Qu'impose l'universalité du code génétique pour l'utilisation d'un gène ?
On peut utiliser la séquence d'un gène quelle que soit son origine.
Quel est le rôle d'un vecteur de transfert en transgenèse végétale ?
Il fait pénétrer un fragment d'ADN dans la cellule et le génome végétal.
Par quelles méthodes un vecteur de transfert peut-il introduire l'ADN ?
Par des méthodes biologiques, physiques ou chimiques.
Que permet la totipotence cellulaire en biologie végétale ?
De régénérer une plante entière à partir d'une cellule.
Quelles sont les premières étapes de la transgenèse classique ?
Identification et isolement du gène d’intérêt.
Que fait-on après avoir multiplié la construction génétique en transgenèse classique ?
On transfère et sélectionne les cellules transformées.
Quelle est la dernière étape de la transgenèse classique avant l’incorporation dans une variété commerciale ?
L’évaluation de l’expression du gène.
Quel est le rôle de la coculture avec Agrobacterium transformé ?
Elle permet de transformer les cellules végétales.
Comment sont sélectionnées les cellules végétales transformées ?
Elles se développent sur un milieu où seules les cellules transformées poussent.
Que fait la biolistique dans la transformation végétale ?
Elle bombarde les tissus avec des microparticules enrobées d’ADN.
Quel est l'effet du PEG sur les protoplastes ?
Il facilite le transfert d’ADN à travers leurs membranes.
Comment l’électroporation agit-elle sur les protoplastes ?
Elle les perméabilise par des chocs électriques.
Quel type d'insertion produit la transgenèse classique ?
Une insertion aléatoire par recombinaison illégitime.
Quels phénomènes accompagnent souvent la transgenèse classique ?
Des insertions multiples et des remaniements fréquents du transgène et du site d’insertion.
Quels types de modifications génomiques peuvent provoquer les insertions aléatoires ?
Des délétions, des insertions d’ADN, des translocations et des duplications.
Que comprend l’évaluation des risques selon la réglementation européenne ?
L’étude des effets génomiques de la transgenèse.
Quelle directive encadre l’utilisation des OGM en milieu confiné ?
La directive 2001/18.
Que réglemente la directive 2001/18 concernant les OGM ?
Leur dissémination volontaire dans l’environnement.
Qu'impose le DNA Damage Check Point lors de cassures double-brin ?
Il ralentit ou arrête le cycle cellulaire le temps de réparation.
Quelles sont les sources des cassures double-brin de l'ADN ?
Elles proviennent des dérivés réactifs de l’oxygène, erreurs de réplication, UV, produits chimiques ou radioactivité.
Combien de cassures double-brin subit une cellule par jour ?
Environ 10 cassures double-brin par jour.
Combien de cassures double-brin provoque la radioactivité par cellule et par Gray ?
La radioactivité provoque 20 à 40 cassures par cellule et par Gray.
Qu'est-ce que la recombinaison homologue ?
Un mécanisme d’échange d’information génétique entre séquences homologues.
Qu'est-ce que la SSA en réparation d'ADN ?
Un sous-mécanisme de recombinaison homologue utilisant des régions répétées homologues séparées par une cassure.
Quelle homologie et conséquence caractérisent la SSA ?
Elle nécessite au moins 30 paires de bases d’homologie et provoque de grandes délétions sans insertion.
Comment la MMEJ ligature-t-elle les extrémités d'ADN ?
Indépendamment de Ku70/Ku80 grâce à une micro-homologie de 5 à 25 paires de bases.
Qu'est-ce que le ciblage génique ?
L'insertion d'un fragment d'ADN exogène dans un locus donné par recombinaison homologue.
Quels sont les principaux outils du ciblage génique ?
Le knock-out du gène, le remplacement d’allèle et le landing-pad.
Quelle est la formule de l’efficacité de ciblage génique ?
.
Quelle est la fréquence du ciblage génique chez les plantes supérieures ?
Elle est de 0,01 à 0,1 %.
Quelle homologie peut atteindre 80 % dans le ciblage génique chez les plantes ?
Une homologie de 700 paires de bases.
Quelle est la dominance du stade chez Physcomitrella patens ?
Le stade haploïde est dominant.
Quelle est la durée du cycle de développement de Physcomitrella patens ?
Le cycle dure de 10 à 12 semaines.
Quelles capacités régénératives possède Physcomitrella patens ?
Il régénère à partir de protoplastes ou d’explants.
Quel est le nombre chromosomique de Physcomitrella patens ?
Le nombre chromosomique est n=27.
Quelle est la taille approximative du génome de Physcomitrella patens ?
Le génome fait environ 500 Mb.
Quel est le phénotype du double mutant rad51-1/2 chez Physcomitrella patens ?
Il est incompétent pour le ciblage génique.
Les mutants simples rad51-1 ou rad51-2 affectent-ils l’intégration aléatoire de l’ADN chez Physcomitrella patens ?
Non, ils ne sont pas affectés.
Les mutants simples rad51-1 ou rad51-2 affectent-ils le ciblage génique chez Physcomitrella patens ?
Non, ils ne sont pas affectés.
Quel effet ont les cassures double-brin sur la recombinaison homologue chez les plantes ?
Elles l'augmentent de 10 à 100 fois.
Quelles sont les quatre principales nucléases dirigées ?
Les méganucléases, zinc finger nucleases, TALEN et CRISPR/Cas9.
Qu'est-ce qu'une méganucléase ?
Une endonucléase coupant l’ADN double-brin sur un site de 12 à 40 paires de bases.
De quoi sont composées les zinc finger nucleases (ZFN) ?
D’un domaine de liaison à l’ADN en doigts de zinc et du domaine catalytique FokI.
Combien de paires de bases reconnaît chaque doigt de zinc ?
Chaque doigt reconnaît spécifiquement 3 paires de bases.
Comment doit fonctionner FokI dans les ZFN ?
Il doit fonctionner en dimère avec deux ZFN encadrant le site cible.
Qu'est-ce que les TALEN ?
Des TALE fusionnés au domaine catalytique de FokI reconnaissant l’ADN via leurs RVD.
Comment CRISPR/Cas9 est-il guidé vers sa cible ?
Par les 20 premiers nucléotides d’un ARN guide proche d’un motif PAM NGG.
Quelles modifications les SDN permettent-ils au locus choisi ?
La mutagenèse ciblée, l’insertion ciblée et le ciblage génique par cassures double-brin.
Quel type de cassure produisent les nickases ?
Des cassures simple-brin.
Pourquoi les nickases réduisent-elles les effets hors-cible ?
Parce que les cassures simple-brin sont religuées sans mutation.
Comment CRISPRi interfère-t-il avec la transcription ?
En utilisant dCas9 et un ARN guide sans couper l’ADN.
Que modifie le base editing ?
Des bases de l’ADN ou de l’ARN.
Quel avantage présente le base editing concernant le ciblage hors-cible ?
Il réduit le ciblage hors-cible.
Quels composants associe le prime editing ?
Une Cas9 nickase, une transcriptase inverse modifiée et un pegRNA.
Quel rôle joue le pegRNA dans le prime editing ?
Il spécifie la cible et sert de matrice.
Comment le SDN-1 permet-il un knock-out ?
Par réparation illégitime sans ADN donneur créant mutations ponctuelles ou délétions.
Qu'impose le SDN-2 pour remplacer un allèle ?
L'intégration par recombinaison homologue d'une cassette presque identique avec bases modifiées.
Comment le SDN-3 insère-t-il un transgène au niveau de la cassure ?
Par recombinaison homologue ou illégitime dirigée avec ou sans régions homologues.
Que permettent les cassures induites sur plusieurs loci ?
Des knock-outs simultanés, délétions chromosomiques, inversions et gènes chimériques.
Quels sont les quatre groupes de NGT définis par le JRC ?
Les NGT produisant cassures double-brin, simple-brin ou aucune, modifications épigénétiques, et agissant sur ARN transcrits.
Quelle différence génétique maximale définit une plante NGT-1 équivalente à une plante conventionnelle ?
Au maximum 20 modifications génétiques par génome monoploïde.
Quelles modifications sont autorisées en mutagenèse ciblée d’une plante NGT-1 ?
Substitution ou insertion ≤20 nucléotides, délétion quelconque, avec ≤3 modifications par séquence codante.
Quelle condition impose la cisgenèse NGT-1 sur la séquence modifiée ?
La séquence doit exister dans le pool génique de l’espèce.
Quelle autre condition impose la cisgenèse NGT-1 sur la séquence modifiée ?
Elle ne doit pas interrompre un gène endogène.
Quelle demande a fait le Conseil de l’Union européenne en 2019 ?
Étudier le statut des nouvelles techniques génomiques selon le droit de l’Union.
Quelles sont les principales limites de l’édition du génome ?
L’identification des gènes et allèles d’intérêt, la transformation, l’efficacité du knock-in, la réglementation, la propriété intellectuelle, l’acceptation publique et l’hétérogénéité des marchés.
Quelles applications agronomiques les SDN permettent-elles ?
La résistance aux maladies, tolérance aux herbicides, réduction des composés antinutritionnels, amélioration nutritionnelle, conservation, rendement et conversion en biocarburants.
Comment les SDN facilitent-ils l’insertion d’allèles ?
Ils permettent l’insertion d’assortiments d’allèles dans des génotypes sans croisement.
Quel est l’usage des SDN dans le pyramidage de QTL ?
Ils facilitent le pyramidage de QTL dans les lignées élites.
Comment les SDN aident-ils les espèces mineures ou orphelines ?
Ils permettent l’introduction d’allèles d’intérêt chez ces espèces.
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1. Pourquoi un gène bactérien peut-il être utilisé pour produire une protéine dans une cellule végétale ?
2. Quel est le rôle principal d’un vecteur de transfert en transgenèse végétale ?
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