QCM : Biologie moléculaire : réplication et expression — 30 questions

Explication

Le bromure d’éthidium est un agent intercalant qui s’insère entre les paires de bases et devient fluorescent sous UV. La séparation des molécules selon leur densité relève du gradient de chlorure de césium, et non du BET.

Explication

La centrifugation forme un gradient de densité dans lequel chaque molécule d’ADN atteint la zone dont la densité est égale à la sienne. La longueur, la richesse en sel ou une répartition uniforme ne constituent pas le principe décrit.

Explication

La 5-bromodésoxyuridine est un analogue structural de la thymidine dans lequel le brome remplace le groupement méthyle porté par le carbone 5. Elle ne correspond donc pas à une thymidine simplement inchangée ni à un remplacement du phosphate.

Explication

Lorsque la densité optique à 600 nm double dans cette plage de mesure, la population bactérienne est considérée comme ayant doublé pendant l’intervalle. La DO évalue la croissance globale, tandis que la séparation de l’ADN selon sa densité utilise un gradient de chlorure de césium.

Explication

Dans le modèle semi-conservatif, chaque molécule d’ADN fille associe un brin parental à un brin nouvellement synthétisé. La conservation du duplex entier décrit le modèle conservatif, tandis que le mélange de segments correspond au modèle dispersif.

Explication

Meselson et Stahl ont réalisé en 1958 l’expérience qui a permis d’identifier le modèle de réplication de l’ADN. Les autres scientifiques cités sont associés à la structure de l’ADN ou au séquençage, et non à cette démonstration expérimentale.

Explication

La PCR amplifie spécifiquement une région d’ADN située entre deux amorces afin d’en obtenir de nombreuses copies. La détermination de la succession des nucléotides relève du séquençage, tandis que les deux autres opérations ne définissent pas la PCR.

Explication

Un cycle de PCR commence par la séparation des deux brins, suivie de l’hybridation des amorces sur les séquences complémentaires, puis de l’élongation par l’ADN polymérase. Inverser ces étapes empêcherait les amorces de guider correctement la synthèse des nouveaux brins.

Explication

La région du gène p53 amplifiée par PCR dans le cours mesure 300 paires de bases. Les autres longueurs proposées ne correspondent pas à la région indiquée.

Explication

L’électrophorèse sépare les fragments en fonction de leur taille et de leur charge négative liée aux groupements phosphates. La séparation selon la densité correspond plutôt à l’utilisation d’un gradient de chlorure de césium.

Explication

Les groupements phosphates donnent aux acides nucléiques une charge globale négative, ce qui les attire vers l’électrode positive. Une molécule globalement positive migrerait dans la direction opposée, mais ce n’est pas le cas de l’ADN.

Explication

Les petits fragments d’ADN traversent plus facilement les pores du gel et migrent donc plus rapidement et plus loin. Les fragments plus grands sont davantage ralentis par cette structure poreuse.

Explication

L’incorporation aléatoire de didésoxynucléotides arrête l’élongation et crée des fragments de longueurs différentes, dont l’ordre permet de reconstituer la séquence. Les dNTP, eux, permettent la poursuite de l’élongation au cours de la synthèse.

Explication

Deux pics à la même position signalent que deux bases sont détectées à cet emplacement, ce qui peut correspondre à deux séquences différentes chez un individu hétérozygote. Un pic unique correspond plutôt à une seule base détectée à cette position.

Explication

Le promoteur est une région de l’ADN reconnue et utilisée pour initier la transcription par l’ARN polymérase. Il ne s’agit ni d’une région d’ARN intervenant dans la traduction ni d’une structure impliquée dans la séparation des chromosomes.

Explication

La transcription in vitro nécessite une matrice d’ADN, une ARN polymérase et les quatre ribonucléotides triphosphates; un ribonucléotide marqué au $^{32}\mathrm{P}$ permet de détecter l’ARN par autoradiographie. Les désoxyribonucléotides triphosphates sont associés à la réplication plutôt qu’à la transcription.

Explication

TTGACA et TATAAT correspondent à des séquences promotrices étudiées pour leur rôle dans l’initiation de la transcription bactérienne. Elles ne sont pas considérées ici comme des codons traduits en acides aminés.

Explication

Une séquence située à +800 se trouve en aval du promoteur et peut donc intervenir dans l’élongation ou la terminaison. Le promoteur, plutôt qu’une séquence éloignée à +800, renseigne sur l’initiation de la transcription.

Explication

La position +800 permet d’analyser des étapes postérieures à l’initiation, comme l’élongation ou la terminaison. Le promoteur est l’élément associé au démarrage de la transcription, et non au recrutement des ribosomes.

Explication

Une substitution échange un nucléotide contre un autre et ne modifie pas nécessairement la longueur, alors qu’une insertion ou une délétion modifie la quantité de nucléotides. L’effet sur le cadre de lecture dépend de la longueur insérée ou supprimée.

Explication

Cinq n’est pas un multiple de trois, donc l’insertion décale le cadre de lecture et peut faire apparaître un codon STOP prématuré. Une insertion multiple de trois conserve le cadre, mais ce n’est pas le cas ici.

Explication

Un cadre ouvert de lecture correspond à une séquence délimitée par un codon d’initiation et un codon STOP, avec un potentiel de traduction. Il s’agit d’une séquence nucléotidique, et non d’une suite d’ARNts ou d’une séquence protéique.

Explication

L’ARNm est la matrice directement lue par le système de traduction pour produire une protéine. L’ARNt apporte les acides aminés et l’ARNr participe au ribosome, mais ni l’un ni l’autre n’est la matrice traduite.

Explication

Le SDS impose une charge négative aux protéines, ce qui permet une séparation électrophorétique principalement fondée sur leur taille. Les acides nucléiques possèdent déjà des charges négatives dues à leurs phosphates, ce qui correspond à une autre situation expérimentale.

Explication

Le nombre d’acides aminés se calcule avec $n = \frac{M}{110}$, soit $\frac{22\,000}{110} = 200$. Multiplier la masse par 110 ou soustraire 110 ne correspond pas à la relation donnée.

Explication

Vingt n’est pas un multiple de trois et provoque donc un décalage du cadre de lecture. Trente est un multiple de trois : le cadre est conservé, mais des acides aminés supplémentaires sont ajoutés.

Explication

Les facteurs généraux sont requis pour assembler et faire fonctionner le complexe d’initiation avec l’ARN polymérase eucaryote. Les facteurs spécifiques, en revanche, modulent l’intensité de la transcription en réponse à des séquences régulatrices.

Explication

p53 est un facteur spécifique qui se fixe à la séquence régulatrice située à -150 et stimule la transcription avec la matrice 1. Cette action ne signifie pas que p53 remplace les facteurs généraux nécessaires à l’initiation basale.

Explication

L’épaisseur de la bande reflète la quantité de transcrit produite dans l’expérience. La taille du transcrit est indiquée par la position de la bande, et non par son épaisseur.

Explication

L’effet activateur de p53 dépend de la présence de la séquence régulatrice située à -150; son retrait dans la matrice 2 fait disparaître cette augmentation. Les facteurs généraux peuvent encore assurer l’initiation basale, mais ils n’expliquent pas l’activation spécifique par p53.