QCM : Cartographie génétique par liaison — 18 questions

Explication

Chaque croisement fournit une carte partielle, et plusieurs croisements permettent de relier progressivement davantage de régions. Un seul croisement ne révèle donc pas nécessairement l’organisation complète du génome.

Explication

Un chromosome dépourvu de marqueur polymorphe ne peut pas former de groupe de liaison observable, d’où la nécessité d’une bonne couverture du génome. Des marqueurs nombreux mais regroupés dans certaines régions laisseraient d’autres chromosomes ou segments indétectables.

Explication

Le taux de recombinaison et la distance génétique peuvent varier selon des facteurs sexuels, génétiques ou environnementaux, alors que l’ordre des gènes reste conservé. L’idée que l’ordre des gènes changerait avec chaque distance variable confond la position relative des gènes et l’échelle de mesure.

Explication

Les doubles recombinants sont les classes les moins nombreuses et leur comparaison avec les parentaux révèle l’allèle ou le gène situé au milieu. Les classes les plus fréquentes sont généralement les parentales, qui ne permettent pas à elles seules d’identifier le gène central.

Explication

Lorsque les gènes sont liés, les combinaisons parentales sont généralement beaucoup plus fréquentes que les recombinantes. Des fréquences comparables entre les huit phénotypes indiqueraient plutôt une indépendance génétique.

Explication

Un marqueur est un locus polymorphe dont les différentes formes peuvent être détectées par le phénotype ou par l’analyse de l’ADN. Il peut donc être moléculaire sans produire de modification morphologique visible.

Explication

Même lorsque les distances génétiques et l’échelle varient, les rapports entre distances changent moins et l’ordre des gènes reste strictement conservé. Des distances différentes ne rendent donc pas les cartes incomparables et ne signifient pas que les gènes ont changé d’ordre.

Explication

Dans un test-cross, la F1 triple hétérozygote est croisée avec un individu homozygote récessif, de sorte que les phénotypes de la descendance reflètent directement les gamètes produits par la F1. Un croisement entre deux hétérozygotes ne permet pas cette lecture directe.

Explication

Une carte saturée permet de relier chaque locus du génome à au moins un marqueur, sans représenter nécessairement tous les gènes. Elle n’est donc pas exhaustive au sens d’un inventaire complet des gènes.

Explication

Une carte génétique indique l’ordre des gènes liés ainsi que les distances génétiques qui les séparent. La séquence nucléotidique relève d’une carte physique ou d’un séquençage, et non de cette représentation.

Explication

Les marqueurs moléculaires ont réduit le temps nécessaire à la cartographie : la carte de tomate publiée en 1992 a été obtenue en sept ans, alors que les cartes morphologiques précédentes demandaient plus de 40 ans. L’écart montre l’accélération apportée par ces marqueurs.

Explication

Le taux de recombinaison vaut $r(A,B)=\frac{99}{726}=0,136$, soit 13,6 %, ce qui correspond à une distance de 13,6 cM. La valeur 0,136 est une proportion, tandis que 13,6 cM exprime cette distance génétique.

Explication

L’échange des allèles du gène A dans les doubles recombinants montre qu'A occupe la position centrale. B et C sont donc les deux gènes extérieurs, ce qui correspond à l’ordre B–A–C, équivalent à C–A–B dans le sens inverse.

Explication

Le taux de recombinaison est la proportion d’individus recombinants parmi tous les descendants, soit $r = \frac{N_{recombinants}}{N_{total}}$. L’effectif total est donc le dénominateur, et non le numérateur.

Explication

Le test trois points permet d’étudier simultanément la liaison entre trois gènes, leur ordre chromosomique et les distances qui les séparent. La fréquence des mutations et la dominance des allèles ne constituent pas les objectifs spécifiques de cette méthode.

Explication

L’ordre des gènes se déduit en comparant les doubles recombinants aux phénotypes parentaux et en repérant le gène dont les allèles ont changé de combinaison. La fréquence des caractères dominants ne fournit pas directement cette information.

Explication

Le nombre de groupes de liaison d’une carte saturée correspond au nombre de chromosomes du génome haploïde, soit $n = 5$ lorsque $2n = 10$. Le nombre diploïde ne donne donc pas directement le nombre attendu de groupes.

Explication

Un croisement réunissant un gène de chacun des deux groupes permet de déterminer s’ils sont indépendants ou liés. Cartographier les groupes séparément ne suffit pas à établir leur position relative.