Qu’est-ce qu’un ribozyme ?
Une molécule d’ARN qui joue un rôle d’enzyme.
Quelle proportion des ARN cellulaires les ARNm représentent-ils ?
2 %.
Quelle proportion des ARN cellulaires les ARNr représentent-ils ?
82 %.
Quel est le rôle des ARNt ?
Ils servent d’adaptateurs entre les ARNm et les acides aminés.
Quel est le produit fonctionnel final de l’expression d’un gène codant un polypeptide ?
Le polypeptide.
Quelles informations le Northern blot fournit-il sur les transcrits ?
Leur taille et leur abondance par rapport à une référence.
Quelle enzyme synthétise le premier brin d’ADNc à partir d’ARNm polyadénylés ?
La transcriptase inverse.
Que représente une banque d’ADNc ?
Les ARN exprimés dans un type cellulaire et à un moment donnés.
Que représente une banque génomique ?
Le génome de l’organisme.
Que mesure le cycle seuil Ct en qRT-PCR ?
Le nombre de cycles avant que le produit devienne détectable.
Qu’est-ce que la transcription génétique ?
La copie de l’information génétique de l’ADN en un brin d’ARN.
Combien de brins d’ADN servent de matrice pour transcrire un gène donné ?
Un seul brin.
Quel brin d’ADN peut servir de matrice pour des gènes voisins ?
Des brins différents peuvent servir de matrice.
Quelle relation unit l’ARN au brin matrice et au brin codant ?
L’ARN est complémentaire du brin matrice et identique au brin codant, sauf que l’uracile remplace la thymine.
En quoi les éléments cis-régulateurs diffèrent-ils des éléments trans-régulateurs ?
Les éléments cis sont des séquences d’ADN ; les éléments trans sont des produits de gènes qui reconnaissent les éléments cis.
Combien de protéines un ARNm polycistronique procaryote peut-il coder ?
Plusieurs protéines.
Quelle est la fonction du promoteur dans la transcription par l’ARN polymérase II ?
Il permet le recrutement de l’ARN polymérase.
Où se situe le promoteur par rapport à la région transcrite ?
En amont de la région transcrite.
Quels facteurs généraux s’assemblent sur les promoteurs utilisés par la polymérase II ?
TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIF, TFIIE et TFIIH.
Quelle est la première étape de l’initiation par la polymérase II ?
TBP se lie à la boîte TATA.
Que fait TFIIH avant le passage de la polymérase II à l’élongation ?
Il ouvre partiellement l’ADN, puis phosphoryle la polymérase après la synthèse d’une dizaine de nucléotides.
Qu’est-ce qu’un intron dans un gène eucaryote ?
Une région non codante située entre les exons et excisée du transcrit primaire lors de l’épissage.
Qu’est-ce qu’un exon dans l’ARNm définitif ?
Une séquence de nucléotides présente après l’épissage.
Quelles sont les deux étapes finales de l’épissage du pré-ARNm ?
L’intron est éliminé, puis les exons sont ligaturés.
Quels ARN nucléaires contiennent les snRNP du spliceosome ?
U1, U2, U4, U5 et U6.
Quelle liaison relie la 7-méthylguanosine à l’extrémité 5′ de l’ARNm ?
Une liaison triphosphate 5′-5′.
Quelle protéine accélère l’addition des adénosines lors de la polyadénylation ?
La protéine PABPII.
Quels ARNr l’ARN polymérase I transcrit-elle dans le nucléole ?
Les précurseurs des ARNr 18S, 5,8S et 28S.
À quels éléments UBF se lie-t-il pour initier la transcription par la polymérase I ?
Aux éléments UCE et CPE.
Quel facteur UBF recrute-t-il après sa liaison aux éléments UCE et CPE ?
Le facteur SL-1.
Quels ARN l’ARN polymérase III transcrit-elle notamment ?
Les ARNt, l’ARNr 5S et le snRNA U6.
Que sont les enhancers en régulation transcriptionnelle ?
Des éléments cis-activateurs distaux.
À quelle régulation les silencers sont-ils associés ?
À la répression.
Comment les complexes de remodelage de la chromatine déplacent-ils les nucléosomes ?
Ils utilisent une activité ATPase pour modifier la structure nucléosomale et déplacer les nucléosomes sur l’ADN.
Quelle modification les HAT apportent-elles aux histones ?
Elles acétylent les histones.
Quelle modification les HDAC apportent-elles aux histones ?
Elles désacétylent les histones.
À quel état transcriptionnel la chromatine condensée est-elle associée ?
À un gène inactif.
Quel rôle cis les enhancers et les silencers exercent-ils respectivement ?
Les enhancers activent et les silencers répriment l’expression à distance.
Quel effet le remodelage de la chromatine et l’acétylation des histones ont-ils sur la transcription ?
Ils décondensent la chromatine et favorisent l’assemblage des acteurs de transcription sur le promoteur.
Quel effet les HAT ont-elles sur les histones et la transcription ?
Elles acétylent les histones et favorisent l’activation de la transcription.
Que font les HDAC aux histones et par qui sont-elles recrutées ?
Elles désacétylent les histones après leur recrutement par un répresseur.
Que protège une protéine liée à l’ADN lors de l’empreinte à la DNase I ?
Son site de liaison contre la coupure enzymatique.
Quel phénomène révèle la région protégée lors de l’empreinte à la DNase I ?
Une région appelée footprint.
Que permet d’analyser la ChIP dans la chromatine in vivo ?
L’association d’une protéine avec l’ADN.
Quelle taille ont les fragments de chromatine obtenus par sonication pour la ChIP ?
De 500 à 1000 pb.
Qu’est-ce que l’EMSA, ou gel-shift ?
Une méthode détectant l’interaction entre une protéine et une sonde d’ADN ou d’ARN par retard de migration en électrophorèse non dénaturante.
Comment un gène rapporteur teste-t-il l’activité d’une séquence régulatrice ?
On mesure l’activité du rapporteur après transfection de cellules portant la séquence avec un promoteur basal et un gène rapporteur.
Quels domaines composent la structure modulaire des facteurs de transcription eucaryotes ?
Un domaine de liaison à l’ADN, un domaine d’activation de la transcription et parfois un domaine flexible.
Comment NFAT et AP1 contrôlent-ils l’expression de l’IL2 ?
Ils coopèrent pour se lier à leurs sites faibles et contrôler l’expression de l’IL2.
Que provoque l’activation du récepteur aux glucocorticoïdes ?
Sa libération, sa translocation dans le noyau et la stimulation de la transcription.
Quelle immunodéficience caractérise le syndrome des lymphocytes dénudés de type II ?
Une immunodéficience héréditaire sévère et rare, autosomale récessive.
Quelle anomalie de surface caractérise le syndrome des lymphocytes dénudés de type II ?
L’absence de protéines HLA de classe II à la surface des lymphocytes.
Qu’a révélé l’analyse des transcrits des patients étudiés ?
Les transcrits des gènes HLA de classe II étaient absents.
Qu’a révélé l’analyse du locus MHC-II chez les patients étudiés ?
Aucune mutation n’y a été identifiée.
Quel facteur muté a été identifié dans la fraction RFX complétant la transcription in vitro ?
RFX5.
Que permet l’épissage alternatif à partir d’une même unité de transcription ?
La production de différentes protéines.
Quelle proportion des gènes humains peut présenter des variants d’épissage ?
100 %.
Quelle transformation l’édition par ADAR apporte-t-elle à l’ARN ?
Elle convertit une adénine en inosine.
Quel type d’ARN attire l’enzyme ADAR ?
L’ARN double brin.
Que fait l’aconitase à l’ARNm du récepteur de la transferrine en présence de fer ?
Elle se lie aux éléments IRE et favorise sa dégradation.
Quel est l’effet de la dégradation de l’ARNm du récepteur de la transferrine sur sa production ?
Elle empêche la production du récepteur.
Que devient l’ARNm du récepteur de la transferrine en absence de fer ?
Il reste stable et est traduit.
Quelle est la forme générale d’un ARN ?
Une chaîne simple brin.
Que peuvent former les appariements intramoléculaires de l’ARN ?
Des structures secondaires.
À quelles molécules les ARN cellulaires peuvent-ils être associés ?
À des protéines.
Comment les ARN sont-ils élués lors de leur purification sur colonne de silice ?
Avec de l’eau.
Que révèle un pic unique sur la courbe de fusion d’une qRT-PCR ?
La présence d’un seul produit amplifié.
Quelle est la capacité d’analyse des puces à ADN ?
Elles mesurent simultanément l’expression de plusieurs centaines ou milliers de gènes.
À quelle extrémité l’ARN polymérase ajoute-t-elle les ribonucléotides ?
À l’extrémité 3′ du brin d’ARN.
Quel type de liaison l’ARN polymérase forme-t-elle pendant l’élongation ?
Des liaisons phosphodiester.
Où se situe approximativement la boîte TATA du promoteur de la polymérase II ?
Entre −35 et −25 par rapport au site d’initiation.
Quels éléments du promoteur sont proximaux et lesquels sont distaux ?
Les boîtes CAAT et GC sont proximales ; les enhancers sont distaux.
Que comprend TFIID en plus de TBP ?
Treize protéines appelées TAF.
Quelle est la longueur moyenne d’un exon chez les mammifères ?
Environ 150 pb.
Quelle est la longueur de l’intron le plus long mentionné ?
500 kb.
Quelle taille compte le précurseur d’ARNr 45S ?
13 000 nucléotides.
Quels ARNr le traitement du précurseur 45S produit-il ?
Les ARNr 18S, 5,8S et 28S.
Comment les snoRNP reconnaissent-ils les sites du précurseur d’ARNr ?
Par interaction avec les snoRNA.
Quels sont les composants de TFIIIB et son rôle ?
TFIIIB comprend TBP, BRF1 et BDP1, essentiels à l’initiation et au recrutement de l’ARN polymérase III.
Qu’est-ce qu’un enhancesome ?
Un complexe assemblé par liaison coopérative de facteurs de transcription sur un enhancer.
Quel rôle le médiateur joue-t-il en régulation transcriptionnelle ?
Il permet à l’enhancesome de communiquer avec l’ARN polymérase II et les facteurs généraux de transcription.
Comment appelle-t-on la région régulatrice présente chez la plupart des gènes de Saccharomyces cerevisiae ?
Une UAS, ou Upstream Activating Sequence.
Quelles familles composent les complexes de remodelage de la chromatine ?
SWI/SNF, ISWI et Mi2/NuRD.
Que permet l’activité ATPase des complexes de remodelage de la chromatine ?
Elle permet notamment le glissement des nucléosomes sur l’ADN.
Quels gènes rapporteurs sont présentés pour les plantes ?
La GUS, ou β-glucuronidase.
Quels autres gènes rapporteurs sont présentés ?
La luciférase, la β-galactosidase et la GFP.
Quels types d’interactions les domaines de liaison à l’ADN établissent-ils avec l’ADN ?
Des liaisons hydrogène, des liaisons ioniques ou des interactions hydrophobes.
À combien de nucléotides chaque doigt de zinc se lie-t-il dans le grand sillon de l’ADN ?
À cinq nucléotides.
Comment le leucine zipper interagit-il avec l’ADN ?
Il interagit avec l’ADN sur deux sillons majeurs adjacents.
À quels ligands répondent notamment les récepteurs nucléaires présentés ?
Au cortisol, à la thyroxine, à l’acide rétinoïque, aux œstrogènes et à la progestérone.
Quelle protéine est présente et n’est pas déficiente dans le syndrome des lymphocytes dénudés ?
RFX1.
Quelles protéines stabilisent RFX5 sur le promoteur HLA-DR ?
RFXAP et RFXANK.
Combien de groupes de complémentation l’analyse du syndrome des lymphocytes dénudés a-t-elle mis en évidence ?
Quatre groupes.
Comment la polyadénylation cytoplasmique peut-elle déclencher la traduction ?
Par l’interaction de la PABP avec les facteurs d’initiation.
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1. Quelle propriété définit un ribozyme ?
2. Quelle association décrit correctement les proportions et les fonctions des principaux types d’ARN cellulaires ?
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