoquent une maladie chez un sujet sain, tandis que les microorganismes opportunistes provoquent habituellement une maladie lorsque les défenses sont altérées ou que le microbiome est déséquilibré.

• Une origine endogène signifie que le microorganisme pathogène provient du microbiome déséquilibré de l’hôte, tandis qu’une origine exogène signifie qu’il provient de l’environnement, d’un animal ou d’une personne infectée ou porteuse saine.

• La virulence est la capacité quantitative d’un microorganisme à provoquer une maladie, tandis que le pouvoir pathogène désigne qualitativement le type de maladie provoquée.

• L’apparition d’une maladie dépend notamment du degré de résistance de l’hôte et de la virulence du microorganisme pathogène.

Compléments

• Des microorganismes pathogènes spécifiques sont:

  • Salmonella typhi
  • Vibrio cholerae
  • Mycobacterium tuberculosis
  • Neisseria meningitis

• Escherichia coli du microbiome intestinal peut provoquer des infections urinaires, tandis que Streptococcus mutans du microbiome buccal peut provoquer la maladie carieuse.

💡 Astuce mémo

Virulence quantitative, pouvoir pathogène qualitatif

📊 Tableaux de synthèse

Comparaison des microorganismes