QCM : Biologie moléculaire : acides nucléiques — 25 questions

Explication

Un nucléotide associe une base azotée, un sucre et un groupement phosphate. La présence du phosphate le distingue notamment du nucléoside, qui ne comprend qu’une base liée à un sucre.

Explication

Un nucléoside est formé d’une base liée à un sucre, alors qu’un nucléotide possède en plus un groupement phosphate. Confondre ces deux molécules revient donc à attribuer à tort un phosphate au nucléoside.

Explication

Les pyrimidines possèdent un seul hétérocycle à six sommets, tandis que les purines possèdent deux hétérocycles accolés. La cytosine, la thymine et l’uracile sont des pyrimidines, alors que l’adénine et la guanine sont des purines.

Explication

Le sucre de l’ADN est le désoxyribose, tandis que celui de l’ARN est le ribose. Cette distinction porte sur le sucre constitutif et permet notamment de différencier les deux types d’acides nucléiques.

Explication

Les nucléotides d’un polynucléotide sont reliés par des liaisons phosphodiester entre les positions 3’ et 5’ des sucres. La liaison N-osidique relie plutôt une base azotée à un sucre.

Explication

La structure primaire correspond à la succession ordonnée des bases de l’acide nucléique. Les structures secondaire et tertiaire renvoient à des niveaux d’organisation tridimensionnelle, et non à la séquence elle-même.

Explication

Les acides nucléiques sont orientés selon un axe 5’ vers 3’, et leur séquence est écrite dans ce même sens conventionnel. L’orientation 3’ vers 5’ peut décrire l’autre brin dans certaines structures, mais ce n’est pas la convention d’écriture de la séquence.

Explication

L’ADN est constitué de désoxyribose et des bases adénine, guanine, cytosine et thymine; il est généralement bicaténaire et porte l’information génétique. L’uracile caractérise plutôt l’ARN, ce qui rend la présence d’U incorrecte pour l’ADN.

Explication

L’adénine s’apparie avec la thymine par deux interactions hydrogène, tandis que la guanine s’apparie avec la cytosine par trois. Les associations A-C et G-T ne correspondent pas aux appariements complémentaires de l’ADN.

Explication

Les deux brins d’ADN sont complémentaires et orientés en sens opposés, tandis que les sucres et les phosphates se trouvent à la périphérie et les bases appariées au centre. La disposition des bases et l’antiparallélisme sont donc essentiels à la structure de la double hélice.

Explication

L’ARN contient les bases A, G, C et U, alors que l’ADN utilise la thymine à la place de l’uracile. La thymine n’est donc pas la base caractéristique de l’ARN.

Explication

L’ARN messager assure le transfert de l’information entre l’ADN et les protéines, tandis que l’ARN de transfert apporte les acides aminés. Les ribosomes sont formés notamment par les ARN ribosomaux associés à des protéines.

Explication

L’ARNt est une petite molécule de 70 à 90 nucléotides portant une extrémité 3’ CCA et un anticodon. L’extrémité CCA est donc située en 3’, et l’ARNt ne porte pas un ribosome entier.

Explication

L’extraction commence par la lyse, puis les protéases éliminent les protéines avant la séparation des acides nucléiques par chromatographie d’échange d’ions. Les protéases ne digèrent pas les acides nucléiques et ne réalisent pas leur séparation chromatographique.

Explication

Les RNases hydrolysent les acides ribonucléiques, alors que les DNases ciblent les acides désoxyribonucléiques. Une exonucléase ou une endonucléase décrit plutôt un mode de coupure, sans préciser nécessairement l’acide nucléique ciblé.

Explication

Les exonucléases libèrent des nucléotides à partir d’une extrémité 5’ ou 3’, tandis que les endonucléases hydrolysent une liaison ester située à l’intérieur de la chaîne. Les deux activités ne correspondent donc pas à deux directions opposées d’une même coupure terminale.

Explication

La dénaturation sépare les deux brins d’ADN, ce qui permet ensuite à la sonde complémentaire de s’apparier à la séquence cible. La sonde n’est donc pas l’agent qui dégrade ou remplace un brin.

Explication

L’ADN polymérase utilise une amorce pour disposer d’une extrémité de départ, un brin matrice et des désoxyribonucléotides pour construire le nouveau brin. Les acides aminés et les ribonucléotides ne sont pas les substrats de cette synthèse d’ADN.

Explication

La transcriptase inverse synthétise de l’ADN en utilisant un ARN comme matrice. À l’inverse, l’ADN-polymérase ADN-dépendante utilise un ADN comme matrice.

Explication

La PCR suit une dénaturation à 94 °C, une hybridation des amorces vers 60–65 °C et une synthèse à 72 °C. La température règle les étapes du cycle, tandis que le nombre de cycles détermine l’amplification obtenue.

Explication

Le facteur théorique après $n$ cycles est $2^n$ ; pour 30 cycles, il est donc de l’ordre de $10^6$ à $10^8$. La température de 94 °C correspond à une étape de dénaturation et ne sert pas à calculer ce facteur.

Explication

La PCR-RFLP associe l’extraction de l’ADN, l’amplification de la région ciblée, la digestion enzymatique et l’analyse des tailles par électrophorèse. Le séquençage direct constitue une autre méthode et ne décrit pas cette succession d’étapes.

Explication

Les ddNTP incorporés interrompent la synthèse, ce qui produit des fragments terminés à différentes positions. Les dNTP, et non les ddNTP, permettent l’élongation de la chaîne.

Explication

Le NGS permet une analyse parallèle de nombreuses régions génomiques et de plusieurs patients. La terminaison par des ddNTP caractérise le séquençage de Sanger, et non le principe distinctif du NGS.

Explication

Le NGS comprend notamment la fragmentation, la ligation d’adaptateurs, l’hybridation sur une puce, le séquençage par synthèse et les étapes d’analyse informatique. La terminaison par ddNTP et la lecture d’un électrophérogramme correspondent plutôt au séquençage de Sanger.