QCM : Acides aminés : structure et propriétés — 24 questions

Questions et réponses du QCM

1. Quelle association entre le type de résine et l’acide aminé retenu est correcte ?

Une résine polyaminée cationique fixe un acide aminé anionique à pH supérieur au pHi
Une résine polysulfonée anionique fixe un acide aminé zwittérion à pH égal au pHi
Une résine polyaminée cationique fixe un acide aminé cationique à pH inférieur au pHi
Une résine polysulfonée anionique fixe un acide aminé anionique à pH supérieur au pHi

Une résine polyaminée cationique fixe un acide aminé anionique à pH supérieur au pHi

Explication

À un pH supérieur au pHipHi, l’acide aminé est anionique et peut être retenu par une résine polyaminée cationique. Une résine polysulfonée anionique retient au contraire les acides aminés cationiques lorsque le pH est inférieur au pHipHi.

2. Que signifie le point isoélectrique pHipHi d’un acide aminé ?

Le pH auquel la somme de ses charges intramoléculaires est nulle
Le pH imposé à une solution contenant plusieurs acides aminés
La concentration en sels nécessaire à son élution
La longueur d’onde à laquelle l’acide aminé absorbe le plus

Le pH auquel la somme de ses charges intramoléculaires est nulle

Explication

Le point isoélectrique est le pH pour lequel la somme des charges intramoléculaires de l’acide aminé est nulle. Il s’agit d’une propriété de l’acide aminé, alors que le pH décrit l’état de la solution.

3. Pour un acide aminé sans chaîne latérale ionisable dont les deux constantes sont pKA=2,3pK_A=2{,}3 et pKB=9,7pK_B=9{,}7, quelle est la valeur de pHipHi ?

12,012{,}0
4,74{,}7
6,06{,}0
7,47{,}4

$$6{,}0$$

Explication

Pour cet acide aminé, le point isoélectrique se calcule par pHi=pKA+pKB2=2,3+9,72=6,0pHi=\frac{pK_A+pK_B}{2}=\frac{2{,}3+9{,}7}{2}=6{,}0. Le pH de la solution peut être différent, car il est fixé par les conditions du milieu.

4. Quelle propriété de la proline la distingue-t-elle des 19 autres acides aminés historiques ?

Elle possède une fonction carboxylique secondaire au lieu d’une fonction primaire
Elle ne contient pas de carbone α dans sa structure générale
Elle possède une fonction amine secondaire au lieu d’une amine primaire
Elle possède deux groupes R attachés au même carbone α

Elle possède une fonction amine secondaire au lieu d’une amine primaire

Explication

La proline est l’exception des 20 acides aminés historiques, car son groupement amine est secondaire. Les autres possèdent une fonction amine primaire, même si leurs groupes R diffèrent.

5. Dans une chromatographie échangeuse d’ions, que deviennent les acides aminés dont la charge est opposée à celle de la résine ?

Ils précipitent dans la colonne puis sont révélés par la ninhydrine
Ils traversent la colonne avec les espèces de même charge lors du lavage
Ils sont transformés en zwittérions avant toute fixation sur la résine
Ils se fixent sur la résine, tandis que les autres sont éliminés par lavage

Ils se fixent sur la résine, tandis que les autres sont éliminés par lavage

Explication

Les acides aminés de charge opposée à la résine sont retenus par interaction électrostatique, tandis que les autres sont évacués par lavage avant l’élution des espèces fixées. La traversée sans fixation concerne plutôt les acides aminés de même charge que la résine.

6. Quelle différence concernant les acides aminés protéinogènes distingue les procaryotes des eucaryotes ?

Les procaryotes en possèdent 22, contre 21 chez les eucaryotes, en raison de la pyrrolysine
Les procaryotes en possèdent 21, contre 22 chez les eucaryotes, en raison de la sélénocystéine
Les deux groupes en possèdent 22, car la pyrrolysine et la sélénocystéine sont universelles
Les deux groupes en possèdent 21, car la pyrrolysine est absente des organismes vivants

Les procaryotes en possèdent 22, contre 21 chez les eucaryotes, en raison de la pyrrolysine

Explication

Les procaryotes comptent 22 acides aminés protéinogènes, tandis que les eucaryotes en comptent 21. La différence vient de la pyrrolysine, présente chez les procaryotes, alors que la sélénocystéine existe dans les deux groupes.

7. Dans un champ électrique, comment se comporte un acide aminé placé à un pH supérieur à son pHipHi ?

Il forme un zwittérion immobile dans le support
Il est cationique et migre vers la cathode
Il est anionique et migre vers l’anode
Il devient neutre et migre vers la cathode

Il est anionique et migre vers l’anode

Explication

À un pH supérieur au pHipHi, l’acide aminé porte une charge nette négative et migre vers l’anode. Le zwittérion immobile correspond au pH égal au pHipHi, tandis qu’un pH inférieur produit un cation attiré par la cathode.

8. Quelles sont les étapes caractéristiques de l’électrophorèse des acides aminés sur acétate de cellulose ?

Injection dans une colonne, séparation par hydrophobie, puis détection ultraviolette
Précipitation des acides aminés, chauffage du support, puis révélation par un sel
Dissolution dans une résine, lavage des ions, puis élution par une base
Dépôt sur le support, migration sous champ électrique, puis révélation à la ninhydrine

Dépôt sur le support, migration sous champ électrique, puis révélation à la ninhydrine

Explication

L’électrophorèse implique le dépôt sur un support d’acétate de cellulose, une migration différentielle sous champ électrique et une révélation à la ninhydrine. La séparation par hydrophobie correspond plutôt à une chromatographie de partage, et non à ce procédé électrophorétique.

9. Quels éléments sont portés par le carbone α dans la structure générale d’un acide aminé ?

Une fonction carbonyle, une fonction phosphate et un atome métallique
Deux fonctions carboxyliques et un groupe phosphate variable
Une fonction amide, une fonction hydroxyle et un groupe méthyle
Une fonction carboxylique, une fonction amine et un groupe R

Une fonction carboxylique, une fonction amine et un groupe R

Explication

Le carbone α porte une fonction acide carboxylique, une fonction amine et un groupe R. Le groupe R varie selon l’acide aminé, tandis que les deux fonctions définissent le squelette commun.

10. Une solution d’acides nucléiques présente un rapport A260/A280=1,6A_{260}/A_{280}=1{,}6. Quelle conclusion convient le mieux ?

La pureté est insuffisante pour une extraction utilisable
La valeur confirme une absorption maximale à 257 nm257\ \text{nm}
La mesure indique principalement la charge des acides aminés
La solution est correctement purifiée pour l’ADN ou l’ARN

La pureté est insuffisante pour une extraction utilisable

Explication

Une extraction d’ADN ou d’ARN est considérée comme utilisable lorsque le rapport A260/A280A_{260}/A_{280} est supérieur à 1,81{,}8. Une valeur de 1,61{,}6 est donc inférieure au seuil attendu, et ce rapport évalue la pureté des acides nucléiques plutôt que la charge des acides aminés.

11. Par quel mécanisme les protéines sont-elles dégradées en peptides puis en acides aminés ?

Par oxydation spontanée des liaisons peptidiques
Par condensation successive de molécules d’eau
Par hydrolyse chimique ou enzymatique
Par réduction des groupes carboxyliques

Par hydrolyse chimique ou enzymatique

Explication

La dégradation des protéines s’effectue par hydrolyse, qui peut être chimique ou catalysée par des enzymes. La condensation de molécules d’eau correspond au mécanisme inverse de formation des liaisons peptidiques.

12. À pH 6, quel comportement observe-t-on pour l’histidine et la cystéine sur la résine polyaminée ?

L’histidine est éluée, tandis que la cystéine demeure fixée
Les deux acides aminés sont élués puisqu’ils changent de charge
Les deux acides aminés demeurent fixés puisqu’ils sont ionisés
La cystéine est éluée, tandis que l’histidine demeure fixée

L’histidine est éluée, tandis que la cystéine demeure fixée

Explication

À pH 6, l’histidine est positive car le pH est inférieur à son pHi de 7,47, tandis que la cystéine est négative car le pH dépasse son pHi de 5,03; leurs interactions avec la résine entraînent donc des comportements différents. La cystéine n’est pas éluée dans cette situation, malgré son état ionisé.

13. Pourquoi la glycine ne possède-t-elle pas de carbone asymétrique ?

Son groupe R est un groupement carboxylique, ce qui neutralise la chiralité du carbone α
Elle possède deux groupes R différents qui empêchent la formation d’un centre asymétrique
Son carbone α est absent, car la glycine est dépourvue de squelette commun
Son groupe R est un atome d’hydrogène, ce qui donne deux substituants identiques au carbone α

Son groupe R est un atome d’hydrogène, ce qui donne deux substituants identiques au carbone α

Explication

Dans la glycine, le groupe R est un atome d’hydrogène ; le carbone α porte donc deux substituants identiques et n’est pas asymétrique. À l’inverse, la plupart des autres acides aminés historiques possèdent au moins un carbone asymétrique.

14. Quel acide aminé aromatique présente une absorption ultraviolette maximale proche de 257 nm257\ \text{nm} ?

La tyrosine
L’histidine
La phénylalanine
Le tryptophane

La phénylalanine

Explication

La phénylalanine absorbe au maximum autour de 257 nm257\ \text{nm}, tandis que le tryptophane atteint son maximum vers 280 nm280\ \text{nm} et la tyrosine vers 275 nm275\ \text{nm}. La confusion entre le tryptophane et la phénylalanine porte donc sur leurs longueurs d’onde caractéristiques.

15. Lorsque le pH du milieu augmente, quelle transformation de groupes ionisables peut se produire chez un acide aminé ?

Le groupe carboxylique passe de COOH à COO− et le groupe amine de NH3+ à NH2
Le groupe carboxylique devient NH3+ et le groupe amine devient COO−
Le groupe carboxylique passe de COO− à COOH et le groupe amine de NH2 à NH3+
Les deux groupes perdent leur capacité à porter une charge

Le groupe carboxylique passe de COOH à COO− et le groupe amine de NH3+ à NH2

Explication

Selon le pH, le groupement carboxylique peut se déprotoner de COOH vers COO−, tandis que le groupement amine peut passer de NH3+ vers NH2. Les autres propositions inversent ces formes ou attribuent aux groupes des fonctions chimiques différentes.

16. Dans une chromatographie de partage utilisant une phase stationnaire hydrophile et un solvant hydrophobe, quel acide aminé est généralement élué en premier ?

Un acide aminé fortement retenu par la phase stationnaire
Un acide aminé à chaîne latérale hydrophobe
Un acide aminé à chaîne latérale polaire chargée
Un acide aminé à chaîne latérale hydrophile

Un acide aminé à chaîne latérale hydrophobe

Explication

Les acides aminés hydrophobes préfèrent le solvant hydrophobe et sont donc moins retenus par la phase stationnaire hydrophile; ils sont élués en premiers. Les acides aminés hydrophiles interagissent davantage avec la phase stationnaire et migrent plus tard.

17. Quel est le rôle structural des acides aminés dans les peptides et les protéines ?

Ils forment des polymères qui s’assemblent en acides aminés
Ils remplacent les nucléotides dans les molécules d’ARN
Ils constituent les sous-unités monomériques de ces polymères
Ils catalysent directement toutes les réactions métaboliques

Ils constituent les sous-unités monomériques de ces polymères

Explication

Les acides aminés sont les monomères qui s’assemblent pour former les peptides et les protéines, des polymères d’acides aminés. Une protéine n’est donc pas un monomère, contrairement à un acide aminé.

18. Pour séparer l’histidine de pHi 7,47 et la cystéine de pHi 5,03 sur une résine polyaminée, quelle stratégie de pH faut-il appliquer ?

Maintenir la résine à pH 7,47 pendant toute la séparation
Commencer à pH 5,03, puis augmenter le pH jusqu’à 7,47
Commencer à pH 6, puis augmenter progressivement le pH jusqu’à 12
Commencer à pH 12, puis diminuer progressivement le pH jusqu’à 6

Commencer à pH 12, puis diminuer progressivement le pH jusqu’à 6

Explication

La séparation repose sur un départ à pH 12 suivi d’une diminution progressive jusqu’à pH 6. Les valeurs de pHi servent ensuite à déterminer l’état de charge et la rétention, mais elles ne définissent pas la séquence de pH à appliquer.

19. Quelle caractéristique chiralité concerne les acides aminés incorporés dans les protéines humaines ?

Ils sont de type L, ce qui illustre l’homochiralité de la vie humaine
Ils forment un mélange équimoléculaire D/L, dépourvu de configuration privilégiée
Ils alternent entre les formes D et L selon leur position dans la protéine
Ils sont de type D, ce qui explique leur rotation systématique vers la droite

Ils sont de type L, ce qui illustre l’homochiralité de la vie humaine

Explication

Les acides aminés des protéines humaines sont de configuration L, phénomène appelé homochiralité de la vie humaine. Cette configuration ne signifie pas automatiquement que chaque acide aminé fait tourner la lumière dans le même sens.

20. Sur quel critère principal la chromatographie de partage sépare-t-elle les acides aminés ?

Leur point isoélectrique
Leur hydrophobie ou leur hydrophilie
Leur masse moléculaire relative
Leur charge électrique nette

Leur hydrophobie ou leur hydrophilie

Explication

La chromatographie de partage distingue les acides aminés selon leur affinité hydrophobe ou hydrophile entre les phases. La charge électrique constitue plutôt le critère caractéristique de la chromatographie échangeuse d’ions.

21. Que décrit la notation D ou L d’un acide aminé en projection de Fischer ?

Le sens de rotation de la lumière polarisée par la molécule
La vitesse de racémisation de la molécule après la mort cellulaire
La configuration liée à la position du groupe NH2 sur le carbone α
La proportion relative des formes ionisées dans une solution aqueuse

La configuration liée à la position du groupe NH2 sur le carbone α

Explication

En projection de Fischer, D ou L indique la configuration selon la position du groupe NH2 sur le carbone α. Cette notation ne permet pas de déduire si la molécule est dextrogyre ou lévogyre.

22. Quels acides aminés appartiennent au groupe des acides aminés aromatiques ?

L’acide aspartique, l’acide glutamique et la lysine
La cystéine, la méthionine et la proline
Le tryptophane, la tyrosine et la phénylalanine
La glycine, l’alanine et la valine

Le tryptophane, la tyrosine et la phénylalanine

Explication

Les acides aminés aromatiques sont définis ici par le tryptophane, la tyrosine et la phénylalanine. La glycine, l’alanine et la valine appartiennent à d’autres catégories selon leur chaîne latérale.

23. Quelle distinction décrit correctement les rôles des acides aminés protéinogènes et non protéinogènes ?

Les protéinogènes servent à la synthèse protéique, les autres remplissent d’autres fonctions biologiques
Les protéinogènes forment l’hème, les autres servent à assembler les protéines
Les protéinogènes stockent l’énergie, les autres déterminent la séquence des protéines
Les protéinogènes produisent des hormones, les autres constituent les peptides

Les protéinogènes servent à la synthèse protéique, les autres remplissent d’autres fonctions biologiques

Explication

Les acides aminés protéinogènes sont incorporés lors de la synthèse des protéines, tandis que les non protéinogènes exercent d’autres fonctions biologiques. Ces dernières peuvent notamment concerner des médiateurs, des hormones ou des réserves énergétiques.

24. Comment se répartissent les 20 acides aminés protéinogènes historiques selon la polarité et la charge de leur chaîne latérale ?

5 apolaires, 6 polaires non chargés et 9 polaires chargés
9 apolaires, 5 polaires non chargés et 6 polaires chargés
9 apolaires, 6 polaires non chargés et 5 polaires chargés
6 apolaires, 9 polaires non chargés et 5 polaires chargés

9 apolaires, 6 polaires non chargés et 5 polaires chargés

Explication

La répartition historique est de 9 acides aminés à chaîne latérale apolaire, 6 polaires non chargées et 5 polaires chargées. Le total des acides aminés polaires est donc 11, mais cette valeur ne remplace pas la distinction entre les deux catégories polaires.

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Que sont les acides aminés dans les peptides et protéines ?

Ce sont les sous-unités monomériques.

Quelle proportion de la masse sèche cellulaire est constituée de protéines ?

Plus de 50 % de la masse sèche.

Comment se dégradent les protéines en acides aminés ?

Par hydrolyse chimique ou enzymatique.

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