Flashcards : Bases de la biologie moléculaire — 88 cartes

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1Question

De quoi est constitué un nucléotide ?

Réponse

D'une base azotée, d'un ose et d'un ou plusieurs groupements phosphate.

2Question

Quelles sont les bases azotées pyrimidiques ?

Réponse

La cytosine, la thymine et l’uracile.

3Question

Quelles sont les bases azotées puriques ?

Réponse

L’adénine et la guanine.

4Question

Quel ose compose l’ARN ?

Réponse

Le β-D-ribose.

5Question

Quel ose compose l’ADN ?

Réponse

Le 2-désoxy-β-D-ribose.

6Question

Quelle différence existe entre le β-D-ribose et le 2-désoxy-β-D-ribose ?

Réponse

La présence d’un groupement OH ou H en position 2’.

7Question

Comment s’apparient l’adénine et la thymine dans l’ADN ?

Réponse

Par deux liaisons hydrogène.

8Question

Quelle liaison différencie un nucléoside d’un nucléotide ?

Réponse

Un nucléotide associe un nucléoside à un, deux ou trois phosphates.

9Question

Comment sont synthétisés les acides nucléiques ?

Réponse

Par des polymérases à partir de nucléotides triphosphates avec Mg2+ comme cofacteur.

10Question

Par quelle liaison les nucléotides d’un acide nucléique sont-ils reliés ?

Réponse

Par des liaisons phosphodiester entre le OH en 3’ et le phosphate en C5’ du nucléotide suivant.

11Question

Dans quel sens lit-on les séquences d’ADN et d’ARN par convention ?

Réponse

De l’extrémité 5’ vers l’extrémité 3’.

12Question

Quelles différences structurales distinguent l’ARN de l’ADN ?

Réponse

L’ARN contient du ribose, A, U, C, G, est monocaténaire et plus court, l’ADN contient du désoxyribose, A, T, C, G et forme une double hélice bicaténaire antiparallèle.

13Question

Quelle proportion des ARN est représentée par les ARN ribosomiques ?

Réponse

82 % des ARN sont des ARN ribosomiques.

14Question

Quelle proportion des ARN est représentée par les ARN de transfert ?

Réponse

16 % des ARN sont des ARN de transfert.

15Question

Quelle ARN polymérase synthétise les ARNr 28S, 18S et 5,8S ?

Réponse

L’ARN polymérase I synthétise ces ARNr.

16Question

Quels ARN sont synthétisés par l’ARN polymérase III ?

Réponse

Les ARNt, l’ARNr 5S, les ARNsn et les ARN 7S.

17Question

Qu'est-ce qu'un gène en biologie moléculaire ?

Réponse

Une séquence d'ADN codant pour une protéine ou un ARN.

18Question

Quels éléments comprend un gène ?

Réponse

Un promoteur, des séquences cis-régulatrices, un site d'initiation, exons, introns, signaux de fin.

19Question

Quelle est la différence entre le brin sens et le brin antisens ?

Réponse

Le brin sens est identique au transcrit sauf T remplacé par U, le brin antisens est complémentaire et matrice de l'ARN polymérase II.

20Question

Quelles étapes composent l'expression d'un gène ?

Réponse

Transcription en transcrit primaire, maturation en ARNm, traduction en protéine.

21Question

À quels niveaux s'effectue la régulation de l'expression des gènes ?

Réponse

Au contrôle transcriptionnel, maturation de l'ARN, traduction et activité protéique.

22Question

Quelle différence entre éléments cis- et trans-régulateurs ?

Réponse

Les cis sont des séquences d’ADN, les trans sont des protéines.

23Question

Quel effet ont les trans-activateurs sur la transcription ?

Réponse

Ils favorisent la transcription.

24Question

Quel effet ont les trans-répresseurs sur la transcription ?

Réponse

Ils inhibent la transcription.

25Question

Où se situe la boîte TATA par rapport au site d’initiation ?

Réponse

Environ 25 nucléotides en amont.

26Question

Quelle protéine reconnaît la boîte TATA via TFIID ?

Réponse

La TBP (TATA-binding protein).

27Question

Quel est le rôle de la boîte CAAT ?

Réponse

Elle participe à l’orientation de la transcription.

28Question

Quelle est la première étape de l’initiation transcriptionnelle ?

Réponse

Fixation des facteurs trans sur les éléments cis.

29Question

Quels substrats utilise l’ARN polymérase II ?

Réponse

Les ribonucléosides triphosphates ATP, CTP, GTP et UTP.

30Question

Quel brin l'ARN polymérase II lit-elle pendant l'élongation ?

Réponse

Le brin antisens dans le sens 3’→5’.

31Question

Dans quel sens l'ARN polymérase II synthétise-t-elle le transcrit primaire ?

Réponse

Dans le sens 5’→3’ par ajout à l'extrémité 3’ OH.

32Question

Que consomme chaque nucléotide incorporé dans le transcrit ?

Réponse

Les deux liaisons anhydride d’acide de son nucléoside triphosphate.

33Question

Quelle molécule est libérée lors de l'incorporation d'un nucléotide ?

Réponse

Un pyrophosphate est libéré.

34Question

Que contient le transcrit primaire en termes de séquences ?

Réponse

Il contient des exons et des introns.

35Question

Le transcrit primaire contient-il le promoteur ?

Réponse

Non, le promoteur est en amont du site d’initiation.

36Question

Que contiennent les exons dans le transcrit primaire ?

Réponse

Des séquences codantes et non codantes.

37Question

Que deviennent les introns lors de la maturation ?

Réponse

Ils sont éliminés et ne font pas partie de l’ARNm.

38Question

Quels sont les trois événements de la maturation du transcrit primaire ?

Réponse

Ajout d'une coiffe en 5', excision-épissage des introns, ajout d'une queue poly-A en 3'.

39Question

Quelle est la nature chimique de la coiffe 5' ?

Réponse

Une 7-méthyl-guanosine triphosphate.

40Question

Quels rôles joue la coiffe 5' sur l'ARNm ?

Réponse

Elle protège l'ARNm, permet sa sortie du noyau et facilite sa reconnaissance par les ribosomes.

41Question

Quels sites caractérisent chaque intron ?

Réponse

Un site donneur GU en 5' et un site accepteur AG en 3'.

42Question

Où se situe l'adénylate de branchement dans un intron ?

Réponse

Environ 40 nucléotides avant le site accepteur.

43Question

Que permet l'épissage alternatif ?

Réponse

De produire plusieurs ARNm et protéines à partir d'un même gène.

44Question

Quel pourcentage des gènes peut être concerné par l'épissage alternatif ?

Réponse

90 % des gènes.

45Question

Que reconnaît l’excision-épissage dans l’ARN pré-messager ?

Réponse

Les introns.

46Question

Comment se forme le lasso lors de l’excision-épissage ?

Réponse

Par liaison entre l’adénylate de branchement et le premier guanylate.

47Question

Quelle enzyme catalyse la liaison phosphoester entre deux exons ?

Réponse

Une ARN ligase.

48Question

Quels sites caractérisent les introns pour l’épissage ?

Réponse

Un site donneur GU en 5’ et un site accepteur AG en 3’.

49Question

Quelle séquence précède le site accepteur des introns ?

Réponse

Une séquence riche en bases pyrimidiques.

50Question

Quelles sont les deux étapes d’ajout de la queue poly-A ?

Réponse

Clivage par endonucléase puis ajout de plus de 1000 adénylates par poly-A polymérase.

51Question

Qu'établit le code génétique entre ARNm et acides aminés ?

Réponse

La correspondance entre les codons de l’ARNm et les acides aminés.

52Question

Combien de codons comprend le code génétique ?

Réponse

Le code génétique comprend 64 codons.

53Question

Quels codons STOP existent dans le code génétique ?

Réponse

UAA, UAG et UGA sont les codons STOP.

54Question

Quel codon initie la traduction et quel acide aminé code-t-il ?

Réponse

Le codon AUG initie la traduction et code la méthionine.

55Question

Quelles régions de l'ARNm ne sont pas traduites ?

Réponse

Les régions avant AUG et après le codon STOP ne sont pas traduites.

56Question

Pourquoi le code génétique est-il dit dégénéré ?

Réponse

Parce qu’un même acide aminé peut être codé par plusieurs codons.

57Question

Quel acide aminé est codé uniquement par un seul codon et lequel ?

Réponse

La méthionine est codée uniquement par AUG.

58Question

Quelle est la structure et la taille typique d’un ARNt ?

Réponse

Un ARNt fait environ 70 nucléotides avec une structure en trèfle et tridimensionnelle en L.

59Question

Quels éléments s'assemblent lors de l'initiation de la traduction ?

Réponse

L'ARNt chargé en méthionine, l'ARNm et les sous-unités ribosomiques 40S et 60S.

60Question

Que recrute l'élongation au site A du ribosome ?

Réponse

Un ARNt.

61Question

Que se passe-t-il lors de la terminaison de la traduction au site A ?

Réponse

Un codon STOP arrive et la liaison ester est hydrolysée en présence d'un facteur eRF.

62Question

Combien de liaisons riches en énergie sont hydrolysées pour incorporer un acide aminé ?

Réponse

Quatre liaisons riches en énergie.

63Question

Qu'est-ce qu'un peptide signal ?

Réponse

Une séquence hydrophobe de 15 à 20 acides aminés à l'extrémité N-terminale de certaines protéines.

64Question

Quel est le rôle du peptide signal dans la cellule ?

Réponse

Il sert à l'adressage des protéines vers l'extérieur, la membrane ou des organites.

65Question

Que fait l'élongation après avoir transféré le peptide au site A ?

Réponse

Elle transpose le complexe du site A vers le site P.

66Question

Quelles sous-unités ribosomiques forment le ribosome 80S fonctionnel ?

Réponse

Les sous-unités 40S et 60S.

67Question

Qu'est-ce que la réplication de l'ADN ?

Réponse

C'est la synthèse qui reproduit le génome pendant la phase S.

68Question

Qu'impose la réplication semi-conservative de l'ADN ?

Réponse

Chaque molécule d'ADN contient un brin parental et un brin néosynthétisé.

69Question

Comment commence la réplication de l'ADN ?

Réponse

Elle commence à plusieurs origines reconnues par des protéines nucléaires.

70Question

Quelle est la direction de synthèse des ADN polymérases ?

Réponse

Elles synthétisent l'ADN dans le sens 5’→3’.

71Question

Quelle enzyme produit l'amorce d'ARN pour la réplication ?

Réponse

La primase produit l'amorce d'ARN.

72Question

Quelle activité de correction possèdent les ADN polymérases ?

Réponse

Elles ont une activité exonucléasique 3’→5’ de correction.

73Question

Quelle est la fréquence d'erreur lors de la réplication de l'ADN ?

Réponse

Il y a moins d'une erreur par milliard de nucléotides synthétisés.

74Question

Qu'est-ce qu'une variation du génome ?

Réponse

Un changement permanent de la structure de l’ADN copié dans les générations futures.

75Question

Qu'impose une substitution sur le cadre de lecture ?

Réponse

Elle ne décale pas le cadre de lecture.

76Question

Quelle différence y a-t-il entre une délétion et une substitution ?

Réponse

Une délétion ajoute ou supprime des nucléotides et peut décaler le cadre.

77Question

Qu'est-ce qu'une substitution synonyme ?

Réponse

Une substitution qui ne change pas l’acide aminé.

78Question

Que fait une substitution non-sens sur un codon ?

Réponse

Elle transforme un codon codant en codon STOP.

79Question

Quel effet a une délétion ou insertion de trois nucléotides sur le cadre de lecture ?

Réponse

Elle ne décale pas le cadre de lecture.

80Question

Quel est l'effet d'une variation sur un ou deux nucléotides ?

Réponse

Elle décale généralement le cadre de lecture et peut être désastreuse.

81Question

Quelle est la particularité du variant ΔF508 de CFTR ?

Réponse

C'est une délétion de l’acide aminé 508 sans décalage du cadre, présente dans 70 % des mucoviscidoses.

82Question

Quelles étapes comprend la synthèse d'un ADN complémentaire à partir d'un ARNm ?

Réponse

Elle comprend purification de l'ARNm, hybridation d'un oligo(dT), synthèse du premier brin, dégradation de l'ARNm, synthèse du second brin et suppression de la boucle.

83Question

Qu'est-ce que la PCR ?

Réponse

La PCR est une méthode qui amplifie une séquence d'ADN en produisant beaucoup de copies.

84Question

Quels sont les réactifs essentiels d'une PCR ?

Réponse

Ils sont l'ADN matrice, une ADN polymérase thermostable Taq, une paire d'amorces, des désoxyribonucléosides triphosphates, un tampon et du Mg++.

85Question

Quelles sont les trois phases de chaque cycle de PCR ?

Réponse

Dénaturation, hybridation des amorces, et élongation par la Taq polymérase.

86Question

À quelle température se fait la dénaturation lors d'un cycle de PCR ?

Réponse

Elle se fait à environ 90–96 °C.

87Question

À quelle température se fait l'hybridation des amorces en PCR ?

Réponse

Elle se fait à environ 50–65 °C.

88Question

À quelle température se fait l'élongation par la Taq polymérase en PCR ?

Réponse

Elle se fait à environ 72 °C.

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Teste tes connaissances avec un QCM de 55 questions sur Bases de la biologie moléculaire.

1. Concernant la structure des nucléotides :

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