Flashcards : Peptides et protéines — 49 cartes

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1Question

Qu'est-ce qu'une macromolécule ?

Réponse

Une molécule carbonée de grande taille avec poids > 5000 daltons.

2Question

À quoi correspond un dalton en masse ?

Réponse

À 1,66 × 10⁻²⁴ grammes.

3Question

Qu'appelle-t-on le protéome ?

Réponse

L'ensemble des protéines d'une cellule ou organisme.

4Question

Combien de protéines différentes existeraient chez l'Homme ?

Réponse

Entre 80 000 et 400 000 selon les études.

5Question

Quels rôles assurent les protéines ?

Réponse

Des rôles structuraux, transport, catalyse, communication et régulation génique.

6Question

Qu'est-ce qu'une protéine ?

Réponse

Un hétéropolymère d'acides aminés liés par des liaisons peptidiques.

7Question

Par quoi est déterminée la séquence des acides aminés d'une protéine ?

Réponse

Par l'information génétique.

8Question

Combien d'acides aminés contient un oligopeptide ?

Réponse

Moins de 10 acides aminés.

9Question

Quelle est la taille maximale d'un polypeptide en acides aminés ?

Réponse

Moins de 100 acides aminés.

10Question

Combien d'acides aminés contient une protéine ?

Réponse

Plus de 100 acides aminés.

11Question

Combien d'acides aminés comprend l'insuline ?

Réponse

51 acides aminés.

12Question

Comment est généralement désignée l'insuline ?

Réponse

Comme une hormone peptidique.

13Question

Selon les auteurs, comment peut être considérée l'insuline ?

Réponse

Comme un peptide ou une protéine.

14Question

Qu'est-ce qu'un acide alpha-aminé ?

Réponse

Un monomère des peptides et protéines avec un carbone α portant une amine, un acide carboxylique et un radical R.

15Question

Comment se forme la liaison peptidique entre deux acides aminés ?

Réponse

Par condensation entre la fonction carboxylique d'un acide aminé et la fonction amine d'un autre avec élimination d'eau.

16Question

Quelle fonction porte l'extrémité N-terminale d'un polypeptide ?

Réponse

La fonction amine libre du premier acide aminé.

17Question

Quelle fonction porte l'extrémité C-terminale d'un polypeptide ?

Réponse

La fonction carboxylique libre du dernier acide aminé.

18Question

Qu'est-ce que la structure primaire d'une chaîne polypeptidique ?

Réponse

La séquence des acides aminés lue de l'extrémité N vers l'extrémité C.

19Question

Qu'est-ce que la liaison peptidique en termes de résonance?

Réponse

Un hybride de résonance entre deux formes mésomères.

20Question

Quelle conséquence a la double liaison partielle sur la rotation C–N?

Réponse

Elle empêche la rotation autour de l’axe C–N.

21Question

Quels atomes sont coplanaires dans la liaison peptidique?

Réponse

Les atomes C, O, N, H et les deux Cα voisins.

22Question

Quelle configuration place les deux Cα du même côté de la liaison peptidique?

Réponse

La configuration cis.

23Question

Pourquoi la configuration trans est-elle favorisée?

Réponse

Elle réduit les répulsions entre chaînes latérales.

24Question

Que permet la polarité de la liaison peptidique?

Réponse

La formation de liaisons hydrogène essentielles aux structures supérieures.

25Question

Quels sont les deux angles de rotation autour des Cα en structure secondaire ?

Réponse

Les angles Φ et ψ.

26Question

Que montrent les diagrammes de Ramachandran ?

Réponse

Les couples d’angles Φ et ψ possibles ou exclus par encombrement stérique.

27Question

Que permet un couple d’angles Φ et ψ identique sur plusieurs résidus successifs ?

Réponse

L’apparition de conformations régulières de la chaîne polypeptidique.

28Question

Quelle particularité de la glycine influence sa conformation ?

Réponse

Sa chaîne latérale réduite à un hydrogène.

29Question

À quelle structure la glycine participe-t-elle notamment ?

Réponse

La structure du collagène.

30Question

Quel angle Φ est bloqué chez la proline ?

Réponse

L’angle Φ est bloqué à −65°.

31Question

Quelle fonction ont la proline et la glycine dans la chaîne polypeptidique ?

Réponse

Elles favorisent la création de coudes.

32Question

Qu'est-ce qu'une hélice α en structure secondaire ?

Réponse

Une hélice α est une structure secondaire généralement dextre stabilisée par des liaisons hydrogène entre CO du résidu n et NH du résidu n+4.

33Question

Combien de résidus par tour comporte une hélice α ?

Réponse

Une hélice α comporte 3,6 résidus par tour.

34Question

Quelle est la longueur typique d'une hélice α en nombre de résidus ?

Réponse

Une hélice α mesure généralement 10 à 20 résidus.

35Question

Qu'est-ce qu'un feuillet β ?

Réponse

Un feuillet β est constitué de 2 à 15 brins étirés reliés par des liaisons hydrogène entre groupes CO et NH de brins voisins.

36Question

Comment s'orientent les chaînes latérales dans un feuillet β ?

Réponse

Les chaînes latérales sont alternativement orientées vers le haut et vers le bas.

37Question

Quelle différence de stabilité existe entre feuillets β antiparallèles et parallèles ?

Réponse

Les feuillets β antiparallèles sont plus stables que les parallèles car leurs liaisons hydrogène sont mieux orientées.

38Question

Quel rôle jouent les coudes et boucles dans les protéines ?

Réponse

Ils relient hélices et feuillets, changent la direction de la chaîne et forment des sites de reconnaissance, liaison ou actifs enzymatiques.

39Question

Quel ion lie la boucle hydrophile dans le motif hélice-boucle-hélice ?

Réponse

La boucle hydrophile lie le calcium via des résidus chargés négativement.

40Question

Qu'est-ce que la structure tertiaire d'une protéine ?

Réponse

C'est l'organisation tridimensionnelle biologiquement active résultant du rapprochement de résidus éloignés.

41Question

Quelles liaisons stabilisent le repliement tertiaire ?

Réponse

Les liaisons hydrogène, ioniques, interactions hydrophobes et forces de Van der Waals.

42Question

Entre quels groupements les liaisons ioniques peuvent-elles se former au pH cellulaire ?

Réponse

Entre le carboxylate de Glu et l’ammonium de Lys.

43Question

Quels acides aminés peuvent former des interactions hydrophobes grâce à leurs groupements méthyl ?

Réponse

La valine et l’alanine.

44Question

Qu'impose la structure quaternaire dans une protéine ?

Réponse

L'association de plusieurs chaînes polypeptidiques en protomères.

45Question

Comment s'associent les chaînes polypeptidiques en structure quaternaire ?

Réponse

Par des interactions non covalentes et parfois des ponts disulfure intercaténaires.

46Question

Qu'est-ce qu'un groupement prosthétique ?

Réponse

Un groupement non protéique associé à une protéine.

47Question

De quoi est constitué l'hétérotétramère de l'hémoglobine ?

Réponse

De deux chaînes α et deux chaînes β.

48Question

Pourquoi l'hémoglobine est-elle une hétéroprotéine ?

Réponse

Parce que chaque chaîne polypeptidique est associée à un groupement prosthétique hème.

49Question

Quel rôle joue l'hémoglobine dans l'organisme ?

Réponse

Elle transporte le dioxygène des poumons vers les tissus périphériques.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 24 questions sur Peptides et protéines.

1. Quelle caractéristique définit une macromolécule par rapport à une petite molécule ?

2. Que désigne le terme « protéome » ?

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