Flashcards : Acides aminés et protéines — 65 cartes

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1Question

Que contient la cellule dans un espace contraint ?

Réponse

Des glucides, des lipides et des protéines.

2Question

Que permettent les interrelations métaboliques à partir du glucose ?

Réponse

De produire des acides aminés, acides gras et précurseurs d'acides nucléiques.

3Question

Que génère notamment le cycle de Krebs ?

Réponse

Des acides gras, acides aminés, précurseurs d'ADN et d'hémoglobine.

4Question

Qu'est-ce que la séquence peptidique ?

Réponse

L'ordre des acides aminés liés dans une protéine.

5Question

Quelles fonctions assurent les protéines dans la cellule ?

Réponse

Elles assurent liaison, métabolisme, structure, catalyse, transport et signalisation.

6Question

Quelle est la concentration sanguine approximative de l'albumine ?

Réponse

Environ 60 g/L de sang.

7Question

Quelle fonction principale remplit l'albumine ?

Réponse

Elle transporte des hormones et d'autres composés.

8Question

De quoi est composée l'insuline ?

Réponse

De deux chaînes protéiques, A et B, liées par des liaisons covalentes.

9Question

Quel effet l'insuline a-t-elle sur la glycémie ?

Réponse

Elle diminue la glycémie en favorisant l'entrée du glucose dans les cellules.

10Question

Quelles sont les quatre liaisons du carbone α dans un acide α-aminé ?

Réponse

Un groupe carboxyle, une fonction amine, un atome d’hydrogène et une chaîne latérale R.

11Question

Quelle forme prend le groupe carboxyle à pH 7,4 ?

Réponse

Il est majoritairement sous forme COO⁻.

12Question

Quelle forme prend la fonction amine à pH physiologique 7,4 ?

Réponse

Elle est majoritairement sous forme NH₃⁺.

13Question

De quoi dépendent les propriétés d’un acide aminé isolé ?

Réponse

De son groupe carboxyle, sa fonction amine et sa chaîne latérale.

14Question

De quoi dépendent principalement les propriétés d’un acide aminé dans une protéine ?

Réponse

De sa chaîne latérale.

15Question

Combien d'acides aminés protéinogènes existe-t-il ?

Réponse

Il existe 21 acides aminés protéinogènes.

16Question

Qu'est-ce que la sélénocystéine par rapport à la cystéine ?

Réponse

La sélénocystéine est un analogue de la cystéine avec du sélénium à la place du soufre.

17Question

Quelle transformation subit la proline après traduction ?

Réponse

La proline peut être transformée en hydroxyproline.

18Question

Quelle modification post-traductionnelle affecte la lysine ?

Réponse

La lysine peut être transformée en hydroxylysine.

19Question

Que forme l'oxydation de deux cystéines ?

Réponse

Deux cystéines oxydées forment une cystine.

20Question

Quels sont les acides aminés indispensables chez l’Homme ?

Réponse

Ils sont l’histidine, la leucine, la thréonine, la lysine, le tryptophane, la phénylalanine, la valine, la méthionine et l’isoleucine.

21Question

Quelles sont les caractéristiques des acides aminés hydrophobes ?

Réponse

Ils ont une très faible affinité pour l’eau et une chaîne latérale surtout carbone et hydrogène.

22Question

Quels atomes contiennent les chaînes latérales des acides aminés hydrophiles ?

Réponse

Elles contiennent de l’oxygène, du soufre ou de l’azote.

23Question

Quelle affinité ont les acides aminés hydrophiles pour l’eau ?

Réponse

Ils présentent une affinité pour l’eau.

24Question

Quels types de fonctions chimiques peuvent porter les acides aminés hydrophiles ?

Réponse

Ils peuvent être basiques, acides ou porter des fonctions amide, alcool ou thiol.

25Question

Qu'est-ce qu'un acide aminé amphipathique ?

Réponse

Un acide aminé avec une région hydrophobe et une région hydrophile.

26Question

Quelle propriété permet aux acides aminés amphipathiques de former des interfaces ?

Réponse

La présence simultanée de régions hydrophobes et hydrophiles.

27Question

Quelle région hydrophile possède la lysine ?

Réponse

Une région NH₃⁺ hydrophile.

28Question

De quoi est constituée la région hydrophobe de la lysine ?

Réponse

De quatre groupes CH₂.

29Question

Qu'est-ce que la chiralité en chimie moléculaire ?

Réponse

La chiralité est la propriété d’une molécule asymétrique non superposable à son image miroir.

30Question

Qu'impose la présence d'un carbone α portant quatre groupements différents ?

Réponse

Elle rend possible la chiralité d'une molécule.

31Question

Comment reconnaître un acide aminé de série L en représentation de Fischer ?

Réponse

Sa fonction amine est à gauche quand le carboxyle est en haut.

32Question

Comment reconnaître un acide aminé de série D en représentation de Fischer ?

Réponse

Sa fonction amine est à droite quand le carboxyle est en haut.

33Question

Que signifie un pouvoir rotatoire positif ou négatif ?

Réponse

Il indique le sens de déviation de la lumière polarisée.

34Question

Le pouvoir rotatoire permet-il de déduire la série L ou D d'un acide aminé ?

Réponse

Non, il ne permet pas de déduire la série L ou D.

35Question

Quels acides aminés aromatiques absorbent entre 260 et 290 nm ?

Réponse

La phénylalanine, la tyrosine et le tryptophane.

36Question

À quelle longueur d'onde la phénylalanine a-t-elle un maximum d'absorption ?

Réponse

260 nm.

37Question

Quelle est la longueur d'onde du maximum d'absorption de la tyrosine ?

Réponse

275 nm.

38Question

À quelle longueur d'onde le tryptophane absorbe-t-il au maximum ?

Réponse

280 nm.

39Question

Quel acide aminé aromatique est le plus rare dans les protéines ?

Réponse

Le tryptophane.

40Question

Quelle est la proportion approximative du tryptophane dans les protéines ?

Réponse

Inférieure à 1 % hors sélénocystéine.

41Question

Qu'est-ce qu'une liaison hydrogène ?

Réponse

Une interaction électrostatique entre un hétéroatome électronégatif avec un doublet non liant et un hydrogène lié à un autre atome électronégatif.

42Question

Quels acides aminés polaires chargés sont acides ?

Réponse

L'aspartate et le glutamate.

43Question

Quels acides aminés polaires chargés sont basiques ?

Réponse

L'arginine, la lysine et l'histidine.

44Question

Où se situent les acides aminés hydrophiles dans les protéines hydrosolubles ?

Réponse

À la surface des protéines.

45Question

Où se situent les acides aminés hydrophobes dans les protéines hydrosolubles ?

Réponse

À l'intérieur des protéines.

46Question

Sur quel groupement la sérine peut-elle être phosphorylée ?

Réponse

Sur son groupement hydroxyle.

47Question

Quel effet peut avoir la phosphorylation de la thréonine ?

Réponse

Elle peut activer ou inhiber l'activité d'une protéine.

48Question

Comment varie la charge des acides aminés selon le pH ?

Réponse

Ils sont cationiques à pH acide, zwitterioniques entre les pKa, anioniques à pH basique.

49Question

Qu'est-ce que le pH isoélectrique d'un acide aminé ?

Réponse

C'est le pH où l'acide aminé est un ion dipolaire avec charge globale nulle.

50Question

Quelle formule donne le pH isoélectrique pour un acide aminé sans chaîne latérale ionisable ?

Réponse

pHi=pKCOOH+pKNH3+2pH_i = \frac{pK_{COOH}+pK_{NH_3^+}}{2}

51Question

Quels sont les pKa entourant la forme zwitterionique de l'acide aspartique ?

Réponse

Les pKa sont 2,1 et 4,0.

52Question

Quel est le pH isoélectrique calculé pour l'acide aspartique ?

Réponse

pHi=3,05pH_i = 3,05

53Question

Qu'est-ce qu'un pont disulfure ?

Réponse

Une liaison covalente formée par oxydation de deux groupements thiols de cystéines.

54Question

Combien de ponts disulfures possède l'insuline ?

Réponse

L'insuline possède trois ponts disulfures.

55Question

Où se trouve le pont disulfure intracaténaire dans l'insuline ?

Réponse

Dans la chaîne A.

56Question

Combien de ponts disulfures intercaténaires relient les chaînes A et B de l'insuline ?

Réponse

Deux ponts disulfures intercaténaires.

57Question

Quel est le rôle du dithiothréitol dans l'étude des protéines ?

Réponse

Il réduit les ponts disulfures et protège ou libère les groupements thiols.

58Question

Qu'est-ce qu'une liaison peptidique ?

Réponse

Une liaison amide formée par condensation entre un groupe carboxyle et un groupe amine.

59Question

Quelle masse minimale caractérise une protéine par rapport à un polypeptide ?

Réponse

Une protéine a une masse supérieure à 10 000 Da.

60Question

Comment se lit la séquence d'une chaîne polypeptidique ?

Réponse

De l'extrémité amino-terminale libre vers l'extrémité carboxy-terminale libre.

61Question

Quelle est la distance entre deux carbones α successifs dans une chaîne peptidique ?

Réponse

3,6 Å, quelle que soit la nature des acides aminés.

62Question

Que définit la structure primaire d'une protéine ?

Réponse

Le nombre et l'ordre des acides aminés dans la chaîne polypeptidique.

63Question

Quels types de structures secondaires ordonnées existent et comment sont-elles stabilisées ?

Réponse

Les hélices α et feuillets β, stabilisés par des liaisons hydrogène du squelette peptidique.

64Question

Qu'est-ce que la structure tertiaire d'une protéine ?

Réponse

Le repliement tridimensionnel d'une chaîne protéique formant sa conformation native fonctionnelle.

65Question

Qu'est-ce que la structure quaternaire d'une protéine ?

Réponse

L'association de plusieurs sous-unités protéiques identiques ou différentes.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 22 questions sur Acides aminés et protéines.

1. Concernant la cellule et l’intégration métabolique :

2. Parmi les produits associés au cycle de Krebs, la(les)quelle(s) est(sont) exacte(s) ?

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