Fiche de révision : Systèmes d’information en épidémiologie

📋 Plan du Cours

1. Définitions des systèmes d’information en santé
2. Recueils épidémiologiques principaux
3. Registres et cohortes
4. Réseaux de surveillance
5. Bases médico-administratives
6. Qualité et croisement des données
7. Producteurs et diffusion des indicateurs

📖 1. Définitions des systèmes d’information en santé

🔑 Notions clés & Définitions

• Système d’information en santé : Ensemble organisé de ressources qui permet de collecter, stocker, traiter et distribuer de l’information relative aux usagers du système de santé.

★ À maîtriser

📌 Le système informatique est le sous-ensemble technique du système d’information, qui comprend aussi une organisation et des procédures relevant du système social.

• La production des données épidémiologiques transforme des événements observés en données brutes, puis en indicateurs mis à disposition et interprétés.

Compléments

• Pour les hospitalisations liées à la COVID-19, SI-VIC a été utilisé jusqu’au 30 juin 2023, puis OSCOUR® a recueilli les hospitalisations après passage aux urgences, y compris en réanimation.

💡 Astuce mémo

Événements → données → indicateurs → interprétation

📖 2. Recueils épidémiologiques principaux

★ À maîtriser

• Les quatre principaux recueils sont:
  • le registre
  • la cohorte
  • le réseau de surveillance
  • la base de données médico-administratives

Compléments

• Les maladies à signalement obligatoire complètent les recueils épidémiologiques et font l’objet d’une déclaration auprès de l’ARS et de Santé publique France.

• En 2026, 38 maladies sont à signalement obligatoire : 36 infectieuses et 2 non infectieuses, le mésothéliome et le saturnisme chez l’enfant mineur.

• Les cinq maladies à signalement obligatoire avec surveillance seule sont:

  • VIH
  • hépatite B aiguë
  • tétanos
  • mésothéliomes
  • COVID-19

💡 Astuce mémo

RCRB : Registre, Cohorte, Réseau, BDMA

📖 3. Registres et cohortes

🔑 Notions clés & Définitions

• Registre : Vise l’exhaustivité des cas ou des malades sur un territoire donné, avec des données détaillées collectées à long terme.
• Cohorte : Suivi longitudinal d’un échantillon de personnes ayant des caractéristiques ou des expositions communes afin d’identifier la survenue d’événements en lien avec ces expositions.

★ À maîtriser

• Une cohorte recueille des données médico-administratives et cliniques, ainsi que des informations détaillées sur les expositions aux facteurs de risque.

Compléments

• Un registre peut contenir:

  • les diagnostics
  • les actes
  • les services de prise en charge
  • les résultats de laboratoire
  • les résultats d’imagerie
  • le détail de la pathologie
  • l’histoire de la maladie

• Le registre permet de suivre des parcours complets, de l’hospitalisation ou de la prise en charge ambulatoire jusqu’à l’éventuel décès.

📌 Les principales limites logistiques d’un registre sont sa lourdeur, son coût, la difficulté du suivi longitudinal et la nécessité de coordonner tous les acteurs et de maintenir le dispositif dans le temps.

• Le réseau FRANCIM recueille tous les nouveaux cas de cancers dans 24 départements et la métropole lilloise, couvrant 22 % de la population métropolitaine, soit environ 14 millions de personnes.

📌 Une cohorte n’est pas exhaustive, mais cette limite doit normalement être compensée par la représentativité de l’échantillon.

• La cohorte CONSTANCES est composée d’un échantillon aléatoire de 220 000 volontaires affiliés au régime général de la Sécurité sociale, nés entre 1941 et 2000.

💡 Astuce mémo

Registre = exhaustivité des cas ; cohorte = suivi d’un échantillon exposé

📖 4. Réseaux de surveillance

🔑 Notions clés & Définitions

• Réseau de surveillance : Recueille en continu des informations sur une ou plusieurs pathologies grâce au volontariat de structures apparentées et représentatives.

★ À maîtriser

📌 Les réseaux de surveillance couvrent un large territoire, sont réactifs et sont adaptés aux événements fréquents et répétés comme les épidémies saisonnières.

Compléments

• Les réseaux de surveillance peuvent recueillir des données médico-administratives, cliniques et paracliniques, notamment biologiques.

📌 Un réseau de surveillance n’est pas exhaustif, mais sa représentativité dépend des professionnels volontaires qui y participent.

• Au 1er janvier 2026, le réseau Sentinelles comprenait 1 157 médecins généralistes libéraux et 127 pédiatres libéraux répartis sur l’ensemble du territoire.

💡 Astuce mémo

Volontariat de structures représentatives → surveillance continue et réactive

📖 5. Bases médico-administratives

🔑 Notions clés & Définitions

• Base de données médico-administratives : Rassemble des données de soins et de gestion produites notamment par les établissements et les remboursements de l’Assurance maladie.

★ À maîtriser

• Le PMSI contient tous les séjours hospitaliers des établissements publics et privés, avec les diagnostics codés selon la CIM-10 et les actes médicaux codés selon la CCAM.

• Le SNDS comprend: les données du PMSI, les consommations extra-hospitalières de soins, les remboursements de prescriptions et d’examens de laboratoire, les causes médicales de décès

• Les bases médico-administratives offrent une exhaustivité à l’échelle de la France entière, des milliers de variables pour 68 millions de Français et une profondeur historique supérieure à 20 ans.

📌 Les bases médico-administratives contiennent peu de données cliniques et sociales, et leur objectif tarifaire peut entraîner un sous-codage des diagnostics ou actes peu valorisés.

• Dans les régions ayant connu au moins 30 jours avec un taux d’occupation des lits de réanimation supérieur ou égal à 75 %, le risque de décès était 2,2 fois plus élevé, avec un odds-ratio ajusté de 2,2 [1,9-2,6].

Compléments

• Lors de la première vague de 2020, 14 513 patients atteints de COVID-19 ont été hospitalisés en réanimation et 4 256 sont décédés, soit une létalité de 29,3 %.

📐 Formule — La létalité observée lors de la première vague de 2020 vérifie $\text{létalité}=\frac{4\,256}{14\,513}\times100=29{,}3\,\%$ chez les patients atteints de COVID-19 hospitalisés en réanimation.

💡 Astuce mémo

BDMA = exhaustive et historique ; données cliniques limitées

📖 6. Qualité et croisement des données

★ À maîtriser

📌 La difficulté en épidémiologie est de disposer de données exhaustives et de bonne qualité.

📌 Le croisement de plusieurs recueils est souvent nécessaire lorsqu’aucun système d’information ne fournit seul des données suffisamment exhaustives et de bonne qualité.

• Les indicateurs sont calculés à partir des variables brutes contenues dans le système d’information à visée épidémiologique, puis mis à disposition et interprétés.

Compléments

📌 Une enquête ponctuelle peut être réalisée lorsqu’aucun recueil existant ne répond à la demande, mais elle est soumise à une complexité réglementaire importante.

• Un exemple de données brutes est le nombre d’hommes et de femmes hospitalisés pour COVID-19 un jour donné dans un établissement donné.

💡 Astuce mémo

Données incomplètes ou hétérogènes → croisement des recueils ou enquête ponctuelle

📖 7. Producteurs et diffusion des indicateurs

★ À maîtriser

• Santé publique France est une agence sanitaire sous tutelle du ministère chargé de la santé dont la mission est d’améliorer et de protéger la santé des populations.

• Les trois axes de Santé publique France sont:

  • anticiper par la veille et la surveillance
  • comprendre par la recherche et les enquêtes
  • agir par l’expertise, le conseil et la communication

📌 Chaque indicateur utilisé dans un travail de recherche doit être accompagné de la source des données et d’une référence bibliographique mentionnant les méthodes de recueil.

📌 Les producteurs de données et les organismes chargés de leur mise à disposition ne sont pas nécessairement les mêmes.

Compléments

• En France, Santé publique France dispose d’une implantation nationale et régionale, notamment avec Santé publique France Centre-Val de Loire.

• Les principales plateformes citées sont:

  • Santé publique France
  • EpiDcliC
  • l’Observatoire régional de la santé
  • l’Organisation mondiale de la santé
  • Our World in Data

💡 Astuce mémo

Produire → calculer → diffuser → interpréter

📊 Tableaux de synthèse

Comparaison des quatre recueils épidémiologiques