QCM : Réticulum endoplasmique — 20 questions

Explication

Le réticulum endoplasmique participe à la biosynthèse et aux modifications protéiques, au contrôle qualité et à la réponse au stress conformationnel. Il intervient aussi dans la biosynthèse des phospholipides et le contrôle du métabolisme du cholestérol.

Explication

Les protéines solubles résidentes du cytosol sont synthétisées dans le cytosol. Les protéines membranaires, qu’elles soient résidentes ou sécrétées, sont synthétisées à la surface cytosolique du RER ; elles ne suivent donc pas le même itinéraire que les protéines cytosoliques solubles.

Explication

La séquence signal est une courte séquence N-terminale de la protéine naissante, comportant environ 20 acides aminés hydrophobes. Elle peut également présenter une charge positive ou négative ; une séquence transmembranaire peut, elle, être située plus loin dans la protéine.

Explication

La protéine sécrétée est entièrement transférée dans la lumière du réticulum endoplasmique. La signal peptidase clive puis la séquence signal est dégradée ; la protéine ne reste donc pas ancrée comme une protéine transmembranaire.

Explication

Une protéine transmembranaire comporte un domaine cytosolique, un domaine luminal et une région hydrophobe d’ancrage. La séquence signal n’est pas nécessairement commune aux deux types : elle est clivée dans le type 1 et conservée comme domaine transmembranaire dans le type 2.

Explication

Le type 1 possède une extrémité N-terminale luminale et une extrémité C-terminale cytosolique. Sa séquence d’arrêt de translocation devient transmembranaire, tandis que la séquence signal est clivée ; l’orientation proposée pour le type 2 est donc inversée.

Explication

Le type 2 possède une extrémité N-terminale cytosolique et une extrémité C-terminale luminale. Sa séquence signal sert aussi de domaine transmembranaire et n’est pas clivée, contrairement au type 1.

Explication

La N-glycosylation ajoute un oligosaccharide à l’azote de la chaîne latérale d’une asparagine. Elle est réalisée par une oligosaccharide transférase dans une séquence consensus Asn-X-Thr ou Asn-X-Ser, et non dans une séquence signal définie par cette fonction.

Explication

L’oligosaccharide précurseur compte 14 sucres : 2 GlcNAc, 9 mannoses et 3 glucoses. Il est ancré dans la membrane du réticulum endoplasmique par le dolichol ; le nombre de glucoses n’est donc pas de neuf.

Explication

Le contrôle de qualité implique les glucosidases 1 et 2, la calnexine, la calréticuline et ERp57. Ces acteurs favorisent le repliement correct ou permettent de détecter les protéines mal conformées ; la mannosidase 1 intervient plutôt dans l’étape de dégradation décrite séparément.

Explication

Une glycoprotéine mal repliée est rétrotransloquée vers le cytosol, ubiquitinylée par un complexe E3 puis dégradée par le protéasome. L’élimination préalable d’un mannose central par la mannosidase 1 fait partie de cette voie ; elle n’est pas remplacée par une phosphorylation.

Explication

L’ancre GPI fixe une protéine de type 1 à la membrane du RE tout en conservant une certaine mobilité. Sa fixation implique la coupure du domaine transmembranaire C-terminal, puis l’ajout covalent de l’ancre en C-terminal ; la N-glycosylation concerne, elle, une asparagine.

Explication

La fixation de l’ancre GPI nécessite d’abord le clivage du domaine transmembranaire C-terminal, puis la greffe covalente de l’ancre au nouveau C-terminal. Le domaine transmembranaire n’est donc pas conservé après cette modification.

Explication

La scramblase du RE assure un transfert non spécifique et bidirectionnel entre les feuillets. Les flippases de la membrane plasmique réalisent au contraire un transfert spécifique et unidirectionnel ; la mitochondrie reçoit des phospholipides par des transporteurs ou des protéines d’échange plutôt que par trafic vésiculaire.

Explication

En cas de manque de cholestérol, SREBP quitte le RE et gagne le Golgi, où S1P et S2P le clivent. Son domaine globulaire rejoint ensuite le noyau et active les gènes de l’HMG-CoAR et du LDLR ; le protéasome intervient plutôt dans la dégradation physiologique de l’HMG-CoAR lorsque le cholestérol est suffisant.

Explication

Lorsque le cholestérol est suffisant, le protéasome dégrade l’HMG-CoAR afin de maintenir une faible quantité de cette enzyme dans le RE. Cette dégradation ne concerne pas SREBP et ne survient pas spécifiquement lors d’une carence en cholestérol.

Explication

Le glycogène hépatique est converti en glucose-1-phosphate puis en glucose-6-phosphate. Ce dernier traverse la membrane grâce à la glucose-6-translocase avant l’action de la glucose-6-phosphatase, et non grâce à une enzyme de conjugaison.

Explication

Les xénobiotiques sont des molécules extérieures à l’organisme, souvent apolaires et liposolubles. Le foie les rend polaires et hydrosolubles afin de faciliter leur élimination urinaire ; les molécules apolaires sont, au contraire, difficilement éliminées par les urines.

Explication

La fonctionnalisation d’un xénobiotique RH consomme du dioxygène et du NADPH,H+ pour former ROH, de l’eau et du NADP+. Elle ajoute donc un groupement hydroxyle ; la conjugaison correspond à une autre étape, impliquant une fonction hydrophile liée de façon covalente.

Explication

La phase 1 met en jeu les cytochromes P-450 associés au feuillet cytosolique du REL. La phase 2 conjugue le xénobiotique avec une fonction hydrophile, telle que l’acide glucuronique ou l’acétate ; elle ne correspond donc pas à l’action des cytochromes P-450.