Qu'est-ce que la biologie des données au tournant du XXe au XXIe siècle ?
Une science s'appuyant sur des données de plus en plus massives.
Quelles données comprennent les données biologiques massives ?
Des données de séquençage, protéomiques, métabolomiques, structures protéiques, images et données phénotypiques ou de santé.
Que faut-il combiner pour donner du sens aux données biologiques ?
Les concepts biologiques avec des outils informatiques, mathématiques, statistiques et des moyens de calcul et stockage.
Qu'a publié Gregor Mendel en 1866 sur l'hérédité ?
Les résultats quantitatifs de croisements de pois et trois lois de l'hérédité.
Quelles sont les trois lois de l'hérédité déduites par Mendel ?
Uniformité, ségrégation et indépendance des caractères.
En quelle année les lois de Mendel ont-elles été redécouvertes ?
En 1901.
Par combien de groupes les lois de Mendel ont-elles été redécouvertes en 1901 ?
Par trois groupes indépendants.
Que Morgan a-t-il établi entre 1910 et 1915 ?
Que les chromosomes sont le support de l'hérédité.
Dans quelle période Morgan a-t-il établi le rôle des chromosomes ?
Entre 1910 et 1915.
Qui a établi que les chromosomes sont le support de l'hérédité ?
Morgan.
Dans quelle œuvre Mendel a-t-il publié ses résultats sur l'hérédité ?
Experiments in plant hybridisation, 1865-1866.
Quelle découverte Avery a-t-il faite en 1944 sur l'ADN ?
L'ADN est le support de l'hérédité.
Qui a contribué en 1953 au modèle de la double hélice de l'ADN ?
Watson, Crick, Franklin et Gosling.
Entre quelles années Kendrew et Perutz ont-ils déterminé les premières structures protéiques ?
Entre 1958 et 1960.
Quelles protéines Kendrew et Perutz ont-ils étudiées par rayons X ?
La myoglobine et l'hémoglobine.
Que code le codon CAU dans le code génétique ?
L'arginine.
Que code le codon CCU dans le code génétique ?
La proline.
Quel codon code la méthionine dans le code génétique ?
Le codon ATG.
Quelle méthode Sanger a-t-il mise au point en 1977 ?
Une méthode de séquençage de l’ADN avec des inhibiteurs terminant les chaînes.
Qu'ont transformé les projets de séquençage génomique depuis les années 1990 ?
Les approches biologiques.
Quel changement d'accent ont provoqué les projets de séquençage génomique ?
Du siècle du gène au siècle du génome.
Quels organismes ont été concernés par les premiers projets de séquençage génomique entre 1990 et 2000 ?
Des bactéries, la levure, la drosophile, le nématode, l’arabette et le génome humain de référence.
En quelle année le premier génome humain a-t-il été publié sous forme de brouillon ?
En 2001.
En quelle année une version parachevée du génome humain a-t-elle été publiée ?
En 2004.
Combien de nucléotides comporte le génome humain ?
Environ 3 milliards de nucléotides.
Combien de fois la taille du fragment de 1000 nucléotides le génome humain représente-t-il ?
Environ 3 millions de fois.
Qui a écrit "Le siècle du gène" publié en 2003 ?
Evelyn Fox-Keller.
Qu'est-ce que la génomique fonctionnelle vise à caractériser ?
La fonction de chaque gène d’un génome.
Quelles sont les deux questions centrales après le séquençage d’un génome ?
Localiser les gènes et déterminer leur fonction.
Que mesure la transcriptomique ?
Le niveau de transcription de tous les gènes d’un échantillon.
Quelle technologie transcriptomique a été utilisée en 1997 ?
Les biopuces à ADN.
Quelle méthode transcriptomique est apparue en 2007 ?
La transcriptomique par séquençage massivement parallèle avec le RNA-seq.
Qu'est-ce que la protéomique ?
La caractérisation à large échelle des protéines dans un échantillon.
Pourquoi les quantités de transcrits sont-elles une indication approximative de l'activité d'un gène ?
À cause des régulations post-transcriptionnelles et post-traductionnelles.
Combien de tissus et d'individus sont analysés dans le projet GTEx ?
54 tissus provenant de 1000 individus.
Quelles méthodes sont utilisées dans le projet GTEx pour analyser les tissus ?
Extraction de l’ARN, séquençage et quantification.
Qu'est-ce que l'interactome ?
L'ensemble des interactions entre protéines d'un système biologique.
Quels types d'interactions comprend l'interactome ?
Des interactions stables dans des complexes multimériques et des interactions transitoires.
Quelles sont les deux natures des interactions protéiques ?
Stables en complexes multimériques ou transitoires avec liaisons temporaires.
Quel effet ont les interactions transitoires sur les protéines ?
Elles modifient l’activité des protéines.
Que représente une carte métabolique ?
Le réseau simplifié des réactions biochimiques et enzymes d'une base de données.
Quelle base de données est citée pour les cartes métaboliques ?
KEGG.
Qu'impose la loi de Moore sur la capacité des ordinateurs à coût constant ?
Les capacités doublent tous les deux ans.
En quelle année les technologies NGS sont-elles apparues ?
En 2007.
Comment a évolué le coût du séquençage d'un génome humain entre 2001 et 2024 ?
Il est passé de 3 milliards à 600 dollars.
Quel projet a été lancé en 2008 pour étudier la diversité génotypique humaine ?
Le projet 1000 génomes.
Qu'est-ce que la métagénomique ?
Séquencer tout l'ADN d'un écosystème pour identifier espèces et protéines.
Que décrit la progression du nombre de transistors selon la loi de Moore ?
Une progression exponentielle.
Quelle conséquence ont les technologies NGS sur le coût du séquençage ?
Elles le diminuent fortement.
Quels sont les objectifs de la métagénomique ?
Identifier espèces, caractériser abondance et découvrir protéines.
Quelles approches omiques soutiennent la génomique fonctionnelle ?
Le transcriptome, protéome, localome, transcriptomique spatiale, interactome, phénome, structurome et métabolomique.
Que mesurent les approches holistiques dans un système biologique ?
La quantité et l’activité de nombreuses molécules.
Quels types de molécules sont mesurés par les approches holistiques ?
Le génome, transcriptome, protéome, structurome, interactome et métabolome.
Quelle est la chaîne d'information dans un système biologique ?
De l’ADN à l’ARN, aux polypeptides, aux protéines, puis aux activités biologiques et métabolites.
Que combine la biologie intégrative ?
Les approches holistiques et systémiques.
Quel est le but de la biologie intégrative ?
Relier les différentes composantes et interactions d’un système biologique.
Comment la biologie contemporaine transforme-t-elle les données brutes ?
Elle les convertit en information pertinente grâce aux mathématiques et à l’informatique.
Quels sont les défis numériques majeurs en biologie à l’ère des données massives ?
Le stockage exponentiel, la puissance de calcul, l’efficacité algorithmique et l’intelligence artificielle.
Quels défis scientifiques la bioinformatique doit-elle relever ?
La modélisation, l’intégration multi-omique, l’extraction d’information et la représentation des connaissances.
Qu’est-ce que la bioinformatique selon J. M. Hancock (2014) ?
Un domaine interdisciplinaire développant méthodes et outils pour comprendre des données biologiques volumineuses et complexes.
Quels types de modélisation inclut la bioinformatique ?
La modélisation statistique des données et la modélisation mathématique des systèmes biologiques.
Quels développements techniques fait la bioinformatique ?
Le développement d’outils logiciels, de bases de données et l’annotation experte des données.
Teste tes connaissances avec un QCM de 26 questions sur Introduction à la bioinformatique.
1. Concernant la protéomique, cochez la (les) proposition(s) exacte(s) :
2. L’évolution du coût du séquençage d’un génome humain est caractérisée par :
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