QCM : Introduction à la bioinformatique — 26 questions

Explication

La protéomique caractérise à grande échelle les protéines d’un échantillon, notamment par spectrométrie de masse. Les transcrits d’ARN relèvent de la transcriptomique, et non de la protéomique.

Explication

Le coût du séquençage d’un génome humain diminue d’environ 3 milliards de dollars en 2001 à 16 millions en 2006, puis 1 500 dollars en 2016 et 600 dollars en 2024. Les autres montants proposés déplacent ces valeurs vers des années différentes.

Explication

La quantité de transcrits donne une indication approximative de l’activité d’un gène, car des régulations post-transcriptionnelles et post-traductionnelles interviennent ensuite. Elle ne constitue donc pas une mesure directe et complète de l’activité génique.

Explication

La loi de Moore associe un doublement des capacités informatiques tous les deux ans, à coût constant, à une progression exponentielle du nombre de transistors. Une progression linéaire ajoute une quantité constante plutôt que de multiplier les valeurs.

Explication

L’interactome décrit l’ensemble des interactions protéiques, qu’elles soient stables ou transitoires. Le protéome correspond plutôt à l’ensemble des protéines présentes dans un échantillon, et non à leurs interactions.

Explication

Le code génétique associe des codons à des acides aminés ou à des signaux de terminaison. CAU code l’arginine selon les données fournies, tandis que CCU code la proline ; ATG code la méthionine et UAA, UAG et UGA sont des codons stop.

Explication

Les interactions protéiques peuvent être stables au sein de complexes multimériques ou transitoires avec des liaisons temporaires. Ces interactions transitoires peuvent modifier l’activité des protéines, tandis qu’un complexe multimérique n’est pas nécessairement transitoire.

Explication

Le premier génome humain a été publié en 2001 sous forme de brouillon, puis une version parachevée est sortie en 2004. Les dates inversées ou remplacées par 2003 ne correspondent pas aux jalons indiqués.

Explication

Les défis scientifiques incluent la modélisation des objets biologiques, l’intégration multi-omique, l’extraction d’information pertinente et la représentation des connaissances. L’intégration multi-omique combine plusieurs types de données, alors que la représentation des connaissances organise et visualise l’information ; la modélisation statistique relève plutôt des activités de la bioinformatique.

Explication

Après le séquençage, il faut localiser les gènes et déterminer leur fonction. L’identification des tissus concernés ou la mesure directe des protéines ne constituent pas les deux questions centrales mentionnées.

Explication

Morgan établit entre 1910 et 1915 que les chromosomes sont le support de l’hérédité. La redécouverte indépendante des lois de Mendel date de 1901 et concerne trois groupes de chercheurs, tandis que l’ADN sera identifié plus tard comme support moléculaire.

Explication

Les approches holistiques mesurent systématiquement la quantité et l’activité de nombreuses molécules dans plusieurs niveaux biologiques. Elles concernent notamment le génome, le transcriptome, le protéome, le structurome, l’interactome et le métabolome.

Explication

La transcriptomique mesure simultanément le niveau de transcription de tous les gènes dans un échantillon soumis à des conditions définies. Les premières approches reposaient sur des biopuces en 1997, tandis que le RNA-seq apparaît en 2007.

Explication

Les premiers projets de séquençage entre 1990 et 2000 ont concerné plusieurs organismes, dont la levure, la drosophile, le nématode, l’arabette et l’être humain. Le génome humain de référence ne recense pas toutes les variations génétiques humaines.

Explication

La biologie s’appuie sur des données de plus en plus massives au tournant du XXe et du XXIe siècle. Cette évolution ne concerne pas les seuls génomes ou séquençages, mais aussi de nombreuses autres catégories de données.

Explication

En 1866, Mendel publie les résultats quantitatifs de croisements de pois et en déduit trois lois de l’hérédité. Ces lois concernent l’uniformité de la première génération, la ségrégation et l’indépendance des caractères, qui sont deux notions distinctes.

Explication

L’information biologique suit une chaîne allant de l’ADN vers l’ARN, les polypeptides, les protéines, puis les activités biologiques et les métabolites. La transcription produit l’ARN à partir de l’ADN, alors que la traduction produit des polypeptides à partir de l’ARN.

Explication

Les données massives en biologie incluent notamment le séquençage, la protéomique, la métabolomique, les structures protéiques, les images et les données phénotypiques ou de santé. La protéomique concerne les protéines, tandis que la métabolomique concerne les petites molécules.

Explication

La génomique fonctionnelle mobilise plusieurs approches omiques, dont le transcriptome, le protéome, le localome et la métabolomique. Le transcriptome concerne les ARN, tandis que le protéome concerne les protéines; ils ne désignent donc pas la même mesure.

Explication

L’interprétation des données biologiques massives nécessite d’associer les concepts biologiques à l’informatique, aux mathématiques et aux statistiques. Elle requiert aussi des capacités importantes de calcul et de stockage, et non une seule de ces ressources.

Explication

La génomique fonctionnelle cherche à caractériser la fonction des gènes grâce à des indices fournis par différentes technologies à haut débit. Le séquençage détermine le texte de l’ADN, tandis que la génomique fonctionnelle vise son interprétation biologique.

Explication

Les technologies NGS apparaissent en 2007 et contribuent à la diminution des coûts du séquençage. La baisse brutale des coûts est distinguée de cette date d’apparition et est indiquée pour 2008.

Explication

Le projet 1000 génomes est lancé en 2008 pour caractériser la diversité génotypique des populations humaines. Il ne s’agit donc pas d’un projet lancé en 2007 ni d’une étude limitée à l’expression des protéines.

Explication

La biologie intégrative combine les approches holistiques et systémiques. Cette combinaison sert à relier les différentes composantes et interactions d’un système biologique, plutôt qu’à se limiter à un seul niveau moléculaire.

Explication

Les projets de séquençage de la fin des années 1990 ont déplacé l’accent vers l’étude de génomes entiers. Le siècle du gène concernait plutôt la découverte et la fonction des gènes, et l’ouvrage cité est celui d’Evelyn Fox-Keller.

Explication

Avery établit en 1944 que l’ADN est le support moléculaire de l’hérédité. En 1953, Watson, Crick, Franklin et Gosling contribuent à l’établissement du modèle de la double hélice, tandis que les chromosomes correspondent au support cellulaire.