Flashcards : Acides aminés, peptides et protéines — 71 cartes

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1Question

Quelles fonctions possède un acide α-aminé liées au carbone α ?

Réponse

Une fonction acide carboxylique et une fonction amine basique.

2Question

Qu'est-ce qui caractérise généralement le carbone α d'un acide α-aminé ?

Réponse

Il est généralement asymétrique.

3Question

Combien d'acides aminés principaux participent à la constitution des protéines ?

Réponse

Vingt acides aminés principaux participent.

4Question

Quel acide aminé particulier s'ajoute aux 20 principaux dans les protéines ?

Réponse

La sélénocystéine s'ajoute aux 20 principaux.

5Question

Combien d'acides aminés existent dans le vivant ?

Réponse

Plus de 150 acides aminés existent dans le vivant.

6Question

Quels groupes fonctionnels comprennent les acides aminés protéinogènes ?

Réponse

Ils comprennent les groupes aliphatiques, alcool, hétérocyclique, soufrés, neutres, acides, basiques et aromatiques.

7Question

Qu'est-ce que la transamination dans les acides aminés ?

Réponse

C'est le transfert d'une fonction amine en position α vers une fonction cétone en position α d'un autre acide aminé.

8Question

Quelles enzymes interviennent dans la transamination au foie ?

Réponse

Les aminotransférases ALAT et ASAT.

9Question

Quelle enzyme intervient dans la désamination oxydative des acides aminés ?

Réponse

La L-glutamate déshydrogénase.

10Question

Quelle modification chimique affecte la position C-terminale des peptides ?

Réponse

La réaction d’amidation.

11Question

Dans quels peptides la réaction d’amidation intervient-elle ?

Réponse

Dans la maturation de neuropeptides et d’hormones peptidiques comme la calcitonine et la vasopressine.

12Question

Que forme l’oxydation de deux fonctions thiol de cystéines ?

Réponse

Un pont disulfure.

13Question

Que provoque la réduction d’un pont disulfure ?

Réponse

La rupture du pont disulfure.

14Question

Quels acides aminés sont concernés par la phosphorylation ?

Réponse

La sérine, la thréonine et la tyrosine.

15Question

Quelle est la formule de la constante de dissociation acide KaK_a ?

Réponse

Ka=[H+][A-COO][A-COOH]K_a = \frac{[H^+][A\text{-}COO^-]}{[A\text{-}COOH]}

16Question

Comment s'écrit l'équation de Henderson-Hasselbalch ?

Réponse

pH=pKa+log([A-COO][A-COOH])pH = pKa + \log\left(\frac{[A\text{-}COO^-]}{[A\text{-}COOH]}\right)

17Question

Quel est le pKa typique du groupement α-carboxyle ?

Réponse

Il est généralement compris entre 2 et 2,5.

18Question

Quel est le pKa typique du groupement α-aminé ?

Réponse

Il est généralement compris entre 9 et 10.

19Question

Quelle est la formule du point isoélectrique pIpI pour un acide aminé neutre ?

Réponse

pI=pKa1+pKa22pI = \frac{pKa_1+pKa_2}{2}

20Question

Quelle est la formule du point isoélectrique pIpI pour un acide aminé acide ?

Réponse

pI=pKa1+pKa32pI = \frac{pKa_1+pKa_3}{2}

21Question

Quelle est la formule du point isoélectrique pIpI pour un acide aminé basique ?

Réponse

pI=pKa2+pKa32pI = \frac{pKa_2+pKa_3}{2}

22Question

Quel rôle structural ont les acides aminés dans l'organisme?

Réponse

Ils structurent les peptides, protéines et certaines molécules comme les phosphatidylsérines.

23Question

Quels acides aminés sont excitateurs dans le système nerveux central?

Réponse

Le glutamate et l’aspartate sont excitateurs.

24Question

Quel acide aminé est inhibiteur dans le système nerveux central?

Réponse

Le GABA est inhibiteur.

25Question

Quel est le métabolite du tryptophane mentionné?

Réponse

La sérotonine est un métabolite du tryptophane.

26Question

Quels acides aminés sont précurseurs des hormones thyroïdiennes T3 et T4?

Réponse

La phénylalanine et la tyrosine sont précurseurs.

27Question

Que sont les acides aminés essentiels?

Réponse

Ce sont ceux que l’organisme ne peut pas synthétiser.

28Question

Citez trois acides aminés essentiels.

Réponse

L’isoleucine, la leucine et la valine sont essentiels.

29Question

L’arginine est-elle un acide aminé essentiel?

Réponse

Oui, l’arginine est un acide aminé essentiel.

30Question

Qu'est-ce qu'une liaison peptidique ?

Réponse

Une liaison amide covalente entre deux acides aminés.

31Question

Pourquoi la liaison peptidique est-elle rigide et plane ?

Réponse

À cause de la résonance électronique.

32Question

Autour de quelles liaisons la rotation est-elle possible dans un peptide ?

Réponse

Autour des liaisons entre le carbone α et les atomes N et C.

33Question

Dans quel sens se lit la séquence d'un peptide ?

Réponse

De l'extrémité amino-terminale vers l'extrémité carboxy-terminale.

34Question

Combien d'acides aminés contiennent les oligopeptides ?

Réponse

Jusqu'à une vingtaine d'acides aminés.

35Question

Quelle est la taille maximale des polypeptides ?

Réponse

Jusqu'à 3 000 acides aminés ou davantage.

36Question

Quelle est la masse typique des protéines ?

Réponse

Entre 5 000 et plus d'un million de daltons.

37Question

Qu'est-ce que la structure primaire d'une protéine ?

Réponse

L'enchaînement covalent des acides aminés du N-terminal au C-terminal.

38Question

Qu'est-ce que la structure secondaire d'une protéine ?

Réponse

Le repliement régulier ou non de la chaîne polypeptidique en hélices α, feuillets β, boucles et coudes.

39Question

Que désigne la structure tertiaire d'une protéine ?

Réponse

L'assemblage tridimensionnel des structures secondaires, motifs supersecondaires et régions non structurées.

40Question

Que décrit la structure quaternaire d'une protéine ?

Réponse

L'assemblage tridimensionnel de plusieurs sous-unités protéiques identiques ou différentes.

41Question

Qu'obtient-on par le repliement protéique enfouissant les résidus apolaires?

Réponse

Une structure protéique stable.

42Question

Quelles interactions se trouvent au cœur des protéines?

Réponse

Les liaisons ioniques, hydrophobes, hydrogène, Van der Waals et ponts disulfure.

43Question

Combien d'acides aminés contient un tour d'hélice α?

Réponse

3,6 acides aminés par tour.

44Question

Par quelles liaisons l'hélice α est-elle stabilisée?

Réponse

Par des liaisons hydrogène intracaténaires entre résidus n et n+4.

45Question

Comment les chaînes latérales sont-elles disposées dans un feuillet β?

Réponse

Alternativement au-dessus et au-dessous du plan du feuillet.

46Question

Quelles sont les deux orientations possibles d'un feuillet β?

Réponse

Parallèle ou antiparallèle.

47Question

Quelle est la fonction d'un coude dans une protéine?

Réponse

Il change la direction du squelette de 180 degrés.

48Question

Quelle liaison stabilise souvent un coude et entre quels résidus?

Réponse

Une liaison hydrogène entre les résidus i et i+3.

49Question

Quelles sont les deux catégories principales de protéines selon leur composition?

Réponse

Holoprotéines et hétéroprotéines.

50Question

Quelles sont les principales modifications post-traductionnelles des protéines?

Réponse

Clivage protéolytique, phosphorylation, glycosylation, palmitoylation, méthylation et acétylation.

51Question

Qu'est-ce que la régulation allostérique d'une protéine?

Réponse

Modification de son activité par changement de structure après fixation d'un ligand.

52Question

Quelle forme de courbe de saturation présente la myoglobine?

Réponse

Une courbe hyperbolique.

53Question

Quelle forme de courbe de saturation présente l'hémoglobine?

Réponse

Une courbe sigmoïde.

54Question

Quelles sont les deux formes de l'hémoglobine selon leur affinité pour l'oxygène?

Réponse

Forme T tendue à faible affinité et forme R relâchée à forte affinité.

55Question

Quels sont les inhibiteurs allostériques de la liaison de l'oxygène à l'hémoglobine?

Réponse

Les protons H+, le CO₂ et le 2,3-bisphosphoglycérate.

56Question

Quelle liaison peptidique caractérise le glutathion ?

Réponse

La liaison implique la fonction acide carboxylique de la chaîne latérale du glutamate.

57Question

Quel rôle joue le glutathion face au stress oxydant ?

Réponse

Il neutralise le stress oxydant.

58Question

Quelle fonction biologique est associée à l’ocytocine ?

Réponse

La contraction utérine.

59Question

Quelle est la structure peptidique de la ciclosporine ?

Réponse

C’est un peptide cyclique de 11 acides aminés.

60Question

Quel rôle thérapeutique a la ciclosporine ?

Réponse

Elle est utilisée comme immunosuppresseur dans le rejet de greffe.

61Question

Combien de chaînes composent une immunoglobuline ?

Réponse

Deux chaînes lourdes et deux chaînes légères.

62Question

Quels types de domaines possède une immunoglobuline ?

Réponse

Des domaines variables de liaison à l’antigène et des domaines constants.

63Question

Quelle structure forme le collagène grâce à sa séquence spécifique ?

Réponse

Une triple hélice droite de tropocollagène.

64Question

Quelles méthodes permettent d’étudier la structure des protéines ?

Réponse

La radiocristallographie, la RMN et le dichroïsme circulaire.

65Question

Comment l’électrophorèse sépare-t-elle les molécules ?

Réponse

Selon leur charge dans un champ électrique.

66Question

Sur quel critère l’isoélectrofocalisation sépare-t-elle les molécules ?

Réponse

Selon leur point isoélectrique dans un gradient de pH.

67Question

Quelle est la première étape de la chromatographie d’affinité ?

Réponse

Faire passer l’échantillon sur la colonne.

68Question

Que fait-on après avoir éliminé les molécules indésirables en chromatographie d’affinité ?

Réponse

On récupère la molécule d’intérêt.

69Question

Quelle extrémité du peptide la méthode d’Edman utilise-t-elle pour séquencer ?

Réponse

L’extrémité amino-terminale.

70Question

Combien d’acides aminés peut-on séquencer par la méthode d’Edman automatisée ?

Réponse

Jusqu’à 50 acides aminés.

71Question

Quelles étapes comprend le Western blot ?

Réponse

Séparation par SDS-PAGE, transfert sur membrane, détection par anticorps.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 34 questions sur Acides aminés, peptides et protéines.

1. Quelle caractéristique définit la structure d’un acide α-aminé ?

2. Combien d’acides aminés principaux, avec la sélénocystéine, participent à la constitution des peptides et des protéines ?

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