Fiche de révision : Microbiologie générale et bactéries

📋 Plan du Cours

1. Diversité du monde microbien
2. Rôle et diversité des bactéries
3. Taille et morphologie bactériennes
4. Paroi et coloration de Gram
5. Structures bactériennes et endospores
6. Métabolisme et croissance microbienne
7. Classification et identification microbiennes

📖 1. Diversité du monde microbien

🔑 Notions clés & Définitions

• Microbiologie : Étude des micro-organismes.

★ À maîtriser

📌 Les micro-organismes peuvent être unicellulaires ou multicellulaires, et se répartissent en procaryotes à proto-noyau et eucaryotes à vrai noyau.

• Les procaryotes comprennent les Archaea et les bactéries, lesquelles peuvent être Gram positives ou Gram négatives.

Compléments

• Les eucaryotes comprennent : les algues, les champignons, dont les levures et les moisissures, les protozoaires

💡 Astuce mémo

Procaryote : proto-noyau ; eucaryote : vrai noyau.

📖 2. Rôle et diversité des bactéries

★ À maîtriser

• Certaines bactéries sont pathogènes, tandis que d’autres sont utiles.

• Les bactéries utiles contribuent à : la production d’antibiotiques, la production d’aliments comme le beurre, le fromage et le yaourt, des applications en médecine, industrie et agriculture, le cycle géochimique

Compléments

• Les bactéries sont des organismes ubiquitaires.

📖 3. Taille et morphologie bactériennes

★ À maîtriser

• La taille bactérienne indiquée s’étend des mycoplasmes, d’environ 0,1 μm, aux spirochètes, jusqu’à 500 μm.

Compléments

• Les formes bactériennes illustrées comprennent notamment Bifidobacterium adolescentis, Treponema pallidum et Streptomyces coelicolor.

📖 4. Paroi et coloration de Gram

★ À maîtriser

• La coloration de Gram se réalise avec le cristal violet pendant 1 min, le Lugol pendant 1 min, l’alcool pendant 30 s, puis la safranine pendant 30 s.

📌 Après coloration de Gram, les bactéries Gram positives apparaissent bleu-violet, tandis que les Gram négatives apparaissent roses.

Compléments

• Le Lugol utilisé lors de la coloration de Gram est composé d’iode et d’iodure de potassium.

💡 Astuce mémo

Violet, Lugol, alcool, safranine.

📖 5. Structures bactériennes et endospores

★ À maîtriser

• Les endospores caractérisent principalement les genres :
  • Bacillus
  • Clostridium
  • Sporosarcina

Compléments

• Les dispositions des flagelles sont :

  • monotriche
  • lophotriche
  • amphitriche
  • péritriche

• La capsule bactérienne est polysaccharidique.

• Les exemples cités sont :

  • Bacillus anthracis, associé au charbon
  • Bacillus cereus, associé à une intoxication alimentaire
  • Clostridium perfringens, associé à la gangrène gazeuse
  • Clostridium botulinum, associé au botulisme et à la paralysie respiratoire
  • Clostridium tetani, associé au tétanos
  • Sporosarcina pasteurii, associé à la biocimentation

• Les endospores peuvent être sphériques, cylindriques ou ovoïdes, se situer en position centrale, subterminale ou terminale, et déformer ou non la bactérie.

• Les bactéries sont des procaryotes possédant un seul chromosome et peuvent se multiplier par scission binaire.

📖 6. Métabolisme et croissance microbienne

🔑 Notions clés & Définitions

• Aw : Teneur en eau libre d’un aliment.

★ À maîtriser

• Les catégories de comportement vis-à-vis de l’oxygène sont :
  • aérobies strictes
  • anaérobies strictes
  • aérobies facultatives
  • microaérophiles
  • anaérobies aérotolérantes

📐 Formule - L’activité de l’eau vérifie $Aw = \frac{\text{pression partielle (aliment)}}{\text{pression partielle (eau pure)}}$.

Compléments

• La croissance microbienne est présentée sous forme de courbe de croissance.

📖 7. Classification et identification microbiennes

★ À maîtriser

• La classification microbienne peut s’appuyer sur des caractères morphologiques et biochimiques.

• Les caractères génétiques, notamment le séquençage de l’ARNr 16S, ont contribué aux progrès de la classification microbienne.

• L’identification moléculaire peut cibler un organisme par qPCR ou hybridation de l’ADN, notamment par FISH, ou établir le profil d’une communauté par PCR-DGGE et TRFLP.

Compléments

📌 Le nom d’une espèce associe le genre et l’épithète spécifique, comme dans Escherichia coli, et les noms de famille se terminent par -aceae, comme Enterobacteriaceae.

• Le séquençage à haut débit (NGS) comprend notamment les technologies Illumina et 454.

• L’identification morphologique ou biochimique repose sur une culture pure, des observations et des tests simples, puis l’utilisation d’une clé de détermination.

• Les caractères utilisés dans une clé de détermination sont :

  • la morphologie
  • la présence d’endospores
  • la coloration de Gram
  • l’aérobiose ou l’anaérobiose
  • la catalase
  • l’oxydase
  • le sérotypage