Flashcards : Biochimie structurale des protéines — 61 cartes

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1Question

Qu'est-ce qu'une liaison peptidique ?

Réponse

Une liaison covalente de type amide entre deux acides aminés avec le motif CO=NH.

2Question

À quoi correspond l'angle φ dans la structure peptidique ?

Réponse

À la rotation autour de la liaison Cα–N.

3Question

À quoi correspond l'angle ψ dans la structure peptidique ?

Réponse

À la rotation autour de la liaison Cα–C.

4Question

Quelle configuration adopte la liaison peptidique ?

Réponse

La configuration trans.

5Question

Qu'est-ce que la structure primaire d'une protéine ?

Réponse

L'enchaînement linéaire et covalent d'acides aminés selon la séquence génomique.

6Question

Comment définit-on un oligopeptide ?

Réponse

Un peptide de moins de 25 acides aminés.

7Question

Quelle est la taille maximale d'un polypeptide ?

Réponse

Moins de 100 acides aminés.

8Question

À partir de combien d'acides aminés parle-t-on d'une protéine ?

Réponse

Plus de 100 acides aminés.

9Question

Quelles formes peuvent avoir les peptides ?

Réponse

Ils peuvent être linéaires, cycliques ou multicaténaire.

10Question

Qu'est-ce que le glutathion ?

Réponse

Un peptide γGlu-Cys-Gly protégeant les fonctions thiol.

11Question

Sous quelles formes le glutathion existe-t-il ?

Réponse

Sous les formes réduite GSH et oxydée GSSG.

12Question

Quelle est la structure du glucagon ?

Réponse

Un peptide monocaténaire linéaire de 29 acides aminés.

13Question

Quelle est la séquence du glucagon ?

Réponse

NH2-HSQGTFTSNYSLYLDSRRAENFVEYLMNT-COOH.

14Question

De quoi est composée l'insuline ?

Réponse

De deux chaînes de 21 et 30 acides aminés.

15Question

Quelle est la nature de la gramicidine S ?

Réponse

Un peptide cyclique antibiotique bactérien de 10 acides aminés.

16Question

Qu'est-ce que la structure secondaire d'une protéine ?

Réponse

La configuration spatiale locale d’une chaîne polypeptidique stabilisée par des liaisons non covalentes.

17Question

Par quelles liaisons l'hélice α est-elle stabilisée ?

Réponse

Par des liaisons hydrogène intrachaîne.

18Question

Combien de résidus comporte un tour d'hélice α ?

Réponse

3,6 résidus par tour.

19Question

Comment se forme un feuillet β ?

Réponse

Par l’association de brins β stabilisés par des liaisons hydrogène.

20Question

Quel effet ont la leucine et la valine sur le feuillet β ?

Réponse

Elles favorisent la formation d’un feuillet β plus stable.

21Question

Qu'est-ce que la structure tertiaire d'une protéine ?

Réponse

Le repliement global d’une chaîne polypeptidique maintenu par des liaisons covalentes et non covalentes entre chaînes latérales.

22Question

Que désigne la structure quaternaire d'une protéine ?

Réponse

L’association de deux ou plusieurs chaînes polypeptidiques avec chacune sa propre structure tertiaire.

23Question

Quand une protéine oligomérique est-elle homopolymérique ?

Réponse

Lorsque ses sous-unités sont identiques.

24Question

Quelle structure manquent les protéines fibreuses ?

Réponse

Elles ne possèdent ni structure tertiaire ni structure quaternaire.

25Question

Quelle est la structure formée par deux hélices α dans la kératine ?

Réponse

Une superhélice.

26Question

Quels sont les niveaux d'organisation de la kératine après la superhélice ?

Réponse

Protofibrilles, microfibrilles et fibre réticulée par des ponts disulfure.

27Question

Quel motif répété caractérise le collagène ?

Réponse

Le motif Gly–X–Y.

28Question

Quels acides aminés modifiés trouve-t-on dans le collagène ?

Réponse

De la proline, hydroxyproline et hydroxylysine glycosylée.

29Question

Quelle structure forme le collagène avant les microfibrilles ?

Réponse

Une triple hélice appelée tropocollagène.

30Question

Quels résidus sont reliés par le pontage covalent du collagène ?

Réponse

Des résidus d’allysine entre eux.

31Question

Quel motif caractérise la fibroïne en feuillets β ?

Réponse

Le motif Gly + (Val ou Ser).

32Question

Qu'est-ce qu'une protéine globulaire ?

Réponse

Une protéine globulaire a une forme sphérique avec des structures secondaires alternées.

33Question

Où se situent les acides aminés hydrophiles dans une protéine globulaire ?

Réponse

Ils sont surtout à la surface externe.

34Question

Où se situent les acides aminés hydrophobes dans une protéine globulaire ?

Réponse

Ils sont surtout à l’intérieur.

35Question

Combien d'acides aminés contient la myoglobine ?

Réponse

La myoglobine contient 153 acides aminés.

36Question

Combien d'hélices α comprend la myoglobine ?

Réponse

Elle comprend huit hélices α nommées de A à H.

37Question

Quelles classes d'immunoglobulines existent ?

Réponse

Les classes IgG, IgA, IgM, IgD et IgE.

38Question

Quelle est la structure quaternaire de la glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase ?

Réponse

C'est un homotétramère.

39Question

Que contient chaque sous-unité de la glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase ?

Réponse

Deux domaines associant feuillets β et hélices α.

40Question

Qu'est-ce que la glycosylation ?

Réponse

L'addition enzymatique d'un glucide à une chaîne polypeptidique.

41Question

Que comprend la N-glycosylation ?

Réponse

L'ajout d'un oligoside avec N-acétylglucosamine et formation d'une liaison amide.

42Question

Où se déroule la O-glycosylation ?

Réponse

Dans l'appareil de Golgi.

43Question

Qu'est-ce que la glycation ?

Réponse

La fixation non enzymatique d'oses simples sur des groupements aminés libres.

44Question

Que reflète l'HbA1c chez les patients diabétiques ?

Réponse

La glycémie moyenne sur trois mois.

45Question

À quoi correspond une variation de 1 % d'HbA1c ?

Réponse

À 0,29 g/L ou 1,6 mM de glucose.

46Question

Que comprend la maturation post-traductionnelle ?

Réponse

L'acquisition des structures II, III, IV, modifications d'acides aminés et clivage de précurseurs.

47Question

Quelles structures protéiques la dénaturation perturbe-t-elle principalement ?

Réponse

Les structures tertiaire et quaternaire.

48Question

Quel est l'état final d'une protéine après dénaturation ?

Réponse

Un état déployé.

49Question

Quels agents peuvent dénaturer les protéines ?

Réponse

La température élevée, les pH extrêmes, la concentration ionique élevée, les solvants organiques apolaires et certaines substances chimiques.

50Question

Quels types d'interactions l'urée à 8 M perturbe-t-elle ?

Réponse

Les liaisons hydrogène et les interactions hydrophobes.

51Question

Quel effet a le 2-mercaptoéthanol à 1 mM sur les ponts disulfure ?

Réponse

Il rompt les ponts disulfure.

52Question

Quel type de liaison sont les ponts disulfure ?

Réponse

Des liaisons covalentes.

53Question

Que fait le SDS à 1 % aux protéines ?

Réponse

Il perturbe toutes les liaisons non covalentes et charge négativement les protéines.

54Question

Comment la méthode de Biuret dose-t-elle les protéines ?

Réponse

Par formation d’un complexe tétracoordonné avec les ions Cu2+ en milieu alcalin.

55Question

Quelle coloration produit la méthode de Biuret et à quelle longueur d'onde ?

Réponse

Une coloration violette mesurée à 540 nm.

56Question

Quels réactifs combine la méthode de Lowry pour doser les protéines ?

Réponse

La réaction de Biuret et le réactif de Folin-Ciocalteu.

57Question

Quelle est la longueur d'onde de la coloration produite par la méthode de Lowry ?

Réponse

691 nm.

58Question

Quel colorant utilise la méthode de Bradford pour le dosage protéique ?

Réponse

Le bleu de Coomassie G250 en milieu acide.

59Question

Quelle est la différence principale entre endopeptidases et exopeptidases ?

Réponse

Les endopeptidases coupent à l’intérieur, les exopeptidases aux extrémités de la chaîne.

60Question

Quels acides aminés la pepsine cible-t-elle ?

Réponse

Les acides aminés aromatiques.

61Question

Quelle spécificité a la carboxypeptidase B ?

Réponse

Elle cible les acides aminés basiques.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 29 questions sur Biochimie structurale des protéines.

1. Comment se forme un feuillet β ?

2. Comment classe-t-on un peptide constitué de 80 acides aminés selon sa longueur ?

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