Flashcards : Séquençage Sanger et PCR (41 cartes)

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1Question

Quelle attribution est associée au séquençage Sanger ?

Réponse

Frederick Sanger, 1977.

2Question

Que permet de déterminer le séquençage Sanger ?

Réponse

La séquence de nucléotides de l’ADN.

3Question

Quel autre nom porte le séquençage Sanger ?

Réponse

La méthode de terminaison de chaîne.

4Question

Quelle matrice la PCR à terminaison de chaîne utilise-t-elle ?

Réponse

L’ADN d’intérêt.

5Question

Que provoque l’incorporation aléatoire d’un ddNTP pendant l’élongation ?

Réponse

L’arrêt de l’élongation et la production de fragments de longueurs différentes.

6Question

Quel groupe les ddNTP ne possèdent-ils pas ?

Réponse

Le groupe 3′-OH.

7Question

Vers quelle électrode migre l’ADN chargé négativement pendant l’électrophorèse sur gel ?

Réponse

Vers l’électrode positive.

8Question

Quel critère l’électrophorèse sur gel utilise-t-elle pour séparer les oligonucléotides terminés par chaîne ?

Réponse

Leur taille.

9Question

Quels fragments d’ADN se déplacent le plus vite dans un gel ?

Réponse

Les fragments les plus petits.

10Question

Comment détermine-t-on la séquence à partir des fragments obtenus ?

Réponse

On lit les fragments du plus petit au plus grand.

11Question

Dans quel sens lit-on la séquence du brin synthétisé ?

Réponse

Dans le sens 5′ à 3′.

12Question

Combien de voies le séquençage manuel utilise-t-il pour séparer les fragments ?

Réponse

Quatre voies, correspondant aux quatre ddNTP.

13Question

Comment le séquençage automatisé sépare-t-il les fragments ?

Réponse

Dans une seule électrophorèse sur gel capillaire.

14Question

Quelle structure les deux brins d’ADN forment-ils en s’enroulant l’un autour de l’autre ?

Réponse

Une double hélice.

15Question

De quoi chaque brin d’ADN est-il constitué ?

Réponse

D’une chaîne de désoxyribonucléotides.

16Question

Si l’amorce cible le brin complémentaire, quel brin la séquence lue représente-t-elle ?

Réponse

Le brin d’intérêt.

17Question

Si l’amorce cible le brin d’intérêt, quel brin la séquence lue représente-t-elle ?

Réponse

Le brin complémentaire, à reconvertir.

18Question

Quel est l’objectif de la PCR sur une séquence d’ADN cible ?

Réponse

Amplifier la séquence entière.

19Question

Que produit le séquençage Sanger jusqu’à la longueur de la cible ?

Réponse

Des fragments terminés de toutes les longueurs possibles.

20Question

Entre quels groupes l’ADN polymérase forme-t-elle une liaison phosphodiester ?

Réponse

Entre le 3′-OH du dernier nucléotide et le 5′-phosphate du suivant.

21Question

Combien de réactions PCR le séquençage Sanger manuel utilise-t-il ?

Réponse

Quatre réactions PCR.

22Question

Combien de types de ddNTP chaque réaction Sanger manuelle contient-elle ?

Réponse

Un seul type de ddNTP.

23Question

Comment le séquençage Sanger automatisé répartit-il les quatre ddNTP ?

Réponse

Il les mélange dans une seule réaction.

24Question

Comment les ddNTP sont-ils distingués dans le séquençage Sanger automatisé ?

Réponse

Chacun porte une étiquette fluorescente unique.

25Question

Pourquoi la vitesse de migration des fragments d’ADN dans un gel dépend-elle de leur taille ?

Réponse

Ils ont la même charge par unité de masse.

26Question

Dans quel ordre les bandes d’oligonucléotides apparaissent-elles de bas en haut dans un gel ?

Réponse

Du plus petit au plus grand.

27Question

Dans quel sens l’ADN polymérase synthétise-t-elle l’ADN ?

Réponse

Dans le sens 5′ à 3′.

28Question

À partir de quoi l’ADN polymérase commence-t-elle la synthèse ?

Réponse

À partir d’une amorce fournie.

29Question

Que fait le laser lors du séquençage automatisé ?

Réponse

Il excite les marqueurs fluorescents des fragments.

30Question

Comment l’ordinateur identifie-t-il les ddNTP terminaux ?

Réponse

À partir de la lumière émise.

31Question

Que représente le chromatogramme du séquençage ?

Réponse

Les pics fluorescents correspondant aux nucléotides le long de l’ADN modèle.

32Question

Que révèle une bande dans la voie ddGTP en séquençage manuel ?

Réponse

Le fragment se termine par une guanine.

33Question

Comment les bases azotées complémentaires des deux brins d’ADN sont-elles liées ?

Réponse

Par des liaisons hydrogène.

34Question

Pour la séquence TACG, que produit une amorce ciblant le brin d’intérêt ?

Réponse

ATGC, à reconvertir en TACG.

35Question

Pour la séquence TACG, que produit une amorce ciblant le brin complémentaire ATGC ?

Réponse

TACG directement.

36Question

Quels composants la PCR utilise-t-elle pour amplifier l’ADN cible ?

Réponse

L’ADN cible, des nucléotides, une amorce d’ADN et une ADN polymérase.

37Question

Quelle propriété de la Taq polymérase convient aux températures de la PCR ?

Réponse

Elle résiste aux températures élevées.

38Question

Quel nucléotide le séquençage Sanger ajoute-t-il au matériel de départ de la PCR ?

Réponse

Des didésoxynucléotides.

39Question

Que permettent de générer les didésoxynucléotides en séquençage Sanger ?

Réponse

Des fragments terminés.

40Question

Que peut fournir la PCR pour le séquençage de l’ADN ?

Réponse

De nombreuses copies de l’ADN à séquencer.

41Question

Quel effet un plus grand nombre de matrices a-t-il sur le protocole Sanger ?

Réponse

Il le rend plus efficace.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 15 questions sur Séquençage Sanger et PCR.

1. Quel est l’objectif principal du séquençage Sanger ?

2. Lors d’une PCR à terminaison de chaîne, un mélange contient l’ADN d’intérêt comme matrice, des dNTP normaux et une faible proportion de ddNTP. Que produit l’incorporation aléatoire de ces ddNTP ?

Faire le QCM →

Consultez la fiche

Révisez le cours complet dans la fiche de révision de Séquençage Sanger et PCR.

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